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基于代谢组学和转录组学挖掘荷叶生物碱合成途径关键基因
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作者 李双琴 汪仲毅 +2 位作者 赵琬玥 陈龙清 胡慧贞 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期328-340,共13页
为探究荷叶生物碱生物合成的分子机制,对生物碱含量差异显著品种‘太空莲’(高生物碱含量)、‘巨无霸’(中生物碱含量)和‘大足红莲’(低生物碱含量)的成熟荷叶进行代谢组学和转录组学测序分析。代谢组学分析发现,在‘大足红莲’及‘太... 为探究荷叶生物碱生物合成的分子机制,对生物碱含量差异显著品种‘太空莲’(高生物碱含量)、‘巨无霸’(中生物碱含量)和‘大足红莲’(低生物碱含量)的成熟荷叶进行代谢组学和转录组学测序分析。代谢组学分析发现,在‘大足红莲’及‘太空莲’(低生物碱含量vs高生物碱含量)、‘大足红莲’及‘巨无霸’(低生物碱含量vs中生物碱含量)、‘太空莲’及‘巨无霸’(高生物碱含量vs中生物碱含量)3组中分别存在30、32、14种差异代谢物。这些差异代谢物主要为3类异喹啉类生物碱——苄基异喹啉类、双苄基异喹啉类、阿朴啡类生物碱,包括山矾碱、3′-葡萄糖基-6,7-二羟基-N-甲基-苄基四氢异喹啉、多巴胺、L-酪胺等。为了挖掘上述异喹啉类生物碱生物合成途径的关键基因,进一步对3个品种进行转录组学测序分析。结果表明,‘大足红莲’及‘太空莲’、‘大足红莲’及‘巨无霸’、‘太空莲’及‘巨无霸’3组中的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)分别为2 866、2 739、3 932个,共有的DEGs有379个,这些共有基因中含有异喹啉类生物碱生物合成途径基因。结合代谢组学分析结果,最终筛选并通过实时荧光定量聚合酶链反应验证得到6个关键DEGs——NnCYP80G、Nn6OMT、NnTYDC、NnNCS、NnRAV和NnERF,它们可用于后续基因功能验证和分子调控网络解析。 展开更多
关键词 荷叶生物碱 差异代谢物 差异表达基因 实时荧光定量聚合酶链反应
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绿绒蒿属藏药植物ndhF和rbcL序列片段特征分析 被引量:5
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作者 屈燕 赵琬玥 +2 位作者 区智 冷秋思 熊健 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期84-89,共6页
应用叶绿体ndhF和rbcL序列对绿绒蒿属藏药植物欧贝:长叶绿绒蒿Meconopsis lancifolia、全缘叶绿绒蒿Meconopsis integrifolia、红花绿绒蒿Meconopsis punicea、尼泊尔绿绒蒿Meconopsis napaulensis;刺儿恩:总状绿绒蒿Meconopsis racemos... 应用叶绿体ndhF和rbcL序列对绿绒蒿属藏药植物欧贝:长叶绿绒蒿Meconopsis lancifolia、全缘叶绿绒蒿Meconopsis integrifolia、红花绿绒蒿Meconopsis punicea、尼泊尔绿绒蒿Meconopsis napaulensis;刺儿恩:总状绿绒蒿Meconopsis racemosa、多刺绿绒蒿Meconopsis horridula进行鉴别,对其序列特征差异和亲缘关系进行分析。PCR直接测序后获得六种绿绒蒿的rbcL和ndhF的部分序列。用Clustal X2.1和MEGA6.06等软件分析得到任意两种间均有变异位点和遗传距离,根据rbcL和ndhF基因部分序列数据分别建立系统树。rbcL序列分析显示,任意两种间有变异位点;ndhF序列分析显示,除总状绿绒蒿(居群1)和多刺绿绒蒿序列无明显差异外,其他任意两种间均有位点变异。根据叶绿体ndhF和rbcL基因序列数据可以很好的鉴别6种绿绒蒿属藏药植物。 展开更多
关键词 绿绒蒿属 藏药植物 rbcL、ndhF基因 分子鉴定
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不同浓度赤霉素对长果绿绒蒿种子萌发特性的影响 被引量:9
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作者 赵琬玥 刘伟 +2 位作者 韩杜鹃 区智 屈燕 《种子》 北大核心 2018年第3期23-27,共5页
以生长于云南丽江玉龙雪山的长果绿绒蒿(Meconopsis delavayi(Fr.)Fr.ex Prain)种子为材料,对其表型特征进行了测量,同时分别采用不同浓度(50,100,150,200,250,300mg/L)的赤霉素(GA_3)处理种子,在光照恒温恒湿箱内进行种子萌发实验,研... 以生长于云南丽江玉龙雪山的长果绿绒蒿(Meconopsis delavayi(Fr.)Fr.ex Prain)种子为材料,对其表型特征进行了测量,同时分别采用不同浓度(50,100,150,200,250,300mg/L)的赤霉素(GA_3)处理种子,在光照恒温恒湿箱内进行种子萌发实验,研究不同浓度的赤霉素对长果绿绒蒿种子萌发的影响。结果表明:长果绿绒蒿种子的平均长宽比为(3.25±0.08),平均千粒重为(1.33±0.06)g,种子平均含水量为(6.55±0.85)%。200~300mg/L GA_3处理可提高长果绿绒蒿种子发芽率、发芽势、发芽指数,缩短平均发芽时间,加快种子发芽速度,增强种子的发芽能力,且不同浓度赤霉素处理间差异显著(p<0.05),说明一定浓度的GA_3处理对长果绿绒蒿种子的萌发具有显著的影响。 展开更多
