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基于装置得分的北太平洋波浪能资源评估
1
作者 刘威 时健 +1 位作者 张弛 陶爱峰 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期63-71,共9页
针对波浪能发电量取决于当地波浪特征和波浪能发电装置,而传统单一的波能流密度评估法则只考虑了地区波浪特性,未结合装置加以分析,评估结果偏向理论的问题,本文利用欧洲中期天气预报中心(European Centre for Medium-Range Weather For... 针对波浪能发电量取决于当地波浪特征和波浪能发电装置,而传统单一的波能流密度评估法则只考虑了地区波浪特性,未结合装置加以分析,评估结果偏向理论的问题,本文利用欧洲中期天气预报中心(European Centre for Medium-Range Weather Forecasts, ECMWF)提供的第五代大气再分析数据集(ECMWF Reanalysis v5, ERA5)中的再分析波浪数据,通过装置得分的波浪能评估方法对北太平洋区域1979—2020年波浪能的空间分布进行了分析。结果表明:在本研究所涉及的地区中,纬度较高的地区波能流密度大且装置得分高,本研究所用评估方法的结论同传统评估方法一致,但在中国南海和部分太平洋纬度较低的地区,发电装置有着较好的连续发电条件,发电效率较高。不同装置间的适配区域也有很大不同,AquaBuoy和Pelamis装置的最佳适用区位于北太平洋纬度较高的地区,而Wave Dragon装置的最佳适用区范围更广,在150°E—160°W之间的纬度较低的地区也表现突出。对于中国南海海域,AquaBuoy装置的适配性最好,而北太平洋纬度较高的地区则最适合布置Pelamis装置,北太平洋纬度中游和较低区域最适合布置Wave Dragon装置。 展开更多
关键词 第五代大气再分析数据集 北太平洋 可利用波浪能 AquaBuoy装置 Pelamis装置 Wave Dragon装置
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山药颗粒结合型淀粉合成酶基因DaGBSS的克隆与分析
2
作者 王培龙 徐婉 +5 位作者 杨燕萍 付双彬 应震 杨周祥 姚丽娟 周庄 《中国粮油学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期79-88,共10页
颗粒结合型淀粉合成酶(granule-bound starch synthase,GBSS)是一种能够决定直链淀粉生物合成的关键性酶。通过对山药转录组分析、分子克隆获得一个具有完整ORF的DaGBSS基因,cDNA片段长度为1845 bp,编码614个氨基酸。生物信息学分析结... 颗粒结合型淀粉合成酶(granule-bound starch synthase,GBSS)是一种能够决定直链淀粉生物合成的关键性酶。通过对山药转录组分析、分子克隆获得一个具有完整ORF的DaGBSS基因,cDNA片段长度为1845 bp,编码614个氨基酸。生物信息学分析结果显示DaGBSS蛋白为一酸性稳定蛋白,含有淀粉合酶催化和糖基转移酶2个功能结构域。多序列比对结果显示:糯米山药DaGBSS蛋白与所选的物种具有较高的同源性,且含有典型的功能结构域;生物进化分析结果显示DaGBSS蛋白与圆形薯蓣亚种进化亲缘关系最近。对采收15 d山药块茎进行处理,qRT-PCR、指标分析结果显示DaGBSS基因在山药块茎的表达存在明显的时空差异性,且在距离地表位置最远的部位DaGBSS基因的表达量、GBSS和直链淀粉的含量均为最高。研究通过对山药块茎淀粉合成的早期阶段进行生理、关键调控因子的克隆分析,为探究山药淀粉合成的调控提供参考,同时对糯米山药的分子育种提供了重要的基因资源。 展开更多
关键词 山药 GBSS基因 基因克隆 qRT-PCR分析
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Sirt1在衰老性肌萎缩中的作用
3
作者 莫夏 杨威 +1 位作者 陈宁 范晶晶 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第1期242-249,共8页
