贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)MCCC 1A15695抑菌蛋白分离纯化及应用研究 被引量：1

1

作者 付欢 李亚婷 +5 位作者 肖贵谦 彭磊磊 夏金梅 邵宗泽 曹军伟 赖其良 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期217-224,共8页

对虾“玻璃苗”病的暴发,会导致对虾幼苗大批死亡,给水产养殖带来巨大损失。利用本实验室最近鉴定的“玻璃苗”致病菌副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)vp-HL,从海洋来源芽孢杆菌中筛选拮抗菌,获得一株能够高效抑制vp-HL菌株的贝莱... 对虾“玻璃苗”病的暴发,会导致对虾幼苗大批死亡,给水产养殖带来巨大损失。利用本实验室最近鉴定的“玻璃苗”致病菌副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)vp-HL,从海洋来源芽孢杆菌中筛选拮抗菌,获得一株能够高效抑制vp-HL菌株的贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)MCCC 1A15695。经分离鉴定与活性测定,其有效抑菌物质为蛋白类,该蛋白抑菌谱较广,对包括多种弧菌病原在内的17种病原微生物有抑制作用。经Q Seharose Fast Flow阴离子柱层析、聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)及液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)分离纯化鉴定,确定活性蛋白组分中的有效抑菌物质为枯草杆菌素(subtilisin)、未知蛋白(hypothetical protein)及α-淀粉酶(Alpha-amylase)。蛋白类物质具有高生物安全性,本研究为后续益生菌的开发利用提供了理论基础。 展开更多

关键词 海洋生物学 贝莱斯芽孢杆菌 抗菌蛋白 抑菌谱 弧菌 玻璃苗

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一株印度洋深海食烷菌(Alcanivorax sp．P40)的烷烃羟化酶基因的克隆 被引量：4

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作者 赖其良 袁军 邵宗泽 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期141-146,共6页

以印度洋深层海水,用柴油和石油作为混合碳源经富集培养、分离获得一株具有很强的柴油降解能力的菌株P40.菌株P40革兰氏染色阴性,接触酶和氧化酶为阳性,能还原硝酸盐,不能还原亚硝酸盐.16S rDNA B lastn结果表明其与Alcanivorax dieselo... 以印度洋深层海水,用柴油和石油作为混合碳源经富集培养、分离获得一株具有很强的柴油降解能力的菌株P40.菌株P40革兰氏染色阴性,接触酶和氧化酶为阳性,能还原硝酸盐,不能还原亚硝酸盐.16S rDNA B lastn结果表明其与Alcanivorax dieseloleiB-5T(柴油食烷菌)及A.dieseloleiNO1A具有最高相似性,均为99.8%.菌株P40的gyrB序列与A.dieseloleiNO1A同源性也高达99.2%,而与A.dieseloleiB-5T只有86.9%.此外,从菌株P40中克隆到两个烷烃羟化酶alkB基因片断,分别命名为P40a-lkB1和P40a-lkB2.其中P40a-lkB1与报道的A.dieseloleiB-5T中的alkB同源性较高,达96.3%,而与同为深海来源的菌株NO1A的alkB的同源性更是达100%,P40a-lkB2则与A.borkum ensisSK2T(泊库岛食烷菌)的alkB1同源性最高,但仅为65%. 展开更多

关键词 印度洋 食烷菌 烷烃羟化酶 促旋酶 ALKB GYRB

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南海南沙海域沉积物中可培养微生物及其多样性分析 被引量：30

3

作者 孙风芹 汪保江 +4 位作者 李光玉 刘秀片 杜雅萍 赖其良 邵宗泽 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1578-1587,共10页

