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机器学习联合生物信息学鉴定骨关节炎细胞衰老关键基因及验证
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作者 袁长深 廖书宁 +5 位作者 李哲 吴思萍 陈乐伟 刘晋邑 李彦宏 段戡 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第20期3196-3201,共6页
背景:细胞衰老与骨关节炎的发生、发展密切相关,但具体作用靶点及调控机制尚不清楚。目的:综合生物信息学和机器学习方法挖掘细胞衰老介导骨关节炎的关键基因,并利用实验加以验证,探讨细胞衰老在骨关节炎中的作用。方法:从GEO数据库中... 背景:细胞衰老与骨关节炎的发生、发展密切相关,但具体作用靶点及调控机制尚不清楚。目的:综合生物信息学和机器学习方法挖掘细胞衰老介导骨关节炎的关键基因,并利用实验加以验证,探讨细胞衰老在骨关节炎中的作用。方法:从GEO数据库中获得骨关节炎基因表达谱以及从CellAge数据库中获得细胞衰老相关基因,二者取交集并提取交集基因表达量进行差异分析,然后对差异基因进行GO和KEGG分析,接着通过PPI网络分析和机器学习筛选骨关节炎细胞衰老关键基因,并进行体外细胞实验验证,采用qPCR方法检测关键基因的表达。结果与结论:①获得31个骨关节炎细胞衰老差异基因,GO分析显示主要参与白细胞分化调节、单核细胞分化、T细胞分化调节等生物过程,在DNA转录因子结合、组蛋白去乙酰化酶结合、染色质DNA结合、趋化因子结合中发挥作用;②KEGG分析表明骨关节炎细胞衰老差异基因主要在JAK/STAT信号通路、PI3K/Akt信号通路、FoxO信号通路中被激活;③通过PPI网络拓扑学分析和机器学习方法筛选出骨关节炎细胞衰老关键基因MYC;④体外细胞实验结果表明,实验组骨关节炎软骨细胞中MYC mRNA表达明显低于对照组(正常软骨细胞),差异有显著性意义(P<0.05);⑤结果表明,MYC可作为骨关节炎细胞衰老的关键基因,可能通过介导免疫应答、炎症反应和转录调控等成为骨关节炎防治的新靶标。 展开更多
关键词 骨关节炎 细胞衰老 关键基因 细胞实验 机器学习 生物信息学
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骨关节炎坏死性凋亡关键基因的筛选与验证 被引量:5
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作者 袁长深 官岩兵 +5 位作者 李哲 廖书宁 陈乐伟 梅其杰 段戡 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2023年第5期695-700,共6页
背景:骨关节炎与慢性、低度炎症密切相关。坏死性凋亡是一种具有广泛炎症特性的新型细胞死亡途径,可影响骨关节炎进展,但目前尚未发现骨关节炎坏死性凋亡的相关靶点。目的:基于生物信息学挖掘骨关节炎坏死性凋亡关键基因,并利用动物实... 背景:骨关节炎与慢性、低度炎症密切相关。坏死性凋亡是一种具有广泛炎症特性的新型细胞死亡途径,可影响骨关节炎进展,但目前尚未发现骨关节炎坏死性凋亡的相关靶点。目的:基于生物信息学挖掘骨关节炎坏死性凋亡关键基因,并利用动物实验加以验证,为从坏死性凋亡角度防治骨关节炎提供新的靶点。方法:分别从GEO数据库与GeneCards数据库筛选出骨关节炎相关基因和坏死性凋亡相关基因,继而对两者取交集获得骨关节炎坏死性凋亡基因,进一步进行GO及KEGG富集分析,构建PPI网络,通过Cytoscape软件的5种计算方法获得骨关节炎坏死性凋亡关键基因(Hub基因),最后选用雄性SD大鼠建立膝关节骨关节炎中期模型,通过RT-PCR检测Hub基因在SD大鼠骨关节炎中期模型中的表达情况。结果与结论:①共筛选出38个骨关节炎坏死性凋亡基因,GO及KEGG分析发现其主要在白细胞活性、T细胞受体及白细胞介素17信号通路等方面显著富集;通过Cytoscape的5种不同算法筛选出CYBB、FADD、IL1B、MYC及EGFR 5个Hub基因;②RT-PCR检测结果显示,与正常对照组比较,雄性SD大鼠骨关节炎中期模型软骨中EGFR、IL1B基因呈高表达(P<0.05),CYBB、MYC基因呈低表达(P<0.05),FADD基因表达无明显变化(P>0.05);③结果显示,CYBB、IL1B、MYC及EGFR可作为骨关节炎坏死性凋亡的关键基因,有望成为防治骨关节炎的新靶点。 展开更多
