紫草素(shikonin)抗奥密克戎毒株的实验研究及机制分析

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作者 王秀民 谢小华 +7 位作者 孙永 袁媛 崔志梅 张涛 苏彦雷 孙殿兴 吴红海 张晶 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2024年第9期23-25,I0001,共4页

目的探讨右旋体紫草素(shikonin)抗奥密克戎毒株的药理作用和对新型冠状病毒主蛋白酶的抑制活性。方法使用奥密克戎毒株BA.2.2转染的Vero细胞模型检测shikonin的抗病毒活性;利用体外主蛋白酶荧光偏振模型测试shikonin对于新型冠状病毒... 目的探讨右旋体紫草素(shikonin)抗奥密克戎毒株的药理作用和对新型冠状病毒主蛋白酶的抑制活性。方法使用奥密克戎毒株BA.2.2转染的Vero细胞模型检测shikonin的抗病毒活性;利用体外主蛋白酶荧光偏振模型测试shikonin对于新型冠状病毒主蛋白酶的抑制活性,实验以奈玛特韦为阳性对照化合物。结果Vero细胞模型药理活性测试发现shikonin具有抑制奥密克戎毒株核酸复制的作用;而在体外荧光偏振模型活性测试实验中,shikonin在20、50μM药物浓度并未表现出对主蛋白酶的显著抑制活性。结论紫草素(shikonin)在细胞水平的实验中表现出抗奥密克戎毒株的药理活性,但其可能是主蛋白酶的非特异性抑制剂,抗病毒的作用机理极可能为抑制新型冠状病毒RNA聚合酶。 展开更多

关键词 紫草素 奥密克戎毒株 RNA聚合酶 主蛋白酶 荧光偏振筛选模型 分子对接

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金合欢素对丝裂原蛋白激酶p38α活性抑制作用的研究

2

作者 高聪慧 谢云 +3 位作者 任建平 任茂 王天轶 苏彦雷 《转化医学杂志》 2024年第1期7-10,共4页

目的探讨金合欢素对丝裂原蛋白激酶p38α(p38αMAPK)的抑制作用。方法应用分子对接软件Autodock Vina将金合欢素与靶酶三维晶体结构1KV2的活性位点进行分子对接,而后利用脂多糖诱导的小鼠RAW 264.7细胞炎症模型验证金合欢素对p38αMAPK... 目的探讨金合欢素对丝裂原蛋白激酶p38α(p38αMAPK)的抑制作用。方法应用分子对接软件Autodock Vina将金合欢素与靶酶三维晶体结构1KV2的活性位点进行分子对接,而后利用脂多糖诱导的小鼠RAW 264.7细胞炎症模型验证金合欢素对p38αMAPK的抑制作用。结果金合欢素可结合于1KV2的活性位点处而阻碍底物三磷腺苷的进入,对p38αMAPK的生物学功能产生抑制作用。与模型组相比,阳性对照药地塞米松和金合欢素不同浓度干预后可明显下调小鼠RAW 264.7细胞炎症模型细胞上清液中一氧化氮和肿瘤坏死因子-α水平(P<0.05)。结论金合欢素可能是通过作用于p38αMAPK活性位点而发挥抗炎的药理活性。 展开更多

