中国龙船花Ixora chinensis是一种兼备药用与观赏价值的传统中药材,解析中国龙船花的基因组特征信息,可为其全基因组测序和药效成分生物合成的分子机制研究奠定理论基础。本研究利用Survey基因组测序技术,使用K-mer分析方法对中国龙船...中国龙船花Ixora chinensis是一种兼备药用与观赏价值的传统中药材,解析中国龙船花的基因组特征信息,可为其全基因组测序和药效成分生物合成的分子机制研究奠定理论基础。本研究利用Survey基因组测序技术,使用K-mer分析方法对中国龙船花基因组特征信息展开评估,获得基因组重复度、杂合度以及GC含量等信息。Survey高通量测序获得Raw Data 47.63 Gb,过滤后Clean data 45.62 Gb。K-mer分析表明,基因组大小588.35 Mb,杂合度1.5598%,重复度64.49%,GC含量35.71%,中国龙船花基因组呈现高杂合度、高重复度、基因组庞大的特征。展开更多
为确定巴戟天多糖热水浸提的最佳工艺,以多糖提取率为考察指标,选取液料比、浸提时间、浸提温度3个因素进行单因素试验和基于Box-Behnken设计的响应面试验,利用Design-Expert软件对多糖提取率的二次多项式回归模型进行分析,结果表明:浸...为确定巴戟天多糖热水浸提的最佳工艺,以多糖提取率为考察指标,选取液料比、浸提时间、浸提温度3个因素进行单因素试验和基于Box-Behnken设计的响应面试验,利用Design-Expert软件对多糖提取率的二次多项式回归模型进行分析,结果表明:浸提时间对巴戟天多糖提取率影响最为显著,巴戟天多糖提取的最佳工艺为液料比为25∶1 m L·g^(-1),浸提温度为81℃,浸提时间为3.1 h;该条件下多糖提取率为11.282 4%,与模型预测值接近,相对误差仅为0.38%,说明采用响应面法优化巴戟天多糖提取工艺合理可行。展开更多
目的：应用随机引物扩增多态性DNA技术（ random amplified polymorphic DNA ， RAPD）对大耳白黑眼兔（ white hair black eyes rabbit ， WHBE rabbit ）、日本大耳白兔（ Japanese white rabbit ， JW rabbit ）和新西兰兔（New Zeal...目的：应用随机引物扩增多态性DNA技术（ random amplified polymorphic DNA ， RAPD）对大耳白黑眼兔（ white hair black eyes rabbit ， WHBE rabbit ）、日本大耳白兔（ Japanese white rabbit ， JW rabbit ）和新西兰兔（New Zealand white rabbit， NZW rabbit）3个实验兔品系进行遗传分析。方法选用90只实验兔的皮肤组织样品提取基因组DNA，用60个随机引物对实验兔基因组DNA进行PCR扩增，根据电泳结果筛选出多态性较高的引物进行RAPD-PCR分析，再利用Popgene 3．2统计软件对3个品系的扩增条带进行遗传分析，获得实验数据。结果分析结果表明：（1）60个随机引物中筛选出25个多态性较高的引物，3个品系实验兔共检测到493个扩增片段，长度在100～1800 bp之间，筛选的25个引物中，其中16个引物既可扩增出3个品系共同的DNA条带，也可扩增出WHBE兔特有的特征条带；（2） WHBE兔位点数为234个，其中多态位点数166个，多态位点比为70．94％，JW兔位点数为228个，其中多态位点数122个，多态位点比为53．51％，NZW兔位点数为231个，其中多态位点数94个，多态位点比为40．69％；（3）三个群体的Shannon多样性指数分别为0．3385，0．2222和0．1905；（4） JW兔和NZW兔的遗传相似系数最高，为0．8443，其次为WHBE兔和JW兔的遗传相似系数，为0．8204，WHBE兔和NZW兔的遗传相似系数最低，为0．7862。结论结果表明WHBE兔与JW兔和NZW兔之间有遗传的相似性，也存在着遗传差异，应用RAPD技术可以很好地检测实验兔不同品系之间以及同一品系不同个体之间的亲缘关系。展开更多
文摘中国龙船花Ixora chinensis是一种兼备药用与观赏价值的传统中药材,解析中国龙船花的基因组特征信息,可为其全基因组测序和药效成分生物合成的分子机制研究奠定理论基础。本研究利用Survey基因组测序技术,使用K-mer分析方法对中国龙船花基因组特征信息展开评估,获得基因组重复度、杂合度以及GC含量等信息。Survey高通量测序获得Raw Data 47.63 Gb,过滤后Clean data 45.62 Gb。K-mer分析表明,基因组大小588.35 Mb,杂合度1.5598%,重复度64.49%,GC含量35.71%,中国龙船花基因组呈现高杂合度、高重复度、基因组庞大的特征。
文摘为确定巴戟天多糖热水浸提的最佳工艺,以多糖提取率为考察指标,选取液料比、浸提时间、浸提温度3个因素进行单因素试验和基于Box-Behnken设计的响应面试验,利用Design-Expert软件对多糖提取率的二次多项式回归模型进行分析,结果表明:浸提时间对巴戟天多糖提取率影响最为显著,巴戟天多糖提取的最佳工艺为液料比为25∶1 m L·g^(-1),浸提温度为81℃,浸提时间为3.1 h;该条件下多糖提取率为11.282 4%,与模型预测值接近,相对误差仅为0.38%,说明采用响应面法优化巴戟天多糖提取工艺合理可行。
文摘目的：应用随机引物扩增多态性DNA技术（ random amplified polymorphic DNA ， RAPD）对大耳白黑眼兔（ white hair black eyes rabbit ， WHBE rabbit ）、日本大耳白兔（ Japanese white rabbit ， JW rabbit ）和新西兰兔（New Zealand white rabbit， NZW rabbit）3个实验兔品系进行遗传分析。方法选用90只实验兔的皮肤组织样品提取基因组DNA，用60个随机引物对实验兔基因组DNA进行PCR扩增，根据电泳结果筛选出多态性较高的引物进行RAPD-PCR分析，再利用Popgene 3．2统计软件对3个品系的扩增条带进行遗传分析，获得实验数据。结果分析结果表明：（1）60个随机引物中筛选出25个多态性较高的引物，3个品系实验兔共检测到493个扩增片段，长度在100～1800 bp之间，筛选的25个引物中，其中16个引物既可扩增出3个品系共同的DNA条带，也可扩增出WHBE兔特有的特征条带；（2） WHBE兔位点数为234个，其中多态位点数166个，多态位点比为70．94％，JW兔位点数为228个，其中多态位点数122个，多态位点比为53．51％，NZW兔位点数为231个，其中多态位点数94个，多态位点比为40．69％；（3）三个群体的Shannon多样性指数分别为0．3385，0．2222和0．1905；（4） JW兔和NZW兔的遗传相似系数最高，为0．8443，其次为WHBE兔和JW兔的遗传相似系数，为0．8204，WHBE兔和NZW兔的遗传相似系数最低，为0．7862。结论结果表明WHBE兔与JW兔和NZW兔之间有遗传的相似性，也存在着遗传差异，应用RAPD技术可以很好地检测实验兔不同品系之间以及同一品系不同个体之间的亲缘关系。