关键词 骨关节炎 坏死性凋亡 关键基因 生物信息学 实验验证
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壮医药治疗骨关节炎的研究进展
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作者 陈乐伟 袁长深 +5 位作者 韦安达 廖书宁 石春龙 刘晋邑 李彦宏 段戡 《壮瑶药研究》 2023年第1期293-295,共3页
骨关节炎作为一种最常见的慢性关节疾病,近年来发病率不断增加,严重影响患者的生活质量。壮医药传承于壮族民间,是壮族人民在与自然环境的长期斗争中逐渐形成的一种本土化的医疗保健体系。经过长期的实践和总结,壮医一系列独特的医疗理... 骨关节炎作为一种最常见的慢性关节疾病,近年来发病率不断增加,严重影响患者的生活质量。壮医药传承于壮族民间,是壮族人民在与自然环境的长期斗争中逐渐形成的一种本土化的医疗保健体系。经过长期的实践和总结,壮医一系列独特的医疗理论和治疗方法在治疗各种疾病中均取得了一定的疗效和优势,本文就壮医药治疗骨关节炎的相关研究予以综述,望能为后续该病的治疗提供参考与启示。 展开更多
关键词 壮医药 骨关节炎 研究进展
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壮医经筋疗法治疗腰椎间盘突出症疗效概况
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作者 陈乐伟 徐经洧 +2 位作者 李日波 袁长深 韦安达 《壮瑶药研究》 2023年第3期41-43,共3页
腰椎间盘突出症是一种常见的脊椎疾病,多发生在中年和老年人群中,近年来发病率不断增加,严重影响患者的生活质量。壮医药传承于壮族民间,是壮族人民在与自然环境的长期斗争中逐渐形成的一种本土化的医疗保健体系。经过长期的实践和总结... 腰椎间盘突出症是一种常见的脊椎疾病,多发生在中年和老年人群中,近年来发病率不断增加,严重影响患者的生活质量。壮医药传承于壮族民间,是壮族人民在与自然环境的长期斗争中逐渐形成的一种本土化的医疗保健体系。经过长期的实践和总结,壮医一系列独特的医疗理论和治疗方法在治疗各种疾病中均取得了一定的疗效和优势。现对壮医经筋疗法治疗腰椎间盘突出症的文献予以总结归纳,望能为后续该病的治疗提供参考与启示。 展开更多
关键词 壮医药 经筋疗法 腰椎间盘突出症 研究进展
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基于“毒虚致病”理论概述壮医治疗颈椎病的研究进展
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作者 陈乐伟 徐经洧 +2 位作者 李日波 袁长深 韦安达 《壮瑶药研究》 2023年第3期343-345,共3页
颈椎病是一种常见的脊椎疾病,多发生在中老年群体中,但随着现代生活方式的改变和工作习惯的变化,颈椎病在各年龄群体中普遍存在,严重影响患者的生活质量。壮医药传承于壮族民间,是壮族人民在与自然环境的长期斗争中逐渐形成的一种本土... 颈椎病是一种常见的脊椎疾病,多发生在中老年群体中,但随着现代生活方式的改变和工作习惯的变化,颈椎病在各年龄群体中普遍存在,严重影响患者的生活质量。壮医药传承于壮族民间,是壮族人民在与自然环境的长期斗争中逐渐形成的一种本土化的医疗保健体系。经过长期的实践和总结,壮医一系列独特的医疗理论和治疗方法在治疗各种疾病中均取得了一定的疗效和优势。现从壮医病因病机理论——“毒虚致病”入手,阐述颈椎病的发生机制及壮医独特的治疗方法,以期为临床治疗颈椎病提供参考与启示。 展开更多
关键词 壮医药 颈椎病 毒虚治病 研究进展
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壮瑶医药治疗膝骨关节炎的研究进展
6
作者 廖书宁 吴思萍 +5 位作者 倪秀悦 李哲 官岩兵 陈乐伟 袁长深 傅鹏 《壮瑶药研究》 2023年第1期57-59,共3页