【目的】为了从南沙海域中分离获得微生物菌种资源,【方法】本文通过沉积物采样、可培养菌分离及16S rRNA鉴定,【结果】从22个站点的沉积物样品中获得349株细菌,分属于87个种。发现产芽孢细菌分布最广,并在10个站点的分离株中占多数;它... 【目的】为了从南沙海域中分离获得微生物菌种资源,【方法】本文通过沉积物采样、可培养菌分离及16S rRNA鉴定,【结果】从22个站点的沉积物样品中获得349株细菌,分属于87个种。发现产芽孢细菌分布最广,并在10个站点的分离株中占多数;它们是Bacillus,Halobacillus,Brevibacillus,Paenibacillus,Pontibacillus和Thalassobacillus。其中芽孢杆菌(Bacillus)无论在数量上还是种类上都最多,分别属于34种,其中有8个可能的新种。此外,γ-Proteobacteria是分离率较高的另一亚群;其中,假单胞菌(Pseudomonas),海杆菌(Marinobacter),食烷菌(Alcanivorax)属的细菌最多。统计还发现,在深度750～2000 m之间,低GC含量的细菌最丰富,而深度2000 m以下,分离株则全部为γ-Proteobacteria。【结论】南沙沉积物可培养微生物中产芽孢细菌及γ-Proteobacteria比较丰富;其中,产芽孢细菌的多样性最高,具有进一步研究开发价值。 展开更多

关键词 南海南沙 海洋细菌 生物资源 生物多样性 产芽孢菌 芽孢杆菌

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深海多环芳烃降解菌新鞘氨醇杆菌H25的降解特性及降解基因 被引量：22

4

作者 袁军 赖其良 +1 位作者 郑天凌 邵宗泽 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1208-1213,共6页

【目的】为了从深海环境中筛选新的多环芳烃降解菌,了解其降解基因及降解特性。【方法】以原油作为碳源从印度洋深海海水样品中富集筛选出降解能力较强的多环芳烃降解菌,并根据已报道的相关菌属的多环芳烃起始双加氧酶大亚基序列及侧翼... 【目的】为了从深海环境中筛选新的多环芳烃降解菌,了解其降解基因及降解特性。【方法】以原油作为碳源从印度洋深海海水样品中富集筛选出降解能力较强的多环芳烃降解菌,并根据已报道的相关菌属的多环芳烃起始双加氧酶大亚基序列及侧翼序列设计兼并引物进行扩增。【结果】获得了1株能够高效降解原油、柴油及多种多环芳烃的菌株H25。经16SrDNA序列系统发育分析表明它属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)(96%)。并从该菌株中扩增获得2条相似度为91.0%双加氧酶基因片段。2条序列在NCBI上Blastn分析表明均与菌株N.aromaticivorans DSM12444T的降解质粒pNL1上的双加氧酶大亚基具有最高相似度,分别为99.6%和91.0%。根据pNL1上的双加氧酶序列设计引物获得了包含H25双加氧酶大亚基及上下游序列的2个基因片段H25Ⅰ(2.9kb)和H25Ⅱ(4.5kb)。另外,单碳降解实验表明H25对联苯、2-甲基萘、2,6-二甲基萘、菲、二苯并噻吩、二苯并呋喃等均有较好的降解能力。【结论】H25菌株是Novosphingobium属可能的新种。深海细菌在大洋环境多环芳烃污染的自然净化中起到一定作用,并在环境生物修复中有较大的应用前景。 展开更多

关键词 深海 新鞘氨醇杆菌 多环芳烃 降解 双加氧酶

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一株卓贝尔氏菌F13-1好氧反硝化特性及其反硝化基因的初步研究 被引量：10

5

作者 李小义 王丽萍 +2 位作者 赖其良 李登峰 邵宗泽 《应用海洋学学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期122-129,共8页

