使用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数法(CoMSIA)对33个已报道的喹啉酮类BRD4抑制剂进行3D-QSAR模型建立,研究了其化学结构和生物活性间的关系,并用计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)设计出7个喹啉酮...使用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数法(CoMSIA)对33个已报道的喹啉酮类BRD4抑制剂进行3D-QSAR模型建立,研究了其化学结构和生物活性间的关系,并用计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)设计出7个喹啉酮类抑制剂。结果表明,建立的CoMFA(q^(2)=0.926,r^(2)=0.997,r^(2)_(pred)=0.744)和CoMSIA(q^(2)=0.939,r^(2)=0.991,r^(2)_(pred)=0.786)模型具有较好的预测能力,基于这些模型设计的7个新喹啉酮类BRD4抑制剂具有高活性,并对其进行ADMET性质评价和类药性分析。以上研究结果有助于改造和开发更加有效的喹啉酮类BRD4抑制剂。展开更多
目的近年来,计算机辅助药物设计(computer aided drug design,CADD)发展迅速,受到了中外学者和医药界的广泛关注。系统了解CADD领域的发展进程,对科研人员和药物研发机构的研究方向和工作开展具有十分重要的指导意义和参考价值。方法以...目的近年来,计算机辅助药物设计(computer aided drug design,CADD)发展迅速,受到了中外学者和医药界的广泛关注。系统了解CADD领域的发展进程,对科研人员和药物研发机构的研究方向和工作开展具有十分重要的指导意义和参考价值。方法以中国知网(CNKI)和Web of Science(WOS)数据库作为数据来源,利用可视化工具CiteSpace软件,采用定性与定量相结合的研究方法总结归纳了2010—2022年区间段内发表的CADD文献,绘制科学知识图谱,从研究热点和演进趋势等方面展开分析。结果与结论研究结果显示,国内外关于CADD研究的侧重点各有不同,加快人工智能算法的实际应用,提高计算机药物设计的效率将成为新的研究方向。展开更多
目的探讨程序性死亡受体-1(PD-1)、程序性死亡受体配体-1(PD-L1)抑制剂的三维定量构效关系和分子对接研究。方法针对现有的小分子化合物进行合理研究,取45个新型o-(联苯-3-基甲/氧基)硝基苯抑制剂进行三维定量构效关系研究,包括使用分...目的探讨程序性死亡受体-1(PD-1)、程序性死亡受体配体-1(PD-L1)抑制剂的三维定量构效关系和分子对接研究。方法针对现有的小分子化合物进行合理研究,取45个新型o-(联苯-3-基甲/氧基)硝基苯抑制剂进行三维定量构效关系研究,包括使用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA),并且对分子对接,观察小分子与5J89蛋白的结合效果。结果Co MFA模型(q^(2)=0.644,r^(2)=0.950)和CoMSIA模型(q^(2)=0.622,r^(2)=0.998)具有一定预测能力。TYR:56、GLN:66氨基酸是影响这些抑制剂活性的主要氨基酸。结论该研究是计算机辅助药物方法在抗肿瘤方面的应用,可为开发PD-1/PD-L1抑制剂作为抗癌药物提供参考。展开更多
文摘使用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数法(CoMSIA)对33个已报道的喹啉酮类BRD4抑制剂进行3D-QSAR模型建立,研究了其化学结构和生物活性间的关系,并用计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)设计出7个喹啉酮类抑制剂。结果表明,建立的CoMFA(q^(2)=0.926,r^(2)=0.997,r^(2)_(pred)=0.744)和CoMSIA(q^(2)=0.939,r^(2)=0.991,r^(2)_(pred)=0.786)模型具有较好的预测能力,基于这些模型设计的7个新喹啉酮类BRD4抑制剂具有高活性,并对其进行ADMET性质评价和类药性分析。以上研究结果有助于改造和开发更加有效的喹啉酮类BRD4抑制剂。
文摘目的近年来,计算机辅助药物设计(computer aided drug design,CADD)发展迅速,受到了中外学者和医药界的广泛关注。系统了解CADD领域的发展进程,对科研人员和药物研发机构的研究方向和工作开展具有十分重要的指导意义和参考价值。方法以中国知网(CNKI)和Web of Science(WOS)数据库作为数据来源,利用可视化工具CiteSpace软件,采用定性与定量相结合的研究方法总结归纳了2010—2022年区间段内发表的CADD文献,绘制科学知识图谱,从研究热点和演进趋势等方面展开分析。结果与结论研究结果显示,国内外关于CADD研究的侧重点各有不同,加快人工智能算法的实际应用,提高计算机药物设计的效率将成为新的研究方向。
文摘目的探讨程序性死亡受体-1(PD-1)、程序性死亡受体配体-1(PD-L1)抑制剂的三维定量构效关系和分子对接研究。方法针对现有的小分子化合物进行合理研究,取45个新型o-(联苯-3-基甲/氧基)硝基苯抑制剂进行三维定量构效关系研究,包括使用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA),并且对分子对接,观察小分子与5J89蛋白的结合效果。结果Co MFA模型(q^(2)=0.644,r^(2)=0.950)和CoMSIA模型(q^(2)=0.622,r^(2)=0.998)具有一定预测能力。TYR:56、GLN:66氨基酸是影响这些抑制剂活性的主要氨基酸。结论该研究是计算机辅助药物方法在抗肿瘤方面的应用,可为开发PD-1/PD-L1抑制剂作为抗癌药物提供参考。