膝骨关节炎(keen osteoarthritis,KOA)是一种与体重、年龄密切相关的骨科疾病。现代医学治疗方法有限,不良反应多。壮瑶医药为祖国医学的重要分支,在KOA治疗方面优势突出,拥有许多独特疗法,疗效确切,不良反应小,患者易于接受,发展前景... 膝骨关节炎(keen osteoarthritis,KOA)是一种与体重、年龄密切相关的骨科疾病。现代医学治疗方法有限,不良反应多。壮瑶医药为祖国医学的重要分支,在KOA治疗方面优势突出,拥有许多独特疗法,疗效确切,不良反应小,患者易于接受,发展前景明朗。本文就壮瑶医药治疗KOA的常用方法做一简要概述。 展开更多
关键词 膝骨关节炎 壮医药 瑶医药
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基于Web of Science的骨关节炎氧化应激相关文献可视化分析
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作者 廖书宁 吴思萍 +5 位作者 倪秀悦 李哲 官岩兵 陈乐伟 袁长深 傅鹏 《壮瑶药研究》 2023年第2期229-235,共7页
目的:运用可视化软件对近20年骨关节炎和氧化应激相关文献进行计量学分析,探讨该领域的研究热点及发展趋势,为今后研究提供参考。方法:使用CiteSpace5.8.R1软件,以Web of Science数据库为数据来源,设定检索时间为2001-01-01至2021-12-3... 目的:运用可视化软件对近20年骨关节炎和氧化应激相关文献进行计量学分析,探讨该领域的研究热点及发展趋势,为今后研究提供参考。方法:使用CiteSpace5.8.R1软件,以Web of Science数据库为数据来源,设定检索时间为2001-01-01至2021-12-31进行检索,对获得文献进行发文趋势,国家/地区、机构、作者共现,文献、作者、期刊共被引,以及关键词分析并可视化。结果:共纳入999篇有效文献,这些文献发表机构大多来自大学,发文量最多的是温州医科大学;发文量最多和中心性最高的国家分别是:中国和美国;FRANCISCO J BLANCO教授是最为突出的高产作者,共发文19篇。共现网络显示,对外合作最为紧密的国家是美国;各主要机构和作者间均缺乏广泛而深入的学术联系。共被引分析中,文献共被引排名第一的是Lepetsos P(2016年);LOESER RF在作者共被引中居首位;OSTEOARTHR CARTILAGE是共被引频次最高的期刊,NAT REV RHEUMATOL是2021年该领域共被引期刊中影响因子较高者。关键词共现和突现结果表明,软骨细胞、细胞外基质、细胞凋亡、炎症、抗氧化剂、自噬是研究人员关注的焦点,对应的分子机制基础研究是该领域的发展趋势。结论:近20年,OA与氧化应激领域得到越来越多的关注;抗氧化应激作为治疗OA的一种潜在干预方法,未来研究应注重多国家/地区和机构的协同合作;我国作为该领域研究的重要参与国,尚缺乏重大的研究成果,应加强与美国、意大利、德国等较为深入国家间的学术交流,并发挥我国中医药的优势,开展中医药干预的相关研究,力求发表高水平的科研论文,扩大我国的学术影响力;本研究可视化结果能够为今后OA与氧化应激领域进一步的发展提供参考。 展开更多
关键词 骨关节炎 氧化应激 Web of Science CITESPACE 可视化分析
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壮医药治疗腰椎间盘突出症的研究进展
8
作者 李日波 钟远鸣 +5 位作者 韦安达 钟绵森 张迪 刘顺康 陆楷成 陈乐伟 《壮瑶药研究》 2023年第3期453-455,533,共4页
壮医药历史悠久,它是壮族人民从生产和生活实践中总结出来的与疾病做斗争经验。壮族地区医务工作者对壮族地区常见疾病腰椎间盘突出采用壮医药内服与外治相结合的方法,收到明显的疗效。其中壮医外治法是最引人注目的外治法之一,壮医外... 壮医药历史悠久,它是壮族人民从生产和生活实践中总结出来的与疾病做斗争经验。壮族地区医务工作者对壮族地区常见疾病腰椎间盘突出采用壮医药内服与外治相结合的方法,收到明显的疗效。其中壮医外治法是最引人注目的外治法之一,壮医外治法在临床中种类繁多,使用范围较广,本文对壮医药在腰椎间盘突出中的研究现状进行了综述。 展开更多
关键词 壮医药 腰椎间盘突出症 治疗 综述
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中药烫疗治疗膝骨关节炎相关研究进展