关键词 丝裂原激活蛋白激酶p38α亚型 晶体结构 金合欢素 分子对接 脂多糖 一氧化氮 肿瘤坏死因子-α 药理活性

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鹰嘴豆芽素A对P38αMAPK抑制活性的研究

3

作者 薛倩 侯春立 +5 位作者 张丽波 高聪慧 吴红海 陈虹 何强 苏彦雷 《转化医学杂志》 2024年第2期158-161,共4页

目的 探讨鹰嘴豆芽素A对靶酶丝裂原激活蛋白激酶P38α亚型(P38αMAPK)的抑制作用。方法 应用软件Autodock Vina将鹰嘴豆芽素A与P38αMAPK晶体三维结构1KV2的活性位点进行分子对接,而后利用脂多糖(LPS)诱导的小鼠RAW 264.7细胞炎症模型... 目的 探讨鹰嘴豆芽素A对靶酶丝裂原激活蛋白激酶P38α亚型(P38αMAPK)的抑制作用。方法 应用软件Autodock Vina将鹰嘴豆芽素A与P38αMAPK晶体三维结构1KV2的活性位点进行分子对接,而后利用脂多糖(LPS)诱导的小鼠RAW 264.7细胞炎症模型验证鹰嘴豆芽素A对P38αMAPK的抑制活性。结果 鹰嘴豆芽素A可结合于靶酶晶体结构1KV2的活性位点以干扰正常底物的进入,从而对P38αMAPK的生物学功能起到抑制作用;细胞炎症模型实验证明,与LPS模型组比较,阳性对照药地塞米松和鹰嘴豆芽素A单体浓度各剂量(25、50、100μmol/L)干预后可明显下调细胞上清液中一氧化氮和肿瘤坏死因子-α水平(P<0.05)。结论 鹰嘴豆芽素A可作用于P38αMAPK活性位点而发挥抗炎的药理活性。 展开更多

关键词 鹰嘴豆芽素A 抑制 丝裂原激活蛋白激酶P38α亚型 分子对接 脂多糖 一氧化氮 肿瘤坏死因子-Α

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量子化学计算法分析蒙古黄芪中部分黄酮类化合物抗氧化作用机制 被引量：9

4

作者 苏彦雷 张骥 +2 位作者 蒋建勤 林克江 沈剑刚 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期39-43,共5页

运用量子化学计算方法,研究蒙古黄芪中12个黄酮类化合物量子化学参数与抗氧化活性的关系。结果发现,用最高占据分子轨道(HOMO)能级逐差(ΔEHOMO)法预测的目标化合物活性强弱顺序与文献报道的实验结果非常接近。在表征化合物抗氧化活性方... 运用量子化学计算方法,研究蒙古黄芪中12个黄酮类化合物量子化学参数与抗氧化活性的关系。结果发现,用最高占据分子轨道(HOMO)能级逐差(ΔEHOMO)法预测的目标化合物活性强弱顺序与文献报道的实验结果非常接近。在表征化合物抗氧化活性方面,该方法可能会为预测化合物的抗氧化活性提供参考。 展开更多

关键词 量子化学 黄酮 抗氧化 机制 最高占据分子轨道

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量子化学计算法分析5-氟尿嘧啶抗肿瘤作用机制 被引量：8

5

作者 苏彦雷 薛倩 +3 位作者 王文习 李振彬 冉挺 曲伟 《中南药学》 CAS 2016年第2期142-144,共3页

目的利用量子化学参数阐释5-氟尿嘧啶的抗肿瘤机制。方法利用量子化学软件Hyper Chem 7.0对5-氟尿嘧啶及尿嘧啶的多个不同互变构象式进行从头计算。结果得到5-氟尿嘧啶不同构象式自由能值、每个原子所带电荷值、键级值等参数。结论发现5... 目的利用量子化学参数阐释5-氟尿嘧啶的抗肿瘤机制。方法利用量子化学软件Hyper Chem 7.0对5-氟尿嘧啶及尿嘧啶的多个不同互变构象式进行从头计算。结果得到5-氟尿嘧啶不同构象式自由能值、每个原子所带电荷值、键级值等参数。结论发现5-氟尿嘧啶不同构象式中的C-F键的键级均较尿嘧啶5位C-H的键级大,表明C-F键较C-H难以断裂,与药物化学的理论相一致。 展开更多

关键词 量子化学 5-氟尿嘧啶 抗肿瘤机制

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量子化学计算法对次黄嘌呤代谢机制的分析 被引量：4

6

作者 苏彦雷 刘建芳 +2 位作者 曲炜 陈彩娟 刘倩 《海峡药学》 2013年第11期187-189,共3页

运用量子化学计算的方法 ,解析次黄嘌呤及其代谢的相关化合物,发现由次黄嘌呤代谢至尿酸的过程中,化合物自身能量逐步被提取,并且嘌呤母核化合物中先进行羟化的2位C-H键级较大。