关键词 长果绿绒蒿 赤霉素 种子萌发特性
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全缘叶绿绒蒿ISSR体系的建立与优化 被引量:3
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作者 赵琬玥 冷秋思 +2 位作者 熊健 区智 屈燕 《北方园艺》 CAS 北大核心 2018年第13期80-86,共7页
以全缘叶绿绒蒿的DNA为模板,利用正交实验设计,研究了Mg^(2+)、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶、DNA这5种PCR反应成分对反应体系的影响,以期建立并优化一个适合全缘叶绿绒蒿的ISSR反应体系,并用优化的体系对UBC公布的100条ISSR引物进行筛... 以全缘叶绿绒蒿的DNA为模板,利用正交实验设计,研究了Mg^(2+)、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶、DNA这5种PCR反应成分对反应体系的影响,以期建立并优化一个适合全缘叶绿绒蒿的ISSR反应体系,并用优化的体系对UBC公布的100条ISSR引物进行筛选。结果表明:在50μL优化后的反应体系中,含3 mmol·L^(-1) Mg^(2+)、2mmol·L^(-1)dNTPs、0.4mmol·L^(-1)引物、1.25UTaq DNA聚合酶、60ng DNA。通过梯度PCR仪检验,确定了适宜的退火温度、延伸时间和循环次数。利用该体系共筛选出16条ISSR引物,并对全缘叶绿绒蒿共10株个体材料进行扩增检验,获得了较好的扩增效果。利用该体系,可为今后ISSR标记在绿绒蒿属植物的种质鉴定和遗传多样性分析等方面的应用提供一定的试验基础。 展开更多
关键词 全缘叶绿绒蒿 ISSR 正交设计 体系建立优化
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绿绒蒿属植物不同DNA提取方式的比较 被引量:1
5
作者 刘伟 赵琬玥 +2 位作者 周长梅 武科君 屈燕 《北方园艺》 CAS 北大核心 2017年第15期97-102,共6页
以绿绒蒿属(Meconpsis Vig.)3种植物叶片为试材,采用研钵手动研磨和电动匀浆马达研磨器2种研磨方式处理叶片,采用改良的CTAB法、国产天根试剂盒、德国Qiagen试剂盒法3种提取方式从绿绒蒿属植物叶片中提取DNA,研究了不同提取方式对绿绒... 以绿绒蒿属(Meconpsis Vig.)3种植物叶片为试材,采用研钵手动研磨和电动匀浆马达研磨器2种研磨方式处理叶片,采用改良的CTAB法、国产天根试剂盒、德国Qiagen试剂盒法3种提取方式从绿绒蒿属植物叶片中提取DNA,研究了不同提取方式对绿绒蒿属植物DNA提取效果的影响,以期为绿绒蒿属植物的分子遗传学研究奠定基础。结果表明:几种不同提取方法均能获得较为完整的DNA,研钵手动研磨的植物叶片提取的DNA无论是从质量、纯度还是得率均好于电动匀浆马达研磨器研磨。3种提取方式提取的DNA均可直接用于下游PCR反应,改良的CTAB法提取的DNA纯度和得率均很高;天根试剂盒法和Qiagen试剂盒法提取的DNA得率不高;Qiagen提取的DNA纯度和质量均比较好,但成本较高。 展开更多
关键词 绿绒蒿属植物 DNA提取 研磨 改良CTAB法 试剂盒法
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Decorating Ag/AgCl on UiO-66-NH2: Synergy between Ag plasmons and heterostructure for the realization of efficient visible light photocatalysis 被引量:5
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作者 Wanyue Zhao Tong Ding +4 位作者 Yating Wang Moqing Wu Wenfeng Jin Ye Tian Xingang Li 《Chinese Journal of Catalysis》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1187-1197,共11页