骨骼肌是人体中最大的分泌器官,也是主要的钙、磷存储仓,占人体质量的40%~50%,其分泌的肌因子不仅维持自身功能,还与其他组织器官存在广泛的交互作用,对人体健康至关重要(1)。衰老性肌萎缩是一种以肌肉质量下降和功能衰退为主要特征的... 骨骼肌是人体中最大的分泌器官,也是主要的钙、磷存储仓,占人体质量的40%~50%,其分泌的肌因子不仅维持自身功能,还与其他组织器官存在广泛的交互作用,对人体健康至关重要(1)。衰老性肌萎缩是一种以肌肉质量下降和功能衰退为主要特征的增龄性疾病。根据欧洲衰老性肌萎缩症工作组的定义,社区老年人中患肌肉衰减症的比例为1%~29%,长期接受护理的人群则高达14%~33%(2)。衰老性肌萎缩症不仅严重影响患者的生活质量,还给社会带来了巨大的经济负担(3)。因此,明确衰老性肌萎缩症的病理机制具有重要价值。研究显示,衰老性肌萎缩症与卫星细胞、线粒体和神经肌肉接头(NMJ)的功能紊乱及微小核糖核酸(miRNAs)的表达异常有关,并且伴随着自噬功能下降(4~7)。随着研究的深入,人们发现沉默信息调节因子(Sirt)1在骨骼肌生理病理过程中具有重要作用(8)。本文将从卫星细胞、线粒体、NMJ、自噬及miRNAs方面探讨Sirt1调控衰老性肌萎缩的作用机制,并探讨有效的预防和治疗方式。 展开更多
关键词 沉默信息调节因子1 自噬 微小RNA 白藜芦醇 运动 衰老性肌萎缩 衰老
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尖吻蝮蛇毒腺的缓激肽2型受体结合多肽的筛选与验证
4
作者 蒋安娜 刘杨 +2 位作者 刘桂娜 唐业忠 陆方 《四川动物》 北大核心 2024年第4期361-372,共12页
蛇毒已被证明具有抗炎活性,其中包含许多免疫原性弱、活性强的短肽小分子。蛇毒腺是分泌毒液的器官,含有毒素成分及调控其分泌过程的大量生物活性成分。缓激肽2型受体(B2R)参与重要的细胞内信号通路,作为炎症的调节因子成为潜在的抗炎... 蛇毒已被证明具有抗炎活性,其中包含许多免疫原性弱、活性强的短肽小分子。蛇毒腺是分泌毒液的器官,含有毒素成分及调控其分泌过程的大量生物活性成分。缓激肽2型受体(B2R)参与重要的细胞内信号通路,作为炎症的调节因子成为潜在的抗炎药物开发的靶点。为了获得特异性的B2R结合肽,利用尖吻蝮蛇Deinagkistro-don acutus毒腺T7噬菌体文库对靶点B2R进行3轮生物淘选,测序获得了多个具有潜在结合能力的序列。通过序列长度、溶解性预测、稳定性预测和分子对接等一系列生物信息学分析,最终确定1个含25个氨基酸的肽段,命名为DAvp-4。合成该肽段,通过表面等离子体共振技术验证了DAvp-4和B2R的结合能力,在脂多糖诱导的巨噬细胞模型及糖尿病视网膜病变小鼠模型中肯定了其抗炎作用。此研究不但获得了一个具有成药潜力的毒腺多肽,还显示了噬菌体展示技术在筛选天然产物成分研究中的有效性。 展开更多
关键词 噬菌体展示 毒腺 表面等离子体共振 缓激肽2型受体
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乳腺癌中长非编码RNA及LncRNA编码多肽的功能 被引量：2
5
作者 郭艾敏 朱爽 张军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期312-321,共10页
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的序列长度超过200核苷酸(nucleotide,nt),部分可编码多肽。生物信息分析和多组学技术已被用于在乳腺癌中批量鉴定lncRNA与lncRNA编码肽。本文通过在线软件分析了Spencer数据库中收录的919个lnc... 长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的序列长度超过200核苷酸(nucleotide,nt),部分可编码多肽。生物信息分析和多组学技术已被用于在乳腺癌中批量鉴定lncRNA与lncRNA编码肽。本文通过在线软件分析了Spencer数据库中收录的919个lncRNA编码的乳腺癌肿瘤特异性多肽,结果显示,这些多肽涉及抗癌、抗炎和细胞穿透等活性。乳腺癌的发生发展与lncRNAs的异常表达密切相关,lncRNAs通过编码多肽、调控表观遗传、调节免疫等多种途径影响乳腺癌发展。部分lncRNA编码肽独立于lncRNA,通过表观遗传调控、抑制血管生成等途径调控乳腺癌的发展。lncRNA与lncRNA编码肽在乳腺癌的诊断与治疗中也有较大的应用潜力。因此,本文系统综述了lncRNA与lncRNA编码肽在乳腺癌发生发展与诊断治疗中的作用,对该研究领域目前存在的问题和挑战进行了分析。 展开更多
关键词 乳腺癌 长非编码RNA 长非编码RNA编码肽
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鼠尾藻生殖托不同生长阶段的附生细菌多样性研究