关键词 量子化学 次黄嘌呤 代谢机制

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黄嘌呤氧化还原酶抑制剂的构效关系研究进展 被引量：4

7

作者 苏彦雷 蒋建勤 +1 位作者 汪俊松 王明时 《药学进展》 CAS 2009年第8期350-359,共10页

介绍了近年来黄嘌呤氧化还原酶及其抑制剂的研究进展。从构效关系的角度出发,概述与黄嘌呤氧化还原酶底物结构类似的抑制剂和非嘌呤类抑制剂的特点,为新的黄嘌呤氧化还原酶抑制剂的研发提供参考。

关键词 黄嘌呤氧化还原酶 抑制剂 构效关系

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量子化学计算法对合成中4个芳香重氮盐稳定性的分析 被引量：2

8

作者 苏彦雷 刘建芳 +1 位作者 林克江 蒋建勤 《海峡药学》 2013年第8期186-188,共3页

探讨实验合成过程中芳香重氮盐相对不稳定的原因,用量子化学计算法对目标化合物进行解析计算,分析对比了N-C键级大小以及与重氮基团相连接C原子的电负性大小,推断解释了芳香重氮盐2M相对不稳定的原因,希望本报道能对今后的一些实验研究... 探讨实验合成过程中芳香重氮盐相对不稳定的原因,用量子化学计算法对目标化合物进行解析计算,分析对比了N-C键级大小以及与重氮基团相连接C原子的电负性大小,推断解释了芳香重氮盐2M相对不稳定的原因,希望本报道能对今后的一些实验研究提供参考。 展开更多

关键词 重氮盐 稳定性 量子化学计算法

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蒙古黄芪的研究进展 被引量：8

9

作者 苏彦雷 《海峡药学》 2009年第11期1-4,共4页

目的介绍最近几年来蒙古黄芪的研究概况及展望其进一步研究价值。方法以近几年发表的国内外文献为依据,从化学成分和药理作用等方面对蒙古黄芪的研究进展做一综述。结果蒙古黄芪含有多种化学成分,药理活性显著,具有良好的深入研究和开... 目的介绍最近几年来蒙古黄芪的研究概况及展望其进一步研究价值。方法以近几年发表的国内外文献为依据,从化学成分和药理作用等方面对蒙古黄芪的研究进展做一综述。结果蒙古黄芪含有多种化学成分,药理活性显著,具有良好的深入研究和开发的价值。 展开更多

关键词 蒙古黄芪 化学成分 药理作用

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黄酮类单体抗奥密克戎毒株药理活性研究 被引量：3

10

作者 王利华 孙成宏 +8 位作者 邸琨 范腾飞 孙永 袁媛 王鑫 魏计超 孙殿兴 王文习 苏彦雷 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第1期18-20,I0013,共4页

目的探讨黄酮类单体化合物抗新型冠状病毒的药理活性及作用机制。方法利用Autodock Vina分子对接软件将橙皮素、橙皮苷、芹菜苷、木犀草素、木犀草素-4’-葡萄糖苷对接到新型冠状病毒RNA聚合酶三维结构7BV2的底物结合位点处,研究化合物... 目的探讨黄酮类单体化合物抗新型冠状病毒的药理活性及作用机制。方法利用Autodock Vina分子对接软件将橙皮素、橙皮苷、芹菜苷、木犀草素、木犀草素-4’-葡萄糖苷对接到新型冠状病毒RNA聚合酶三维结构7BV2的底物结合位点处,研究化合物分子与靶酶活性位点之间的相互作用;并利用奥密克戎毒株转染的Vero细胞模型测试这些黄酮类化合物单体的抗病毒活性。结果橙皮素、橙皮苷、芹菜苷、木犀草素、木犀草素-4’-葡萄糖苷均可竞争性地结合于靶酶7BV2的底物进入通道处从而阻碍正常的核苷酸类底物进入,故可对靶酶执行的核酸复制生物学功能起到抑制作用;初步细胞水平抗病毒活性测试实验发现橙皮素和木犀草素具有明显地抑制奥密克戎毒株核酸复制的药理作用,而橙皮苷、芹菜苷、木犀草素-4’-葡萄糖苷抗病毒活性较弱。结论经初步实验发现,橙皮素和木犀草素具有一定的抗新型冠状病毒及其变异株的药理活性,可作为先导化合物行进一步开发,实验数据可为抗新型冠状病毒药物开发提供一定参考。 展开更多