UiO-66-NH2, as typical visible light responsive Zr-based metal-organic frameworks (MOFs), has attracted great interest in recent years. However, rapid combination of the photoinduced carriers limits its further applic... UiO-66-NH2, as typical visible light responsive Zr-based metal-organic frameworks (MOFs), has attracted great interest in recent years. However, rapid combination of the photoinduced carriers limits its further application. Here, we designed a facile precipitation-photoreduction method to post-synthetically decorate Ag/AgCl on the surface of UiO-66-NH2 and form a heterostructure. Metallic Ag can not only transmit electrons between UiO-66-NH2 and AgCl but also absorb visible light, because of the surface plasmon resonance (SPR) effect. The rhodamine B photodegradation rate of UiO-66-NH2/Ag/AgCl (16.2 wt.% Ag) is about 10 and 4 times those of UiO-66-NH2 and Ag/AgCl, respectively. The SPR effect of Ag NPs and the formation of a heterostructure synergistically increase the absorbability of visible light, accelerate the separation of photoinduced charges, and promote the formation of superoxide radicals. We expect that our work could provide a new viewpoint for constructing efficient MOF-based photocatalytic systems. 展开更多
关键词 UiO-66-NH2 Ag/AgCl HETEROSTRUCTURE Visible light photocatalysis Superoxide radical
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绿绒蒿SSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:1
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作者 熊健 屈燕 +1 位作者 冷秋思 赵琬玥 《江苏农业科学》 2019年第8期60-63,共4页
为建立适合绿绒蒿属(Meconopsis Vig.)的SSR反应体系,以多刺绿绒蒿(M.horridula)为试材,应用L_(25)(5~6)进行正交试验,对影响SSR-PCR的主要因素进行优化。结果发现,Mg^(2+)对PCR反应效果影响最大,而dNTPs的影响最小。5个因素水平的变化... 为建立适合绿绒蒿属(Meconopsis Vig.)的SSR反应体系,以多刺绿绒蒿(M.horridula)为试材,应用L_(25)(5~6)进行正交试验,对影响SSR-PCR的主要因素进行优化。结果发现,Mg^(2+)对PCR反应效果影响最大,而dNTPs的影响最小。5个因素水平的变化对绿绒蒿属SSR-PCR反应体系的影响从大到小依次为Mg^(2+)>Taq酶含量>引物浓度>DNA模板量>dNTPs浓度。适宜绿绒蒿属的SSR反应体系:总体积25μL,Mg^(2+)浓度2 mmol/L,dNTPs浓度0.2 mmol/L,引物浓度0.5μmol/L,DNA模板量60 ng,Taq聚合酶量1.6 U,其余用ddH_2O补充。扩增程序为94℃1.5 min;94℃20 s,最适退火温度20 s,72℃1 min,共35个循环;72℃5 min;4℃保存。利用优化后的反应体系对同属另外8种绿绒蒿(M.wallichi、M.racemosa、M.lingholm、M.prattii、M.rudis、M.napaulensis Pinky、M.paniculata、M.superba)进行PCR扩增,均获得优良的扩增产物。因此,该试验建立的反应体系适用于绿绒蒿属植物的SSR-PCR反应。 展开更多
关键词 绿绒蒿 SSR PCR体系优化
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荷花(Nelumbo nucifera)全基因组PRR基因家族鉴定及其在多种非生物胁迫下的表达模式 被引量:2
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作者 汪仲毅 程志鹏 +7 位作者 顾伟卓 赵晗茜 葛奇 杨冬梅 赵琬玥 杨自云 陈龙清 胡慧贞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期60-72,共13页
