目的通过网络药理学方法探讨柠檬苦素治疗肝纤维化的作用机制,并运用分子对接和动物实验进行验证。方法首先,利用SwissTargetPrediction、GeneCards和DisGeNet等数据库筛选柠檬苦素和肝纤维化的靶点,并运用微生信网站获得柠檬苦素与肝...目的通过网络药理学方法探讨柠檬苦素治疗肝纤维化的作用机制,并运用分子对接和动物实验进行验证。方法首先,利用SwissTargetPrediction、GeneCards和DisGeNet等数据库筛选柠檬苦素和肝纤维化的靶点,并运用微生信网站获得柠檬苦素与肝纤维化的共同靶点。然后运用STRING数据库和Cytoscape软件构建共同靶点的蛋白质相互作用网络,并利用CytoNCA插件筛选核心靶点;使用Metascape数据库对共同靶点进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,以预测其可能的作用机制。最后运用AutoDock Vina软件对柠檬苦素与核心靶蛋白进行分子对接验证,并将网络药理学预测结果进行动物实验验证。结果预测结果表明柠檬苦素可能作用于AKT1、VEGFA、HIF1A等86个靶点,参与激素应答、蛋白磷酸化、血管生成等生物过程和PI3K/AKT通路、HIF-1通路、VEGF通路等与肝纤维化相关的信号通路。蛋白质相互作用分析结果显示核心靶点包括AKT1、VEGFA、HIF1A、PIK3CA等11个靶点。分子对接结果表明柠檬苦素与AKT1、VEGFA、HIF1A 3个核心靶蛋白具有较强的结合活性和稳定的结合构象。动物实验显示,与模型组比较,柠檬苦素高剂量(high-dose group of limonin,LH)组、柠檬苦素低剂量(low-dose group of limonin,LL)组中血清透明质酸(hyaluronidase,HA)、层黏连蛋白(laminin,LN)含量(LL组中LN除外)均下降(P<0.01或P<0.05),肝组织炎症和纤维化程度均减轻;Western blotting和实时荧光定量PCR(qPCR)检测显示LH、LL组肝组织中AKT、HIF-1α、VEGF蛋白和mRNA表达水平(LL组中VEGF除外)均下调(P<0.01或P<0.05)。结论柠檬苦素主要作用于AKT1、VEGFA、HIF1A等核心靶点来干预肝纤维化血管新生,其机制可能与其抑制AKT/HIF-1α/VEGF信号通路有关。展开更多
文摘目的通过网络药理学方法探讨柠檬苦素治疗肝纤维化的作用机制,并运用分子对接和动物实验进行验证。方法首先,利用SwissTargetPrediction、GeneCards和DisGeNet等数据库筛选柠檬苦素和肝纤维化的靶点,并运用微生信网站获得柠檬苦素与肝纤维化的共同靶点。然后运用STRING数据库和Cytoscape软件构建共同靶点的蛋白质相互作用网络,并利用CytoNCA插件筛选核心靶点;使用Metascape数据库对共同靶点进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,以预测其可能的作用机制。最后运用AutoDock Vina软件对柠檬苦素与核心靶蛋白进行分子对接验证,并将网络药理学预测结果进行动物实验验证。结果预测结果表明柠檬苦素可能作用于AKT1、VEGFA、HIF1A等86个靶点,参与激素应答、蛋白磷酸化、血管生成等生物过程和PI3K/AKT通路、HIF-1通路、VEGF通路等与肝纤维化相关的信号通路。蛋白质相互作用分析结果显示核心靶点包括AKT1、VEGFA、HIF1A、PIK3CA等11个靶点。分子对接结果表明柠檬苦素与AKT1、VEGFA、HIF1A 3个核心靶蛋白具有较强的结合活性和稳定的结合构象。动物实验显示,与模型组比较,柠檬苦素高剂量(high-dose group of limonin,LH)组、柠檬苦素低剂量(low-dose group of limonin,LL)组中血清透明质酸(hyaluronidase,HA)、层黏连蛋白(laminin,LN)含量(LL组中LN除外)均下降(P<0.01或P<0.05),肝组织炎症和纤维化程度均减轻;Western blotting和实时荧光定量PCR(qPCR)检测显示LH、LL组肝组织中AKT、HIF-1α、VEGF蛋白和mRNA表达水平(LL组中VEGF除外)均下调(P<0.01或P<0.05)。结论柠檬苦素主要作用于AKT1、VEGFA、HIF1A等核心靶点来干预肝纤维化血管新生,其机制可能与其抑制AKT/HIF-1α/VEGF信号通路有关。
