为了分析不同发育阶段健康中国荷斯坦奶牛瘤胃菌群结构多样性,试验采用16S r DNA高通量测序技术对抽提的4个阶段健康奶牛瘤胃内容物的细菌基因组总DNA进行OTUs聚类、超1（Chao1）指数、香浓（Shannon）指数及OTUs交叠分析。结果表明：...为了分析不同发育阶段健康中国荷斯坦奶牛瘤胃菌群结构多样性,试验采用16S r DNA高通量测序技术对抽提的4个阶段健康奶牛瘤胃内容物的细菌基因组总DNA进行OTUs聚类、超1（Chao1）指数、香浓（Shannon）指数及OTUs交叠分析。结果表明：哺乳犊牛瘤胃中主要以普氏菌属-7（46.0%）、毛罗菌科NK3A20（8.9%）、罗氏菌属（4.9%）为主;断奶犊牛瘤胃中主要以普氏菌属-7（31.0%）、毛罗菌科NK3A20（16.0%）、理研菌科RC9-gut-group（2.3%）为主;青成牛瘤胃内的普氏菌属-1（8.5%）、丹毒丝菌科UCG-004（7.5%）、反刍杆菌属（6.4%）、琥珀酸弧菌科UCG-002（5.4%）、普氏菌科UCG-003（4.9%）、理研菌科RC9-gut-group（4.6%）的相对丰度较高;成年牛瘤胃内的普氏菌属-1（38.0%）、琥珀酸弧菌科UCG-0019（4.5%）、理研菌科RC9-gut-group（2.3%）、普氏菌科UCG-003（2.2%）、琥珀酸弧菌科UCG-002（2.1%）、普氏菌属-7（1.5%）相对丰度较高。说明4个阶段中国荷斯坦奶牛瘤胃菌群结构存在明显差异,其中哺乳犊牛与断奶犊牛瘤胃菌群属丰度低、结构简单,青成牛与成年牛瘤胃菌群丰度高、结构复杂。展开更多
文摘为了分析不同发育阶段健康中国荷斯坦奶牛瘤胃菌群结构多样性,试验采用16S r DNA高通量测序技术对抽提的4个阶段健康奶牛瘤胃内容物的细菌基因组总DNA进行OTUs聚类、超1（Chao1）指数、香浓（Shannon）指数及OTUs交叠分析。结果表明：哺乳犊牛瘤胃中主要以普氏菌属-7（46.0%）、毛罗菌科NK3A20（8.9%）、罗氏菌属（4.9%）为主;断奶犊牛瘤胃中主要以普氏菌属-7（31.0%）、毛罗菌科NK3A20（16.0%）、理研菌科RC9-gut-group（2.3%）为主;青成牛瘤胃内的普氏菌属-1（8.5%）、丹毒丝菌科UCG-004（7.5%）、反刍杆菌属（6.4%）、琥珀酸弧菌科UCG-002（5.4%）、普氏菌科UCG-003（4.9%）、理研菌科RC9-gut-group（4.6%）的相对丰度较高;成年牛瘤胃内的普氏菌属-1（38.0%）、琥珀酸弧菌科UCG-0019（4.5%）、理研菌科RC9-gut-group（2.3%）、普氏菌科UCG-003（2.2%）、琥珀酸弧菌科UCG-002（2.1%）、普氏菌属-7（1.5%）相对丰度较高。说明4个阶段中国荷斯坦奶牛瘤胃菌群结构存在明显差异,其中哺乳犊牛与断奶犊牛瘤胃菌群属丰度低、结构简单,青成牛与成年牛瘤胃菌群丰度高、结构复杂。