6
作者 秦子懿 陈军 +2 位作者 臧宇 杨智博 唐学玺 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期98-107,共10页
为探明雌雄异株大型海藻——鼠尾藻(Sargassum thunbergii)生殖组织附生细菌群落结构是否随生殖组织的生长而发生相应变化,本研究通过高通量测序技术对鼠尾藻生殖托不同生长时期的附生细菌群落进行了分析。结果显示:变形菌门(Proteobact... 为探明雌雄异株大型海藻——鼠尾藻(Sargassum thunbergii)生殖组织附生细菌群落结构是否随生殖组织的生长而发生相应变化,本研究通过高通量测序技术对鼠尾藻生殖托不同生长时期的附生细菌群落进行了分析。结果显示:变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是其核心菌门,与其他大型海藻附生细菌的组成类似;α多样性分析显示鼠尾藻生殖托生长初期阶段的附生细菌群落均匀程度更高;β多样性分析显示鼠尾藻生殖托附生细菌群落在不同生长阶段存在显著差异,且性别可能是影响鼠尾藻生殖托附生细菌群落结构组成的一个重要因素;线性判别分析效应量(Line discriminant analysis effect size, LEfSe)软件分析显示,鼠尾藻生殖托在生长初期、生长中期以及成熟期的附生微生物中分别包含11、15和4个可能与自身发育相关的生物标志物。本研究初步揭示了鼠尾藻生殖托附生细菌的多样性和复杂性,为今后精细刻画鼠尾藻藻体与其附生微生物之间相关作用的网络提供了基础数据,也为鼠尾藻的保护和利用提供了新的见解。 展开更多
关键词 雌雄异株大型海藻 鼠尾藻 生殖托 附生细菌 16S rRNA
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细胞外囊泡表征检测方法的对比
7
作者 李莎莎 余飞 刘万卉 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1093-1101,共9页
细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)是细胞主动分泌的具有磷脂双分子层结构的囊泡,天然携带母细胞来源的各种内容物,保留母细胞的生物学特征,可以反映其分泌时的母细胞状态。为了解EVs的生物发生及其在机体内的生物学功能,科学家... 细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)是细胞主动分泌的具有磷脂双分子层结构的囊泡,天然携带母细胞来源的各种内容物,保留母细胞的生物学特征,可以反映其分泌时的母细胞状态。为了解EVs的生物发生及其在机体内的生物学功能,科学家们做了许多尝试,但直接检测EVs有一定的困难,目前的检测技术通常以EVs内容物作为检测对象,实现间接表征的目的。通过分析体液中的EVs,可以实现疾病诊断的目的,对EVs进行详细表征可以推动精准医学的发展。EVs属于内源性物质,可作为递送药物的载体,具有增加药效、降低药物毒理作用和辅助药物通过生物屏障的优势。目前,作为药物或者递送药物的载体应用尚存在的问题,包括(1)EVs内容物的表征,以便使用更明确定义的EVs;(2)开发适合的检测方法来监测体内的EVs,以确定和优化EVs的剂量、给药途径及潜在毒性;(3)确定EVs膜组成的种类及数量。EVs直径为纳米级别,内容物含量少,但临床应用价值大。应用中选择合适的分析技术将能够对EVs类型进行全面表征,并进一步推进对EVs生物学的理解,开发基于EVs的新型诊断和治疗方法,促进其临床转化。本综述介绍了EVs研究中分析技术的原理、应用及优缺点,重点是EVs和EVs中蛋白质的表征检测技术。 展开更多
关键词 细胞外囊泡 检测原理 浓度检测 新兴技术
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香荚兰香草醛的理化分析和药物动力学
8
作者 陈梦蝶 吴亚楠 +1 位作者 郭明 程洁 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1596-1607,共12页