关键词 奥密克戎毒株 RNA聚合酶 黄酮 分子对接 活性测试

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贵州南、北盘江地区姜黄属植物中姜黄素类化合物含量对比研究 被引量：3

11

作者 叶世芸 苏彦雷 +1 位作者 黄勇其 徐文芬 《安徽农业科学》 CAS 2012年第12期7058-7060,共3页

[目的]测定贵州南北盘江地区姜黄属植物中姜黄素类化合物的含量,为该地区药材品质评价提供科学参考依据。[方法]采用高效液相色谱法测定贵州南北盘江地区6种姜黄属植物(根及/或根茎)中姜黄素、去甲姜黄素、双去甲姜黄素的含量,色谱柱为I... [目的]测定贵州南北盘江地区姜黄属植物中姜黄素类化合物的含量,为该地区药材品质评价提供科学参考依据。[方法]采用高效液相色谱法测定贵州南北盘江地区6种姜黄属植物(根及/或根茎)中姜黄素、去甲姜黄素、双去甲姜黄素的含量,色谱柱为InertsilODS-18色谱柱,流动相为无水甲醇-异丙醇-水-冰醋酸(20∶27∶48∶5,V/V/V/V),流速为0.5 ml/min,检测波长为420 nm。[结果]采自贵州安龙的姜黄其姜黄素类化合物含量最高,为5.94%;采自贞丰的郁金其姜黄素类化合物含量低。采自兴义不同基原的郁金中姜黄素类化合物的含量不同;姜黄中的含量最高(3.27%);毛郁金的次之(0.005 4%);莪术中的最低(0.001 5%)。[结论]该方法简便快捷,可为贵州南北盘江地区姜黄属植物药材的品质评价提供科学的参考依据。 展开更多

关键词 贵州南北盘江地区 姜黄属 姜黄素类化合物 高效液相色谱法

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木犀草苷抗奥密克戎毒株药理活性的研究 被引量：1

12

作者 王利华 刘军 +6 位作者 邸琨 张晶 孙永 袁媛 王文习 苏彦雷 孙殿兴 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第7期26-28,I0021,共4页

目的 探索木犀草苷抗奥密克戎毒株的药理活性。方法 利用Autodock Vina软件将木犀草苷对接到新型冠状病毒RNA聚合酶晶体结构7BV2的底物结合位点处,研究二者分子间的相互作用,判断其对该靶酶的抑制作用强弱。而后利用奥密克戎BA.2.2毒株... 目的 探索木犀草苷抗奥密克戎毒株的药理活性。方法 利用Autodock Vina软件将木犀草苷对接到新型冠状病毒RNA聚合酶晶体结构7BV2的底物结合位点处,研究二者分子间的相互作用,判断其对该靶酶的抑制作用强弱。而后利用奥密克戎BA.2.2毒株转染的Vero细胞模型测试木犀草苷的抗病毒活性。结果 木犀草苷可较好的结合于靶酶7BV2的底物进入通道处从而阻碍正常核苷酸类底物的进入,可对靶酶的核酸复制生物学功能起到抑制作用;细胞水平的药理活性测试发现木犀草苷抑制奥密克戎毒株核酸复制的作用较弱。结论 木犀草苷具有相对较弱的抗新型冠状病毒及其变异株的药理活性,可能与其相对较低的细胞膜透过率相关,实验数据可为抗新型冠状病毒药物开发提供一定参考。 展开更多

关键词 木犀草苷 奥密克戎毒株 RNA聚合酶 分子对接 活性测试

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黄酮类化合物抑制新型冠状病毒主蛋白酶的研究 被引量：4

13

作者 王绛辉 张晶 +5 位作者 段绪红 张丹 王鑫 常红 孙殿兴 苏彦雷 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第4期13-16,I0014,共5页

