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基于网络药理学与分子对接技术探讨黄连素-丹参酮ⅡA抗动脉粥样硬化的作用机制
1
作者 黄弘博 史大卓 +4 位作者 王培利 刘剑刚 刘宇轩 许琳洁 张莹 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第22期4051-4062,共12页
目的:基于网络药理学和分子对接的方法探讨“黄连素-丹参酮ⅡA”抗动脉粥样硬化的潜在靶点和通路,以期为基础研究及临床应用提供依据。方法:通过PubChem数据库获得黄连素-丹参酮ⅡA分子结构及作用靶点,应用SwissTargetPrediction平台预... 目的:基于网络药理学和分子对接的方法探讨“黄连素-丹参酮ⅡA”抗动脉粥样硬化的潜在靶点和通路,以期为基础研究及临床应用提供依据。方法:通过PubChem数据库获得黄连素-丹参酮ⅡA分子结构及作用靶点,应用SwissTargetPrediction平台预测作用靶点;通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库检索并筛选动脉粥样硬化的治疗靶点,取药物靶点和疾病靶点的交集;通过STRING 11.5数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并通过Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑分析;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用AutoDock Tools 1.5.6、PyMOL 2.5.5等进行分子对接分析。结果:共获得95个黄连素-丹参酮ⅡA-动脉粥样硬化交集靶点。蛋白质相互作用分析挖掘其有效成分可能作用的核心靶点包括原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、磷脂酰肌醇-3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、细胞分裂周期蛋白42(CDC42)、淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)、Janus激酶2(JAK2)、Abelson鼠白血病病毒癌基因同源物1(ABL1)、Ras相关C3肉毒杆菌毒素底物1(RAC1)等。GO功能富集分析结果显示,黄连素-丹参酮ⅡA抗动脉粥样硬化主要涉及蛋白质磷酸化、信号转导、对外源刺激的反应、对药物的反应、免疫应答等230条生物功能。KEGG信号通路富集结果显示,黄连素-丹参酮ⅡA抗动脉粥样硬化的潜在作用途径包括脂质与动脉粥样硬化信号通路、神经营养素信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、大鼠肉瘤(Ras)信号通路等106条信号通路。将黄连素-丹参酮ⅡA与筛选的8个核心靶点进行分子对接,结合能均<-20.92 kJ/mol,表明关键靶点和黄连素-丹参酮ⅡA结合活性较好,其中与黄连素、丹参酮ⅡA对接结合能是最高的均为靶点蛋白SRC,二者之间具有强烈的结合活性。结论:黄连素-丹参酮ⅡA可能通过SRC、PIK3R1、PIK3CA、CDC42等多靶点,作用于脂质、PI3K/AKT、VEGF、MAPK、Ras等多条信号通路发挥抗动脉粥样硬化作用;分子对接结果显示,黄连素-丹参酮ⅡA与预测的核心靶点结合活性较好,为进一步研究提供应用依据。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 黄连素 丹参酮ⅡA 网络药理学 分子对接 作用机制
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基于网络药理学及分子对接探讨润肝养心方治疗心脏神经症的分子机制
2
作者 许琳洁 史大卓 +2 位作者 马晓娟 黄弘博 张莹 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第4期597-606,共10页
目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨润肝养心方治疗心脏神经症(CN)的物质基础和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、有机小分子生物活性数据库(PubChem)、Swiss Target Prediction数据库检索并筛选出润肝... 目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨润肝养心方治疗心脏神经症(CN)的物质基础和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、有机小分子生物活性数据库(PubChem)、Swiss Target Prediction数据库检索并筛选出润肝养心方(麦冬、酸枣仁、柏子仁、炒白芍、当归、五味子、茯苓、炙甘草)的药物活性成分及作用靶点,利用基因名片数据库(GeneCard)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisGeNET数据库筛选CN疾病靶点,将药物和疾病靶点两者取交集后获得的共有靶点导入STRING数据库获得蛋白互作关系,应用Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络;采用R语言ClusterProfiler程序包(3.18.0)对关键靶点进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并利用Cytoscape 3.8.2构建关键靶点-功能-通路图及关键靶点中药药理调控网络;采用AutoDock Tools 1.5.6进行分子对接研究。