文摘目的探索下肢外周动脉疾病的潜在铁死亡相关生物标志物及诊断治疗靶点。方法应用生物信息学方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载下肢外周动脉疾病的转录组数据集,筛选出差异表达基因(differential expressed genes,DEGs),并与铁死亡基因取交集,得到下肢外周动脉疾病相关的铁死亡基因,对其进行功能富集,同时通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析下肢外周动脉疾病相关的铁死亡基因的诊断价值;之后构建蛋白质相互作用网络,应用Cytoscape中的算法预测关键基因;最后通过miRWalk预测靶向关键基因的miRNA并构建网络图。结果共筛选出9个下肢外周动脉疾病铁死亡相关基因,GO与KEGG的功能富集分析结果表明,这些基因与铁死亡、免疫调节、凋亡及糖尿病、动脉粥样硬化等相关,ROC诊断提示下肢外周动脉疾病患者中9个相关的铁死亡基因的平均曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.930;基于算法筛选出4个关键基因:HMOX1、ALOX5、IL1B和CYBB,而CYBB和HMOX1同时受miR-6734-3p调控。结论通过生物信息学方法分析得出HMOX1、ALOX5、IL1B和CYBB在下肢外周动脉疾病中存在诱导铁死亡的潜在作用,而miR-6734-3p作为HMOX1与CYBB的共同靶向miRNA,有望成为潜在诊断生物标志物及治疗靶点。