为获得高效好氧反硝化细菌,并研究这些细菌的脱氮特性以及好氧反硝化机理,采集了近海表层沉积物进行富集培养,分离获得一株具有高效好氧反硝化能力的菌株F13-1.结合生理生化特征及16S rRNA基因序列分析,初步鉴定菌株F13-1为卓贝尔氏菌(Z... 为获得高效好氧反硝化细菌,并研究这些细菌的脱氮特性以及好氧反硝化机理,采集了近海表层沉积物进行富集培养,分离获得一株具有高效好氧反硝化能力的菌株F13-1.结合生理生化特征及16S rRNA基因序列分析,初步鉴定菌株F13-1为卓贝尔氏菌(Zobellella sp.).在以葡萄糖为碳源,C/N比值为15,盐度为30,摇床转速160 r/min,p H值为7,28℃的最优脱氮条件下菌株F13-1脱氮效果较好,分别能将100 mg/dm3硝酸盐和亚硝酸盐在24和16 h内彻底脱除,脱除速率分别为:5.87 mg/(dm3·h)和5.97 mg/(dm3·h).并且菌株F13-1对高浓度亚硝酸盐具有较好的耐受性,能在高浓度亚硝酸盐存在条件下正常生长及脱氮,156 h内能将400 mg/dm3亚硝酸盐脱除完全.基因组分析表明,该菌株具有完整的反硝化基因簇,包括nap、nir、nor和nos等共17个基因.研究结果表明该菌株具有高效好氧反硝化特性,在养殖废水处理中具有较好的应用潜力. 展开更多

关键词 海洋生物学 生物脱氮 好氧反硝化 卓贝尔氏菌 反硝化基因

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盐单胞菌属一新种的分离与鉴定 被引量：9

6

作者 朱凤玲 曲凌云 +3 位作者 洪旭光 赖其良 张进兴 孙修勤 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期221-228,共8页

对即墨市大桥盐场的底泥样本进行微生物的可培养研究,分离出1株革兰氏阴性的中度嗜盐菌YC-SA28T。16S rRNA序列比对及系统发育分析结果表明,YCSA28T可能为γ-变形菌纲盐单胞菌属的新种,通过系统分类学研究发现,YCSA28T的16S rRNA序列与... 对即墨市大桥盐场的底泥样本进行微生物的可培养研究,分离出1株革兰氏阴性的中度嗜盐菌YC-SA28T。16S rRNA序列比对及系统发育分析结果表明,YCSA28T可能为γ-变形菌纲盐单胞菌属的新种,通过系统分类学研究发现,YCSA28T的16S rRNA序列与亲缘关系最近的盐单胞菌属模式菌株Halomonas ventosaeAl12T同源性为96.9%,其GenBank注册号为FJ984862。YCSA28T的荷兰细菌保藏中心受理序号为NCCB100305T,中国普通微生物保藏管理中心受理序号为CGMCC 1.9150T。YCSA28菌落为乳黄色,细胞杆状或短杆状,周生鞭毛。生长温度范围为5~40℃,生长pH值范围为6.0~9.0,生长绝对盐度（NaCl）范围为2%~15%。氧化酶/过氧化氢酶阳性。辅酶Q-9为主要的呼吸醌,主要脂肪酸为C18：1ω7c（42.88%）,C16：0（23.05%）及C16：1ω7c/ω6c（18.00%）。菌株YCSA28T染色体DNA的x（G＋C）为63.7%~63.9%,与模式菌株Halomonas vento-saeAl12T间的DNA-DNA杂交率为（45±3）%。结合各种形态及生理生化特征可知,YCSA28T应为盐单胞菌属一新种,建议命名为大桥盐单胞菌（Halomonas daqiaonensissp.nov.）。 展开更多

关键词 盐单胞菌 新种 鉴定

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海洋石油污染及其微生物修复研究进展 被引量：14

7

作者 李贵珍 赖其良 +1 位作者 闫培生 邵宗泽 《生物技术进展》 2015年第3期164-169,共6页

海洋石油污染严重影响了海洋生态系统平衡和人类健康,海洋石油污染的微生物修复技术因其自身的优势越来越受到人们的重视。介绍了海洋石油污染的现状和治理方法,并着重介绍了海洋中石油污染微生物修复中降解微生物的种类、降解机理和生... 海洋石油污染严重影响了海洋生态系统平衡和人类健康,海洋石油污染的微生物修复技术因其自身的优势越来越受到人们的重视。介绍了海洋石油污染的现状和治理方法,并着重介绍了海洋中石油污染微生物修复中降解微生物的种类、降解机理和生物修复的研究进展,并指出了生物修复存在并需要克服的问题,以期为海洋石油污染环境修复研究提供参考。 展开更多