结果:润肝养心方筛选得到活性成分146个、作用靶点245个、CN及润肝养心方共有靶点如白细胞介素(IL)-1β、IL-6、肿瘤坏死因子(TNF)等38个。KEGG富集分析关键靶点主要被富集在神经活性配体-受体相互作用、晚期糖基化终末产物(AGE)-糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、脂质与动脉粥样硬化等信号通路,涉及对异源刺激的反应、管径调节、血管直径维持等生物过程。分子对接验证显示关键靶点与槲皮素、芍药苷、山柰酚的结合活性较好。结论:润肝养心方中主要活性成分可能通过调节IL-1β、IL-6、TNF等关键靶点基因及神经活性配体-受体相互作用、AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化等多通路以发挥抗炎、调节神经递质水平等作用治疗CN。 展开更多
关键词 心脏神经症 润肝养心方 网络药理学 分子对接
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史大卓教授治疗冠状动脉搭桥术后中医临床经验
3
作者 黄弘博 史大卓 +1 位作者 马晓娟 张莹 《中西医结合心脑血管病杂志》 2022年第19期3641-3643,共3页
冠状动脉搭桥术作为常见的血运重建方式之一,在冠心病的治疗中占有重要地位。然而冠状动脉搭桥术后仍会有心血管病不良症状及相关并发症发生,因此术后积极治疗在临床中尤为重要。史大卓教授在长期临床实践过程中,基于中医理论,认为冠状... 冠状动脉搭桥术作为常见的血运重建方式之一,在冠心病的治疗中占有重要地位。然而冠状动脉搭桥术后仍会有心血管病不良症状及相关并发症发生,因此术后积极治疗在临床中尤为重要。史大卓教授在长期临床实践过程中,基于中医理论,认为冠状动脉搭桥术后病人较其他冠心病病人气虚更甚,血瘀痰阻,故在治疗时常常采用扶正益气、活血化瘀、化痰宣痹法,疗效显著。 展开更多
关键词 冠状动脉搭桥术后 中医治疗经验 史大卓
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基于“治脾以安五脏”理论论治不稳定型心绞痛 被引量：1
4
作者 许琳洁 史大卓 +1 位作者 黄弘博 张莹 《四川中医》 2022年第10期40-44,共5页
“治脾以安五脏”起源于《黄帝内经》,是中医学阐释和治疗疾病的重要理论,对后世影响深远。中医学认为不稳定型心绞痛(UA)属“胸痹”“心痛”等范畴,病位在心,病机与瘀血阻络、心气不足等引起的心脉痹阻相关。现代医家认为“脾虚”亦贯... “治脾以安五脏”起源于《黄帝内经》,是中医学阐释和治疗疾病的重要理论,对后世影响深远。中医学认为不稳定型心绞痛(UA)属“胸痹”“心痛”等范畴,病位在心,病机与瘀血阻络、心气不足等引起的心脉痹阻相关。现代医家认为“脾虚”亦贯穿UA始终,主张调脾护心,治法多以健脾益气为基础,随证应用活血化瘀、化痰通络等法,疗效显著。本文基于“治脾以安五脏”理论,探讨其在不稳定型心绞痛中的临床应用,以期提供临床治疗思路和依据。 展开更多
关键词 治脾以安五脏 不稳定型心绞痛 冠心病
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人参皂苷Re对氧化低密度脂蛋白诱导的人脐静脉内皮细胞MEK/ERK/NF-κB信号通路的影响
5
作者 陈莉 史大卓 +3 位作者 别玉龙 黄弘博 魏康康 马晓娟 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1327-1333,共7页
目的基于丝裂原活化蛋白激酶/细胞外调节蛋白激酶/核因子-κB(MEK/ERK/NF-κB)信号通路探讨人参皂苷Re(G-Re)对氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的人脐静脉内皮细胞(HUVECs)炎症反应的影响。方法体外培养HUVECs,分别设置空白对照组、模型组... 目的基于丝裂原活化蛋白激酶/细胞外调节蛋白激酶/核因子-κB(MEK/ERK/NF-κB)信号通路探讨人参皂苷Re(G-Re)对氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的人脐静脉内皮细胞(HUVECs)炎症反应的影响。方法体外培养HUVECs,分别设置空白对照组、模型组(ox-LDL 150μg/mL)、G-Re组(20μmol/L)、G-Re加MEK抑制剂组(G-Re 20μmol/L+U0126-EtOH 10μmol/L)。采用CCK8法检测细胞活力;ELISA检测细胞上清液炎症因子IL-6和TNF-α表达水平;免疫荧光检测NF-κB蛋白的荧光强度;Western Blot和RT-PCR检测MEK、ERK和NF-κB蛋白和基因表达。结果与空白对照组比较,模型组细胞活力减弱(P<0.01),炎症因子IL-6和TNF-α表达升高(P<0.05),NF-κB蛋白的荧光强度增加(P<0.05),MEK、ERK和NF-κB蛋白及基因表达上调(P<0.05,P<0.01)。与模型组比较,G-Re组干预后细胞活力增强(P<0.05,P<0.01),炎症因子IL-6和TNF-α表达下降(P<0.05,P<0.01),NF-κB蛋白的荧光强度降低(P<0.05),MEK、ERK和NF-κB蛋白及基因表达下调(P<0.05,P<0.01)。与G-Re组比较,G-Re加MEK抑制剂组ERK和NF-κB基因和蛋白表达上调(P<0.05,P<0.01)。结论G-Re能够减轻ox-LDL诱导的HUVECs的炎症反应和内皮损伤,其作用机制可能与抑制MEK/ERK/NF-κB信号通路的激活有关。 展开更多
关键词 人参皂苷RE 炎症反应 丝裂原活化蛋白激酶 细胞外调节蛋白激酶 核因子-κB 中药单体
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