目的:采用网络药理学方法探讨杞蓉片治疗早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的作用机制。方法:在中药药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platfor...目的:采用网络药理学方法探讨杞蓉片治疗早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的作用机制。方法:在中药药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中获取杞蓉片的有效成分及相应靶点,同时查询人类基因数据库(Genecards)等数据库,获取疾病相关的靶点,并利用韦恩图(Venn)图与药物作用靶点取交集,筛选杞蓉片治疗POI的关键靶点。利用STRING平台建立预测靶蛋白之间的相互关系网络,根据联系密切程度筛选出核心靶标,用R语言进行核心靶标的基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)。结果:收集到符合筛选条件的杞蓉片活性成分102个,染料木素、槲皮素、芹菜素、β-谷固醇等化合物可能为其作用的主要活性成分,药物与POI共同靶点243个,其中肿瘤蛋白p53基因、丝氨酸/苏氨酸激酶1、转录激活因子3、肿瘤坏死因子、表皮生长因子受体、白细胞介素6在促分裂素原活化蛋白激酶、血管内皮生长因子为核心靶基因,通过KEGG通路分析显示,杞蓉片治疗POI的生物信号通路主要集中在磷脂酰肌醇3激酶和蛋白激酶B、缺氧诱导因子1等。分子对接结果显示大部分靶点与成分结合活性较强。结论:杞蓉片通过多种成分、多核心靶点参与了一系列通路,通过发挥多种生物、分子过程来治疗POI。展开更多
文摘目的:采用网络药理学方法探讨杞蓉片治疗早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的作用机制。方法:在中药药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中获取杞蓉片的有效成分及相应靶点,同时查询人类基因数据库(Genecards)等数据库,获取疾病相关的靶点,并利用韦恩图(Venn)图与药物作用靶点取交集,筛选杞蓉片治疗POI的关键靶点。利用STRING平台建立预测靶蛋白之间的相互关系网络,根据联系密切程度筛选出核心靶标,用R语言进行核心靶标的基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)。结果:收集到符合筛选条件的杞蓉片活性成分102个,染料木素、槲皮素、芹菜素、β-谷固醇等化合物可能为其作用的主要活性成分,药物与POI共同靶点243个,其中肿瘤蛋白p53基因、丝氨酸/苏氨酸激酶1、转录激活因子3、肿瘤坏死因子、表皮生长因子受体、白细胞介素6在促分裂素原活化蛋白激酶、血管内皮生长因子为核心靶基因,通过KEGG通路分析显示,杞蓉片治疗POI的生物信号通路主要集中在磷脂酰肌醇3激酶和蛋白激酶B、缺氧诱导因子1等。分子对接结果显示大部分靶点与成分结合活性较强。结论:杞蓉片通过多种成分、多核心靶点参与了一系列通路,通过发挥多种生物、分子过程来治疗POI。