香荚兰的药用价值备受关注。本文分析香荚兰不同部位VOCs的共有主成分,以人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)、β-乳球蛋白(β-lactoglobulin,β-La)及α-乳清蛋白(α-lactalbumin,α-La)为模板蛋白质,建立“固相微萃取气相色谱-质... 香荚兰的药用价值备受关注。本文分析香荚兰不同部位VOCs的共有主成分,以人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)、β-乳球蛋白(β-lactoglobulin,β-La)及α-乳清蛋白(α-lactalbumin,α-La)为模板蛋白质,建立“固相微萃取气相色谱-质谱联用技术-多光谱技术-物理建模-药代动力学”(solid phase microextraction gas chromategraphy-mass spectrometry-multisp-ectral technique-physical modeling-pharmacokinetics,S-M-P-P)链式方法,解析香荚兰共有主成分的输运机制及药效机理。结果表明,香荚兰不同部位共有主VOCs为香草醛(vanillin,Van),其通过静态猝灭作用减弱了HSA/β-La/α-La的内源性荧光,并与HSA形成氢键和范德华力,与β-La/α-La则通过疏水作用力形成非共价复合物。两者间相互作用促进了Van在体内向肠道和肝组织的转运,并被CYP1A2和CYP2C9酶代谢,从而发挥其药理效果。该研究全面而深入地探讨了香荚兰VOCs的输运机制及药理效果,为理解植物源挥发性有机物的药用潜力提供了重要参考。 展开更多
关键词 香荚兰 多光谱技术 固相微萃取气相色谱-质谱联用技术 香草醛
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6种饮食黄酮稳定肥大细胞活性的作用和机制研究
9
作者 张志鑫 刘健 张弦 《合肥工业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第11期1540-1546,共7页
文章旨在探究白杨素、芹菜素、木犀草素、山奈酚、槲皮素和杨梅素稳定肥大细胞的生物活性及其机制。10、20、40μmol/L 6种饮食黄酮预处理骨髓来源肥大细胞(bone marrow derived mast cells,BMMCs),并用50μg/mL化合物48/80(C48/80)刺... 文章旨在探究白杨素、芹菜素、木犀草素、山奈酚、槲皮素和杨梅素稳定肥大细胞的生物活性及其机制。10、20、40μmol/L 6种饮食黄酮预处理骨髓来源肥大细胞(bone marrow derived mast cells,BMMCs),并用50μg/mL化合物48/80(C48/80)刺激细胞活化,采用酶联免疫吸附法和实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测细胞因子白介素6(interleukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)的分泌量和mRNA表达水平,采用western blot检测细胞内丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、p-MAPK、c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK)和p-JNK蛋白水平。结果表明,6种饮食黄酮对C48/80诱导的BMMCs活化具有剂量依赖的稳定作用,其中木犀草素和杨梅素的作用效果最强;机制研究显示木犀草素、槲皮素和杨梅素可通过下调MAPK和JNK的磷酸化水平抑制C48/80诱导的BMMCs活化。 展开更多
关键词 饮食黄酮 肥大细胞 细胞因子 MAPK/JNK信号通路
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基于broccoli的RNA荧光适体设计与筛选
10
作者 何祖洋 白九元 赵云 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期310-319,共10页
为了在活细胞RNA成像中提供更加精准的工具,本文旨在基于broccoli的RNA荧光标记创建荧光强度高、稳定性好的绿色荧光适体.采用理性设计对broccoli进行优化,并通过测定光谱特征和理化性质对broccoli变体进行多轮筛选.结果发现基于对RNA... 为了在活细胞RNA成像中提供更加精准的工具,本文旨在基于broccoli的RNA荧光标记创建荧光强度高、稳定性好的绿色荧光适体.采用理性设计对broccoli进行优化,并通过测定光谱特征和理化性质对broccoli变体进行多轮筛选.结果发现基于对RNA荧光适配体broccoli的三轮突变筛选,获得了荧光强度提升3.3倍的broccoli四位点突变体(命名为Bro);再利用设计的3WJ支架,组建了3WJ-n×Bro RNA荧光适配体家族;采用嵌入串联重复Bro的方式可以显著提升适体的荧光强度,其中3WJ-4×Bro的荧光强度超过3WJ-Bro的2.7倍,且表现出更低的盐离子依赖性和更高的热稳定性、光稳定性和监测灵敏度.结果表明本文设计出的3WJ-n×Bro家族并从中筛选出优异的核酸适配体3WJ-4×Bro,可为在RNA水平上实现活细胞RNA成像提供可视化工具. 展开更多
