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基于内质网应激相关lncRNA的肾透明细胞癌预后模型构建与药物预测
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作者 李渊 李卓阳 +3 位作者 刘格良 胡超扬 贺培凤 于琦 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2024年第2期158-167,共10页
目的基于内质网应激(ERS)相关长链非编码核糖核苷酸(lncRNA)构建肾透明细胞癌(ccRCC)患者预后模型,探讨免疫细胞浸润与ccRCC患者预后的相关性,并寻找可用于治疗ccRCC的新药物。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取ccRCC肿瘤与癌旁组... 目的基于内质网应激(ERS)相关长链非编码核糖核苷酸(lncRNA)构建肾透明细胞癌(ccRCC)患者预后模型,探讨免疫细胞浸润与ccRCC患者预后的相关性,并寻找可用于治疗ccRCC的新药物。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取ccRCC肿瘤与癌旁组织的转录组和临床数据。从MSigDB数据库获取ERS相关基因集。通过Pearson相关性分析筛选ERS共表达lncRNA。通过Lasso回归和单、多因素Cox回归分析筛选有预后意义的ERS相关lncRNA(ERSRL)并构建预后模型。根据预后模型公式计算每个样品的风险值,以中位值为界,将患者分成高、低风险组进行生存差异分析。通过生存曲线、受试者特征曲线、校准曲线评估该预后模型的预测效能。利用CIBERSORT数据库探讨高、低风险组的免疫细胞浸润情况。利用GDSC数据库探讨ERSRL和药物敏感性之间的关系,并筛选对ccRCC具有潜在疗效的药物。结果筛选得到9个有独立预后价值的lncRNA构建预后模型。Kaplan-Meier分析表明高、低风险组之间存在明显生存差异。单、多因素Cox回归分析表明年龄、分级、分期和风险评分可作为ccRCC的独立预后影响因素。训练集风险评分模型1、3、5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.754(95%CI:0.659~0.848)、0.744(95%CI:0.667~0.815)、0.759(95%CI:0.662~0.820),C-index为0.777(95%CI:0.759~0.796)。免疫浸润结果表明,与低风险组相比,在高风险组中的浆细胞、激活的记忆CD4+T细胞、调节性T细胞、M0巨噬细胞、活化肥大细胞浸润水平高。药物敏感性分析筛选得到AZD8055等12种对ccRCC具有潜在疗效的药物。结论基于9个ERSRL构建的ccRCC患者的生存预后预测模型预测效能较好。AZD8055等12种药物对ccRCC具有潜在疗效。 展开更多
关键词 内质网应激 肾透明细胞癌 预后模型 免疫浸润 药物敏感性
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基于蛋白的宫颈癌相关基因生物信息学分析
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作者 程灵婧 李贺同 +8 位作者 张升校 刘鸿齐 于琦 郑超越 冯爽 孔腾 孙翔飞 贺培凤 吕小萍 《医学信息学杂志》 CAS 2023年第12期47-54,共8页
目的/意义运用生物信息学方法挖掘与宫颈癌相关的基因,探讨与HPV E6/E7密切相关差异表达基因的特征及临床意义。方法/过程以UCSC的TCGA和GTEx中宫颈癌的宫颈组织及临床信息作为训练集。以GEO中与宫颈癌相关的表达谱芯片GSE63514作为验... 目的/意义运用生物信息学方法挖掘与宫颈癌相关的基因,探讨与HPV E6/E7密切相关差异表达基因的特征及临床意义。方法/过程以UCSC的TCGA和GTEx中宫颈癌的宫颈组织及临床信息作为训练集。以GEO中与宫颈癌相关的表达谱芯片GSE63514作为验证集。首先,使用R软件limma包筛选肿瘤和正常样本的DEGs,制作与MigDB中E6/E7蛋白相关基因的韦恩图。利用survival包进行生存分析,通过ROC和蛋白表达水平进行验证。其次,通过拷贝数变异和甲基化相关性得到关键基因。最后,构建特异性共表达网络并进行富集分析和免疫浸润分析。结果/结论与HPV E6/E7蛋白相关的差异表达基因有101个,经筛选有3个基因意义显著,分别是E2F1、MCM4和PCNA。同时,经通路分析后发现特异性共表达网络中的基因显著富集在DNA复制、染色体组织等通路。通过免疫相关性分析发现关键基因与CD4 T细胞、B细胞和中性粒细胞显著相关。DNA复制、染色体组织等为宫颈鳞癌发生发展以及HPV E6/E7编码蛋白显著相关的分子机制和关键基因。 展开更多
关键词 宫颈癌 宫颈组织 差异基因 HPV E6/E7编码蛋白
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医信融合:信息赋能医学人才培养创新实践
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作者 何小峰 贺培凤 《医学信息学杂志》 CAS 2023年第8期1-5,共5页
目的/意义在医学人才培养中深度融入信息教育,有助于提升医学人才培养质量,探索高等医学教育改革新方向。方法/过程结合山西医科大学医信融合教育实践经验,阐述医信融合人才培养体系构建路径。结果/结论形成从知识生产到学生认知建构的... 目的/意义在医学人才培养中深度融入信息教育,有助于提升医学人才培养质量,探索高等医学教育改革新方向。方法/过程结合山西医科大学医信融合教育实践经验,阐述医信融合人才培养体系构建路径。结果/结论形成从知识生产到学生认知建构的模式转变,改进建构主义教育教学理论,对学科交叉融合过程中医学人才培养具有显著理论指导意义。 展开更多
关键词 医信融合 医学人才培养 学科交叉 人才培养体系
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医学信息管理专业教材建设的实践与改革 被引量:3
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作者 贺培凤 李小霞 +2 位作者 吕艳华 王秀平 孔瑞珍 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2010年第1期1-4,73,共5页
