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基于LMPSO-SVM的高光谱水稻稻瘟病害分级检测 被引量:3
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作者 刘潭 李子默 +3 位作者 冯帅 王雯琦 袁青云 许童羽 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第11期208-216,235,共10页
为减少水稻产量损失,迫切需要建立快速、准确的水稻叶瘟监测和鉴别方法。本文以东北水稻为研究对象,以小区试验为基础,使用高光谱图像仪获取受稻瘟病菌侵染后不同发病程度的水稻叶片高光谱图像并提取光谱数据。首先,通过SG平滑方法对光... 为减少水稻产量损失,迫切需要建立快速、准确的水稻叶瘟监测和鉴别方法。本文以东北水稻为研究对象,以小区试验为基础,使用高光谱图像仪获取受稻瘟病菌侵染后不同发病程度的水稻叶片高光谱图像并提取光谱数据。首先,通过SG平滑方法对光谱数据进行预处理,然后运用主成分分析(PCA)、Pearson相关系数分析法(PCCs)、PLS-VIP方法对光谱数据进行降维,并提出了一种基于Logistic混沌映射PSO寻优的SVM分级检测模型(LMPSO-SVM)。为了验证提出方法的有效性,以不同降维方法提取的特征变量为输入,分别建立基于人工神经网络(ANN)、支持向量机(SVM)和PSO-SVM的分级模型并进行对比分析。仿真结果表明,各模型对4级病害的识别效果最好,综合5种级别病害,SVM和ANN分级模型的预测准确率波动相对较大,对于病害预测效果不太理想;而在不同特征选择下建立的LMPSO-SVM分级模型对各级病害预测准确率均较高,准确率波动较小,其中基于PCA提取特征变量和全波段作为输入的模型平均准确率非常相近,分别为96.49%和96.12%,PCA提取的输入变量仅为5个,大大简化了模型复杂性,降低了训练难度和训练时间。综合分析,PCA-LMPSO-SVM模型的训练效果最好,可以认为是最佳病害分级模型,其5种级别病害准确率分别为94.29%、96.43%、93.44%、98.30%和100%。因此,本文提出的方法可进一步提高水稻稻瘟病分级检测精度和可靠性,结果可为确定稻瘟病发生情况提供一定的理论基础和技术支撑。 展开更多
关键词 水稻稻瘟病 病害检测 高光谱降维 粒子群算法 LMPSO-SVM
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DNA条形码技术在快速鉴定石斛兰斑翅康瘿蚊(Contarinia maculipennis Felt)上的应用
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作者 蔡波 赵晨阳 +4 位作者 李芬 陈施明 贾静 刘福秀 吴少英 《热带生物学报》 2024年第4期493-498,共6页
石斛兰(Dendrobium nobile)因花形独特、色彩丰富,且植株具有很大药用价值,而深受国际市场喜受。石斛兰在热带、亚热带地区有广泛种植。斑翅康瘿蚊(Contarinia maculipennis Felt)的幼虫可藏于石斛兰花苞中,造成花苞畸形、变色,受到斑... 石斛兰(Dendrobium nobile)因花形独特、色彩丰富,且植株具有很大药用价值,而深受国际市场喜受。石斛兰在热带、亚热带地区有广泛种植。斑翅康瘿蚊(Contarinia maculipennis Felt)的幼虫可藏于石斛兰花苞中,造成花苞畸形、变色,受到斑翅康瘿蚊危害的兰花的观赏性大大降低,影响其经济价值;斑翅康瘿蚊的老熟幼虫还可弹跳入土化蛹,随鲜花贸易进行远距离传播,目前斑翅康瘿蚊的传播已对日本的冲绳、福冈、宫崎和美国的夏威夷等地的石斛兰产业造成严重经济损失。传统瘿蚊科昆虫种类鉴定主要以形态学特征为依据,对于相近种,尤其是幼虫和卵在形态学鉴定上存在着很大局限性,故需寻找准确、快速鉴定斑翅康瘿蚊的方法,同进建议谨防其入侵我国其他的石斛兰种植区。本研究通过DNA条形码技术成功鉴定采自海南岛的样本为斑翅康瘿蚊,并详细描述了斑翅康瘿蚊的形态特征,为相关检疫部门准确、快速鉴定斑翅康瘿蚊提供科学依据。 展开更多
关键词 石斛兰 斑翅康瘿蚊 形态特征 分子鉴定
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梨火疫细菌实时荧光PCR和诱捕PCR-ELISA检测方法的建立 被引量:18