关键词 RNA荧光适体 Broccoli适体 RNA成像
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核转录因子Relish的结构与功能研究进展
11
作者 张红 刘青珍 《吉首大学学报（自然科学版）》 CAS 2024年第1期77-83,共7页
核转录因子Relish是NF-κBs超家族中的一员,是重要的免疫信号传导效应物.Relish的N端有保守的Rel同源结构域,C端有锚蛋白重复结构域.受到外界各种刺激时由Imd通路传导信号,诱导Relish发生磷酸化、切割和其他翻译后修饰.活化的Relish进... 核转录因子Relish是NF-κBs超家族中的一员,是重要的免疫信号传导效应物.Relish的N端有保守的Rel同源结构域,C端有锚蛋白重复结构域.受到外界各种刺激时由Imd通路传导信号,诱导Relish发生磷酸化、切割和其他翻译后修饰.活化的Relish进入细胞核与DNA结合调控靶基因表达,帮助生物体适应各种生理环境和刺激,抵御外来病原体入侵和感染.本文对Relish的结构与功能作了简要综述.Relish的结构主要包括Rel同源结构域、锚蛋白重复结构域、核定位序列、caspase靶位点、富含丝氨酸区域、富含脯氨酸-谷氨酸-丝氨酸结构域;Relish的功能主要有参与先天免疫、调节神经发育和寿命、调控肠道稳态和形态、参与压力调节及调节其他生理活动. 展开更多
关键词 Relish NF-ΚB 先天免疫 Imd通路
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抗痛蝎多肽的分离与筛选
12
作者 王玉 张晓婷 +5 位作者 姜鸣 吴艳艳 杨亮 杨清湖 刘霞 白占涛 《延安大学学报（自然科学版）》 2024年第2期37-42,48,共7页
东亚钳蝎(Buthusmartensii Karsch)是我国重要的中药材之一,其毒液富含多种离子通道及受体的调制分子,对疼痛,癫痫等疾病有治疗作用。因此,针对蝎毒素中复杂多肽的分离、筛选与鉴定是蝎毒素研究与开发的重点。为了分离并筛选出具有镇痛... 东亚钳蝎(Buthusmartensii Karsch)是我国重要的中药材之一,其毒液富含多种离子通道及受体的调制分子,对疼痛,癫痫等疾病有治疗作用。因此,针对蝎毒素中复杂多肽的分离、筛选与鉴定是蝎毒素研究与开发的重点。为了分离并筛选出具有镇痛效果的蝎毒多肽,实验利用反相高效液相色谱的方法分离纯化蝎毒,将得到的4种蝎毒多肽组分分别命名为BmKⅡ-10、BmKⅡ-11、BmKⅡ-16和BmKⅡ-24,结合质谱技术鉴定其分子量分别为7530.8 Da、7366.0 Da、5949.6 Da和6852.4 Da。通过构建疼痛模型检测蝎毒多肽组分对小鼠疼痛的影响,结果显示,BmKⅡ-10,BmKⅡ-11可能为蝎毒中的致痛组分,而BmKⅡ-16具有显著的镇痛效果,能有效抑制由福尔马林和角叉菜胶引起的自发痛与机械痛行为。本研究所采用的多肽分离纯化方法能有效获得蝎毒素中多种多肽组分,进一步验证发现部分组分与疼痛密切相关,为疼痛药物的开发与应用提供了理论和实验依据。 展开更多
关键词 东亚钳蝎 蝎毒多肽 分离纯化 抗痛
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包载C3G的新型纳米纤维脂质体在酸奶中的应用
13
作者 施报平 刘晓冰 +1 位作者 王怀旭 郑家荣 《深圳大学学报（理工版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期348-357,共10页