通过对国内部分院校医学信息管理专业教材建设情况的调查,分析了该专业目前教材建设所取得的成就和存在的问题,有针对性地提出了完善教材建设的改革与创新思路。
关键词 医学信息管理 教材建设 改革 实践
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高校图书馆科学发展探析 被引量:5
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作者 贺培凤 成星亮 高驰 《医学信息学杂志》 CAS 2009年第1期43-45,共3页
科学发展观要求发展要有科学的定位、把发展作为第一要务、坚持以人为本、全面协调可持续发展、统筹兼顾等,现结合图书馆发展建设的实际,提出图书馆实现科学发展的具体策略。希望能给高校图书馆的发展提供借鉴与帮助。
关键词 科学发展观 高校图书馆 资源共享 图书馆工作
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医学信息管理专业实践教学改革新思路 被引量:10
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作者 贺培凤 卫毅慧 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2008年第6期15-18,共4页
针对医学信息管理专业教育的现状和存在的不足,提出了一种新的实践教学改革思路,即创建"专业实践技能特训"实践教学环节。最后介绍了"专业实践技能培训"的实现途径。
关键词 医学信息学 实践教学 教学改革 专业实践技能特训
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地方医学科技文献平台建设运行机制分析与研究 被引量:3
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作者 贺培凤 何小峰 《医学信息学杂志》 CAS 2008年第5期34-37,共4页
以山西省医学科技文献平台为依托,阐述并分析地方性医学科技文献平台的运行机制,讨论地方性医学科技文献平台在不同的发展阶段可能会遇到的来自不同相关利益群体的各种障碍,以及相对应的预防和处理措施。
关键词 医学科技文献平台 运行机制 产业结构分析
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建立医药信息资源评估体系的构想 被引量:1
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作者 贺培凤 袁永旭 吕艳华 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2006年第5期10-12,共3页
立足山西省,通过对医药信息资源的战略思考,试图从医药信息资源的评估内容分析、评估体系的内容分析以及建立评估体系的关键问题等方面建立医药信息资源评估体系,并提出建立该体系所具有的重要的战略意义和现实意义。
关键词 医药信息资源 评估体系
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医学信息管理专业教材建设与教学协同性探讨 被引量:1
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作者 贺培凤 孔瑞珍 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2010年第2期3-4,16,共3页
教材建设与课程教学的协调统一,是改善教学效果,提高教学质量的基本保障。本文以《医学文献主题标引》课程为例,探讨其教材建设与教学目的、教学内容、实习环节等方面的协同统一,以提高该课程的教学质量。
关键词 医学文献主题标引 教材建设 医学信息学
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医学信息管理专业教材建设的研究设想 被引量:2
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作者 贺培凤 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2010年第2期1-2,32,共3页
国内医学信息管理专业设立20多年来,与国外相比,教材建设相对滞后。在对山西医科大学医学信息管理系教材建设现状进行调查研究的基础上,提出了教材建设改革与创新的思路,为推进医学信息管理学科的整体发展提供了科学的依据。
关键词 医学信息管理 教材建设 教学质量
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利用触摸屏系统实现馆务公开的初步尝试 被引量:1
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作者 贺培凤 冯毅 《晋图学刊》 2001年第3期68-69,共2页
介绍了本馆利用自行研制的触摸屏系统实现馆务公开的情况 ,具体阐述了该系统的特点、内容及效果 ,对图书馆管理工作的改进有参考借鉴价值。
关键词 触摸屏系统 图书馆管理 馆务公开
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信息传播对经济发展的作用 被引量:2
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作者 贺培凤 晋晓强 《科技情报开发与经济》 2001年第6期30-31,共2页
主要论述了信息传播对经济决策。
关键词 信息传播 经济发展 作用 经济决策 国际贸易 经济增长
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试论对话式知识传播与图书馆工作 被引量:2
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作者 贺培凤 晋晓强 《医学图书馆通讯》 1998年第1期31-31,38,共2页
关键词 对话式知识传播 图书馆工作 读者工作 图书馆员
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山西省医学院校图书馆发展状况调查分析 被引量:1
