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RNAi在水稻病虫害防控中的应用研究进展
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作者 饶玉春 吴日成 +1 位作者 刘富远 戴若惠 《浙江师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第4期361-369,共9页
近年来,来自病原微生物和各类害虫的威胁限制了水稻的生长发育和稳产,亟需一种绿色可控的技术进行有效的生物防治.RNAi技术能够使病虫害相关基因表达下调,具有特异性强、安全性高等优点,相较于化学农药防治,RNAi技术大大降低了非靶标生... 近年来,来自病原微生物和各类害虫的威胁限制了水稻的生长发育和稳产,亟需一种绿色可控的技术进行有效的生物防治.RNAi技术能够使病虫害相关基因表达下调,具有特异性强、安全性高等优点,相较于化学农药防治,RNAi技术大大降低了非靶标生物(non-target organisms, NTOs)的危害.在农业领域,RNAi技术被寄予厚望,被誉为“农药史上的第三次革命”.通过查阅国内外相关文献,并分析、归纳后,综述了近年来RNAi在水稻抗病毒中的作用研究进展,重点阐述了水稻抗病虫害领域应用的最新研究成果,并针对RNAi沉默效率低、稳定性差等问题提出了不同RNAi的增强策略,为实现水稻病虫害精准高效的防治提供现实依据. 展开更多
关键词 RNAI 水稻 病虫害防控 作用模型 策略
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内折香茶菜的染色体数目及核型分析
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作者 杨东娟 陈艺琳 +4 位作者 苏晓芳 冼钰妍 冯艳冰 李瑶瑶 杨永利 《韩山师范学院学报》 2024年第3期31-35,共5页
用酶解去壁低渗火焰干燥法对内折香茶菜染色体数目及核型进行分析,结果表明:内折香茶菜属于二倍体,染色体数目为2n=52,基数为26;核型公式为K(2n)=52=28m+24sm,全组染色体总长为1.05μm,长臂总长为0.616μm.内折香茶菜的核型不对称系数为... 用酶解去壁低渗火焰干燥法对内折香茶菜染色体数目及核型进行分析,结果表明:内折香茶菜属于二倍体,染色体数目为2n=52,基数为26;核型公式为K(2n)=52=28m+24sm,全组染色体总长为1.05μm,长臂总长为0.616μm.内折香茶菜的核型不对称系数为61.36%,其核型类型属于Stebbins核型分类中的“2B”类型. 展开更多
关键词 内折香茶菜 染色体数目 核型分析
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基于iBeacon技术的实时教学考评系统设计
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作者 陆飞 唐建清 +1 位作者 黄华赋 陈瑞均 《韩山师范学院学报》 2024年第3期87-94,共8页
为实现教学的全过程监测,在教学场地安装若干iBeacon基站,开发专用的教学考勤与评价APP,通过智能手机进行学生身份验证,采用基于位置指纹辅助判断的单点RSSI测距定位算法实现考勤签到,进行实时的课堂考勤、课堂教学、学习评价和教学反... 为实现教学的全过程监测,在教学场地安装若干iBeacon基站,开发专用的教学考勤与评价APP,通过智能手机进行学生身份验证,采用基于位置指纹辅助判断的单点RSSI测距定位算法实现考勤签到,进行实时的课堂考勤、课堂教学、学习评价和教学反馈相关数据采集,长期保存并分析数据,及时将教学反馈信息推送到教师端.测试数据表明,系统有效提高了教学过程的效率与质量. 展开更多
关键词 iBeacon 考勤 教学评价
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转录组分析番茄矮化突变体dwt的相关基因 被引量:1
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作者 王倩 杨军 +4 位作者 陈卫英 文国琴 杨鹏 李正国 邹建 《西华师范大学学报(自然科学版)》 2024年第2期134-141,共8页
