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随机生存森林在小细胞肺癌预后分析中的应用 被引量：1
1
作者 解瑞飞 吴波 《中国现代医生》 2016年第17期4-8,F0003,共6页
目的辨识与小细胞肺癌具有本质关联的基因变量,可以帮助临床医生制定个性化治疗方案,延长患者生存期,提高患者预后生活质量。方法共入组117例小细胞肺癌患者,含41000个基因变量,8个一般特征。利用随机生存森林方法结合基因表达谱及预后... 目的辨识与小细胞肺癌具有本质关联的基因变量,可以帮助临床医生制定个性化治疗方案,延长患者生存期,提高患者预后生活质量。方法共入组117例小细胞肺癌患者,含41000个基因变量,8个一般特征。利用随机生存森林方法结合基因表达谱及预后数据从一系列基因变量中探索与小细胞肺癌具有密切相关的基因变量。结果一般特征及EGFR、K-ras、p53表达在预后上无明显差异;所挑选的前12个基因中,FTCD、BTC、PSMC4、SLC43A1与小细胞肺癌具有密切的关系,而UCHL5、PSMC4与PSMD7、PCSK4、VPS13D与VPS13A具有调控依赖关系。结论随机生存森林可以高效的辨识与预后具有密切相关的本质基因。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 随机生存森林 基因表达谱 生存分析 基因调控
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基于PTPR排名的基因随机选择算法
2
作者 解瑞飞 韩斌 +1 位作者 厉力华 祝磊 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期695-705,共11页
面对高维、小样本的基因微阵列数据,有效地提取特征基因成为一项艰巨的任务。在随机特征选择方法的基础上,引入"种子变量"及滚动的排名机制,提出一种基于职业网球选手排名(PTPR)的特征选择算法。用种子变量提高变量搜索过程... 面对高维、小样本的基因微阵列数据,有效地提取特征基因成为一项艰巨的任务。在随机特征选择方法的基础上,引入"种子变量"及滚动的排名机制,提出一种基于职业网球选手排名(PTPR)的特征选择算法。用种子变量提高变量搜索过程的选择性,提高搜索效率,同时充分利用历史记录来动态更新种子变量,加快寻优速度。在公共数据库上的测试实验结果表明,PTPR在随机多次独立运行时得到平均50%～80%的相同基因,而MichaDraminski的方法只能保持相同基因在10%～50%左右;收敛性实验表明,PTPR的收敛速度更快且显著;而在5个数据集的独立测试集上的分类率实验表明,PTPR保持较高的分类率,如PTPR得到最高分类率大约为98%、90%、89%、95%、75%,而MichaDraminski方法的最高分类率为96%、89%、85%、95%、70%。同时,与其他典型方法相比,PTPR也得到了较高的分类率。总体上,PTPR算法具有搜索速度快、结果稳定的特点,而且在不同的分类器上都保持了较优的分类率。 展开更多
关键词 PTPR 特征选择 种子变量 随机搜索 滚动的排名
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肺癌预后预测模型的建立
3
作者 解瑞飞 杨梓 《浙江临床医学》 2022年第7期959-961,共3页
