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题名狗牙根TCP转录因子基因家族鉴定与分析
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作者
孙启雪
陈焯婷
陈荣荣
张兵
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机构
扬州大学动物科学与技术学院
江苏省中国科学院植物研究所
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出处
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2330-2344,共15页
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基金
国家自然科学基金面上项目“蛋白激酶CdCIPK15A调控狗牙根株型的分子机制”(32072613)。
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文摘
TCP转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程发挥着关键作用。狗牙根(Cynodon dactylon)是被广泛应用的、具有重要经济价值的暖季型草坪草,具有发达的根状茎和匍匐茎。本研究从狗牙根基因组鉴定了65个分属于PCF、CIN、CYC/TB1亚族的TCP转录因子。染色体定位分析表明,65个TCP基因不均衡地分布于狗牙根36条染色体上;共线性分析表明,串联复制机制作用于TCP基因。研究结果表明,3个亚家族族内的TCP转录因子基因成员的基因结构、蛋白结构域均高度保守。亚细胞定位预测结果显示,TCP转录因子能够定位于细胞核、叶绿体和线粒体。启动子元件分析发现,TCP基因启动子区存在数量不等的激素应答顺式作用元件。转录组学数据显示,TCP基因具有不同的组织表达模式,该现象在匍匐茎和根状茎尤为明显。本研究为进一步探究TCP转录因子在狗牙根茎特化和生长发育过程中的作用奠定了基础。
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关键词
狗牙根
TCP转录因子
系统进化
共线性分析
生长发育
茎特化
基因表达谱
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Keywords
bermudagrass
TCP transcription factor
phylogenetic evolution
collinearity analysis
growth and development
stem specialization
gene expression profile
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分类号
S688.4
[农业科学—观赏园艺]
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