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海南黄牛IGF2R基因单核苷酸多态性及其生物信息学分析 被引量:2
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作者 杨伟杰 满初日嘎 +7 位作者 吴慧 张振兴 何美荣 蒋俊明 陈巧玲 高宏岩 王凤阳 陈思 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期3520-3528,共9页
【目的】明确海南黄牛胰岛素样生长因子2受体基因(IGF2R)遗传多态性及其在海南黄牛群体中的遗传分布情况,为进一步揭示IGF2R基因对海南黄牛生长性状的调控机理提供理论依据,也为分子标记辅助选择提供新的候选位点。【方法】构建海南黄牛... 【目的】明确海南黄牛胰岛素样生长因子2受体基因(IGF2R)遗传多态性及其在海南黄牛群体中的遗传分布情况,为进一步揭示IGF2R基因对海南黄牛生长性状的调控机理提供理论依据,也为分子标记辅助选择提供新的候选位点。【方法】构建海南黄牛DNA混池,通过PCR扩增和测序技术对海南黄牛IGF2R基因编码区(CDS)进行基因多态性分析,并以Chromas序列比对筛选出错义突变SNP位点;应用PCR-RFLP对202头海南黄牛个体进行基因型鉴定,同时对筛选到的SNP位点进行连锁不平衡及单倍型分析,评估海南黄牛群体中各单倍型的分布情况;通过生物信息学方法分析各单倍型和SNP位点对海南黄牛IGF2R基因CDS区mRNA二级结构、蛋白理化性质及蛋白二级结构的影响。【结果】在海南黄牛IGF2R基因CDS区共检测到4个错义突变SNPs位点,分别为SNP1(g.63977A>G)、SNP2(g.63999T>C)、SNP3(g.69772G>A)和SNP4(g.94987A>C),其中SNP1、SNP2和SNP3位点间呈强连锁不平衡状态。4个SNPs位点在海南黄牛群体中均表现为中度多态性,且处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。海南黄牛群体中存在4种单倍型(F>0.01),分别是H1(ATG)、H2(GCA)、H3(ACA)和H4(GCG);各单倍型及SNP4突变型对海南黄牛IGF2R基因CDS区mRNA二级结构及其最小自由能均有影响。海南黄牛IGF2R蛋白为亲水蛋白,存在跨膜结构和信号肽,其二级结构主要由无规则卷曲和延伸链构成,α-螺旋和β-转角的占比较小。【结论】在海南黄牛IGF2R基因CDS区共检测到4个错义突变SNPs位点,在海南黄牛群体中均表现为中度多态性,且处于Hardy-Weinberg平衡状态。海南黄牛IGF2R基因SNP位点突变对其mRNA二级结构及稳定性均会造成影响,致使IGF2R蛋白二级结构肽链构象发生改变,进而对海南黄牛生长性状的调控造成影响。 展开更多
关键词 海南黄牛 IGF2R基因 SNP位点 生物信息学 生长性状
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羊多杀性巴氏杆菌与布鲁氏菌双重套式PCR检测方法的建立及应用 被引量:2
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作者 吴昊天 满初日嘎 +9 位作者 刘昂 何美荣 侯思梦 李崇瑞 杜丽 陈巧玲 陈思 王凤阳 李昌 金宁一 《动物医学进展》 北大核心 2022年第11期12-17,共6页
为了建立一种高灵敏度和强特异性的羊多杀性巴氏杆菌与布鲁氏菌的双重检测方法,根据多杀性巴氏杆菌kmt1基因序列和布鲁氏菌BCSP31基因序列分别设计了内外两对引物,构建了双重套式PCR检测方法。结果表明,该方法可以特异性扩增kmt1和BCSP3... 为了建立一种高灵敏度和强特异性的羊多杀性巴氏杆菌与布鲁氏菌的双重检测方法,根据多杀性巴氏杆菌kmt1基因序列和布鲁氏菌BCSP31基因序列分别设计了内外两对引物,构建了双重套式PCR检测方法。结果表明,该方法可以特异性扩增kmt1和BCSP31片段,并能从多种组织样本的DNA中准确检测到多杀性巴氏杆菌与布鲁氏菌的核酸片段。检测沙门氏菌、猪链球菌、大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、海藻糖巴氏杆菌和斯氏假单胞菌均为阴性;对于kmt1的检测下限为70.9 copies/μL,对于BCSP31检测下限为89.5 copies/μL;用于检测动物的组织样本符合率为100%。建立的方法有良好的敏感性、特异性和适应性,可以用于动物检疫诊断。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 布鲁氏菌 套式PCR
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Research on design system of band conveyer driven by linear friction 被引量:1
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作者 JIA Chang-xi he mei-rong 《Journal of Coal Science & Engineering(China)》 2009年第4期440-444,共5页
The band conveyer driven by linear friction is a new device. It can reduce drivesize and conveyor belt tensity, and increase delivery capacity. It has feasibility and usability particularly in altering the original co... The band conveyer driven by linear friction is a new device. It can reduce drivesize and conveyor belt tensity, and increase delivery capacity. It has feasibility and usability particularly in altering the original conveyer and solving the problems of capacity insufficiency. The technology has brought certain difficulty for engineers, because it has certaindifficulty both in theory and in calculation. Therefore, Visual Basic 6.0 programming technology was used to develop a set of 'the design system of the band conveyer driven bylinear friction.' After being proved in the field, it can completely meet the demands of thedesign. This paper introduced its main theory or basis in design, so as to provide relatedtechnical support to this kind of project. 展开更多
关键词 line friction driven conveyor belt tensity design system
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