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重叠加权法在药品不良反应信号检测中的模拟研究
1
作者 韦连慧 张朋朋 +5 位作者 刘永梅 郭晓晶 许金芳 陈枭 陈晨鑫 叶小飞 《中国药物警戒》 2023年第6期646-650,共5页
目的通过模拟研究探索重叠加权法在药品不良反应信号检测中均衡混杂因素的效果。方法采用点估计值、标准误、偏倚、均方差、95%置信区间覆盖率综合评价倾向性评分分层、倾向性评分匹配、逆概率加权法及重叠加权法这4种方法在4种不同组... 目的通过模拟研究探索重叠加权法在药品不良反应信号检测中均衡混杂因素的效果。方法采用点估计值、标准误、偏倚、均方差、95%置信区间覆盖率综合评价倾向性评分分层、倾向性评分匹配、逆概率加权法及重叠加权法这4种方法在4种不同组间重叠程度时效应估计的准确性和稳定性。结果在本研究的模拟情景中,重叠加权法效应估计的结果最准确、稳定,其他3种方法的准确性和稳定性随着重叠程度的减小均逐渐变差,逆概率加权法差异最大。结论重叠加权法可以作为在药品不良反应信号检测中均衡混杂因素的一种选择。 展开更多
关键词 药品不良反应 信号检测 混杂因素 重叠加权 倾向性评分分层 倾向性评分匹配 逆概率加权
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免疫检查点抑制剂甲状腺免疫相关不良反应分析 被引量：3
2
作者 郑轶 翟映红 +9 位作者 郭晓晶 许金芳 迟立杰 郭志坚 陈晨鑫 梁际洲 韦连慧 陈枭 叶小飞 贺佳 《中国药物警戒》 2023年第1期92-95,共4页
目的以免疫检查点抑制剂(ICIs)甲状腺免疫相关不良反应为例,初步探索基于中国药物警戒系统(CHPS)开展药品主动监测的可行性,为相关研究提供依据。方法基于2家哨点医院的CHPS数据,提取2020年1月1日至2021年6月30日应用过ICIs的肿瘤患者信... 目的以免疫检查点抑制剂(ICIs)甲状腺免疫相关不良反应为例,初步探索基于中国药物警戒系统(CHPS)开展药品主动监测的可行性,为相关研究提供依据。方法基于2家哨点医院的CHPS数据,提取2020年1月1日至2021年6月30日应用过ICIs的肿瘤患者信息,以及未使用过ICIs的肿瘤患者信息作为对照。基于广义估计方程,对ICIs的甲状腺免疫相关不良反应进行探索。结果共纳入1691名患者,其中ICIs组666名,对照组1025名。应用广义估计方程模型处理患者的随访数据,充分考虑了多次重复测量数据间相关性的问题,发现显性甲状腺毒症有统计学意义(P<0.05),发生率为4.50%,中位时间为41.5 d。结论ICIs的应用可能会导致显性甲状腺毒症,临床医师在给患者应用ICIs时应注意显性甲状腺毒症的发生,确保患者用药安全。 展开更多
关键词 免疫检查点抑制剂 甲状腺 中国药物警戒系统 主动监测 药品不良反应
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机器学习方法在FAERS布加替尼不良反应信号检测中的应用 被引量：1
3
作者 陈枭 郭晓晶 +5 位作者 许金芳 韦连慧 陈晨鑫 梁际洲 郑轶 叶小飞 《中国药物警戒》 2023年第6期639-645,共7页
目的评估机器学习算法在检测布加替尼(Brigatinib)药品不良反应信号中的性能。方法使用美国食品药品监督管理局(FDA)不良反应事件报告系统(FAERS)2017年4月1日至2022年3月31日收集的布加替尼药品不良反应信号数据开展研究。首先为研究... 目的评估机器学习算法在检测布加替尼(Brigatinib)药品不良反应信号中的性能。方法使用美国食品药品监督管理局(FDA)不良反应事件报告系统(FAERS)2017年4月1日至2022年3月31日收集的布加替尼药品不良反应信号数据开展研究。首先为研究药品构建一个输入数据集,包括药品标签上列出的已知不良反应和未知不良反应。对于已知不良反应,训练4种机器学习算法,并通过曲线下面积(AUC)评估机器学习算法[随机森林(random forest,RF)、极限梯度提升机(extreme gradient boosting)、Logistic回归和邻近算法(k-NearestNeighbor,kNN)]与传统不相称分析方法[报告优势比(ROR)]和信息成分(IC)]进行比较。结果kNN算法具有最高的AUC,平均值0.875,其余方法中Logistic回归(0.852),XGBoost(0.722),RF(0.662)和DPA(0.548)。在未知不良反应数据集中,以kNN算法建立的机器学习模型检出6个额外信号(占15.8%),传统不相称方法检出4个额外信号(占10.5%)。结论以kNN算法建立的机器学习模型比传统DPA方法在药品不良反应信号检测方面性能更佳。 展开更多