矢车菊素-3-O-葡萄糖苷(cyanidin-3-O-glucoside,C3G)具有较强的抗炎、抗氧化和抗癌活性,但受到外界环境影响易降解,导致其应用大大受限.为增强脂质体和C3G的稳定性,向脂质体配方中加入水溶性且耐消化的纤维溶胶Fibersol-2,然后将此配... 矢车菊素-3-O-葡萄糖苷(cyanidin-3-O-glucoside,C3G)具有较强的抗炎、抗氧化和抗癌活性,但受到外界环境影响易降解,导致其应用大大受限.为增强脂质体和C3G的稳定性,向脂质体配方中加入水溶性且耐消化的纤维溶胶Fibersol-2,然后将此配方包载的C3G添加到牛奶中进行发酵,对发酵后酸奶的相关指标进行评估,从而确定包载C3G对酸奶的影响.研究发现,将纳米纤维脂质体添加到酸奶中,可明显促进保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌的增殖,降低酸奶的pH值,并增加酸奶的酸度、持水力、双乙酰含量和抗氧化活性,抑制酸奶蛋白氧化;纳米纤维脂质体对酸奶的质构有正向影响,但对酸奶的挥发性风味物质无明显影响.研究表明,向纳米脂质体中加入Fibersol-2以稳定脂质体、保护C3G的策略是切实可行的;将包载C3G的纳米纤维脂质体应用在酸奶发酵中也可以多方面提升产品品质,可以作为功能性酸奶的一种新研发思路. 展开更多
关键词 分子生物学 食品科学 Fibersol-2 矢车菊素-3-O-葡萄糖苷 纳米纤维脂质体 包埋 酸奶
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从蛋白质环境引起的实际变化中剖析配体结构的误差
14
作者 乔琳琳 李永乐 +1 位作者 郭聪 BICZYSKO Malgorzata 《上海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期229-242,共14页
配体构象应变能(ligand conformational strain energy,LCSE)是计算机辅助药物发现中考虑的一个重要参数.通过量子力学(quantum mechanical,QM)方法对自由态配体和蛋白质口袋中的结合态配体的结构进行计算并比较,可以获得配体构象应变能... 配体构象应变能(ligand conformational strain energy,LCSE)是计算机辅助药物发现中考虑的一个重要参数.通过量子力学(quantum mechanical,QM)方法对自由态配体和蛋白质口袋中的结合态配体的结构进行计算并比较,可以获得配体构象应变能.然而,对配体构象应变能的合理范围以及计算方法仍然存在争议.选择8个柔性较大、特征结构模式多样的配体,这些结构的分辨率在高分辨率(0.86×10^(−10))与中等分辨率(3.10×10^(−10))之间,分别采用3种不同的量子力学方法:密度泛函(density functional theory,DFT)M062XD3、Hartree-Fock和GFN1-xTB,对8个配体进行逐步优化并计算配体能量,分析在结合态配体逐步优化到局域能量最小的自由态配体的过程中配体在结构和能量上的差异.量子力学计算结果显示,配体构象应变能小于6.0 kcal/mol,结合态配体结构中显著的几何参数误差是结合态和自由态配体结构的主要能量差异.因此,在分析配体构象应变能之前,对结合态配体结构进行精确实验测定非常重要. 展开更多
关键词 蛋白质配体复合物 应变能 势能面 密度泛函 HARTREE-FOCK GFN1-xTB
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铁死亡相关的环状RNA在疾病中的作用及机制
15
作者 王芹 何梦婕 龙方懿 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期295-311,共17页
环状RNA(circular RNA,circRNA)是真核生物细胞中一类特殊的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),具有高度稳定性。目前已广泛发现circRNA可作为微RNA(microRNA,miRNA)海绵参与各种疾病发生发展过程。作为近年来研究的热点,circRNA的功能... 环状RNA(circular RNA,circRNA)是真核生物细胞中一类特殊的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),具有高度稳定性。目前已广泛发现circRNA可作为微RNA(microRNA,miRNA)海绵参与各种疾病发生发展过程。作为近年来研究的热点,circRNA的功能和作用不断被发现和利用,其既可作为蛋白质支架使靶点结合更紧密,也可以调节疾病信号分子的转录表达,还能作为翻译模板,参与蛋白质的表达。此外,研究证实了铁死亡在疾病发展中具有重要作用,而铁死亡相关circRNA的分子机制研究也是医学研究领域的新前沿。最近研究发现,circRNA不仅能作为miRNA和蛋白质支架参与调控铁死亡,还能从转录水平调节铁死亡相关信号分子。目前,人工合成的环状RNA已被设计用于RNA疫苗,各种基因治疗技术、药物递送载体也为靶向circRNA的药物开发提供重要依据。本文阐述了circRNA的功能和作用、铁死亡调控的关键靶点及其在疾病中的作用,并且着重阐释了铁死亡相关circRNA在肿瘤、神经系统疾病及糖尿病并发症等多系统疾病中的作用机制,概述了circRNA相关的药物开发策略,为基于铁死亡相关circRNA的药物开发提供新的思路。 展开更多
