克隆化培养上海地区户尘螨,获得不同编码序列的重组Der p 2变应原进行当地人群血清特异性IgG分析,探讨其应用价值。从过敏性疾病患者床褥采集分离户尘螨,采用封闭式培养系统进行培养,分离培养单个孕螨获得克隆化的螨群。用RT-PCR的方法...克隆化培养上海地区户尘螨,获得不同编码序列的重组Der p 2变应原进行当地人群血清特异性IgG分析,探讨其应用价值。从过敏性疾病患者床褥采集分离户尘螨,采用封闭式培养系统进行培养,分离培养单个孕螨获得克隆化的螨群。用RT-PCR的方法扩增不同螨克隆的Der p 2编码基因,插入原核表达载体pET-19b在大肠杆菌内进行表达,所获得的蛋白经Dot blot和ELISA检测其抗原性及与人群血清IgG的反应水平。结果显示,成功对户尘螨种群进行克隆化培养。获得14个核苷酸多样性位点,对应的两个不同序列的重组Der p 2蛋白与鼠单抗1D8的亲和力不同,但与上海地区人群IgG结合力相似(r=0.864)。检测不同地区尘螨主要变应原的序列多样性,有助于开发更有针对性的疫苗组分,以及特异性保护性IgG的筛选。展开更多
针对分类模型在处理基因表达小样本高维度数据集上存在的分类准确性不足、过拟合、计算复杂度大等问题,提出一种改进模型Two Boosting Deep Forest(TBDForest)。在多描部分采用均等式特征利用方法对原始特征进行变换;在分类过程中考虑...针对分类模型在处理基因表达小样本高维度数据集上存在的分类准确性不足、过拟合、计算复杂度大等问题,提出一种改进模型Two Boosting Deep Forest(TBDForest)。在多描部分采用均等式特征利用方法对原始特征进行变换;在分类过程中考虑到模型所集成的每个森林的拟合质量,将上层最重要的部分判别特征输入到下一级联层,在层间改善类分布问题;对原级联层采用子层级联的结构,增加样本训练机会,减少训练开销,避免模型对参数的依赖。通过在五种疾病基因表达小样本数据集上的验证结果表明,改进的模型增强分类算法在小样本数据集的分类性能上达到了更好的分类效果。展开更多
文摘克隆化培养上海地区户尘螨,获得不同编码序列的重组Der p 2变应原进行当地人群血清特异性IgG分析,探讨其应用价值。从过敏性疾病患者床褥采集分离户尘螨,采用封闭式培养系统进行培养,分离培养单个孕螨获得克隆化的螨群。用RT-PCR的方法扩增不同螨克隆的Der p 2编码基因,插入原核表达载体pET-19b在大肠杆菌内进行表达,所获得的蛋白经Dot blot和ELISA检测其抗原性及与人群血清IgG的反应水平。结果显示,成功对户尘螨种群进行克隆化培养。获得14个核苷酸多样性位点,对应的两个不同序列的重组Der p 2蛋白与鼠单抗1D8的亲和力不同,但与上海地区人群IgG结合力相似(r=0.864)。检测不同地区尘螨主要变应原的序列多样性,有助于开发更有针对性的疫苗组分,以及特异性保护性IgG的筛选。
文摘针对分类模型在处理基因表达小样本高维度数据集上存在的分类准确性不足、过拟合、计算复杂度大等问题,提出一种改进模型Two Boosting Deep Forest(TBDForest)。在多描部分采用均等式特征利用方法对原始特征进行变换;在分类过程中考虑到模型所集成的每个森林的拟合质量,将上层最重要的部分判别特征输入到下一级联层,在层间改善类分布问题;对原级联层采用子层级联的结构,增加样本训练机会,减少训练开销,避免模型对参数的依赖。通过在五种疾病基因表达小样本数据集上的验证结果表明,改进的模型增强分类算法在小样本数据集的分类性能上达到了更好的分类效果。
