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基于转录组测序鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因
1
作者 韩紫燕 吴申军 鲍海港 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期149-155,共7页
本研究旨在通过转录组测序(RNA-seq)鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因,为确定雌性鸡胚性腺不对称发育的分子机制提供参考。随机选择6胚龄(E6)和8胚龄(E8)的雌鸡胚胎各18~24只,分离并采集其两侧性腺,每6~8个同侧同期性腺组成一个... 本研究旨在通过转录组测序(RNA-seq)鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因,为确定雌性鸡胚性腺不对称发育的分子机制提供参考。随机选择6胚龄(E6)和8胚龄(E8)的雌鸡胚胎各18~24只,分离并采集其两侧性腺,每6~8个同侧同期性腺组成一个样品,匀浆后提取总RNA经质控后送商业公司进行转录组测序。每个样品3个生物学重复。通过基因差异表达分析,GO、KEGG信号通路分析和基因集变异分析(GSVA),筛选雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因和生物学通路。经实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对筛选出的差异表达基因进行验证。转录组差异表达分析结果显示雌性鸡胚左右两侧性腺在E6和E8分别存在195个和315个差异表达基因。GO功能富集和KEGG信号通路富集分析发现两侧性腺差异表达基因主要富集在卵子发生、细胞发育、piRNA代谢过程等生物学过程并筛选出Pou5f3、STK31、DMRTB1等与鸡胚性腺不对称发育相关的功能基因。本研究为进一步研究雌性鸡胚性腺不对称发育的分子调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 雌性鸡胚 性腺 不对称发育 转录组测序
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基于转录组测序挖掘雌性鸡胚性腺不对称发育中的重要lncRNA及其靶基因
2
作者 韩紫燕 鲍海港 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期36-41,共6页
为了挖掘雌性鸡胚性腺不对称发育中的重要长链非编码RNA(lncRNA)及其靶基因,试验以采集的胚胎孵化第9天(E9阶段)的雌性鸡胚两侧性腺为研究对象,采用转录组测序(RNA-seq)技术和生物信息学方法对雌性鸡胚左右两侧性腺进行转录组分析预测ln... 为了挖掘雌性鸡胚性腺不对称发育中的重要长链非编码RNA(lncRNA)及其靶基因,试验以采集的胚胎孵化第9天(E9阶段)的雌性鸡胚两侧性腺为研究对象,采用转录组测序(RNA-seq)技术和生物信息学方法对雌性鸡胚左右两侧性腺进行转录组分析预测lncRNA,运用DESeq2 v1.30.1软件鉴定两侧性腺间差异表达的mRNA和lncRNA,预测差异表达lncRNA的顺式和反式靶基因,对靶基因进行GO功能注释和KEGG信号通路分析;通过实时荧光定量PCR扩增验证重要靶基因的表达。结果表明:转录组分析预测出653个基因间lncRNA,467个内含子lncRNA,1339个反义lncRNA。雌性鸡胚左右两侧性腺间有1856个差异表达mRNA和443个差异表达lncRNA。GRIA1、DIO3、FSHR、LHX9、CYP17A1和TOX3等229个基因为差异表达lncRNA的靶基因。两侧性腺差异表达lncRNA的靶基因主要富集到了类固醇代谢过程、细胞内雌激素受体信号通路的正向调节、代谢通路等过程。实时荧光定量PCR扩增验证重要靶基因的表达结果与RNA-seq结果基本一致。说明雌性鸡胚左右两侧性腺具有不同表达水平和特异性表达的mRNA和lncRNA,它们可能影响雌性鸡胚左右两侧性腺的不对称发育。 展开更多
关键词 转录组测序 鸡胚 雌性性腺 不对称发育 长链非编码RNA
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不同添加剂对玉米秸秆青贮料pH及粗蛋白质含量的影响 被引量：8
3
作者 韩紫燕 王忠艳 +3 位作者 刘亚楠 杨尚谕 李施垚 陈丽军 《饲料博览》 2019年第7期22-25,共4页
为研究不同比例的添加剂糖蜜和尿素对玉米秸秆青贮饲料中pH及蛋白质含量的影响,试验设计了空白对照组和添加不同剂量添加剂的试验组,青贮60 d后对青贮饲料进行了pH测定和粗蛋白质含量测定.结果表明,玉米秸秆直接青贮,pH差异不显著,但粗... 为研究不同比例的添加剂糖蜜和尿素对玉米秸秆青贮饲料中pH及蛋白质含量的影响,试验设计了空白对照组和添加不同剂量添加剂的试验组,青贮60 d后对青贮饲料进行了pH测定和粗蛋白质含量测定.结果表明,玉米秸秆直接青贮,pH差异不显著,但粗蛋白质含量较低;而加入添加剂的各组青贮玉米秸秆的粗蛋白质含量明显提高,其中添加尿素0.6%和糖蜜6.0%的整体水平优于其他组.另外,糖蜜含量越高pH越低,即青贮料的品质越好. 展开更多
关键词 添加剂 玉米秸秆 青贮饲料 糖蜜 尿素
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尿素和糖蜜添加比例对玉米秸秆青贮效果的影响 被引量：2
4
作者 陈丽军 王忠艳 +3 位作者 李施垚 刘亚楠 杨尚谕 韩紫燕 《饲料博览》 2019年第6期6-8,14,共4页
为优化不同比例的糖蜜、尿素对收获籽实后的玉米秸秆青贮料制作质量的影响,设计了空白对照组以及添加不同剂量的糖蜜、尿素的试验组,青贮60d后对青贮料进行了感官评定和乳酸测定。结果表明,添加不同比例的糖蜜、尿素的各试验组青贮玉米... 为优化不同比例的糖蜜、尿素对收获籽实后的玉米秸秆青贮料制作质量的影响,设计了空白对照组以及添加不同剂量的糖蜜、尿素的试验组,青贮60d后对青贮料进行了感官评定和乳酸测定。结果表明,添加不同比例的糖蜜、尿素的各试验组青贮玉米秸秆的整体品质均优于或等于空白对照组,且不同比例糖蜜对乳酸影响极显著,其中添加0.6%尿素和6.0%糖蜜的青贮料感官评分最高,添加6.0%糖蜜的青贮料中乳酸含量最高。 展开更多
关键词 添加剂 玉米秸秆 青贮饲料 糖蜜 尿素
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