目的:研究丝甘蛋白聚糖(SRGN)对卵巢癌耐药性的影响及作用机制。方法:采用基因表达谱交互分析工具(GEPIA)提取卵巢癌相关数据集并分析SRGN m RNA在人类正常卵巢组织与卵巢癌组织的表达差异;基于基因表达数据库(GEO)获取SRGN mRNA在顺铂...目的:研究丝甘蛋白聚糖(SRGN)对卵巢癌耐药性的影响及作用机制。方法:采用基因表达谱交互分析工具(GEPIA)提取卵巢癌相关数据集并分析SRGN m RNA在人类正常卵巢组织与卵巢癌组织的表达差异;基于基因表达数据库(GEO)获取SRGN mRNA在顺铂敏感性与顺铂耐药性卵巢癌细胞株(A2780)中的表达差异;采用STRING在线数据库筛选SRGN的互作蛋白(置信度为0.900,联结数为10),然后通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,预测SRGN调节卵巢癌耐药性的潜在通路;采用医学本体信息检索平台COREMINE挖掘SRGN、卵巢癌、耐药性三者显著关联的生物过程。结果:SRGN mRNA在卵巢癌组织中的表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05),在顺铂耐药性卵巢癌细胞株中表达显著高于顺铂敏感性卵巢癌细胞株(P<0.001)。筛选出10个与SRGN互作的蛋白,包括白蛋白、转化生长因子β1、血小板因子4、血纤维蛋白溶酶原、血管内皮生长因子A等;SRGN参与调节卵巢癌耐药性的KEGG代谢通路有缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路、凝血与补体级联反应信号通路等,生物过程有基因表达、细胞生长、凋亡过程、细胞死亡。结论:SRGN介导卵巢癌耐药可能与缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路等有关。展开更多
目的研究骨成形蛋白-激活素膜结合阻断因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法运用GEPIA在线工具分析BAMBI在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异;基于GEO数据库分析BAMBI在顺铂敏感性...目的研究骨成形蛋白-激活素膜结合阻断因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法运用GEPIA在线工具分析BAMBI在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异;基于GEO数据库分析BAMBI在顺铂敏感性与顺铂耐药性的卵巢癌细胞株中的表达差异;CTRP数据库进行卵巢癌细胞BAMBI表达量与化疗药物敏感性相关性分析;综合运用基因互做分析、基因通路富集、基因相关性分析、文本挖掘、miRNA-mRNA相互作用分析等生物信息学方法进一步证明BAMBI调节卵巢癌耐药性及探索其内在机制。结果BAMBI在卵巢癌组织的表达显著低于正常卵巢,同时对顺铂耐药的卵巢癌细胞系中BAMBI表达量也显著低于对顺铂敏感的卵巢癌细胞系,与BAMBI高度关联性的基因大部分与卵巢癌耐药性有关;基因通路富集对与BAMBI相关联的基因分析发现,TGF-β(转化生长因子-β)信号通路、Hippo信号通路、细胞因子及其受体等通路的富集程度最高;TSPAN5与BAMBI高度相关,并且在卵巢癌和顺铂耐药的细胞株A2780中低表达;文本挖掘显示,细胞增殖、生长、凋亡过程以及信号转导等生物过程同时与BAMBI蛋白、卵巢癌、肿瘤耐药性具有显著的关联性;miRNA-mRNA互作分析发现,靶向于BAMBI的15个miRNA皆与卵巢癌耐药性或其他肿瘤耐药性相关。结论低表达BAMBI介导了卵巢癌的耐药性的发生。展开更多
