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1株鸭疫里默氏杆菌的全基因组测序及耐药性与遗传进化分析 被引量：6
1
作者 祝希辉 李艳兰 +7 位作者 王志伟 庞喆羽 李玉保 刘成 司振书 路建彪 曹胜亮 薛希娟 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1140-1149,共10页
【目的】了解鸭疫里默氏杆菌的耐药性、基因组结构与遗传变异程度,为鸭疫里默氏杆菌耐药性与基因组研究提供参考。【方法】本研究对1株从病死鸭脑组织分离的鸭疫里默氏杆菌疑似菌株进行了PCR鉴定、耐药性检测及全基因组框架图测序,并基... 【目的】了解鸭疫里默氏杆菌的耐药性、基因组结构与遗传变异程度,为鸭疫里默氏杆菌耐药性与基因组研究提供参考。【方法】本研究对1株从病死鸭脑组织分离的鸭疫里默氏杆菌疑似菌株进行了PCR鉴定、耐药性检测及全基因组框架图测序,并基于16S rDNA与管家基因对其进行了遗传进化分析。【结果】测序数据经过质控与过滤后成功组装为1个包含38个contigs的基因组框架,使用Abricate软件、CARD在线数据库共检测出6种不同的耐药基因,其中4种与耐药表型符合;将基因序列提交至MLST数据库,发现了一种新ST型,定为ST93。构建的16S rDNA和管家基因进化树结果表明,分离菌株与2株鸭疫里默氏杆菌具有较近的亲缘关系。【结论】分离鉴定得到1株鸭疫里默氏杆菌,该菌株为多药耐药菌株,其基因组中携带多个耐药基因;鸭疫里默氏杆菌的基因变异程度较大,且存在跨区域流行传播风险。在临床用药时应注意合理用药,及时监控抗性基因的水平转移,防止鸭疫里默氏杆菌跨区域流行。 展开更多
关键词 鸭疫里默氏杆菌 耐药性 耐药基因 基因组 生物信息学
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噬菌体与动物细胞的相互作用
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作者 庞喆羽 祝希辉 +3 位作者 李艳兰 王志伟 李玉保 薛希娟 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第20期35-40,共6页
噬菌体是动物体内最丰富的生物群体。噬菌体易获得、宿主特异性强、不易产生耐药性等特点使其在治疗耐药细菌感染方面具有很大优势。随着基因工程和显微镜技术的发展,噬菌体对动物细胞的调节机制逐渐被发现。笔者综述了近年来关于噬菌... 噬菌体是动物体内最丰富的生物群体。噬菌体易获得、宿主特异性强、不易产生耐药性等特点使其在治疗耐药细菌感染方面具有很大优势。随着基因工程和显微镜技术的发展,噬菌体对动物细胞的调节机制逐渐被发现。笔者综述了近年来关于噬菌体进入动物细胞的机制、噬菌体在细胞内的分布及与细胞内受体相互作用的研究进展,强调了噬菌体在协助宿主细胞杀灭细菌过程中的作用,讨论了噬菌体与动物细胞相互作用对噬菌体治疗的意义,旨在为噬菌体治疗耐药细菌的研究提供理论基础。 展开更多
关键词 噬菌体 哺乳动物 细胞 相互作用 治疗
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致病性大肠杆菌携带原噬菌体的预测及耐药性与毒力研究 被引量：6
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作者 祝希辉 庞喆羽 +4 位作者 王志伟 裴兰英 曹胜亮 薛希娟 李玉保 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第3期1126-1134,共9页
【目的】研究致病性大肠杆菌携带原噬菌体的比例、原噬菌体携带毒力基因及耐药基因的情况,了解致病性大肠杆菌中原噬菌体对菌株的耐药性与毒力的影响,保证噬菌体生产菌的生物安全性,为大肠杆菌噬菌体的基础研究与应用提供借鉴。【方法】... 【目的】研究致病性大肠杆菌携带原噬菌体的比例、原噬菌体携带毒力基因及耐药基因的情况,了解致病性大肠杆菌中原噬菌体对菌株的耐药性与毒力的影响,保证噬菌体生产菌的生物安全性,为大肠杆菌噬菌体的基础研究与应用提供借鉴。【方法】从NCBI中下载大肠杆菌全基因组信息,通过在线网站预测大肠杆菌中携带的原噬菌体数目,并分析原噬菌体的GC含量、基因组大小、占细菌基因组比例等基因组特征及完整型原噬菌体的类型,对原噬菌体做初步分类,统计分析完整型原噬菌体中携带耐药基因数目、耐药表型、耐药机制与毒力基因数目、毒力基因家族分布等。【结果】112株大肠杆菌携带完整型原噬菌体1024个,疑似型原噬菌体287个,缺陷型原噬菌体505个。1024个完整型原噬菌体中,多数与长尾噬菌体相似,占70.21%(719/1024);共有63种噬菌体类型,其中BP4795(登录号:NC_004813.1)类型的占比最高,达到19.24%(197/1024),其次是DE3(登录号:NC_042057.1),占比11.72%(120/1024)。