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作者 朱建裕 廖晓兰 +3 位作者 高必达 朱水芳 陈红运 戴富泉 《植物检疫》 北大核心 2003年第1期7-10,共4页
根据梨火疫细菌中独特而保守存在的质粒pEA2 9,设计了 1对引物和 3条探针 ,建立了实时荧光PCR检测方法和诱捕PCR ELISA检测方法。实时荧光PCR采用带荧光标记的核酸杂交探针 ,边扩增边检测 ,步骤简单 ,不需PCR后处理 ,可避免假阳性和交... 根据梨火疫细菌中独特而保守存在的质粒pEA2 9,设计了 1对引物和 3条探针 ,建立了实时荧光PCR检测方法和诱捕PCR ELISA检测方法。实时荧光PCR采用带荧光标记的核酸杂交探针 ,边扩增边检测 ,步骤简单 ,不需PCR后处理 ,可避免假阳性和交叉污染 ;诱捕PCR ELISA检测方法只需简单处理的样品就能检测 ,减少了核酸不纯出现的漏检 ,由于增加了核酸杂交探针 ,可不需凝胶电泳EB染色检测 ,不会出现假阳性问题。 展开更多
关键词 梨火疫细菌 实时荧光PCR 检测方法 聚合酶链式反应 诱捕PCCR-ELISA
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重大潜在入侵害虫番茄潜叶蛾的SS-COⅠ快速检测技术 被引量:20
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作者 张桂芬 刘万学 +2 位作者 郭建洋 张毅波 万方浩 《生物安全学报》 2013年第2期80-85,共6页
【背景】番茄潜叶蛾是源自南美洲的一种最具毁灭性的世界性入侵害虫,其适生区范围广,且与其他潜叶类昆虫难以准确、快速识别。【方法】以田间常见的其他6种潜叶类害虫为对照,采用基于mtDNA COⅠ基因的种特异性SS-COⅠ方法,研究番茄潜叶... 【背景】番茄潜叶蛾是源自南美洲的一种最具毁灭性的世界性入侵害虫,其适生区范围广,且与其他潜叶类昆虫难以准确、快速识别。【方法】以田间常见的其他6种潜叶类害虫为对照,采用基于mtDNA COⅠ基因的种特异性SS-COⅠ方法,研究番茄潜叶蛾快速分子检测技术。【结果】种特异性检测结果显示,SS-COⅠ引物只对番茄潜叶蛾mtDNA具有扩增能力,对美洲斑潜蝇、南美斑潜蝇、三叶草斑潜蝇、葱斑潜蝇、豌豆潜叶蝇、桃潜叶蛾等其他潜叶类害虫不具有扩增效果。该引物不仅对成虫和单粒卵具有很好的扩增效能,对单根触角、头部、胸部、腹部以及翅和足等成虫残体亦具有同样的扩增能力,其最低检出阈值为312.5pg·μL-1。【结论与意义】该方法在有效防范番茄潜叶蛾侵入我国,保障农业生产安全和生态环境安全中意义重大。 展开更多
关键词 番茄潜叶蛾 潜在入侵生物 种特异性SS-COⅠ引物 分子检测 快速鉴定
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两种NC膜条上马铃薯A病毒DAS-ELISA检测研究 被引量:5
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作者 田世民 施丽飞 +5 位作者 周朋 邹明强 薛强 李锦丰 齐小花 王楠 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期712-714,共3页
基于双抗体夹心ELISA反应原理,在两种不同加工成形的硝酸纤维素膜条(NC strip)上进行了马铃薯A病毒(PVA)的检测研究,并以酶标板ELISA做参比。结果表明,在NC条-2(NC strip-2)上的检测灵敏度与酶标板ELISA相当,而反应试剂的用量仅为酶标板... 基于双抗体夹心ELISA反应原理,在两种不同加工成形的硝酸纤维素膜条(NC strip)上进行了马铃薯A病毒(PVA)的检测研究,并以酶标板ELISA做参比。结果表明,在NC条-2(NC strip-2)上的检测灵敏度与酶标板ELISA相当,而反应试剂的用量仅为酶标板ELISA的百分之一;NC条-1(NC strip-1)由于加样点间易发生交叉污染而不适合进行ELISA检测。应用NC条-2可稳定进行PVA的ELISA检测,为进一步开展微流体斑点免疫检测研究奠定了基础。 展开更多
关键词 马铃薯A病毒 DAS-ELISA NC条
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毒麦及其近似种rDNA ITS-RFLP初步分析 被引量:5