目的通过随机生存森林(RSF)法提取肺敏感基因,结合列线图(nomogram)算法,建立肺癌预后预测模型.方法分析117例肺腺癌患者中的41,000个基因变量、5个临床一般特征.在患者基因表达谱数据上应用RSF法,筛选出影响肺癌的敏感基因,并建立患者... 目的通过随机生存森林(RSF)法提取肺敏感基因,结合列线图(nomogram)算法,建立肺癌预后预测模型.方法分析117例肺腺癌患者中的41,000个基因变量、5个临床一般特征.在患者基因表达谱数据上应用RSF法,筛选出影响肺癌的敏感基因,并建立患者预后生存预测模型和复发预测模型.结果使用性别、年龄、T分期、N分期、吸烟时间共5个临床特征建立患者预后生存模型、复发模型,一致性指数C值分别为0.684(95%CI:0.646~0.723)、0.648(95%CI:0.597~0.699);在5个临床一般特征中加入PSMD12、HUS1B、TIMM50后,生存预测模型一致性指数C值为0.767(95%CI:0.733~0.802),而仅用PSMD12、HUS1B、TIMM50建立生存预测模型一致性指数C值为0.711(95%CI:0.671~0.751).而使用N分期、PSMD12、HUS1B、TIMM50建立复发预测模型一致性指数C值为0.795(95%CI:0.752~0.838).结论通过RSF筛选的基因变量,与临床一般特征相结合,可以有效建立预后生存预测模型、复发预测模型,帮助临床医师为患者评估预后情况,并指导医师制定合理的治疗方案. 展开更多
关键词 随机生存森林 列线图 肺癌 预后模型
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CA125联合经阴道彩色多普勒超声在卵巢癌新辅助化疗监测中的应用价值 被引量：10
4
作者 赵璐 金海艳 +2 位作者 夏雪梅 张菁菁 解瑞飞 《中国性科学》 2017年第2期19-22,共4页
目的:探讨CA125联合经阴道彩色多普勒超声在卵巢癌新辅助化疗监测中的应用价值。方法:收集2013年3月至2015年3月我院妇产科收治的行新辅助化疗卵巢癌患者114例,所有入组患者均于新辅助化疗前后分别检测CA125水平及测定经阴道彩色多普勒... 目的:探讨CA125联合经阴道彩色多普勒超声在卵巢癌新辅助化疗监测中的应用价值。方法:收集2013年3月至2015年3月我院妇产科收治的行新辅助化疗卵巢癌患者114例,所有入组患者均于新辅助化疗前后分别检测CA125水平及测定经阴道彩色多普勒超声相关指标,分析CA125及经阴道彩色多普勒超声指标化疗前后的差异,计算、比较二者在新辅助化疗效果监测中的敏感性、特异性及准确性。结果:新辅助化疗后CA125水平明显降低,差异有统计学意义(P<0.05),其监测敏感性为63.26%,特异性为56.25%,准确率为62.28%;新辅助化疗后,卵巢癌原发灶瘤体体积明显缩小,血流最大速度明显降低,同时血流阻力指数明显增大,差异均有统计学意义(均P<0.05),其监测敏感性为83.67%,特异性为81.25%,准确率为81.58%。CA125联合经阴道彩色多普勒超声的监测敏感性为94.89%,特异性为68.75%,准确率为91.22%,与单独应用CA125及经阴道多普勒超声监测结果具有统计学差异(P<0.05)。结论:CA125联合经阴道彩色多普勒超声可明显提高卵巢癌新辅助化疗监测的准确性,能更好的评估新辅助化疗的效果,为临床评估奠定基础。 展开更多
关键词 卵巢癌 CA125 经阴道彩色多普勒超声 新辅助化疗
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洗必泰外敷治疗PICC局部感染疗效观察 被引量：2
5
作者 俞素琴 姚兰 解瑞飞 《浙江中西医结合杂志》 2017年第10期886-888,共3页
经外周静脉穿刺中心静脉导管（peripherally Inserted central catheters,PICC）为肿瘤患者提供了一条安全、无痛、便捷的输液通路,是一种从周围静脉导入且末端位于中心静脉的深静脉置管技术,因其操作简单、安全、导管留置时间长等特点... 经外周静脉穿刺中心静脉导管（peripherally Inserted central catheters,PICC）为肿瘤患者提供了一条安全、无痛、便捷的输液通路,是一种从周围静脉导入且末端位于中心静脉的深静脉置管技术,因其操作简单、安全、导管留置时间长等特点而被广泛应用于临床（[1]）。但置管后穿刺点周围皮肤局部感染是置管后主要并发症之一, 展开更多
关键词 PICC 局部感染 洗必泰