大肠杆菌携带原噬菌体的GC含量在38%~57%之间,基因组大小为3.1~152.6 kb,其中80 kb以内的原噬菌体占97.03%(1762/1816)。1024个完整型原噬菌体中携带耐药基因占比为6.35%(65/1024),共携带耐药基因253个,分别来自11个抗生素耐药基因家族;携带一个或多个毒力基因的完整性原噬菌体占42.78%(438/1024),共携带毒力基因1274个,分别来自9个不同毒力因子家族,平均每个完整型原噬菌体携带毒力基因2.9个。【结论】大肠杆菌普遍携带原噬菌体,原噬菌体中部分携带耐药基因与毒力基因,在实际应用中应充分评估其风险,防止原噬菌体造成的耐药基因与毒力基因在菌株之间的转移。 展开更多
关键词 大肠杆菌 原噬菌体 耐药基因 毒力基因
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基因工程编辑噬菌体的技术及应用 被引量：3
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作者 李艳兰 祝希辉 +3 位作者 李玉保 管玉堂 薛希娟 乔彦良 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第9期41-45,共5页
噬菌体主要用于治疗细菌性感染,将其作为抗菌药物开发具有巨大的优势及应用潜力。但噬菌体疗法受宿主谱狭窄、安全性评价体系不完善等因素影响,作为抗菌药物的研究进展缓慢。近年来,多重耐药菌的增加使人们对以噬菌体作为抗菌药物重新... 噬菌体主要用于治疗细菌性感染,将其作为抗菌药物开发具有巨大的优势及应用潜力。但噬菌体疗法受宿主谱狭窄、安全性评价体系不完善等因素影响,作为抗菌药物的研究进展缓慢。近年来,多重耐药菌的增加使人们对以噬菌体作为抗菌药物重新产生了兴趣。基因工程技术的发展给噬菌体的编辑提供了广泛的可能性,使得噬菌体可以精确检测和杀灭细菌。文章综述了噬菌体编辑技术的进展,以期为噬菌体疗法在临床上发挥更大的作用提供参考。 展开更多
关键词 噬菌体 耐药性 基因重组 基因编辑 噬菌体疗法
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噬菌体介导基因转移的研究进展
5
作者 祝希辉 薛希娟 +1 位作者 李艳兰 李玉保 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第6期27-31,共5页
噬菌体是一种侵染细菌的病毒,可特异性裂解细菌。噬菌体可存在于人类和动物肠道内,通过机体排泄而释放至外环境并稳定存在,在细菌之间的基因转移中发挥重要作用。噬菌体介导的基因转移可分为普遍性转导与局限性转导两种方式。噬菌体介... 噬菌体是一种侵染细菌的病毒,可特异性裂解细菌。噬菌体可存在于人类和动物肠道内,通过机体排泄而释放至外环境并稳定存在,在细菌之间的基因转移中发挥重要作用。噬菌体介导的基因转移可分为普遍性转导与局限性转导两种方式。噬菌体介导的细菌基因转移需要满足以下3个条件,即噬菌体和细菌的浓度超过一定阈值,细菌生理状态适合噬菌体感染,pH值、温度等环境因素适合噬菌体感染。噬菌体介导的基因转移给公共卫生及畜牧养殖带来很多的问题,因此笔者对噬菌体介导基因转移的转导方式进行了综述,分析了影响噬菌体基因转移的因素,并介绍了噬菌体介导基因转移的应用,提出了噬菌体介导基因转移过程中亟待解决的问题,以期为研究环境中的基因转移现象提供借鉴。 展开更多
关键词 噬菌体 转导 基因转移 影响因素 生物安全 耐药性 食品安全
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ATP荧光检测仪在泡沫消毒剂杀菌效果检测中的应用 被引量：2
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作者 王稼林 薛希娟 +3 位作者 孙伦 刘健 宋桂才 张恒 《中国畜牧兽医文摘》 2018年第5期69-69,171,共2页
本研究主要针对目前应用较多的一种新型泡沫消毒剂现场杀菌效果进行测试,采用ATP荧光检测仪辅助消毒效果检测,与其他两种消毒剂进行消毒效果比较;研究表明泡沫消毒剂杀菌效果最好,杀菌率可以达到97%,ATP荧光检测仪可以准确、快速读取检... 本研究主要针对目前应用较多的一种新型泡沫消毒剂现场杀菌效果进行测试,采用ATP荧光检测仪辅助消毒效果检测,与其他两种消毒剂进行消毒效果比较;研究表明泡沫消毒剂杀菌效果最好,杀菌率可以达到97%,ATP荧光检测仪可以准确、快速读取检测结果。 展开更多
关键词 泡沫消毒 ATP荧光检测仪 杀菌率
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