目的探讨部分黄酮类化合物对新型冠状病毒主蛋白酶的抑制作用。方法以奈玛特韦为阳性对照化合物,利用主蛋白酶荧光偏振法筛选模型检验黄酮类化合物橙皮素、木犀草素、染料木素、毛蕊异黄酮、芹菜素、根皮素、芹菜素-7-葡萄糖苷、染料木... 目的探讨部分黄酮类化合物对新型冠状病毒主蛋白酶的抑制作用。方法以奈玛特韦为阳性对照化合物,利用主蛋白酶荧光偏振法筛选模型检验黄酮类化合物橙皮素、木犀草素、染料木素、毛蕊异黄酮、芹菜素、根皮素、芹菜素-7-葡萄糖苷、染料木苷、染料木素-4'-葡萄糖苷和橙皮苷对于新型冠状病毒主蛋白酶的抑制活性。结果阳性对照物奈玛特韦在100、50、25μmol/L浓度对于主蛋白酶的抑制率分别为91%、76%和70%,而黄酮类化合物橙皮素、木犀草素、染料木素、毛蕊异黄酮、芹菜素、根皮素、芹菜素-7-葡萄糖苷、染料木苷、染料木素-4'-葡萄糖苷和橙皮苷在对应药物浓度均未表现出对主蛋白酶的有效抑制活性。结论上述黄酮类化合物在细胞水平具有抗新型冠状病毒的药理活性,其作用机理极可能为抑制新型冠状病毒RNA聚合酶,而并非抑制主蛋白酶,实验数据可为后续抗新型冠状病毒药物的研发提供思路和参考。 展开更多

关键词 新型冠状病毒 主蛋白酶 荧光偏振筛选模型 黄酮 药理活性

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颈椎灵胶囊对颈神经根炎模型大鼠血浆6-酮-前列腺等成分含量的影响

14

作者 苏彦雷 曹小勇 +2 位作者 刘明 李红 隋艳华 《贵阳中医学院学报》 2007年第1期65-67,共3页

目的:观察颈椎灵胶囊对实验性颈神经根炎大鼠血浆6-酮-前列腺素F1a、血栓素B2、血清前列腺素E2含量的影响,观察其抗炎作用及活血止痛作用。方法:将浸有福尔马林的定量滤纸片贴放在颈6,7神经根腋下,制作实验性颈神经根炎模型,ig给予大鼠... 目的:观察颈椎灵胶囊对实验性颈神经根炎大鼠血浆6-酮-前列腺素F1a、血栓素B2、血清前列腺素E2含量的影响,观察其抗炎作用及活血止痛作用。方法:将浸有福尔马林的定量滤纸片贴放在颈6,7神经根腋下,制作实验性颈神经根炎模型,ig给予大鼠颈椎灵胶囊4天、7天、14天、21天后,从心脏取血,按测试药盒说明抗凝,采用放射免疫法测定血浆TXB2、6-K-PGF1a、血清PGE2含量。结果:颈椎灵胶囊可使6-K-PGF增加,使TXB2降低,PGE2降低。结论:颈椎灵胶囊具有温经通络和活血止痛的作用。 展开更多

关键词 颈椎灵胶囊 6-K-PGF1A PGE2 TXB2

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桑辛素对新型冠状病毒主蛋白酶抑制作用的研究

15

作者 张培红 赵洁 +5 位作者 张欣欣 陈虹 闫成 苏彦雷 张晶 孙殿兴 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第10期9-11,I0005,共4页

目的 探讨桑辛素对新型冠状病毒主蛋白酶的抑制作用。方法 利用软件AutoDock将桑辛素与主蛋白酶晶体结构6LU7的活性位点进行分子对接;而后利用主蛋白酶荧光偏振筛选模型检验桑辛素对于新型冠状病毒主蛋白酶的抑制活性。结果 桑辛素与主... 目的 探讨桑辛素对新型冠状病毒主蛋白酶的抑制作用。方法 利用软件AutoDock将桑辛素与主蛋白酶晶体结构6LU7的活性位点进行分子对接;而后利用主蛋白酶荧光偏振筛选模型检验桑辛素对于新型冠状病毒主蛋白酶的抑制活性。结果 桑辛素与主蛋白酶活性位点具有较强的分子间相互作用,分子对接过程释放的自由能为-8.3 kcal/mol;在药理活性测试中,桑辛素在400、200、100、25μmol/L浓度对主蛋白酶的抑制率分别为45%、34%、8%、1%。结论 实验表明,桑辛素具有一定的主蛋白酶抑制活性。与既往报道的小分子黄酮类化合物相比,桑辛素对主蛋白酶的抑制活性明显增强,其原因可能为黄酮母核引入了脂溶性取代基进而增强了其与主蛋白酶活性位点处的结合能力相关,为黄酮母核类主蛋白酶抑制剂的结构优化提供参考。 展开更多