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一种生物相关性优先的两步卵巢癌化疗疗效敏感基因选取方法
6
作者 韩斌 王清 +2 位作者 解瑞飞 厉力华 祝磊 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期572-581,共10页
作为卵巢癌主要诊疗手段之一的化疗,费用昂贵,副作用大,且患者反应的个体差异很大。本文提出一种首先依据诊断结果(卵巢癌化疗疗效)相关性进行特征选择,然后利用蒙特卡洛方法对特征基因排序,最终建立预测化疗反应模型的方法,克服了过度... 作为卵巢癌主要诊疗手段之一的化疗,费用昂贵,副作用大,且患者反应的个体差异很大。本文提出一种首先依据诊断结果(卵巢癌化疗疗效)相关性进行特征选择,然后利用蒙特卡洛方法对特征基因排序,最终建立预测化疗反应模型的方法,克服了过度依赖分类率的弊端。首先利用奇异值分解,基于散点图和Kolmogorov-Smirnovtest(K-S test)的定性和定量分析非生物因素对基因表达谱的影响,结合化疗反应样本的聚类图进行基因筛选;然后采用基于信息增益的随机森林方法精选基因,得到与化疗相关的敏感基因。实验结果表明,此方法与经典方法(SVMRFE、T-test)相比,所选取出的特征基因具有较好的分类能力且保持稳定;从生物学角度分析显示,此方法所得到的敏感基因与化疗疗效的联系更加紧密,50个基因中,有4个(NR2F2、CLDN3、PURA、C1ORF38)直接与卵巢癌相关;17个(USO1、TCF7L2、NR2F2等)与肿瘤或癌症直接相关,或与肿瘤密切相关的生物过程(例细胞生长与繁殖、新陈代谢、细胞循环、DNA修复等)相关。 展开更多
关键词 卵巢癌化疗疗效 有监督奇异值分解(SSVD) 特征选取 随机森林 决策树
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FGFR-1、cyclinD1在乳腺癌中的表达及其临床意义 被引量：6
7
作者 邓敏 解瑞飞 王惠 《中国现代医生》 2016年第4期1-4,共4页
目的探讨成纤维生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR-1)及细胞周期蛋白D1(cyclinD1)在乳腺癌组织中的表达及其临床意义。方法应用原位杂交及免疫组织化学S-P法检测乳腺癌、乳腺纤维腺瘤和正常乳腺组织中FGFR-1、cyclin... 目的探讨成纤维生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR-1)及细胞周期蛋白D1(cyclinD1)在乳腺癌组织中的表达及其临床意义。方法应用原位杂交及免疫组织化学S-P法检测乳腺癌、乳腺纤维腺瘤和正常乳腺组织中FGFR-1、cyclinD1 mRNA及蛋白水平的表达。结果在乳腺癌中,FGFR-1蛋白和FGFR-1基因的阳性率分别为70.0%(21/30)、70.0%(21/30),cyclinD1蛋白和cyclinD1基因的阳性率分别为66.7%(20/30)、76.7%(23/30),明显高于纤维腺瘤与正常乳腺组织(P<0.05),FGFR-1表达与cyclinD1表达一致。结论 FGFR-1的过表达在人类乳腺癌的发生、发展中起重要作用,其机制可能通过上调cyclinD1的表达发挥作用,FGFR-1、cyclinD1的过度表达可作为判断乳腺癌预后的重要指标。 展开更多
关键词 FGFR-1 CYCLIN D1 乳腺癌 免疫组化 原位杂交
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肺癌相关的同时性重复癌2例
8
作者 吴波 丁笑笑 +4 位作者 蔡玉节 胡洁 周晓泉 解瑞飞 应申鹏 《中国乡村医药》 2016年第15期57-57,88,共2页