为了探究荷花(Nelumbo nucifera)伪应答调控蛋白(pseudo-response regulators, PRR)NnPRR家族成员的特征及其在非生物胁迫响应中的作用,通过生物信息学分析,将7个NnPRR基因从荷花全基因组中挖掘出来,对其基因结构、蛋白保守基序、顺式... 为了探究荷花(Nelumbo nucifera)伪应答调控蛋白(pseudo-response regulators, PRR)NnPRR家族成员的特征及其在非生物胁迫响应中的作用,通过生物信息学分析,将7个NnPRR基因从荷花全基因组中挖掘出来,对其基因结构、蛋白保守基序、顺式作用元件及共线性关系等进行了鉴定分析,并利用实时定量PCR技术探究各基因分别在外源施加300 mmol/L NaCl、 5 mmol/L水杨酸(salicylic acid, SA)及4℃低温处理下的表达模式。研究结果表明,该家族基因在荷花中可分为3个分支,集中分布在chr2、chr3、chr5和chr6染色体上,该家族蛋白均定位于细胞核。该家族基因在启动子区域发现大量光响应元件,且一些基因还具有低温、茉莉酸甲酯及脱落酸等响应元件。从基因的表达模式上看,NnPRR基因家族7个基因均正向响应外源NaCl处理,而NnPRR2、NnPRR4、NnPRR3等基因则特异性响应外源SA或低温胁迫,推测该家族基因特异性参与荷花非生物逆境胁迫。本研究结果为深入研究荷花PRR基因家族响应逆境胁迫提供了理论基础,也为抗逆新品种的选育提供了新的基因资源。 展开更多
关键词 荷花 PRR基因家族 启动子元件 非生物胁迫 表达模式
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全缘叶绿绒蒿(Meconopsis integrifolia)的ISSR遗传多样性分析 被引量:5
9
作者 赵琬玥 冷秋思 +1 位作者 屈燕 区智 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第20期6891-6899,共9页
为研究全缘叶绿绒蒿的ISSR遗传多样性,本研究以全缘叶绿绒蒿16个居群共185个个体为研究对象,采用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)标记技术分析全缘叶绿绒蒿遗传多样性,利用Popgen1.32计算遗传相似系数(GS)、Shannon指数(I)、Nei’s指... 为研究全缘叶绿绒蒿的ISSR遗传多样性,本研究以全缘叶绿绒蒿16个居群共185个个体为研究对象,采用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)标记技术分析全缘叶绿绒蒿遗传多样性,利用Popgen1.32计算遗传相似系数(GS)、Shannon指数(I)、Nei’s指数(He)等遗传参数;AMOVA进行遗传变异分析;利用MEGA4.0软件及UPGMA法进行聚类分析并构建树状图,并用MVSP中的主成分分析(PCA)对群体的遗传关系进行聚类分析;用TFPGA软件进行Mental检测。ISSR的21条引物共扩增出279个条带,平均每条引物扩增出13.3个条带,其中多态性条带278个,条带在150~2 000 bp之间均有分布,物种水平上的遗传多样性百分比PPB=99.64%,Nei’s基因多样性指数(He)范围在0.052 0~0.208 3之间,Shannon’s多样性信息指数(I)在0.079 5~0.313 4范围内;遗传分化系数(Gst)和AMOVA分析均显示遗传变异主要存在于种群间。种群间基因流(Nm)小于1,遗传漂变在全缘叶绿绒蒿的遗传分化中所起作用较大。Mental相关性检验,p值均大于0.05,说明遗传距离与地理距离间相关性不显著,地理距离对居群间的遗传分化没有明显影响。通过全缘叶绿绒蒿的遗传多样性研究发现,ISSR是一种非常便捷、有效的分子标记技术,能够为后续的种质鉴定、杂交育种和资源收集与合理开发利用提供一定的理论依据和参考。 展开更多
关键词 全缘叶绿绒蒿 ISSR 遗传多样性
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北京高校五人制足球运动开展现状调查研究
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作者 杨兆春 赵琬玥 邱程 《休闲》 2020年第10期0043-0043,共1页
五人制足球运动项目作为足球运动的一项分支,受到了人们的日益关注和喜爱。全面开展五人制足球运动对于促进国 足运动水平的整体提高有着积极的促进作用。本文我们以北京体育大学为研究对象,通过对北京体育大学五人制足球运动开展的 基... 五人制足球运动项目作为足球运动的一项分支,受到了人们的日益关注和喜爱。全面开展五人制足球运动对于促进国 足运动水平的整体提高有着积极的促进作用。本文我们以北京体育大学为研究对象,通过对北京体育大学五人制足球运动开展的 基础条件调查、开展现状、发展的对策研究入手,分析当前在开展过程中存在的不足,从而为其更好的发展提出对策建议。 展开更多
关键词 五人制足球运动 开展现状 问题研究
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