为了挖掘番茄(Solanum lycopersicum)株高发育调控相关基因,本文以樱桃番茄Micro Tom及其矮化突变体dwt为材料,通过转录组测序和表达水平分析筛选鉴定到15个与株高发育调控相关的候选基因。其中,TCH4-like1、TCH4-like2、ABAR7、ABAR10... 为了挖掘番茄(Solanum lycopersicum)株高发育调控相关基因,本文以樱桃番茄Micro Tom及其矮化突变体dwt为材料,通过转录组测序和表达水平分析筛选鉴定到15个与株高发育调控相关的候选基因。其中,TCH4-like1、TCH4-like2、ABAR7、ABAR10、PP2C7、PP2C13和PR1等基因的表达异常,从而影响BRs、ABA和SA信号途径,并抑制番茄的生长,进而导致dwt番茄矮化。同时,ABAR7、ABAR10、PP2C7、PP2C13、PR1等基因与WRKY33、MPK3基因共同影响MAPK信号途径,从而调控dwt突变体矮化性状的形成。另外,peroxidase-like1、peroxidase-like2和peroxidase-like3等基因的表达受到强烈抑制,从而影响dwt木质素合成,并促成dwt的矮化特征形成。结果可为番茄株高发育调控中关键调控基因的鉴定奠定良好基础,同时也为番茄矮化育种提供重要线索。 展开更多
关键词 番茄 矮化 转录组测序 激素
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小黑杨Rubisco小亚基基因启动子的克隆及表达活性分析
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作者 曹佳玉 曹丽娜 +7 位作者 张俏艺 张双 胡志宝 赵唐锐 许志茹 李春明 全先奎 刘关君 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期625-633,共9页
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)是光合作用中决定碳同化速率的关键酶,其中小亚基(rbcS)是由核基因编码,并且主要在叶片中表达。利用RT-qPCR技术确定了小黑杨(Populus×xiaohei)叶片中高表达的Rubisco小亚基基因PxrbcS1和P... 核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)是光合作用中决定碳同化速率的关键酶,其中小亚基(rbcS)是由核基因编码,并且主要在叶片中表达。利用RT-qPCR技术确定了小黑杨(Populus×xiaohei)叶片中高表达的Rubisco小亚基基因PxrbcS1和PxrbcS2基因,并克隆了其上游2 240、2 174 bp的启动子。对其进行启动子元件分析结果表明,PxrbcS1和PxrbcS2的启动子具有多个与光诱导表达相关的元件,例如G-box、MRE和Box4等元件。构建pBI-121-p PxrbcS1::GUS和pBI-121-p PxrbcS2::GUS植物表达载体并遗传转化84K杨(P. alba×P. glandulosa)。GUS组织化学染色以及qPCR表达分析表明PxrbcS1和PxrbcS2的启动子能够驱动GUS基因在84K杨叶片特异性高表达。总之,上述结果表明该研究成功地从小黑杨中克隆了具有叶片高表达活性的PxrbcS1和PxrbcS2的启动子,该启动子可应用到包括杨树在内的植物光合作用相关的基因功能研究以及提高植物光合作用的遗传操作中。 展开更多
关键词 杨树 Rubisco小亚基启动子 克隆 调控元件 遗传转化 GUS染色
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水稻株型的遗传基础与分子调控机理研究进展
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作者 杨得正 付惠仙 +4 位作者 肖素勤 雷凌云 李天时 程在全 刘丽 《生物技术进展》 2024年第3期349-359,共11页
高产是水稻育种的主要目标之一,而水稻株型对水稻产量具有决定性作用。从基因层面上解析水稻株型的形成机理是利用分子育种技术培育理想株型的前提和条件。从理想株型的概念、叶片形态和穗部性状、水稻株型的重要激素调控机制、株型相... 高产是水稻育种的主要目标之一,而水稻株型对水稻产量具有决定性作用。从基因层面上解析水稻株型的形成机理是利用分子育种技术培育理想株型的前提和条件。从理想株型的概念、叶片形态和穗部性状、水稻株型的重要激素调控机制、株型相关基因的克隆与功能研究等方面总结了水稻理想株型的研究进展,分析了现有研究存在的问题,并提出未来水稻株型的研究方向,以期为通过株型改良提高水稻产量及培育超高产水稻品种提供参考。 展开更多
关键词 水稻 株型 激素调控 遗传基础 分子调控
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水稻短穗小粒突变体spsg的鉴定与基因定位