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作者 张姮 康林 +1 位作者 高必达 陈冬美 《植物检疫》 2008年第2期70-72,共3页
本研究对毒麦属6个种的核糖体ITS进行PCR-RFLP分析,首次从分子水平上鉴定区分了毒麦属4个种(毒麦、亚麻毒麦、多花黑麦草、瑞士黑麦草)。根据这4个种ITS的测序结果,选取3种内切酶(BssSI、TfiI、NehI)应用于PCR-RFLP分析。根据酶切图谱可... 本研究对毒麦属6个种的核糖体ITS进行PCR-RFLP分析,首次从分子水平上鉴定区分了毒麦属4个种(毒麦、亚麻毒麦、多花黑麦草、瑞士黑麦草)。根据这4个种ITS的测序结果,选取3种内切酶(BssSI、TfiI、NehI)应用于PCR-RFLP分析。根据酶切图谱可将4个近似种鉴别区分。为建立PCR- RFLP分子鉴定方法而有效地区分毒麦及近似种提供依据。 展开更多
关键词 毒麦 ITS区 RFLP DNA限制酶
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利用ID-ELISA技术调查分析海南3种主要番木瓜病毒分布及感病情况 被引量:1
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作者 杨勇 庹德财 +4 位作者 沈文涛 言普 黎小瑛 周鹏 王锐萍 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2015年第10期1866-1872,共7页
利用PCR方法分别扩增番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV)、番木瓜畸形花叶病毒(papaya leaf distortion mosaic virus,PLDMV)和番木瓜花叶病(papaya mosaic virus,Pa MV)的外壳蛋白(coat protein,CP)基因,并连接到原核表达载体... 利用PCR方法分别扩增番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV)、番木瓜畸形花叶病毒(papaya leaf distortion mosaic virus,PLDMV)和番木瓜花叶病(papaya mosaic virus,Pa MV)的外壳蛋白(coat protein,CP)基因,并连接到原核表达载体p ET-28a上,获得重组质粒p ET28-PRSV-CP、p ET28-PLDMV-CP和p ET28-Pa MV-CP,通过转化、诱导表达后,经SDS-PAGE分析显示,这3种CP蛋白在大肠杆菌中高效表达,其中PRSV CP蛋白和PLDMV CP以包涵体形式存在,Pa MV CP以可溶蛋白形式存在。利用Ni2+-NTA琼脂糖亲和层析纯化获得了3种病毒的重组CP蛋白,并免疫大白兔获得高效价的抗体。Western blot检测结果表明,这3种抗血清与对应的诱导表达蛋白发生特异反应。再采用抗血清建立一种快捷、简便和低成本的ID-ELISA(Indirect enzymelinked immunosorbent assay)技术,并利用此技术对海南岛283个疑似感病的番木瓜样品进行检测鉴别,初步掌握了海南岛3种主要番木瓜病毒的分布及感病情况,为下一步该病的有效防治策略提供科学依据。 展开更多
关键词 番木瓜病毒 外壳蛋白 抗血清 ID-ELISA
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玉米褪绿斑驳病毒抗体及TAS-ELISA试剂盒的研制 被引量:3
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作者 李桂芬 马洁 +2 位作者 张永江 魏梅生 朱水芳 《检验检疫学刊》 2014年第6期42-45,共4页
将纯化的玉米褪绿斑驳病毒(Maize chlorotic mottle virus)制剂免疫家兔,获得兔多克隆抗体;将纯化的玉米褪绿斑驳病毒制剂免疫BALB/c小鼠,用杂交瘤细胞技术获得1株分泌玉米褪绿斑驳病毒单克隆抗体的杂交瘤细胞株并制备腹水抗体。研制了... 将纯化的玉米褪绿斑驳病毒(Maize chlorotic mottle virus)制剂免疫家兔,获得兔多克隆抗体;将纯化的玉米褪绿斑驳病毒制剂免疫BALB/c小鼠,用杂交瘤细胞技术获得1株分泌玉米褪绿斑驳病毒单克隆抗体的杂交瘤细胞株并制备腹水抗体。研制了多克隆抗体为包被抗体,单克隆抗体为检测抗体的TAS-ELISA试剂盒。 展开更多
