目的查询筛选骨质增生丸治疗颈椎病(Cervical Myelopathy,CM)的靶点基因、信号通路,以了解骨质增生丸的药理学作用。方法检索TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台,设置生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,获得骨质增生丸的主要有效...目的查询筛选骨质增生丸治疗颈椎病(Cervical Myelopathy,CM)的靶点基因、信号通路,以了解骨质增生丸的药理学作用。方法检索TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台,设置生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,获得骨质增生丸的主要有效成分,使用UniProt数据库获得靶点基因,然后查询GeneCards数据库,查找CM相关的靶点基因。用韦恩图取两者靶点基因的交集,再运用STRING数据库和Cytoscape软件,对靶点基因进行GO和KEGG的数据分析,再绘制中药-成分-靶基因-疾病的网络作用图。结果骨质增生丸的有效化学成分共520个,筛选后获得最终83个,靶点基因545个,确定CM靶点573个,二者共同靶点基因86个,PPI网络分析发现蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素1β(IL1β)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、激活蛋白1(JUN)、血管内皮生长因子(VEGFA)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、低氧诱导因子-1(HIF1A)、原癌基因蛋白(FOS)可能是骨质增生丸治疗CM的关键靶点。GO富集分析共有563数据(P<0.05),其中生物过程主要包括positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter(RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、response to drug(药物反应)、positive regulation of cell proliferation(细胞增殖的正调控等)等;KEGG通路富集分析数据明确了166条信号通路,其中信号通路主要是PI3K-Akt signaling pathway(磷脂酰肌醇3-激酶信号通路)、TNF signaling pathway(肿瘤坏死因子信号通路)、Cytokine-cytokine receptor interaction(细胞因子-细胞因子受体结合)等通路。结论骨质增生丸可能是通过多靶点、多通路治疗CM,主要起到抗炎、调控免疫及抗氧化的作用,但后期需要通过分子对接与生物实验验证靶点的有效性,证实骨质增生丸的作用机制,为后期临床用药提供新思路。展开更多
文摘目的查询筛选骨质增生丸治疗颈椎病(Cervical Myelopathy,CM)的靶点基因、信号通路,以了解骨质增生丸的药理学作用。方法检索TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台,设置生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,获得骨质增生丸的主要有效成分,使用UniProt数据库获得靶点基因,然后查询GeneCards数据库,查找CM相关的靶点基因。用韦恩图取两者靶点基因的交集,再运用STRING数据库和Cytoscape软件,对靶点基因进行GO和KEGG的数据分析,再绘制中药-成分-靶基因-疾病的网络作用图。结果骨质增生丸的有效化学成分共520个,筛选后获得最终83个,靶点基因545个,确定CM靶点573个,二者共同靶点基因86个,PPI网络分析发现蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素1β(IL1β)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、激活蛋白1(JUN)、血管内皮生长因子(VEGFA)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、低氧诱导因子-1(HIF1A)、原癌基因蛋白(FOS)可能是骨质增生丸治疗CM的关键靶点。GO富集分析共有563数据(P<0.05),其中生物过程主要包括positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter(RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、response to drug(药物反应)、positive regulation of cell proliferation(细胞增殖的正调控等)等;KEGG通路富集分析数据明确了166条信号通路,其中信号通路主要是PI3K-Akt signaling pathway(磷脂酰肌醇3-激酶信号通路)、TNF signaling pathway(肿瘤坏死因子信号通路)、Cytokine-cytokine receptor interaction(细胞因子-细胞因子受体结合)等通路。结论骨质增生丸可能是通过多靶点、多通路治疗CM,主要起到抗炎、调控免疫及抗氧化的作用,但后期需要通过分子对接与生物实验验证靶点的有效性,证实骨质增生丸的作用机制,为后期临床用药提供新思路。