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作者 王紫瑶 罗会超 +4 位作者 刘鹏程 叶亚峰 马伯军 刘斌美 陈析丰 《浙江师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第4期418-427,共10页
为研究穗发育相关基因的分子机制,对水稻“武运粳7号”辐射诱变,筛选到1个短穗小粒突变体spsg(short panicle and small grain),调查统计了该突变体的各项农艺性状,对其粒子进行扫描电镜观察,利用图位克隆技术对目的基因进行精细定位、... 为研究穗发育相关基因的分子机制,对水稻“武运粳7号”辐射诱变,筛选到1个短穗小粒突变体spsg(short panicle and small grain),调查统计了该突变体的各项农艺性状,对其粒子进行扫描电镜观察,利用图位克隆技术对目的基因进行精细定位、测序鉴定及穗长相关的单倍型分析.结果表明:与野生型对照相比,突变体spsg的一级枝梗数和每穗粒数显著下降,粒长和粒宽均变小,导致穗长显著变短;该突变体的籽粒颖壳表皮细胞的长度变短;目的基因定位在水稻第11号染色体的190 kb区间内,对候选基因的测序发现,SP1(short panicle 1)基因的编码区因缺失11个碱基而发生移码突变,spsg是SP1基因的1个新等位变异;SPSG基因在籼、粳型水稻品种间存在明显的分化,籼稻品种的单倍型穗长显著优于粳稻品种.研究结果为深入解析水稻穗发育的分子机制提供了一定的理论依据. 展开更多
关键词 水稻 短穗 小粒 基因定位 单倍型分析
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基于叶绿体基因rbcL和trnL-F序列的河北省野生苔草属亲缘关系分析
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作者 周欣莹 董彦娜 +4 位作者 邱玉鹏 孙浩男 刘亚伟 李艳 刘冬云 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期2728-2736,共9页
为研究河北省野生苔草属(Carex)植物的亲缘关系,本研究以43种河北省野生苔草及国外引种的27份苔草种质为试验材料,克隆了叶绿体基因rbcL和trnL-F序列,进行遗传多样性及亲缘关系分析,并构建了系统发育树。结果表明,从70份苔草属植物中成... 为研究河北省野生苔草属(Carex)植物的亲缘关系,本研究以43种河北省野生苔草及国外引种的27份苔草种质为试验材料,克隆了叶绿体基因rbcL和trnL-F序列,进行遗传多样性及亲缘关系分析,并构建了系统发育树。结果表明,从70份苔草属植物中成功克隆到的rbcL和trnL-F序列数量分别为67条、60条,测序成功率分别为95.7%、85.7%,经正反序列拼接对齐获得序列长度分别为716 bp、976 bp,并上传至NCBI获得登录号。二者合并得到59条序列,长度为1692 bp。rbcL,trnL-F以及合并序列分别定义了43,56,58个单倍型。基于合并序列的59份种质间遗传距离为0~0.0421,平均遗传距离为0.0142,整体划分为3大类,与形态学分类基本相符。trnL-F序列有望开发为DNA条形码,以期为苔草属的分类鉴定、系统发育等研究提供依据。 展开更多
关键词 苔草属 RBCL TRNL-F 亲缘关系 遗传多样性
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生物信息实践类课程思政的设计与实践
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作者 刘艳 张敬 +3 位作者 陈平 唐凯临 吕爱平 朱瑞新 《实验室科学》 2024年第3期207-210,共4页
课程思政是高等学校在专业课程教学过程中实现立德树人的重要途径。生物信息课程设计是一门生物医学类综合实践课程,结合当今抗疫形势,通过“新冠药物的发现与再利用”项目设计开展教学活动,将思政元素自然地融入课程中,构建典型的思政... 课程思政是高等学校在专业课程教学过程中实现立德树人的重要途径。生物信息课程设计是一门生物医学类综合实践课程,结合当今抗疫形势,通过“新冠药物的发现与再利用”项目设计开展教学活动,将思政元素自然地融入课程中,构建典型的思政教学案例,将理论知识、实践训练与育人教育相辅相成,遵循学生的学习成长规律和实际需求,锻炼并培养学生解决突发性公共卫生的基础研究能力。 展开更多
关键词 课程思政 实验教学 生物信息 课程设计
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珙桐AP2/ERF家族相关基因的克隆及功能鉴定