关键词 玉米褪绿斑驳病毒 多克隆抗体 单克隆抗体 TAS-ELISA试剂盒
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基于ITS-nrDNA的疫霉属系统进化分析
9
作者 金刚 陈涛 +4 位作者 唐向民 苏文潘 黄惠芳 檀小辉 王春田 《科学技术与工程》 北大核心 2014年第1期143-145,153,共4页
基于对GenBank下载的121株疫霉菌Phytophthora的核糖体DNA的ITS序列分析,以Pythium sylvaticum为外围群,按最大简约法(maximum parsimony)构建其系统发育树,以对疫霉菌的系统发育关系进行研究。结果表明,疫霉属总体上可分为5个类群;P.un... 基于对GenBank下载的121株疫霉菌Phytophthora的核糖体DNA的ITS序列分析,以Pythium sylvaticum为外围群,按最大简约法(maximum parsimony)构建其系统发育树,以对疫霉菌的系统发育关系进行研究。结果表明,疫霉属总体上可分为5个类群;P.undulata和P.batemanensis与Pythium sylvaticum的亲缘关系近,而与疫霉属的亲缘关系远;ITS序列分析结果不支持P.cryptogea和P.drechsleri为同物异名的观点。 展开更多
关键词 疫霉属 转录间隔区 系统进化
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The Application of Reverse Transcription-loop-mediated Isothermal Amplification for the Rapid Detection of Maize Chlorotic Dwarf Virus
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作者 徐颖 张峰 +1 位作者 于莹 邱志君 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2017年第12期2450-2453,共4页
Maize chlorotic dwarf virus (MCDV) is a quarantine pest as approved by Chinese government. A rapid, sensitive and specific MCDV detection method using reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification (R... Maize chlorotic dwarf virus (MCDV) is a quarantine pest as approved by Chinese government. A rapid, sensitive and specific MCDV detection method using reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) was estab- lished in this study. Based on the sequence of MCDV coat protein coding gene, specific primers were designed and similar sensitivities were observed between RT- LAMP and RT-PCR, except that RT-LAMP was quicker, and the reaction could be finished within 1 h. In addition, the presence or absence of the fluorescent display in daylight allows naked easy detection of the amplification of MCDV genomic RNA using calcein. The RT-LAMP assay was applied successfully to detect MCDV in maize seeds, and the result by the addition of calcein was consistent with the result detected by the real time turbidimeter. 展开更多
