【背景】睾丸是雄性动物重要生殖器官,具有产生精子和分泌雄激素的功能,睾丸质量与繁殖性能有直接联系。睾丸性状受下丘脑-垂体-性腺轴多基因共同调控,其分子机理尚不清楚。宁都黄鸡睾丸性状变异系数大,繁殖性能一致性差。【目的】通过...【背景】睾丸是雄性动物重要生殖器官,具有产生精子和分泌雄激素的功能,睾丸质量与繁殖性能有直接联系。睾丸性状受下丘脑-垂体-性腺轴多基因共同调控,其分子机理尚不清楚。宁都黄鸡睾丸性状变异系数大,繁殖性能一致性差。【目的】通过对不同睾丸性状个体垂体组织进行全长转录组测序,挖掘候选基因以及关键信号通路,探究影响睾丸性状的遗传基础,以期为发展地方鸡种睾丸性状的选种选育提供依据。【方法】以70只22周龄宁都黄公鸡为研究对象,分为大睾丸组和小睾丸组,从两组中分别选取3个个体,构建垂体组织的全长转录本表达谱,筛选高表达量及两组个体差异表达基因或转录本,对差异基因或转录本进行功能富集分析。随机选取6个基因,进行基因表达水平验证。参考已知垂体细胞的标记基因,筛选与8种细胞标记基因对应的差异表达基因或转录本,并分析这些差异基因或转录本以及高表达量基因或转录本与睾丸性状相关性。【结果】在6个宁都黄鸡垂体组织中,检测到21834个基因,29355个全长转录本。其中,332个基因及229个转录本在两组个体中差异表达。KEGG通路分析结果显示,这些差异基因或转录本主要富集于Apelin信号、甘油磷脂代谢等通路。一共发现5个促性腺细胞标记基因或其对应转录本与部分睾丸性状显著相关,包括NFASC(neurofascin)及其对应转录本XM_015298904.2、TESC(tescalcin)及其对应转录本XM_025155510.1、FSHB(folliclestimulatinghormonebeta)转录本ONT.20974.4、RLN3(relaxin 3)、NDUFB2(NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2)转录本ONT.1176.4。1个催乳素细胞标记基因EGR1(early growth response 1),2个滤泡星状细胞标记基因TMSB4X(thymosin beta 4,X-linked)、C1H12ORF57(chromosome 1 open reading frame),1个促甲状腺细胞标记基因CHGB(chromogranin B)均与部分睾丸性状显著相关。2个高表达量基因TMSB4X、HSP90AA1(heat shock protein 90 alpha family class A member 1)与部分睾丸性状显著相关。FSHB、EGR1均为基因互作网络中节点基因。【结论】经初步功能分析,EGR1、TMSB4X、FSHB、RLN3为睾丸性状调控的关键基因。MAPK信号通路、神经活性配体-受体相互作用、GnRH信号通路为睾丸性状调控的关键基因通路。展开更多
文摘【背景】睾丸是雄性动物重要生殖器官,具有产生精子和分泌雄激素的功能,睾丸质量与繁殖性能有直接联系。睾丸性状受下丘脑-垂体-性腺轴多基因共同调控,其分子机理尚不清楚。宁都黄鸡睾丸性状变异系数大,繁殖性能一致性差。【目的】通过对不同睾丸性状个体垂体组织进行全长转录组测序,挖掘候选基因以及关键信号通路,探究影响睾丸性状的遗传基础,以期为发展地方鸡种睾丸性状的选种选育提供依据。【方法】以70只22周龄宁都黄公鸡为研究对象,分为大睾丸组和小睾丸组,从两组中分别选取3个个体,构建垂体组织的全长转录本表达谱,筛选高表达量及两组个体差异表达基因或转录本,对差异基因或转录本进行功能富集分析。随机选取6个基因,进行基因表达水平验证。参考已知垂体细胞的标记基因,筛选与8种细胞标记基因对应的差异表达基因或转录本,并分析这些差异基因或转录本以及高表达量基因或转录本与睾丸性状相关性。【结果】在6个宁都黄鸡垂体组织中,检测到21834个基因,29355个全长转录本。其中,332个基因及229个转录本在两组个体中差异表达。KEGG通路分析结果显示,这些差异基因或转录本主要富集于Apelin信号、甘油磷脂代谢等通路。一共发现5个促性腺细胞标记基因或其对应转录本与部分睾丸性状显著相关,包括NFASC(neurofascin)及其对应转录本XM_015298904.2、TESC(tescalcin)及其对应转录本XM_025155510.1、FSHB(folliclestimulatinghormonebeta)转录本ONT.20974.4、RLN3(relaxin 3)、NDUFB2(NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2)转录本ONT.1176.4。1个催乳素细胞标记基因EGR1(early growth response 1),2个滤泡星状细胞标记基因TMSB4X(thymosin beta 4,X-linked)、C1H12ORF57(chromosome 1 open reading frame),1个促甲状腺细胞标记基因CHGB(chromogranin B)均与部分睾丸性状显著相关。2个高表达量基因TMSB4X、HSP90AA1(heat shock protein 90 alpha family class A member 1)与部分睾丸性状显著相关。FSHB、EGR1均为基因互作网络中节点基因。【结论】经初步功能分析,EGR1、TMSB4X、FSHB、RLN3为睾丸性状调控的关键基因。MAPK信号通路、神经活性配体-受体相互作用、GnRH信号通路为睾丸性状调控的关键基因通路。