关键词 环状RNA 铁死亡 脂代谢 铁代谢 基因治疗
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AsmiR156:沙蓬干旱记忆分子调控网络的潜在枢纽
16
作者 房庭舟 AWUKU Ibrahim +6 位作者 燕霞 钱朝菊 范兴科 赵鹏姝 廖钰秋 史梁 马小飞 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1-10,共10页
为探索miRNA-mRNA如何参与沙蓬干旱响应和干旱记忆,选择沙蓬干旱敏感生态型AEX为植物材料,开展3轮干旱-复水循环实验后进行转录组和sRNA测序。分别鉴定出341个和7858个响应干旱胁迫的沙蓬miRNA(DEMIs)和mRNA(DEMs)。DEMI-DEM调控网络构... 为探索miRNA-mRNA如何参与沙蓬干旱响应和干旱记忆,选择沙蓬干旱敏感生态型AEX为植物材料,开展3轮干旱-复水循环实验后进行转录组和sRNA测序。分别鉴定出341个和7858个响应干旱胁迫的沙蓬miRNA(DEMIs)和mRNA(DEMs)。DEMI-DEM调控网络构建表明,24个沙蓬DEMIs参与调控1423个DEMs,这些靶基因主要参与细胞分化功能。鉴定出两个干旱记忆miRNA(DMMIs)miR156和miR6173,分别调控11个和6个干旱记忆基因(DMGs)。miR156的靶基因包括3个转录因子(TF)AsRWP-RK、AsC3H11和AsWRKY33;miR6173的靶基因包括两个GST(谷胱甘肽S转移酶)。在先前的研究中,AsC3H11和AsWRKY33作为TF分子开关参与沙蓬干旱记忆分级调控网络,因此,沙蓬miR156可作为“miRNA-转录因子-功能基因”网络的候选枢纽。研究解析了沙蓬干旱响应和干旱记忆的分子调控基础,将为荒漠植物中的抗逆遗传资源开发提供理论依据。 展开更多
关键词 沙蓬 干旱胁迫 干旱记忆 miRNA 转录组
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本科留学生“药学分子生物学”课程教学改革与实践
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作者 魏勇军 张晓玲 《生物加工过程》 CAS 2024年第4期460-466,共7页
随着我国经济的不断发展,教育实力不断提升,本科留学生数量稳步增加。近年来,多所高校纷纷招收药学或制药工程专业留学生。“药学分子生物学”是药学相关本科专业的必修课程。但是,药学本科留学生来自不同国家,文化背景和高中教学水平不... 随着我国经济的不断发展,教育实力不断提升,本科留学生数量稳步增加。近年来,多所高校纷纷招收药学或制药工程专业留学生。“药学分子生物学”是药学相关本科专业的必修课程。但是,药学本科留学生来自不同国家,文化背景和高中教学水平不一,急需针对性地开展分子生物学课程教学工作。基于此,笔者及所在团队建立本科留学生“药学分子生物学”课程内容和教学模式,在跨学科融合、产学研用结合等方面提出了教学改革思路并加以实践,增加了相关课程思政的内容,旨在建立“药学分子生物学”教学体系,提高教师的“药学分子生物学”课程教学水平,锻炼留学生的科研思维,为培养高素质“知华”“友华”的药学专业人才奠定基础,也为国内本科生的药学分子生物学双语教学提供参考。 展开更多
关键词 药学分子生物学 本科留学生 教学内容 跨学科融合 产学研用结合
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孤雌卤虫雌激素相关受体基因(ERR)的表达特性分析
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作者 刘雪 韩学凯 +1 位作者 欧阳雪梅 隋丽英 《天津科技大学学报》 CAS 2024年第2期34-41,共8页