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作者 刘晋邑 张久一 +5 位作者 廖书宁 陈乐伟 吴思萍 倪秀悦 袁长深 傅鹏 《壮瑶药研究》 2023年第3期474-476,共3页
膝骨关节炎(keen osteoarthritis,KOA)是一种以疼痛、关节炎症、骨质增生、软骨退变为特点的骨关节疾病。现代医学治疗方法有限,中药烫疗作为祖国医学的重要治疗手段,效果明确,操作简答、副作用小,易于被患者所接受。本文就中药烫疗治疗... 膝骨关节炎(keen osteoarthritis,KOA)是一种以疼痛、关节炎症、骨质增生、软骨退变为特点的骨关节疾病。现代医学治疗方法有限,中药烫疗作为祖国医学的重要治疗手段,效果明确,操作简答、副作用小,易于被患者所接受。本文就中药烫疗治疗KOA的常用手段做简要阐述。 展开更多
关键词 中药烫疗 膝骨关节炎
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基于文献计量的骨关节炎与自噬研究态势分析 被引量:3
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作者 袁长深 李哲 +5 位作者 官岩兵 廖书宁 陈乐伟 梅其杰 段戡 《中国医药导报》 CAS 2022年第24期5-10,21,共7页
目的探讨骨关节炎(OA)与自噬的研究态势,梳理该领域的发展历程,分析当前的研究动态及热点,对OA与自噬相关领域研究进行系统综述和趋势展望,为后续研究提供参考。方法基于PubMed文献数据库,使用citexs数据分析平台,采用文献计量学方法对2... 目的探讨骨关节炎(OA)与自噬的研究态势,梳理该领域的发展历程,分析当前的研究动态及热点,对OA与自噬相关领域研究进行系统综述和趋势展望,为后续研究提供参考。方法基于PubMed文献数据库,使用citexs数据分析平台,采用文献计量学方法对2011年1月至2021年12月关于OA与自噬研究进行文献分析及大数据挖掘。结果检索获得有效文献480篇,分析发现该领域年度发文量不断增加,2021年达到年发文量顶峰108篇,其中发文量最多的国家为中国(207篇,43.13%),而发文量最多的研究机构为美国的斯克里普斯研究所,刊载该领域文献量最多的期刊是Osteoarthritis Cartilage(24篇),单名作者发文量最多为4篇,该方面中国学者贡献最多,检索文献中关键词出现频率最多的为autophagy、apoptosis、chondrocytes、inflammation、cartilage,最多的关联基因为MTOR(143篇)。此外,本研究还列出15篇推荐文献。结论该领域研究正处于快速上升阶段,研究内容随着时间的推移不断深入,虽然目前相关机制尚不清楚,但自噬作为OA的治疗靶点将具有广阔的临床前景,靶向复杂的氧化应激信号通路或调节MTOR干预可能是治疗OA的有效方式。 展开更多
关键词 骨关节炎 自噬 研究态势 文献计量学
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3.6亿美人心计
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作者 陈乐伟 《商界》 2014年第1期70-73,共4页
其实林意被捕已经很久,久到恐怕连她自己都已记不起当初的风光。即便如此,2013年年末,一条“40岁上海美女混迹深圳富豪固,被控骗8富豪3.6亿”的新闻横空出世,依然如平地惊雷,个个关键词都足够吸引眼球,更何况其中还牵扯到国企... 其实林意被捕已经很久,久到恐怕连她自己都已记不起当初的风光。即便如此,2013年年末,一条“40岁上海美女混迹深圳富豪固,被控骗8富豪3.6亿”的新闻横空出世,依然如平地惊雷,个个关键词都足够吸引眼球,更何况其中还牵扯到国企高管、民间投资大户、台湾商界大佬。 展开更多
关键词 人心 民间投资 关键词 富豪 风光 高管 国企 大户
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加工中心上加工圆周均布孔系的编程方法
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作者 陈乐伟 马春红 《机械工程师》 2002年第5期33-34,共2页