妊娠期急性胰腺炎(acute pancreatitis in pregnancy,APIP)是妊娠期间发生的一类较少见的急腹症,可对母胎生命健康产生很大威胁,一旦诊疗不及时,母胎死亡率会大大增加。APIP发病率为1/10000~1/1200[1-3],且随胎龄增加而升高[4]。该疾病...妊娠期急性胰腺炎(acute pancreatitis in pregnancy,APIP)是妊娠期间发生的一类较少见的急腹症,可对母胎生命健康产生很大威胁,一旦诊疗不及时,母胎死亡率会大大增加。APIP发病率为1/10000~1/1200[1-3],且随胎龄增加而升高[4]。该疾病在妊娠期间,症状往往不典型,给临床诊疗带来一定的困难,近年来由于临床医生对该疾病的重视、医疗技术的提高及相关学科专家的合作,APIP死亡率较前显著下降[2],早期诊疗有助于改善母胎预后。展开更多
目的探讨溶质载体家族1成员4(solute carrier family 1 member 4,SLC1A4)在卵巢癌铂类化疗耐药性中的作用。方法通过GEO、TCGA数据库分析工具分析SLC1A4在卵巢癌或铂类耐药性卵巢癌中的表达;通过GEO数据库分析SLC1A4在铂类药物处理的卵...目的探讨溶质载体家族1成员4(solute carrier family 1 member 4,SLC1A4)在卵巢癌铂类化疗耐药性中的作用。方法通过GEO、TCGA数据库分析工具分析SLC1A4在卵巢癌或铂类耐药性卵巢癌中的表达;通过GEO数据库分析SLC1A4在铂类药物处理的卵巢癌细胞系中的表达;通过Kaplan Meier-plotter分析SLC1A4表达量与卵巢癌患者总生存期(overall survival,OS)、无疾病进展生存率(progression free survival,PFS)的相关性;通过DepMap平台分析SLC1A4基因效应与卵巢癌化疗药物敏感相关性;通过流式细胞试验和肿瘤细胞克隆集落形成试验验证低表达SLC1A4介导卵巢癌细胞顺铂耐药;通过TargetScan预测靶向于SLC1A4的微小RNA(miRNA),并在TCGA数据库卵巢癌样本中验证其相关性;运用COREMINE工具进行文本挖掘分析SLC1A4介导卵巢癌化疗耐药性的生物过程。结果SLC1A4在卵巢癌患者及铂类耐药性的卵巢癌中的显著降低(P<0.05),而且与患者的OS、PFS显著相关(P<0.05);铂类药物处理卵巢癌细胞增加SLC1A4的表达;SLC1A4对卵巢癌的基因效应与铂类药物敏感性正相关;过表达SLC1A4增加顺铂引起的卵巢癌细胞凋亡和减少肿瘤细胞克隆集落形成;hsa-let-7c-5p靶向于SLC1A4并在耐药性卵巢癌患者样本中呈显著负相关。结论低表达SLC1A4介导卵巢癌铂类耐药性,并且有可能与hsa-let-7c-5p调控有关。展开更多
文摘目的:研究丝甘蛋白聚糖(SRGN)对卵巢癌耐药性的影响及作用机制。方法:采用基因表达谱交互分析工具(GEPIA)提取卵巢癌相关数据集并分析SRGN m RNA在人类正常卵巢组织与卵巢癌组织的表达差异;基于基因表达数据库(GEO)获取SRGN mRNA在顺铂敏感性与顺铂耐药性卵巢癌细胞株(A2780)中的表达差异;采用STRING在线数据库筛选SRGN的互作蛋白(置信度为0.900,联结数为10),然后通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,预测SRGN调节卵巢癌耐药性的潜在通路;采用医学本体信息检索平台COREMINE挖掘SRGN、卵巢癌、耐药性三者显著关联的生物过程。结果:SRGN mRNA在卵巢癌组织中的表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05),在顺铂耐药性卵巢癌细胞株中表达显著高于顺铂敏感性卵巢癌细胞株(P<0.001)。筛选出10个与SRGN互作的蛋白,包括白蛋白、转化生长因子β1、血小板因子4、血纤维蛋白溶酶原、血管内皮生长因子A等;SRGN参与调节卵巢癌耐药性的KEGG代谢通路有缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路、凝血与补体级联反应信号通路等,生物过程有基因表达、细胞生长、凋亡过程、细胞死亡。结论:SRGN介导卵巢癌耐药可能与缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路等有关。