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作者 曾沥 孙曼丽 +2 位作者 刘晋芸 胡小盼 魏炜 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期159-167,共9页
为探究AP2/ERF类转录因子在珙桐开花调控及花器官发育中的作用,本研究通过从实验室珙桐不同发育时期苞片和叶片的转录组数据中筛选出调控珙桐苞片发育相关AP2/ERF家族基因DiAP2-1、DiDREB-1和DiRAV-1,经过生物信息学分析、基因克隆及功... 为探究AP2/ERF类转录因子在珙桐开花调控及花器官发育中的作用,本研究通过从实验室珙桐不同发育时期苞片和叶片的转录组数据中筛选出调控珙桐苞片发育相关AP2/ERF家族基因DiAP2-1、DiDREB-1和DiRAV-1,经过生物信息学分析、基因克隆及功能鉴定初步研究了目的基因在珙桐苞片发育过程中的调控机制.亚细胞定位实验显示DiAP2-1主要定位于细胞质,DiDREB-1和DiRAV-1主要定位于细胞核.对目的基因在珙桐中的表达模式分析发现DiAP2-1和DiRAV-1在苞片发育过程中表达量逐渐降低,DiDREB-1只在苞片第三时期高表达,推测DiDREB-1、DiRAV-1属于A类基因,DiAP2-1属于B类基因.表型实验显示DiDREB-1和DiRAV-1转基因拟南芥株系较野生型表现为明显的早花,DiAP2-1同源基因对应的拟南芥突变体与同一时期野生型拟南芥对比表现为花瓣减少且萼片大,角果呈短粗状且败育.对关键开花调控基因表达模式分析发现DiDREB-1和DiRAV-1异源表达后使其他促花因子表达量上调进而使拟南芥花期提前.以上结果表明,AP2/ERF类转录因子DiAP2-1、DiDREB-1和DiRAV-1在珙桐苞片及花器官发育和珙桐开花调控中发挥了重要作用. 展开更多
关键词 珙桐 花器官 苞片 AP2/ERF
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褐角苔遗传转化体系的建立
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作者 黄丹 彭涛 +4 位作者 姜山 王顺莉 李旭强 马怀富 盛福源 《广西科学》 CAS 北大核心 2024年第3期469-477,共9页
本研究旨在筛选适用于农杆菌(Agrobacterium)介导的角苔植物遗传转化体系,为今后研究早期陆生植物的进化提供理论基础。实验使用携带p CAMBIA1305.2质粒的农杆菌AGL1菌株对褐角苔(Folioceros fuciformis)外植体进行侵染,将潮霉素作为筛... 本研究旨在筛选适用于农杆菌(Agrobacterium)介导的角苔植物遗传转化体系,为今后研究早期陆生植物的进化提供理论基础。实验使用携带p CAMBIA1305.2质粒的农杆菌AGL1菌株对褐角苔(Folioceros fuciformis)外植体进行侵染,将潮霉素作为筛选标记,通过比较外植体预培养时间、菌液OD值、菌液添加量、乙酰丁香酮(AS)浓度和共培养时间来构建该物种的遗传转化体系。结果表明,褐角苔抗性植株筛选所用潮霉素的最适浓度为15 mg/L,预培养4 d的外植体侵染后状态最好。最佳侵染条件为共培养基中添加80μL OD600为0.8的农杆菌菌液,AS浓度为100μmol/L,共培养时间为3 d。通过潮霉素筛选、PCR、实时荧光定量PCR(RT-q PCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)染色鉴定获得转基因植株褐角苔。研究结果可为后续角苔植物基因功能的研究提供技术支持。 展开更多
关键词 褐角苔 外植体 农杆菌介导法 遗传转化体系
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西瓜深绿色果皮底色基因初步定位及候选基因预测
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作者 安伯函 张艳玲 +6 位作者 郭宇 袁成志 朱宇萌 刘秀杰 刘继秀 高越 高美玲 《高师理科学刊》 2024年第6期62-67,80,共7页