关键词 海洋 石油污染 海洋微生物 微生物修复

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东山湾软珊瑚共附生可培养细菌的多样性和产酶活性鉴定 被引量：2

8

作者 刘阳 赖其良 +4 位作者 陈华 王建宁 余志伟 王丽萍 邵宗泽 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 2013年第3期396-403,共8页

利用稀释10倍的2216E培养基,采用涂布平板法分离软珊瑚共附生可培养细菌,然后提取各菌株基因组DNA,扩增其16S rRNA基因并测序,通过比对分析确定菌株的分类地位,进而研究东山湾软珊瑚共附生可培养细菌的多样性;同时测定各菌株产淀粉酶、... 利用稀释10倍的2216E培养基,采用涂布平板法分离软珊瑚共附生可培养细菌,然后提取各菌株基因组DNA,扩增其16S rRNA基因并测序,通过比对分析确定菌株的分类地位,进而研究东山湾软珊瑚共附生可培养细菌的多样性;同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶和酯酶能力,进而获得具有产酶活性的细菌资源.结果表明:一共分离到244株细菌,剔除重复后共获得128株不同的细菌.128株细菌包括变形菌纲(86株)、放线菌纲(高G+C革兰氏阳性菌,17株)、厚壁菌门(低G+C革兰氏阳性菌,22株)和拟杆菌纲(3株)4大类群,共包含44个属,72个种,多样性十分丰富,其中有9株细菌的16S rRNA基因相似度低于98.0%,为分离到的潜在新种.同时,128株细菌3种酶活检测的结果表明:16株细菌具有淀粉酶活性,73株细菌具有酯酶活性,23株细菌具有蛋白酶活性,其中15株细菌同时具有3种酶活性.本研究首次报道了东山湾软珊瑚共附生可培养细菌丰富的多样性,同时获得了具有良好的产酶特性菌株资源,具有进一步研究和应用价值. 展开更多

关键词 海洋生物学 软珊瑚 共附生细菌 多样性 酶活鉴定

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南大西洋热液区沉积物可培养细菌的多样性分析和产酶活性鉴定 被引量：1

9

作者 杜雅萍 李贵珍 +4 位作者 赖其良 董纯明 孙风芹 刘秀片 邵宗泽 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期427-433,共7页

为获得深海可培养微生物资源,利用2216E培养基,采用涂布平板法从南大西洋热液区沉积物中分离可培养细菌,并通过16S rRNA基因进行分类鉴定.同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶、木聚糖酶、褐藻酸酶和脂肪酶(三丁酸甘油酯和吐温80)... 为获得深海可培养微生物资源,利用2216E培养基,采用涂布平板法从南大西洋热液区沉积物中分离可培养细菌,并通过16S rRNA基因进行分类鉴定.同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶、木聚糖酶、褐藻酸酶和脂肪酶(三丁酸甘油酯和吐温80)的能力.分离共获得216株菌株,经16S rRNA基因序列比对,共获得71株不同的菌株.其中包括变形菌纲62株、放线菌纲3株、芽孢杆菌纲2株和拟杆菌纲4株,分布于27个属,41个种.酶活检测结果显示,具有淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶(底物为三丁酸甘油酯)和脂肪酶(底物为吐温80)的产酶细菌分别为18、14、25、32株,供测细菌中未检出产果胶酶、木聚糖酶和褐藻酸酶的菌株.这些菌株为进一步研究开发提供了深海微生物资源. 展开更多

关键词 海洋生物学 细菌 多样性 酶活鉴定 热液区 南大西洋

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北极表层海水中氯代十六烷降解菌的多样性 被引量：8

10

作者 王建宁 董纯明 +2 位作者 赖其良 林龙山 邵宗泽 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1011-1020,共10页