文摘目的研究骨成形蛋白-激活素膜结合阻断因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法运用GEPIA在线工具分析BAMBI在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异;基于GEO数据库分析BAMBI在顺铂敏感性与顺铂耐药性的卵巢癌细胞株中的表达差异;CTRP数据库进行卵巢癌细胞BAMBI表达量与化疗药物敏感性相关性分析;综合运用基因互做分析、基因通路富集、基因相关性分析、文本挖掘、miRNA-mRNA相互作用分析等生物信息学方法进一步证明BAMBI调节卵巢癌耐药性及探索其内在机制。结果BAMBI在卵巢癌组织的表达显著低于正常卵巢,同时对顺铂耐药的卵巢癌细胞系中BAMBI表达量也显著低于对顺铂敏感的卵巢癌细胞系,与BAMBI高度关联性的基因大部分与卵巢癌耐药性有关;基因通路富集对与BAMBI相关联的基因分析发现,TGF-β(转化生长因子-β)信号通路、Hippo信号通路、细胞因子及其受体等通路的富集程度最高;TSPAN5与BAMBI高度相关,并且在卵巢癌和顺铂耐药的细胞株A2780中低表达;文本挖掘显示,细胞增殖、生长、凋亡过程以及信号转导等生物过程同时与BAMBI蛋白、卵巢癌、肿瘤耐药性具有显著的关联性;miRNA-mRNA互作分析发现,靶向于BAMBI的15个miRNA皆与卵巢癌耐药性或其他肿瘤耐药性相关。结论低表达BAMBI介导了卵巢癌的耐药性的发生。
文摘妊娠期急性胰腺炎(acute pancreatitis in pregnancy,APIP)是妊娠期间发生的一类较少见的急腹症,可对母胎生命健康产生很大威胁,一旦诊疗不及时,母胎死亡率会大大增加。APIP发病率为1/10000~1/1200[1-3],且随胎龄增加而升高[4]。该疾病在妊娠期间,症状往往不典型,给临床诊疗带来一定的困难,近年来由于临床医生对该疾病的重视、医疗技术的提高及相关学科专家的合作,APIP死亡率较前显著下降[2],早期诊疗有助于改善母胎预后。
文摘目的探讨溶质载体家族1成员4(solute carrier family 1 member 4,SLC1A4)在卵巢癌铂类化疗耐药性中的作用。方法通过GEO、TCGA数据库分析工具分析SLC1A4在卵巢癌或铂类耐药性卵巢癌中的表达;通过GEO数据库分析SLC1A4在铂类药物处理的卵巢癌细胞系中的表达;通过Kaplan Meier-plotter分析SLC1A4表达量与卵巢癌患者总生存期(overall survival,OS)、无疾病进展生存率(progression free survival,PFS)的相关性;通过DepMap平台分析SLC1A4基因效应与卵巢癌化疗药物敏感相关性;通过流式细胞试验和肿瘤细胞克隆集落形成试验验证低表达SLC1A4介导卵巢癌细胞顺铂耐药;通过TargetScan预测靶向于SLC1A4的微小RNA(miRNA),并在TCGA数据库卵巢癌样本中验证其相关性;运用COREMINE工具进行文本挖掘分析SLC1A4介导卵巢癌化疗耐药性的生物过程。结果SLC1A4在卵巢癌患者及铂类耐药性的卵巢癌中的显著降低(P<0.05),而且与患者的OS、PFS显著相关(P<0.05);铂类药物处理卵巢癌细胞增加SLC1A4的表达;SLC1A4对卵巢癌的基因效应与铂类药物敏感性正相关;过表达SLC1A4增加顺铂引起的卵巢癌细胞凋亡和减少肿瘤细胞克隆集落形成;hsa-let-7c-5p靶向于SLC1A4并在耐药性卵巢癌患者样本中呈显著负相关。结论低表达SLC1A4介导卵巢癌铂类耐药性,并且有可能与hsa-let-7c-5p调控有关。