关键词 不相称分析 布加替尼 信号检测 药品不良反应 机器学习算法 美国食品药品监督管理不良反应事件报告系统
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缺失数据处理在药物流行病学研究中的应用及进展 被引量：1
4
作者 韦连慧 郭晓晶 +7 位作者 许金芳 陈晨鑫 陈枭 迟立杰 郑轶 梁际洲 贺佳 叶小飞 《药物流行病学杂志》 CAS 2022年第1期60-64,共5页
缺失数据是药物流行病学研究中常见而且难以避免的问题,但与混杂因素相比,往往没有受到重视,其会导致后续对药物的评估引入潜在偏倚,以致得出错误结论。本文旨在通过介绍几种缺失数据的处理方法,为药物流行病学研究提供更多有价值的信息。
关键词 药物流行病学 观察性研究 缺失数据
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国外主要自发呈报系统数据库分析及应用 被引量：10
5
作者 迟立杰 陈晨鑫 +6 位作者 郑轶 韦连慧 陈枭 郭志坚 郭晓晶 贺佳 叶小飞 《中国药物警戒》 2021年第12期1144-1147,共4页
目的介绍目前国外主要药品不良反应自发呈报系统世界卫生组织个案安全性病例报告数据库(VigiBase)、美国食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)、欧洲药品管理局不良反应数据库(EudraVigilance)应用现状。方法查阅国外主要自发呈... 目的介绍目前国外主要药品不良反应自发呈报系统世界卫生组织个案安全性病例报告数据库(VigiBase)、美国食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)、欧洲药品管理局不良反应数据库(EudraVigilance)应用现状。方法查阅国外主要自发呈报系统数据库相关网站,系统检索中外有关利用自发呈报系统文章并进行综述。从数据库的数据格式、利用数据库的权限、数据质量控制等方面对自发呈报系统数据库进行介绍,并对数据库的应用现状举例分析。结果国外自发呈报系统数据库数据可公开下载或在一定条件下获取,目前研究者利用国外自发呈报系统数据库已开展较多研究。结论自发呈报系统数据库对开展上市后安全性监测有较大价值,我国自发呈报系统数据库在数据共享方面可借鉴国外做法。 展开更多
关键词 药品不良反应 自发呈报系统 数据库 国外
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观察性健康数据科学和信息学组织实用工具简介 被引量：1
6
作者 郑轶 郭晓晶 +8 位作者 许金芳 迟立杰 郭志坚 陈晨鑫 梁际洲 韦连慧 陈枭 叶小飞 贺佳 《药物流行病学杂志》 CAS 2021年第12期837-840,846,共5页
运用真实世界大数据进行药品不良反应主动监测受到了国内外学者的高度关注。其中如何实现多个形式不一数据库之间的数据整合,仍然是发挥大数据优势对药品不良反应进行主动监测时存在的一个巨大的挑战。本文旨在通过介绍观察性健康数据... 运用真实世界大数据进行药品不良反应主动监测受到了国内外学者的高度关注。其中如何实现多个形式不一数据库之间的数据整合,仍然是发挥大数据优势对药品不良反应进行主动监测时存在的一个巨大的挑战。本文旨在通过介绍观察性健康数据科学和信息学(OHDSI)组织的几种工具软件,为我国开展药品不良反应主动监测的数据整合提供思路及方向。 展开更多
关键词 观察性健康数据科学和信息学 提取-转换-加载 White Rabbit Rabbit in a hat Usagi OHDSI方法库 ATLAS
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电子健康记录分析中分布式算法的应用现状及分析
7
作者 陈枭 郭晓晶 +7 位作者 许金芳 韦连慧 陈晨鑫 梁际洲 郑轶 迟立杰 贺佳 叶小飞 《药物流行病学杂志》 CAS 2021年第11期767-771,共5页
随着电子健康记录在医疗保健研究中的广泛应用,为了整合多个临床中心的数据进行分析和预测,以达到实现多中心临床试验的研究目的,分布式算法应运而生。本文通过查阅相关文献的研究方法,对数篇文献中提及的分布式算法进行了归纳、总结、... 随着电子健康记录在医疗保健研究中的广泛应用,为了整合多个临床中心的数据进行分析和预测,以达到实现多中心临床试验的研究目的,分布式算法应运而生。本文通过查阅相关文献的研究方法,对数篇文献中提及的分布式算法进行了归纳、总结、整合和比较,初步得出了一些结论。在不考虑迭代通信的情况下首选不产生信息损失的GLORE算法,偏倚为0,标准差为1;若在其他临床中心的数据仅可被借用一次,则首选ODAL算法;而与原始ODAL算法相比,如果存在潜在的外部临床中心,则首选Robust-ODAL。因此应根据各临床中心给出数据的不同情况,灵活选择不同的分布式算法,以发挥不同算法的优势。 展开更多