编制了圆周均布孔系加工的子程序,只需在子程序中给出圆周均布孔系的中心坐标、半径、等分数及起始角度,子程序就可根据所赋相应变量的值进行自动运算,实现等分圆周孔系中各孔的加工。
关键词 加工中心 子程序 中心坐标 半径 等分数 起始角
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西玛格Φ3.5m提升机滑动轴承更换的研究及实践
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作者 刘敬 赵继华 陈乐伟 《山东煤炭科技》 2019年第4期132-133,135,144,共4页
本文主要针对西玛格直径3.5m提升机的滑动轴承的更换,提出了一种快速、高效、安全的对策和实践方案,通过合理的施工,能够大大地提高更换的工作效率及精确性,保证了更换轴承后提升机的平稳安全运行,节省了时间,也为煤矿生产提高了经济效益。
关键词 西玛格 提升机 滑动轴承 更换对策
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矿用提升机钢丝绳调绳法的改进
14
作者 刘敬 陈乐伟 石新民 《山东煤炭科技》 2018年第1期128-129,共2页
本文介绍了两种矿用提升机钢丝绳调绳法,逐一对其进行分析,并重点讲述兖矿集团济宁三号煤矿在用的新型钢丝绳调绳法,该方法方便、安全,有很好的推广价值。
关键词 矿井提升机 钢丝绳 调绳方法
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慢性腰肌劳损中医药治疗进展
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作者 李日波 钟远鸣 +2 位作者 钟绵森 张迪 陈乐伟 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2024年第2期0154-0157,共4页
慢性腰肌劳损是骨科门诊常见病,主要表现为腰或腰骶部疼痛,活动受限。随着科技进步和现代医学的不断发展,中医药在治疗慢性腰肌劳损方面临床上的疗效也得到了广泛的认可,其作用机制逐步得到了诠释。中医药治疗慢性腰肌劳损不仅能有效缓... 慢性腰肌劳损是骨科门诊常见病,主要表现为腰或腰骶部疼痛,活动受限。随着科技进步和现代医学的不断发展,中医药在治疗慢性腰肌劳损方面临床上的疗效也得到了广泛的认可,其作用机制逐步得到了诠释。中医药治疗慢性腰肌劳损不仅能有效缓解患者的疼痛和其他相关症状,还能加速腰椎功能的恢复,同时还具备见效快、成本低和高安全性等优点。本文旨在通过查阅国内外中医药治疗慢性腰肌劳损的相关文献,从中药、针灸推拿、拔罐、小针刀、穴位注射、正骨手法、运动疗法等多个角度深入探讨其疗效机制,以期望为临床治疗慢性腰肌劳损提供有益的参考和启示。 展开更多
关键词 慢性腰肌劳损 疗效机制 腰椎功能 中医药治疗
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从痰瘀机制探讨自噬与骨关节炎的关系
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作者 袁长深 李哲 +5 位作者 官岩兵 廖书宁 陈乐伟 梅其杰 段戡 《湖南中医杂志》 2022年第10期107-110,共4页
自噬可维持骨关节炎(OA)患者软骨内环境的稳定,自噬功能受损则会导致蛋白碎片和衰老的细胞器在软骨细胞内过度沉积,这种病理机制与中医学中的“痰瘀”在OA中的致病机制具有相似之处。本文从痰瘀机制探讨自噬在OA中的作用,认为自噬将机... 自噬可维持骨关节炎(OA)患者软骨内环境的稳定,自噬功能受损则会导致蛋白碎片和衰老的细胞器在软骨细胞内过度沉积,这种病理机制与中医学中的“痰瘀”在OA中的致病机制具有相似之处。本文从痰瘀机制探讨自噬在OA中的作用,认为自噬将机体内“异物(特指‘痰瘀’)重新回收利用”的过程,正是中医气化功能以及化痰祛瘀的微观体现。从自噬角度对中医学中“痰瘀”进行解读为现代中医药临床开辟了新思路,通过自噬深化对“痰瘀”的探究可为中医药临床通过调节自噬探寻防治OA提供理论依据。并从化痰祛瘀调控自噬探寻防治OA的新方法,以期为有效防治OA提供新思路。 展开更多
关键词 骨关节炎 痰瘀互结 自噬
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