果皮颜色是西瓜重要的外观性状,国内外学者研究发现,在不同遗传背景下,其调控基因不同.以深绿和浅绿果皮底色小果型西瓜品系K2,L1为母本和父本构建F_(2)遗传群体,对所构建遗传群体开展了果皮底色的基因初步定位.在实验室前期将高密度遗... 果皮颜色是西瓜重要的外观性状,国内外学者研究发现,在不同遗传背景下,其调控基因不同.以深绿和浅绿果皮底色小果型西瓜品系K2,L1为母本和父本构建F_(2)遗传群体,对所构建遗传群体开展了果皮底色的基因初步定位.在实验室前期将高密度遗传图谱定位果皮底色基因FRC在八号染色体2.01 Mb的基础上,将FRC基因定位到了83.5 kb区段内(27 911 305~27 994 761bp).根据西瓜基因组“97103V2”的注释信息,发现在目标区段内包含15个已注释的基因,初步推测Cla97C08G161570为西瓜果皮底色候选基因,编码2-植基-1,4-萘醌甲基转移酶,该酶参与叶绿醌的生物合成,研究结果为西瓜果皮底色育种和精细定位果皮底色基因打下了基础. 展开更多
关键词 西瓜 果皮底色 基因定位 候选基因
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冰薰2号薰衣草ISSR-PCR反应体系优化及遗传特征分析
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作者 李瑞航 李婧 +7 位作者 马天意 郭佳欣 张梅娟 彭疑芳 王韬 闫爽 赵井泉 沙伟 《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》 2024年第3期63-68,88,共7页
为探究冰薰2号薰衣草的遗传特征,采用ISSR分子标记技术在优化反应体系的基础上对冰薰2号薰衣草亲代及F1代个体进行遗传多样性分析。结果显示,优化的最佳ISSR-PCR扩增体系为:在20μL体系中,dNTP(每种2.5 mmol/L)用量为1.4μL,引物(10μmo... 为探究冰薰2号薰衣草的遗传特征,采用ISSR分子标记技术在优化反应体系的基础上对冰薰2号薰衣草亲代及F1代个体进行遗传多样性分析。结果显示,优化的最佳ISSR-PCR扩增体系为:在20μL体系中,dNTP(每种2.5 mmol/L)用量为1.4μL,引物(10μmol/L)用量为0.7μL,DNA模板量为20 ng,Taq DNA聚合酶用量0.75μmol/min。选取8个ISSR引物对冰薰2号薰衣草亲代及F1代个体进行试验,根据扩增结果进行计算,并分析亲代及F1代个体间遗传多样性指数。结果表明,冰薰2号薰衣草遗传多样性水平低,遗传变异度低。 展开更多
关键词 薰衣草 ISSR 分子标记 遗传特征 遗传多样性
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基于ISSR标记的冰薰1号薰衣草亲本及其F1代遗传多样性分析
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作者 郭佳欣 李瑞航 +8 位作者 马天意 张梅娟 蔡璨 王韬 彭疑芳 黄荣雁 阎爽 赵井泉 沙伟 《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》 2024年第1期67-74,共8页
为探究实验室培育的冰薰1号薰衣草的亲代和子代的遗传多样性,选用32株冰薰1号植株为亲本,及其中6株亲本的F1代群体为试验材料,在进行PCR反应体系优化的基础上,采用ISSR分子标记技术对冰薰1号的亲本群体及自由授粉的F1代群体进行遗传多... 为探究实验室培育的冰薰1号薰衣草的亲代和子代的遗传多样性,选用32株冰薰1号植株为亲本,及其中6株亲本的F1代群体为试验材料,在进行PCR反应体系优化的基础上,采用ISSR分子标记技术对冰薰1号的亲本群体及自由授粉的F1代群体进行遗传多样性分析。筛选的最佳PCR反应体系为:总体积20μL,rTaq 1.0μmol/min,引物浓度为0.7μmol/L,dNTP浓度为0.3 mmol/L,DNA模板浓度为40 ng/μL,最适反应循环数为35。ISSR分析结果表明,冰薰1号薰衣草个体间遗传距离较近,遗传多样性水平较低,遗传稳定。 展开更多
关键词 薰衣草 ISSR-PCR 体系优化 遗传特征
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滇魔芋与南蛇棒种间杂交种的遗传多样性研究
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作者 殷斯 董坤 +1 位作者 袁晶晶 高永 《曲靖师范学院学报》 2024年第3期50-55,共6页