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作者 贺培凤 晋晓强 《科技情报开发与经济》 2002年第4期33-34,共2页
文章就山西省4所医学院校图书馆人才建设、文献资源建设、自动化建设3个方面进行了5年调查,并在其基础上分析了山西省医学院校图书馆发展的优势与劣势,找出了问题所在,为山西医学院校图书馆的发展提供可借鉴的意见。
关键词 山西 医学院校图书馆 发展状况 调查分析 高校图书馆
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建立省级医学科技文献信息中心的构想
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作者 贺培凤 武建光 冯毅 《医学信息学杂志》 CAS 2006年第3期173-175,共3页
提出建立省级医学科技文献信息中心,也即具有公益性、基础性、服务性的科技物质和信息保障系统,更好地为本省科学技术研究和创新活动提供有力支持。
关键词 医学 科技文献 信息中心 构想
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网上信息资源管理系统Eshot2002与Eshot2000的比较分析
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作者 贺培凤 冯毅 《现代情报》 2003年第3期48-50,共3页
本文通过实际工作的应用 ,将文献资源共享系统 ,Eshot2 0 0 2与Eshot2 0 0 0进行功能上的对比分析 ,发现Eshot2 0 0 2不仅延续了Eshot2 0 0 0的许多优点 ,在功能上有了许多扩展与增加 ,方便了网上数字资源的管理。
关键词 资源 网络 软件 管理 比较 分析 网上信息资源管理系统 Eshot2002 Eshot2000 比较分析
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医学信息管理专业管理类教材的创新研究
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作者 贺培凤 何小峰 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2010年第2期8-9,35,共3页
通过分析医学生的学习特点和管理类课程的教学目标,指出医学信息管理专业管理类课程教材总体知识体系虽已趋于成熟,但学科针对性相对缺乏,案例选择不够贴切。建议在选用、编写教材过程中应当注意将侧重点放在新知识点的补充和相关案例... 通过分析医学生的学习特点和管理类课程的教学目标,指出医学信息管理专业管理类课程教材总体知识体系虽已趋于成熟,但学科针对性相对缺乏,案例选择不够贴切。建议在选用、编写教材过程中应当注意将侧重点放在新知识点的补充和相关案例的新陈代谢上,在实践教材为主线的基础上,进行体系创新、教案创新,选用或编写与实践教材配套的理论教材。 展开更多
关键词 医学信息学 管理类课程 教材改革
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面对世纪之交,再论图书馆员的继续教育
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作者 贺培凤 晋晓强 《晋图学刊》 1997年第2期15-16,共2页
关键词 图书馆员 图书馆人员 世纪之交 馆员继续教育 跨世纪人才 图书馆管理 高级专业人员 高校图书馆 品管圈 高等医药院校
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我馆光盘检索应用情况及设想
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作者 贺培凤 《晋图学刊》 1993年第4期43-,49,共2页
我馆于1992年引进了美国银盘公司的只读光盘数据库系统。名称为MEDLINE on Silver P(?)atter(下简称MEDLlNE)。由于只读光盘具有贮存量大(一张盘的存贮容量可达550兆字节);查找速度快(读数据只需0.5~0.7秒);稳定性与数据保存性好,坚固... 我馆于1992年引进了美国银盘公司的只读光盘数据库系统。名称为MEDLINE on Silver P(?)atter(下简称MEDLlNE)。由于只读光盘具有贮存量大(一张盘的存贮容量可达550兆字节);查找速度快(读数据只需0.5~0.7秒);稳定性与数据保存性好,坚固耐用;库存寿命长(最低保存寿命达30年以上);结构小巧,性能价格比高;查全、查准率高等特点,从而得到我院师生的青睐。 展开更多
关键词 美国银盘公司 光盘检索 只读光盘 保存性 数据库系统 atter 查找速度 兆字节 贮存量 科研课题
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复配增塑剂对聚乙烯醇薄膜性能的影响 被引量:12
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作者 任德财 林鹏 +3 位作者 钱镭 贺培凤 杜宇虹 薛蕊 《材料工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第6期86-90,共5页
以尿素/三乙醇胺为复配增塑剂,利用溶液共混法制备了改性PVA薄膜,通过FT-IR研究了尿素/三乙醇胺复配增塑剂与PVA间的相互作用,采用XRD,TGA,DSC表征了增塑改性PVA的结晶性能和热性能,同时分析了复配增塑剂的加入对PVA薄膜力学性能、透光... 以尿素/三乙醇胺为复配增塑剂,利用溶液共混法制备了改性PVA薄膜,通过FT-IR研究了尿素/三乙醇胺复配增塑剂与PVA间的相互作用,采用XRD,TGA,DSC表征了增塑改性PVA的结晶性能和热性能,同时分析了复配增塑剂的加入对PVA薄膜力学性能、透光性能、耐水性能的影响。实验结果表明,复配增塑剂的加入破坏了PVA分子中的氢键作用,降低了PVA的结晶度和熔点温度,热分解温度基本不变;随着复配增塑剂含量的增加,增塑改性后的PVA薄膜抗拉强度下降、断裂伸长率增加,透光性增加,溶胀率下降,溶失率增加。 展开更多
关键词 聚乙烯醇 增塑剂 尿素 三乙醇胺
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