【目的】为了研究北极地区表层海水中氯代十六烷(C16H33Cl)降解菌的多样性,并获得新的卤代烃降解菌资源。【方法】以C16H33Cl为唯一碳源和能源在4℃和25℃下对表层海水样品进行富集,通过平板分离鉴定可培养菌株,并验证其降解能力;同时... 【目的】为了研究北极地区表层海水中氯代十六烷(C16H33Cl)降解菌的多样性,并获得新的卤代烃降解菌资源。【方法】以C16H33Cl为唯一碳源和能源在4℃和25℃下对表层海水样品进行富集,通过平板分离鉴定可培养菌株,并验证其降解能力;同时利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析降解菌群结构。【结果】从12个北极表层海水样品中富集分离得到112株可培养菌株。经过降解实验验证,发现19株菌株能够降解氯代十六烷,其中食烷菌(Alcanivorax)、红球菌(Rhodococcus)表现出很好的乳化和降解现象,海杆菌(Marinobacter)也有较好的降解效果。DGGE分析显示,富集驯化的降解菌群中主要优势菌为Alcanivorax,Parvibaculum和Thioclava属的菌株。【结论】北极海水中卤代烃降解菌主要是α-proteobacteria,γ-proteobacteria,Actinobacteria和Bacteroidetes。文章首次报道了北极海水卤代烷烃降解菌多样性,研究结果对于认识北极环境中的降解菌资源与生物多样性有参考价值。 展开更多

关键词 北极 表层海水 氯代十六烷 生物降解 多样性

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异养硝化-好氧反硝化细菌的研究进展 被引量：18

11

作者 李贵珍 赖其良 +1 位作者 邵宗泽 闫培生 《生物资源》 CAS 2018年第5期419-429,共11页

异养硝化-好氧反硝化菌株的发现是对传统硝化反硝化的突破和发展。近年来由于其独特的生物学特性及其在污水处理中的巨大优势,受到众多学者的青睐。文章介绍了异养硝化-好氧反硝化菌的筛选,异养硝化-好氧反硝化代谢途径和异养硝化-好氧... 异养硝化-好氧反硝化菌株的发现是对传统硝化反硝化的突破和发展。近年来由于其独特的生物学特性及其在污水处理中的巨大优势,受到众多学者的青睐。文章介绍了异养硝化-好氧反硝化菌的筛选,异养硝化-好氧反硝化代谢途径和异养硝化-好氧反硝化菌的影响因素,并总结了异养硝化-好氧反硝化菌在废水处理中的研究进展,最后展望未来研究的方向。 展开更多

关键词 异养硝化-好氧反硝化 代谢途径 生物脱氮 酶

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深海细菌Celeribacter indicus P73T对菲的降解机制 被引量：1

12

作者 曹军伟 赖其良 +1 位作者 袁军 邵宗泽 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期703-707,共5页

来自深海环境的多环芳烃降解菌Celeribacter indicus P73T能够高效降解菲,为揭示菲生物降解的分子机制,对其降解途径进行分析.通过GC-MS联用技术鉴定出菌株P73T降解菲的2个重要的中间代谢产物,1-羟基-2-萘甲酸和1-萘酚.通过分析菌株P73... 来自深海环境的多环芳烃降解菌Celeribacter indicus P73T能够高效降解菲,为揭示菲生物降解的分子机制,对其降解途径进行分析.通过GC-MS联用技术鉴定出菌株P73T降解菲的2个重要的中间代谢产物,1-羟基-2-萘甲酸和1-萘酚.通过分析菌株P73T全基因组,发现了菲降解基因簇（P73 0346-P730354）,编码包括环羟基化双加氧酶、二氢二醇脱氢酶、环裂解双加氧酶、异构酶、水合醛缩酶等.通过验证环羟基化双加氧酶大亚基基因突变株ΔP73_0346：：kan的菲降解能力,证实基因P73 0346编码了菲双加氧酶.依据代谢物检测、基因组分析和突变株功能验证结果,推测菌株P73T降解菲经由菲C3,4-双加氧途径,更进一步地确定了参与此途径的菲双加氧酶等降解相关基因.本研究不仅揭示了菲降解的分子机制,也为菲污染的生物修复技术提供了理论依据. 展开更多