由于魔芋葡甘聚糖在食品、医药等方面的重要价值,魔芋属(Amorphophallus)物种发展为我国西南地区重要的经济作物.为加快优质魔芋杂交种质资源的应用,通过简单重复序列(SSR)标记对滇魔芋(A.yunnanensis)、南蛇棒(A.dunnii)及其杂交种进... 由于魔芋葡甘聚糖在食品、医药等方面的重要价值,魔芋属(Amorphophallus)物种发展为我国西南地区重要的经济作物.为加快优质魔芋杂交种质资源的应用,通过简单重复序列(SSR)标记对滇魔芋(A.yunnanensis)、南蛇棒(A.dunnii)及其杂交种进行了基因分型,并评估了杂交种的遗传多样性,鉴定了杂交种与亲本的亲缘关系.研究结果显示,滇魔芋和杂交种的等位基因数最高,为1.750;而南蛇棒的Shannon指数(I)、表观杂合度(Ho)和预期杂合度(He)最高.杂交种与亲本物种的遗传多样性总体差异不大,这可能与野生亲本物种的遗传多样性较丰富有关.同时,SSR标记可以将杂交种完全鉴定出来,但杂交种与母本滇魔芋的亲缘关系更近,表明母本在杂交过程中产生了更大的遗传影响.这些发现为后续魔芋的分子辅助育种工作提供了新的思路和方向. 展开更多
关键词 滇魔芋 南蛇棒 杂交种 SSR标记
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MADS-box基因家族调控毛茛目植物花器官发育的研究进展
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作者 韩凝 李甜 +2 位作者 李凤娇 唐彩彩 张铮 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期42-54,共13页
毛茛目植物花器官具有复杂多样的特点,是研究花器官形态与遗传进化相关问题的理想植物类群。通过综述毛茛目植物花器官形态的多样性,结合毛茛目基因组、转录组以及芸香唐松草(Thalictrum thalictroides)、蓝花耧斗菜(Aquilegia coulela... 毛茛目植物花器官具有复杂多样的特点,是研究花器官形态与遗传进化相关问题的理想植物类群。通过综述毛茛目植物花器官形态的多样性,结合毛茛目基因组、转录组以及芸香唐松草(Thalictrum thalictroides)、蓝花耧斗菜(Aquilegia coulela)、黑种草(Nigella damascena)、花菱草(Eschscholzia californica)等几个代表物种的花发育研究现状,阐述了当前MADS-box基因家族A、B、C、D、E类基因的功能及其下游靶基因的研究成果,并对未来毛茛目植物花发育的研究切入点和可能面临的挑战进行展望,旨在丰富对基部真双子叶植物花器官发育分子调控途径的理解。 展开更多
关键词 毛茛目 花器官发育 MADS-box基因家族 基部真双子叶植物
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芥菜紫色叶片相关分子标记的开发和应用
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作者 衡双平 崔梦迪 +5 位作者 李晓琳 张梦珂 郑凤 曾威 邢锋 毛光志 《信阳师范学院学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期360-365,共6页
针对紫叶芥菜和绿叶芥菜基因型鉴定问题,以紫叶芥菜ZiYi和绿叶芥菜LvYi亲本及其构建的F1和F2群体为研究材料,采用分子标记方法,研究了BjPur基因在双亲之间的差异,并开发了2对叶色特异的分子标记。进一步利用这2对分子标记对8份紫叶和红... 针对紫叶芥菜和绿叶芥菜基因型鉴定问题,以紫叶芥菜ZiYi和绿叶芥菜LvYi亲本及其构建的F1和F2群体为研究材料,采用分子标记方法,研究了BjPur基因在双亲之间的差异,并开发了2对叶色特异的分子标记。进一步利用这2对分子标记对8份紫叶和红叶芥菜的基因型进行了鉴定。结果显示,利用这些分子标记能够快速区分芥菜不同叶色材料的基因型。 展开更多
关键词 芥菜 紫叶 BjPur基因 基因型 分子标记
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基于转录组的非洲菊GID1家族成员鉴定、分子特性与进化分析
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作者 姜乃钰 《集宁师范学院学报》 2024年第3期71-77,共7页
非洲菊作为世界性鲜切花,具有观赏价值和经济价值。本研究应用生物信息学分析手段,在非洲菊全转录组中鉴定到5个赤霉素代谢相关受体蛋白GID1的家族成员(GID1-like1,GID1-like2,GID1-like3,GID1-like4,GID1-like5)。其理化性质分析结果显... 非洲菊作为世界性鲜切花,具有观赏价值和经济价值。本研究应用生物信息学分析手段,在非洲菊全转录组中鉴定到5个赤霉素代谢相关受体蛋白GID1的家族成员(GID1-like1,GID1-like2,GID1-like3,GID1-like4,GID1-like5)。其理化性质分析结果显示:非洲菊GID1家族多为酸性,具有亲水性的非分泌蛋白,多数具有跨膜结构,其主要构成元件为α-螺旋和无规则卷曲;进化树分析结果表明,非洲菊GID1家族主要为四大分支,所挖掘到的GID1-like3和GID1-like4属于第一大分支,而GID1-like1、GID1-like2、GID1-like5同属于第三大分支;家族互作网络及蛋白保守结构域预测结果显示,GID1家族可能参与植物生长发育过程中赤霉素传导过程。研究结果将为揭示GID1家族在非洲菊赤霉素代谢途径中的生物学功能及非洲菊品种优化提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 非洲菊 赤霉素 GID1 进化分析