关键词 新型冠状病毒 主蛋白酶 荧光偏振筛选模型 桑辛素 抑制作用

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中药络石藤的研究进展 被引量：34

16

作者 李金生 张茜 +2 位作者 张涛 苏彦雷 李振彬 《河北中医药学报》 2016年第2期55-58,共4页

目的:对中药络石藤化学成分及其抗风湿作用的研究进展进行综述。方法:查阅国内外最新研究文献,进行归纳、分析与总结。结果:络石藤是一味临床应用较频繁的抗风湿中药,疗效确切,化学成分研究和药理实验研究也取得了一些基础性成果,但其... 目的:对中药络石藤化学成分及其抗风湿作用的研究进展进行综述。方法:查阅国内外最新研究文献,进行归纳、分析与总结。结果:络石藤是一味临床应用较频繁的抗风湿中药,疗效确切,化学成分研究和药理实验研究也取得了一些基础性成果,但其具体的抗风湿活性成分并未被阐明。结论:应用现代药物设计研究方法思路研究络石藤的抗风湿有效成分,将是阐明络石藤药效物质基础的一个可靠有效的手段,并能对抗风湿类新药的研发提供有意义的参考。 展开更多

关键词 络石藤 抗风湿 化学成分 药理 活性成分 研究进展

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基于分子对接技术精细分析中药化学成分与新型冠状病毒RNA聚合酶之间的结合模式 被引量：7

17

作者 彭安堂 苏彦雷 +6 位作者 刘倩 常希龙 汪俊松 霍长虹 王建荣 段绪红 师洋 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2021年第4期94-101,I0034-I0039,共14页

以SARS RNA聚合酶6NUR为模板,采用同源建模方法,构建出了新型冠状病毒RNA聚合酶的三维结构模型,以之为抗病毒的研究靶点,精细分析靶酶中NTPs结合位点处氨基酸与底物抑制剂的分子间相互作用,虚拟筛选得出黄酮类化合物为抗新型冠状病毒活... 以SARS RNA聚合酶6NUR为模板,采用同源建模方法,构建出了新型冠状病毒RNA聚合酶的三维结构模型,以之为抗病毒的研究靶点,精细分析靶酶中NTPs结合位点处氨基酸与底物抑制剂的分子间相互作用,虚拟筛选得出黄酮类化合物为抗新型冠状病毒活性较强成分,研究结果被证明与抗疫临床治疗实践具有非常高的关联性,亦与某些黄酮类化合物为NS5B抑制剂从而具有抗丙型肝炎病毒活性的现实相符合,故认为以黄酮类化合物为代表的某些中药成分是抗新型冠状病毒的有效成分,希望能引起国内外科研人员的注意,能进一步的实验验证,助力于早日研发成功更好的抗新型冠状病毒药物。 展开更多

关键词 新型冠状病毒 中医 RNA聚合酶 同源建模 6NUR 6M71 分子对接 抑制剂 瑞德西韦 法匹拉韦 黄酮 丙型肝炎病毒 NS5B

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黄芩素抗奥密克戎毒株BA.2.2活性的研究 被引量：10

18

作者 苏彦雷 刘倩 +7 位作者 王君平 孙永 袁媛 吴红海 王天轶 董天剑 李振彬 孙殿兴 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第8期14-16,I0013,共4页

目的 探索黄芩素抗新型冠状病毒(奥密克戎毒株)的药理活性。方法 利用Autodock Vina软件将黄芩素对接到新型冠状病毒RNA聚合酶晶体结构7BV2的底物结合位点处,研究二者分子间的相互作用。而后利用奥密克戎毒株转染的Vero细胞模型测试黄... 目的 探索黄芩素抗新型冠状病毒(奥密克戎毒株)的药理活性。方法 利用Autodock Vina软件将黄芩素对接到新型冠状病毒RNA聚合酶晶体结构7BV2的底物结合位点处,研究二者分子间的相互作用。而后利用奥密克戎毒株转染的Vero细胞模型测试黄芩素的抗病毒活性。结果 黄芩素可较好的结合于靶酶7VB2的底物进入通道处从而阻碍正常核苷酸类底物的进入,对靶酶执行的核酸复制生物学功能起到抑制作用;细胞水平的药理活性测试发现黄芩素具有抑制奥密克戎毒株核酸复制的作用。结论 黄芩素具有抗新型冠状病毒及其变异株的药理活性,可为临床治疗方案制定提供基础实验性的支持。 展开更多

