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基于分子对接技术筛选木姜子属阿朴菲型生物碱的COX-2抑制剂研究(Ⅱ) 被引量：1
1
作者 薛孟祺 汪欣怡 +7 位作者 夏侯真如 夏绫誉 杨平 杨念琦 张菊玉 汪云松 文政琦 杨靖华 《云南民族大学学报（自然科学版）》 CAS 2020年第5期409-418,共10页
木姜子属植物(Litsea)是我国重要的药用植物资源,利用分子对接软件Molegro Virtual Docker 6.0(MVD)研究了木姜子属植物中34个阿朴菲类生物碱与炎症反应中的关键酶—环氧合酶2(COX-2)的抑制作用,综合打分函数与相互作用关系,从一定程度... 木姜子属植物(Litsea)是我国重要的药用植物资源,利用分子对接软件Molegro Virtual Docker 6.0(MVD)研究了木姜子属植物中34个阿朴菲类生物碱与炎症反应中的关键酶—环氧合酶2(COX-2)的抑制作用,综合打分函数与相互作用关系,从一定程度上揭示了阿朴菲生物碱与COX-2之间的构效关系,并获得4个打分等于或高于阳性药物艾瑞昔布的分子(1,2,25,26). 展开更多
关键词 木姜子 阿朴菲生物碱 抗炎 COX-2 分子对接
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基于分子模拟技术筛选木姜子属阿朴菲型生物碱的COX-2抑制剂研究(Ⅰ) 被引量：1
2
作者 薛孟祺 杨念琦 +3 位作者 字慧敏 杨平 杨靖华 汪云松 《云南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期325-331,共7页
环氧合酶-2(COX-2)是炎症治疗中的一个重要靶点,但目前市面上的COX-2抑制剂存在心血管副作用,开发新型低毒的COX-2抑制剂十分必要.该文运用Discovery Studio 2016(DS)与Molegro Virtual Docker6.0(MVD)分子模拟软件,采用构建药效团与分... 环氧合酶-2(COX-2)是炎症治疗中的一个重要靶点,但目前市面上的COX-2抑制剂存在心血管副作用,开发新型低毒的COX-2抑制剂十分必要.该文运用Discovery Studio 2016(DS)与Molegro Virtual Docker6.0(MVD)分子模拟软件,采用构建药效团与分子对接的方法,对传统药用植物木姜子属(Litsea)中分离到的14个特征性阿朴菲生物碱展开研究.研究发现8个阿朴菲生物碱分子(1, 3, 4, 5, 8, 9, 11, 12)与最优药效团可以匹配,其中单甲氧基取代的3个阿朴菲生物碱(1-3)在分子对接中得分较高,有进一步研究的价值.随甲氧基的增多,对接得分逐步降低.研究结果揭示木姜子属阿朴菲生物碱可能是具有潜在COX-2抑制作用的一类分子,值得进一步深入研究. 展开更多
关键词 炎症 COX-2 木姜子属 阿朴菲生物碱 分子对接 药效团
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基于分子对接及药效团模型的木姜子属木脂素类化合物5-LOX抑制剂筛选研究(Ⅰ) 被引量：1
3
作者 夏侯真如 薛孟祺 +5 位作者 汪欣怡 张寅燕 杨彤 文政琦 汪云松 杨靖华 《云南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期369-379,共11页
脂氧合酶-5(5-LOX)是炎症反应中的关键酶之一,其中目前以其作为炎症治疗靶点的上市药物大多有肝毒性、半衰期短等不足之处,因此新型的5-LOX抑制剂的开发十分有必要性.在前期研究基础上,发现传统药物资源木姜子属植物中的木脂素类化合物... 脂氧合酶-5(5-LOX)是炎症反应中的关键酶之一,其中目前以其作为炎症治疗靶点的上市药物大多有肝毒性、半衰期短等不足之处,因此新型的5-LOX抑制剂的开发十分有必要性.在前期研究基础上,发现传统药物资源木姜子属植物中的木脂素类化合物可能具有一定的抗炎活性,于是进一步采用分子对接与药效团模型的虚拟筛选方式,对其进行研究.研究发现35个木脂素类分子均有较好的匹配度,其中32号、33号化合物在两种筛选方式中都有较高的打分结果,且靶点蛋白结合模式与阳性对照齐留通(zileuton)有较高的相似度.研究结果显示,木姜子属植物中的木脂素类化合物可能具有潜在5-LOX抑制活性,且其中的32号、33号分子具有较高的潜在研究价值,值得进一步深入研究. 展开更多
关键词 木姜子属 木脂素 5-LOX抑制剂 分子对接 药效团模型
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基于全新药物设计方法的木姜子属酰胺类化合物5-LOX抑制剂筛选研究
4
作者 夏侯真如 薛孟祺 +4 位作者 汪欣怡 字慧敏 文政琦 李碧桃 杨靖华 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第21期6961-6970,共10页
目的采用基于分子对接及从头设计的方法从木姜子属酰胺类化合物中寻找潜在的5-脂氧合酶(5-lipoxygenase,5-LOX)抑制剂并改造提高其预期活性。方法通过文献资料收集了木姜子属植物中现已分离鉴定的酰胺类化合物10个。应用分子对接技术,... 目的采用基于分子对接及从头设计的方法从木姜子属酰胺类化合物中寻找潜在的5-脂氧合酶(5-lipoxygenase,5-LOX)抑制剂并改造提高其预期活性。方法通过文献资料收集了木姜子属植物中现已分离鉴定的酰胺类化合物10个。应用分子对接技术,通过与5-LOX抑制剂筛选相关的蛋白结晶的对接分析,筛选出木姜子属植物中最优的酰胺类化合物。再以该化合物为基础进行分子库扩充,并通过对该分子库进行类药规则和ADMET筛选,选择其中排名前五的分子进行从头设计碎片生长,最后再从设计结果中筛选出更优的5-LOX潜在抑制剂。结果通过分子对接分析筛选出了木姜子属植物中最优的酰胺化合物N-反式-3,4-亚甲基肉桂酰-3-甲氧基酪胺,利用类药规则和ADMET筛选出9个相对符合药理毒理性质要求的类似分子,采用从头设计方法筛选了出打分值较高的候选化合物6个,并初步阐释了优良5-LOX抑制剂可能的活性残基结合情况。结论木姜子属中酰胺类化合物及其衍生物可能通过抑制5-LOX来发挥抗炎活性作用,相对于传统筛选和改造,分子对接和从头设计技术节约了大量的资源,为新型5-LOX抑制剂的研发提供了一定的参考。 展开更多
关键词 木姜子属 酰胺类化合物 5-LOX抑制剂 分子对接 从头设计 N-反式-3 4-亚甲基肉桂酰-3-甲氧基酪胺
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