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上海市浦东地区109664例人乳头瘤病毒基因分型结果分析
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作者 胡亮 张泽 +3 位作者 窦馨 李明超 周冰鹤 常东 《检验医学》 CAS 2024年第8期810-814,共5页
目的分析人乳头瘤病毒(HPV)样本检测结果,了解上海市浦东地区HPV感染情况,为宫颈癌防治提供依据。方法回顾性分析复旦大学附属浦东医院2016—2023年109664例门诊、住院患者和体检者HPV基因分型结果,结合临床资料,分析HPV感染情况。结果1... 目的分析人乳头瘤病毒(HPV)样本检测结果,了解上海市浦东地区HPV感染情况,为宫颈癌防治提供依据。方法回顾性分析复旦大学附属浦东医院2016—2023年109664例门诊、住院患者和体检者HPV基因分型结果,结合临床资料,分析HPV感染情况。结果109664例HPV样本的阳性率为18.97%(20801例),年阳性率整体呈下降趋势(P<0.01);试剂盒可检测的21种HPV基因亚型均有检出,感染率居前6位的HPV亚型分别是52型(21.82%)、16型(13.47%)、58型(13.29%)、53型(11.85%)、39型(9.90%)和81型(9.37%)。不同年份HPV阳性亚型的分布有所不同。不同年龄组HPV感染率不同(P<0.01),≤20岁组最高(34.09%),31~40岁组最低(16.43%)。HPV混合感染中,2~9重感染均有检出,但以单一感染为主(73.55%)。男性居前3位的HPV阳性亚型分别是6型(22.92%)、11型(18.34%)和58型(7.45%),女性居前3位的HPV阳性亚型分别是52型(17.97%)、16型(10.80%)和58型(10.71%)。结论上海市浦东地区HPV感染率稍高,但年感染率呈下降趋势,且以单一感染为主,不同年份HPV阳性亚型的分布有一定变化,不同年龄组感染率不同,不同性别感染的主要亚型不同。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因亚型 上海 浦东
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河北省野生苔草属植物ISSR分子标记开发及亲缘关系分析 被引量:3
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作者 周欣莹 耿宇航 +3 位作者 贾艳艳 孙浩男 刘冬云 李艳 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2949-2959,共11页
为研究野生苔草属植物的亲缘关系,本研究以河北省33种野生苔草属植物及国外引种的20份苔草属种质为试验材料,采用单因素试验和正交试验,建立并优化了ISSR标记体系,并筛选出12条引物用于研究它们的亲缘关系及遗传多样性。结果表明:在25μ... 为研究野生苔草属植物的亲缘关系,本研究以河北省33种野生苔草属植物及国外引种的20份苔草属种质为试验材料,采用单因素试验和正交试验,建立并优化了ISSR标记体系,并筛选出12条引物用于研究它们的亲缘关系及遗传多样性。结果表明:在25μL的反应体系中,DNA模板80 ng,引物浓度为5μmol·L^(-1),Master Mix用量11μL,循环数48个为最佳配比。筛选出的12条ISSR引物共扩增出197个条带,多态性位点百分率为100%,可将33种河北省野生苔草属植物完全区分,但国外种质无法完全区分。在遗传距离为0.768时,53份苔草属种质可划分为6类,聚类结果与形态学分类的结果基本吻合,种间亲缘关系与地理环境有一定的相关性,以期为河北省野生苔草属的分类鉴定和指纹图谱构建提供一定理论依据。 展开更多
关键词 苔草属 ISSR 亲缘关系 遗传多样性
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