雌激素通过其相关受体进而影响动物的生殖发育与成熟。为了探究雌激素相关受体基因ERR在孤雌卤虫卵巢发育和成熟过程中发挥的作用,本研究对孤雌卤虫(Artemia parthenogenetica)的ERR基因进行了克隆及相关生物信息学分析,并对该基因在不... 雌激素通过其相关受体进而影响动物的生殖发育与成熟。为了探究雌激素相关受体基因ERR在孤雌卤虫卵巢发育和成熟过程中发挥的作用,本研究对孤雌卤虫(Artemia parthenogenetica)的ERR基因进行了克隆及相关生物信息学分析,并对该基因在不同组织(卵巢、头部、躯干)和卵巢在不同发育时期〔卵黄发生早期(early oocytes,EO)、卵黄发生晚期(late oocytes,LO)、早期胚胎(early embryos,EE)、晚期胚胎(later embryos,LE)〕的表达特征进行了探究。结果显示,ERR基因的开放阅读框(ORF)长1536 bp,共编码521个氨基酸,编码蛋白质的相对分子质量和等电点分别为5.7114×10^(4)和5.06,该蛋白质具有两个结构域,没有信号肽和跨膜结构。蛋白质的二级结构主要以无规则卷曲(46.97%)和α-螺旋(40.7%)为主,三级结构与二级结构的结果一致。在NJ系统进化树中,孤雌卤虫(A.parthenogenetica)与大型溞(Daphnia magna)和苏拉威西秀体溞(Diaphanosoma celebensis)最为相近,而与湿木白蚁(Zootermopsis nevadensis)、台湾乳白蚁(Coptotermes formosanus)的亲缘关系较远。表达特征结果显示,ERR基因在孤雌卤虫头部组织中的表达量显著高于卵巢组织和躯干组织中的表达量,且随着卤虫卵巢的发育,表达量逐渐上升,在EE达到最高,随后在LE显著下降(P<0.01)。 展开更多
关键词 孤雌卤虫 雌激素相关受体 生物信息学特征 基因表达 卵巢发育
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分子光谱技术在水体微塑料监测中的应用
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作者 冯文静 唐秀艳 杨思凡 《中文科技期刊数据库（全文版）自然科学》 2024年第6期0215-0218,共4页
在2004年,来自英国普利茅斯大学的汤普森等研究者首次阐述了微塑料.微塑料颗粒一般指那些直径不超过5毫米的塑料粒子、细丝以及碎屑,它们根据来源可被划分为原生微塑料和派生微塑料两种主要类型。微塑料颗粒能够持久留存于陆地、水体、... 在2004年,来自英国普利茅斯大学的汤普森等研究者首次阐述了微塑料.微塑料颗粒一般指那些直径不超过5毫米的塑料粒子、细丝以及碎屑,它们根据来源可被划分为原生微塑料和派生微塑料两种主要类型。微塑料颗粒能够持久留存于陆地、水体、大气以及生物内部,对生态环境的稳定性和人体健康构成隐秘危害。随着人们对微塑料问题认识的深入,我们更为频繁地关注到了河流、海洋、饮用水、土壤、大气以及雨水和生物等环境载体中微塑料污染的现象。研究人员正努力研制出更加便捷和高效的分析方法,旨在准确测定这些微塑料的组成、大小、数量以及形状。 展开更多
关键词 分子光谱技术 水体微塑料监测 应用
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笋篼黄酮的结构鉴定及其与人血清白蛋白结合的分子模拟 被引量：1
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作者 杨波 益莎 +2 位作者 李琴 贺亮 杨光 《生物加工过程》 CAS 2023年第3期301-307,345,共8页
以竹笋加工剩余物笋篼为原料,采用红外光谱(FT IR)、液质联用技术(HPLC MS)对笋篼黄酮(BSDF)的主要组分进行鉴定,并利用分子模拟技术研究了笋篼黄酮类物质与人血清白蛋白(HSA)的结合作用。红外结果表明,BSDF具有黄酮苷类化合物的特征峰... 以竹笋加工剩余物笋篼为原料,采用红外光谱(FT IR)、液质联用技术(HPLC MS)对笋篼黄酮(BSDF)的主要组分进行鉴定,并利用分子模拟技术研究了笋篼黄酮类物质与人血清白蛋白(HSA)的结合作用。红外结果表明,BSDF具有黄酮苷类化合物的特征峰;液质研究结果表明,BSDF中主要有4种黄酮苷类物质,分别是夏佛塔苷、白杨素6 C阿拉伯糖8 C葡萄糖苷、芹菜素6,8 C二那阿拉伯糖苷、白杨素6 CβD葡萄糖苷8 CαL阿拉伯糖苷;分子模拟结果显示,BSDF苷类物质白杨素6 CβD葡萄糖苷8 CαL阿拉伯糖苷能够很好地结合HSA的子域ⅠA和ⅢA。两者之间的结合存在氢键作用力、范德华作用力及阳离子π堆积。该研究为了解笋篼黄酮结构及小分子药物在体内的运输情况提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 竹笋加工剩余物 笋篼 黄酮 人血清白蛋白 结构鉴定 分子模拟
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