单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育与非生物胁迫响应中发挥非常重要的作用。利用妃子笑荔枝果实发育RNA-seq数据库,采用生物信息学分析方法,对荔枝Dof(LcDof)基因家族的基...单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育与非生物胁迫响应中发挥非常重要的作用。利用妃子笑荔枝果实发育RNA-seq数据库,采用生物信息学分析方法,对荔枝Dof(LcDof)基因家族的基本理化特性,亚细胞定位,蛋白质保守结构域,进化关系等进行分析,同时对LcDof基因家族在果实发育中的表达情况进行分析。结果表明:荔枝中包含有19个LcDof基因家族成员,LcDof编码蛋白范围在157~497个氨基酸残基(Amino acid,aa),对应的分子量为17.70~54.35 kDa,等电点(pI)范围为4.49~9.42;预测LcDof家族成员亚细胞定位均定位于细胞核。系统进化关系分析表明,LcDof基因家族分为4组(GroupⅠ~GroupⅣ),LcDof在不同发育阶段的表达模式不同,其中LcDof7、LcDof9、LcDof12、LcDof15在果肉不同发育时期表达量较高,而LcDof3、LcDof10、LcDof16、LcDof17、LcDof19表达量较低。展开更多
Ferrisia virgata （Cockerell） is a post with wide distribution and broad range of host plants, but apparently it has not yet known to be an important post in China. Survey on pests of longan （Dimocarpus longgana Lou...Ferrisia virgata （Cockerell） is a post with wide distribution and broad range of host plants, but apparently it has not yet known to be an important post in China. Survey on pests of longan （Dimocarpus longgana Lour. ） in Zhangjiang of Guangdong Province in 2011 found that F. virgata had caused serious damage on production of longan. The paper first reported damage status of F. virgata on longan and also preliminarily introduced field identification characterlstics and host plants of F. virgata reported.展开更多
文摘单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育与非生物胁迫响应中发挥非常重要的作用。利用妃子笑荔枝果实发育RNA-seq数据库,采用生物信息学分析方法,对荔枝Dof(LcDof)基因家族的基本理化特性,亚细胞定位,蛋白质保守结构域,进化关系等进行分析,同时对LcDof基因家族在果实发育中的表达情况进行分析。结果表明:荔枝中包含有19个LcDof基因家族成员,LcDof编码蛋白范围在157~497个氨基酸残基(Amino acid,aa),对应的分子量为17.70~54.35 kDa,等电点(pI)范围为4.49~9.42;预测LcDof家族成员亚细胞定位均定位于细胞核。系统进化关系分析表明,LcDof基因家族分为4组(GroupⅠ~GroupⅣ),LcDof在不同发育阶段的表达模式不同,其中LcDof7、LcDof9、LcDof12、LcDof15在果肉不同发育时期表达量较高,而LcDof3、LcDof10、LcDof16、LcDof17、LcDof19表达量较低。
基金Supported by Special Project for National Litchi and Longan Industrial Technology System (CARS-33)
文摘Ferrisia virgata （Cockerell） is a post with wide distribution and broad range of host plants, but apparently it has not yet known to be an important post in China. Survey on pests of longan （Dimocarpus longgana Lour. ） in Zhangjiang of Guangdong Province in 2011 found that F. virgata had caused serious damage on production of longan. The paper first reported damage status of F. virgata on longan and also preliminarily introduced field identification characterlstics and host plants of F. virgata reported.