重复癌也称多原发癌,指同一患者同时或先后在单个或多个组织器官发生两种及以上的原发恶性肿瘤。本院收治2例肺癌相关的同时性重复癌,现将其报道如下,以期提高临床医生对肺癌相关的同时性重复癌的认识。1病例摘要例1患者男,66岁,因'... 重复癌也称多原发癌,指同一患者同时或先后在单个或多个组织器官发生两种及以上的原发恶性肿瘤。本院收治2例肺癌相关的同时性重复癌,现将其报道如下,以期提高临床医生对肺癌相关的同时性重复癌的认识。1病例摘要例1患者男,66岁,因'消化道出血4天'于2013年12月12日入院,既往有高血压病、胃溃疡、肝炎及鼻衄病史。查体:鼻咽黏膜略充血,未见明显新生物;右颈部Ⅱ区可及约1.5cm×1.0cm大小淋巴结,质硬、界尚清、固定、无压痛,余浅表淋巴结未触及肿大;气管居中, 展开更多
关键词 同时性重复癌 多原发癌 鼻咽黏膜 多原发肺癌 病例摘要 小淋巴结 晚期鼻咽癌 早期肺癌 消化道出血 肿瘤标志物
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王凯峰:用阳光驱散癌症的阴霾
9
作者 申申 解瑞飞 《健康人生》 2018年第8期36-38,共3页
走到杭州市肿瘤医院门诊3楼最后一个房间，敲开王凯峰主任的办公室门，干净整洁的办公桌前，王凯峰此时正在噼噼啪啪敲着电脑键盘写文件。简单了解我们的杂志栏目后，他很开心地说：“我抽空写了很多关于肿瘤营养的文章，如果有需要，... 走到杭州市肿瘤医院门诊3楼最后一个房间，敲开王凯峰主任的办公室门，干净整洁的办公桌前，王凯峰此时正在噼噼啪啪敲着电脑键盘写文件。简单了解我们的杂志栏目后，他很开心地说：“我抽空写了很多关于肿瘤营养的文章，如果有需要，我都发给你们杂志用。我希望通过你们的平台，给肿瘤患者真正而实在的帮助。” 展开更多
关键词 癌症 阳光 肿瘤患者 医院门诊 电脑键盘 杭州市 办公室 办公桌
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FGFR-1、CyclinD1在胃癌中的表达及其意义 被引量：2
10
作者 邓敏 解瑞飞 王惠 《肿瘤学杂志》 CAS 2017年第3期205-209,共5页
[目的]探讨成纤维生长因子受体-1(FGFR-1)及细胞周期蛋白D1(CyclinD1)在胃癌组织中的表达及其临床意义。[方法]应用免疫组织化学S-P法检测70例胃癌(24例腺癌,21例黏液腺癌,25例印戒细胞癌)组织中FGFR-1、CyclinD1蛋白水平的表达。[结果 ... [目的]探讨成纤维生长因子受体-1(FGFR-1)及细胞周期蛋白D1(CyclinD1)在胃癌组织中的表达及其临床意义。[方法]应用免疫组织化学S-P法检测70例胃癌(24例腺癌,21例黏液腺癌,25例印戒细胞癌)组织中FGFR-1、CyclinD1蛋白水平的表达。[结果 ]胃癌中FGFR-1蛋白的阳性率为61.4%(43/70),明显高于癌旁组织的37.5%(15/40)(P<0.05);FGFR-1在浸润深度超过肌层2/3病例中阳性率为79.5%(31/39),浸润深度未达到肌层2/3病例中阳性率为38.7%(12/31)(P<0.05);伴区域淋巴结转移病例阳性率为69.4%(34/49),无区域淋巴结转移病例阳性率为42.9%(9/21)(P<0.05)。胃癌中CyclinD1蛋白的阳性率为64.3%(45/70),明显高于癌旁组织的25.0%(10/40)(P<0.05);CyclinD1在浸润深度超过肌层2/3病例中阳性率为79.5%(31/39),浸润深度未达到肌层2/3病例中阳性率为45.2%(14/31)(P<0.05);伴区域淋巴结转移病例阳性率为73.5%(36/49),无区域淋巴结转移病例阳性率为42.9%(9/21)(P<0.05)。[结论 ]FGFR-1在胃癌中表达上调,与胃癌的浸润和转移密切相关,其可能通过上调CyclinD1的表达而发挥作用。 展开更多
关键词 成纤维生长因子受体-1 细胞周期蛋白D1 胃肿瘤 免疫组化 酪氨酸激酶
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