关键词 电子健康记录 分布式算法 网格二进制逻辑回归 ODAL
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基于Super Learner的边缘结构模型研究及发展 被引量：3
8
作者 陈晨鑫 郭晓晶 +7 位作者 许金芳 梁际洲 韦连慧 陈枭 郑轶 迟立杰 叶小飞 贺佳 《药物流行病学杂志》 CAS 2022年第2期101-106,共6页
时依性混杂是纵向观察性研究数据中常见,但较难用传统回归模型控制的特殊混杂。边缘结构模型通过计算逆概率权重对原始人群进行加权,获得新的虚拟人群,消除混杂因素的影响,是目前控制时依性混杂较流行的方法。近年来,随着机器学习的发展... 时依性混杂是纵向观察性研究数据中常见,但较难用传统回归模型控制的特殊混杂。边缘结构模型通过计算逆概率权重对原始人群进行加权,获得新的虚拟人群,消除混杂因素的影响,是目前控制时依性混杂较流行的方法。近年来,随着机器学习的发展,利用数据自适应算法计算逆概率权重的边缘结构模型逐步受到关注。Super Learner是其中较新颖的一种方法,其能很好地规避传统估计逆概率权重方法的缺陷。该文基于前人的相关研究,总结传统边缘结构模型和逆概率权重的构建与计算,介绍Super Learner的构建、优缺点以及目前在药物流行病学相关研究中的实际应用,并提出未来可研究和待解决的问题。 展开更多
关键词 Super Learner 边缘结构模型 时依性混杂 逆概率权重
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运用信息成分方法分析伊布替尼的不良反应
9
作者 郑轶 郭晓晶 +8 位作者 许金芳 郭志坚 迟立杰 陈晨鑫 梁际洲 韦连慧 陈枭 叶小飞 贺佳 《中国药物警戒》 2022年第11期1228-1232,共5页
目的全面系统地挖掘伊布替尼导致的药品不良反应(ADR),为临床医生安全用药提供参考。方法运用信息成分(IC)方法,基于美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)数据库对从建库至2021年6月1日中伊布替尼的ADR进行挖掘。结果FA... 目的全面系统地挖掘伊布替尼导致的药品不良反应(ADR),为临床医生安全用药提供参考。方法运用信息成分(IC)方法,基于美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)数据库对从建库至2021年6月1日中伊布替尼的ADR进行挖掘。结果FAERS数据库种共有伊布替尼ADR报告20120份,检测出阳性信号445个,包括Richter综合征[IC的95%置信区间下限(IC_(025))=5.67]和脑曲霉病(IC_(025)=5.05)2种IC_(025)>5的强信号ADR。房颤(n=982,IC_(025)=3.33,IC=3.44),疲乏(n=958,IC_(025)=0.36,IC=0.47),腹泻(n=931,IC_(025)=0.64,IC=0.75)是3种发生频数最高的ADR,其报告数均超过900份。结论伊布替尼在多个系统存在较为广泛的ADR,临床医生应充分关注其ADR,并及时采取相应措施保证患者的用药安全。 展开更多
关键词 伊布替尼 药品不良反应 不成比例分析方法 美国食品药品监督管理局不良事件报告系统数据库
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药物流行病学研究中的时依性变量处理方法简介及比较 被引量：2
10
作者 梁际洲 郭晓晶 +7 位作者 许金芳 陈晨鑫 韦连慧 陈枭 郑轶 迟立杰 叶小飞 贺佳 《药物流行病学杂志》 CAS 2022年第3期190-197,共8页
基于纵向数据的因果推断,进而评价药物安全性与有效性是药物流行病学的重要工作之一。但在现实研究中由于存在不同程度的混杂,无法直接计算药物效应值。混杂中时依性混杂最为常见,却难以通过常规方式消除影响。除了混杂因素,在一些试验... 基于纵向数据的因果推断,进而评价药物安全性与有效性是药物流行病学的重要工作之一。但在现实研究中由于存在不同程度的混杂,无法直接计算药物效应值。混杂中时依性混杂最为常见,却难以通过常规方式消除影响。除了混杂因素,在一些试验中暴露因素同样具有时依性。本文基于领域相关研究,试图对时依性变量的种类进行辨析,简要介绍含时依系数的Cox回归、边缘结构模型、结构嵌套的加速失效时间模型以及序列条件平均模型基本思想与计算方法,总结4种方法的优缺点与应用方向,以期为科研人员在分析中对时依性变量控制有所借鉴与启示。 展开更多
关键词 时依性变量 COX回归 边缘结构模型 加速失效模型 序列条件平均模型
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