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SMAD4下调通过抑制Ⅰ型IFN信号通路促进胰腺癌转移
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作者 贺雅芝 王锋 +4 位作者 王阳 宋亦然 张润 余畋余 童依丽 《同济大学学报（医学版）》 2023年第3期326-335,共10页
目的探究SMAD4下调在胰腺癌侵袭转移中的分子机制。方法通过微阵列分析研究胰腺癌细胞株PANC-1中经SMAD4-siRNA处理后相关基因的变化。使用Limma软件包鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),进行基因本体论(Gene Onto... 目的探究SMAD4下调在胰腺癌侵袭转移中的分子机制。方法通过微阵列分析研究胰腺癌细胞株PANC-1中经SMAD4-siRNA处理后相关基因的变化。使用Limma软件包鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),进行基因本体论(Gene Ontology,GO)生物过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。通过STRING数据库获得DEGs编码蛋白质之间的互相作用关系,运用Cytoscape软件构建蛋白质蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过Cytoscape的插件MCODE进行PPI子网络分析。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证一些关键基因的表达情况。结果通过qRT-PCR和Western印迹法验证PANC-1细胞株中的SMAD4 mRNA水平、蛋白水平被成功下调。经差异分析,共鉴定出402个DEGs,其中有168个上调基因,234个下调基因,GO功能和KEGG信号通路富集分析显示,表达上调的基因主要富集在大分子复合物的亚基组织、大分子复合物的组装、细胞黏附、生物黏附等生物学过程,以及系统性红斑狼疮信号通路中;而表达下调的基因主要富集在免疫反应、防御反应、细胞增殖调控、对损伤的反应等生物学过程,以及细胞因子细胞因子受体相互作用信号通路、RIG-I样受体信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性和胞质DNA感应信号通路。PPI网络中排名前五的节点基因为ISG15、MX1、IFIT1、STAT1、IRF7和IRF1。IFIT2和IFIH1为PPI子网络核心模块的枢纽蛋白。上述基因主要集中在Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)信号通路上。结论SMAD4下调可能通过阻止Ⅰ型IFN介导的免疫监测,在促进胰腺癌的转移中发挥作用。 展开更多
关键词 胰腺癌 干扰素 微阵列 SMAD4 转移
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