关键词 黄芩素 新型冠状病毒 奥密克戎毒株 RNA聚合酶 分子对接 活性测试

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以RNA依赖的RNA聚合酶为靶点的抗新型冠状病毒抑制剂筛选 被引量：14

19

作者 苏彦雷 段绪红 +2 位作者 许文成 赵玲 关世奎 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第5期7-13,I0011,I0012,共9页

目的从理论上筛选出新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)抑制剂。方法依据SARS-CoV-2的RNA聚合酶与SARS聚合酶结构(6NUR)具有高度的同源性,以SARS的RNA聚合酶为模板构建SARS-CoV-2的RNA聚合酶的三维结构,利用分子对接软... 目的从理论上筛选出新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)抑制剂。方法依据SARS-CoV-2的RNA聚合酶与SARS聚合酶结构(6NUR)具有高度的同源性,以SARS的RNA聚合酶为模板构建SARS-CoV-2的RNA聚合酶的三维结构,利用分子对接软件Autodock Vina研究选中15个化合物与模型靶酶的相互作用,评估化合物对SARS-CoV-2的RNA聚合酶的抑制活性。结果研究发现,所选化合物均与靶酶的活性位点有一定相互作用,其中瑞德西韦活性形式、法匹拉韦活性形式、黄酮及异黄酮类化合物与靶酶的相互作用较强,以瑞德西韦活性形式与靶酶的结合能最低(为-7.9kal/mol),化合物1、2、8、13、14与酶的结合作用相对弱,提示对靶酶的抑制活性弱于瑞德西韦等,而化合物15没有酶抑制活性。结论通过虚拟筛选,得到了SARS-CoV-2 RNA聚合酶的一些抑制剂,其中的某些中药"活性成分"与目前临床上应用方剂的疗效具有较大的相关性,与清肺排毒汤等中医药治疗方案相互佐证。本研究为开发实施有效的抗新型冠状病毒治疗方案提供一定的理论参考,具体作用机制可进行进一步深入的研究验证。 展开更多

关键词 新型冠状病毒 RNA聚合酶 抑制剂 筛选 分子对接 瑞德西韦 法拉匹韦 黄酮

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络石藤中木质素类化合物与P38MAPK的分子对接研究 被引量：5

20

作者 苏彦雷 张铭 +3 位作者 赵海珍 段绪红 许文成 胡丽叶 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2021年第6期132-136,I0028-I0030,共8页

目的研究络石藤中木质素类化合物与P38MAPK激酶的分子作用机制。方法以该酶的经典抑制剂SB-203580、BIRB-796为阳性对照化合物,利用分子对接软件Autodock Vina研究络石藤苷元等木质素类化合物与P38MAPK的相互作用。结果所有化合物均以... 目的研究络石藤中木质素类化合物与P38MAPK激酶的分子作用机制。方法以该酶的经典抑制剂SB-203580、BIRB-796为阳性对照化合物,利用分子对接软件Autodock Vina研究络石藤苷元等木质素类化合物与P38MAPK的相互作用。结果所有化合物均以非共价键方式与靶标蛋白结合,与靶标蛋白产生氢键、范德华力、疏水等相互作用,SB-203580对接产生的自由能为-8.9 kal/mol, BIRB-796对接能量为-11.0 kal/mol,络石苷元、去甲络石苷元、络石酰胺、叶下珠脂素与P38MAPK产生对接能量分别为-8.6 kal/mol、-8.4 kal/mol、-7.4 kal/mol、-7.8 kal/mol。结论络石酰胺、叶下珠脂素与P38MAPK的结合作用相对较弱,络石苷元、去甲络石藤苷元的结合作用相对较强。络石苷元、去甲络石苷元等木质素可能是络石藤中抗风湿作用的活性代表成分。 展开更多

关键词 络石藤 木质素 P38MAPK 分子对接 抗风湿

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