目的比较耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)两种基因分型方法的特点,为MRSA流行病学调查选用合适的基因分型方法提供参考。方法用聚合酶链反应(PCR)扩增MRSA基因高变区(Hypervariable region,HVR),并根据扩增片段大小进行基因分型,同时与E...目的比较耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)两种基因分型方法的特点,为MRSA流行病学调查选用合适的基因分型方法提供参考。方法用聚合酶链反应(PCR)扩增MRSA基因高变区(Hypervariable region,HVR),并根据扩增片段大小进行基因分型,同时与ERIC-2随机引物多态性DNA分型法进行比较,并观察不同退火温度条件下两种基因分型方法的差异。结果50株MRSA以基因高变区(HVR)分型,可分为A、B、C、D E 5种基因型,其中以B(47.3%)和D(32.1%)型多见,A(3.5%)、C(10.7%)、E(6.4%)型少见,当退火温度改变时,则不能分型;用ERIC-2随机引物对MRSA进行多态性DNA分型,在低退火温度下分为10种基因型,当退火温度明显改变时,仍能分型,但每型的扩增片断明显减少。结论随机引物多态性DNA分型和HVR基因分型两种方法均能用于MRSA感染的流行病学研究,HVR基因分型PCR反应温度控制严格,分型明确;而随机引物多态性ERIC-2的DNA分型随PCR退火温度的变化而变化,应用时需严格控制PCR退火温度等反应参数,否则重复性较差。展开更多
文摘目的比较耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)两种基因分型方法的特点,为MRSA流行病学调查选用合适的基因分型方法提供参考。方法用聚合酶链反应(PCR)扩增MRSA基因高变区(Hypervariable region,HVR),并根据扩增片段大小进行基因分型,同时与ERIC-2随机引物多态性DNA分型法进行比较,并观察不同退火温度条件下两种基因分型方法的差异。结果50株MRSA以基因高变区(HVR)分型,可分为A、B、C、D E 5种基因型,其中以B(47.3%)和D(32.1%)型多见,A(3.5%)、C(10.7%)、E(6.4%)型少见,当退火温度改变时,则不能分型;用ERIC-2随机引物对MRSA进行多态性DNA分型,在低退火温度下分为10种基因型,当退火温度明显改变时,仍能分型,但每型的扩增片断明显减少。结论随机引物多态性DNA分型和HVR基因分型两种方法均能用于MRSA感染的流行病学研究,HVR基因分型PCR反应温度控制严格,分型明确;而随机引物多态性ERIC-2的DNA分型随PCR退火温度的变化而变化,应用时需严格控制PCR退火温度等反应参数,否则重复性较差。