关键词 深海细菌 Celeribacter INDICUS 菲 降解基因 代谢途径

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南大西洋深海热液区可培养硫氧化微生物多样性及其硫氧化特性 被引量：18

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作者 徐鈜绣 姜丽晶 +3 位作者 李少能 钟添华 赖其良 邵宗泽 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期88-100,共13页

【目的】探索南大西洋热液环境中的硫氧化细菌多样性并研究其硫氧化特性。【方法】通过富集培养和分离纯化获得硫氧化细菌,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析富集菌群组成结构,采用离子色谱法对获得的硫氧化细菌硫氧化特性进行检测。【结... 【目的】探索南大西洋热液环境中的硫氧化细菌多样性并研究其硫氧化特性。【方法】通过富集培养和分离纯化获得硫氧化细菌,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析富集菌群组成结构,采用离子色谱法对获得的硫氧化细菌硫氧化特性进行检测。【结果】从南大西洋深海环境样品中共分离到48株菌,分属于alpha-Proteobacteria(28株,58.3%)、Actinobacteria(11株,22.9%)和gama-Proteobacteria(9株,18.8%)共3个门,其中Thalassospira、Martelella和Microbacterium为优势属。DGGE结果表明深海热液环境样品中微生物多样性丰富且不同站位存在差异。硫氧化特性研究结果表明,约60%的分离菌株具有硫氧化能力,可以氧化S_2O_3^(2–)生成SO_4^(2–)。获得一株硫氧化能力较强的潜在新种L6M1-5,在实验条件下可高效氧化S_2O_3^(2–),最大氧化速率可达0.56 mmol/(L·h)。【结论】南大西洋深海热液环境中可培养硫氧化细菌多样性丰富,为研究热液环境中的硫循环过程提供了实验材料和理论参考;同时高效硫氧化菌的获得,为工业化含硫废水的处理提供了良好的菌种资源。 展开更多

关键词 深海热液区 硫氧化菌 多样性 硫氧化特性

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红树林混合菌群协同降解偶氮染料活性黑5脱色性能研究

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作者 李亚婷 付欢 +5 位作者 肖贵谦 王建宁 林允勇 付晓腾 邵宗泽 赖其良 《生物资源》 CAS 2023年第5期431-439,共9页

通过对福建省龙海市海门岛红树林保护区的近海沉积物样品进行富集驯化,得到了能够协同降解偶氮染料活性黑5的混合菌群HMD9-Q7。经过生化试验和16SrDNA序列分析,鉴定该混合菌群主要由越南蔷薇菌(Rossellomorea vietnamensis)、转化异源... 通过对福建省龙海市海门岛红树林保护区的近海沉积物样品进行富集驯化,得到了能够协同降解偶氮染料活性黑5的混合菌群HMD9-Q7。经过生化试验和16SrDNA序列分析,鉴定该混合菌群主要由越南蔷薇菌(Rossellomorea vietnamensis)、转化异源物食烷菌(Alcanivorax xenomutans)和近海生微泡菌(Microbulbifer maritimus)组成。与单一菌株相比较,混合菌群具有显著的脱色效果,可能因其菌株之间存在着相互协同促进作用。该混合菌群对含20~100 mg/L浓度的活性黑5均产生脱色作用。混合菌群HMD9-Q7可以广泛利用外加碳源和氮源,如葡萄糖、硝酸铵、牛肉膏等;NaCl浓度在5~30 g/L范围内都可对活性黑5进行脱色;在pH 7和温度30℃条件下脱色率最高。在最优条件下,该混合菌群在60 h内对活性黑5的脱色率可达到85%~90%。该新型混合菌群主要通过生物降解途径来实现对活性黑5的脱色。随着降解反应的发生,活性黑5的最大吸收峰逐渐变小直至完全消失,降解产物吸收峰位于近紫外光区。 展开更多

关键词 混合菌群 协同降解 活性黑5 脱色性能

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