关键词 Maize chlorotic dwarf virus (MCDV) Reverse transcription loop-mediatedisothermal amplification (RT-LAMP) Rapid detection
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马铃薯Ⅴ病毒抗体及TAS-ELISA试剂盒的研制
11
作者 李桂芬 马洁 +2 位作者 孔君 张永江 魏梅生 《检验检疫学刊》 2016年第5期5-8,共4页
用纯化的马铃薯Ⅴ病毒(Potato virus Ⅴ)免疫家兔获得多克隆抗体;免疫BALB/c小鼠,用杂交瘤细胞技术获得2株分泌马铃薯Ⅴ病毒单克隆抗体的杂交瘤细胞株并制备腹水抗体。以多克隆抗体为包被抗体,单克隆抗体为检测抗体研制了TAS-ELISA检测... 用纯化的马铃薯Ⅴ病毒(Potato virus Ⅴ)免疫家兔获得多克隆抗体;免疫BALB/c小鼠,用杂交瘤细胞技术获得2株分泌马铃薯Ⅴ病毒单克隆抗体的杂交瘤细胞株并制备腹水抗体。以多克隆抗体为包被抗体,单克隆抗体为检测抗体研制了TAS-ELISA检测试剂盒。 展开更多
关键词 马铃薯Ⅴ病毒 多克隆抗体 单克隆抗体 TAS-ELISA试剂盒
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基于MaxEnt和DIVA-GIS的白蜡枯梢病菌在中国的潜在适生区分析 被引量:6
12
作者 罗志萍 潘绪斌 +1 位作者 王聪 李来梅 《湖南农业科学》 2015年第10期83-87,共5页
为了开展危险性林木病害白蜡枯梢病的风险分析和检疫工作,研究对白蜡枯梢病菌在中国的潜在适生区进行了预测。利用Max Ent软件和DIVA-GIS数据库,选择19个环境因子变量和2.5 min的空间分辨率,并对预测结果的可靠性进行ROC曲线法分析评价... 为了开展危险性林木病害白蜡枯梢病的风险分析和检疫工作,研究对白蜡枯梢病菌在中国的潜在适生区进行了预测。利用Max Ent软件和DIVA-GIS数据库,选择19个环境因子变量和2.5 min的空间分辨率,并对预测结果的可靠性进行ROC曲线法分析评价,同时采用Jackknife刀切法分析了各环境变量对预测结果的影响。结果表明:该病菌在我国局部地区有一定适生风险;根据得到的潜在适生区预测图,白蜡枯梢病菌在中国的高度适生区有台湾中部,中度适生区有西藏西南边陲林区、湖北神农架和宜昌三峡林区、湖南武陵山和张家界林区、广东、广西、重庆、贵州、江西、福建的局部等地;各环境因子贡献率分析表明最冷季降水量对白蜡枯梢病菌的适生区分布影响最大,研究预测结果AUC值为0.932,表明预测结果可信度高。 展开更多
关键词 白蜡树枯梢病 白蜡鞘孢菌(Chalara fraxinea) 适生性分析 MAXENT
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Res-Efficient:应用于作物病害自动识别的轻量级模型
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作者 管洪亮 李克峰 +2 位作者 张广渊 朱振方 王朋 《山东农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2022年第6期858-862,共5页
卷积神经网络模型可通过作物病害图像准确率较高地识别作物病害类型,达到防治作物病害的目的,但传统卷积神经网络模型存在模型尺寸大、迁移效果差等问题。针对这些问题,引入学习率动态衰减训练策略,使用EfficientNetV2的Fused-MBConv和M... 卷积神经网络模型可通过作物病害图像准确率较高地识别作物病害类型,达到防治作物病害的目的,但传统卷积神经网络模型存在模型尺寸大、迁移效果差等问题。针对这些问题,引入学习率动态衰减训练策略,使用EfficientNetV2的Fused-MBConv和MBConv模块替换ResNet18的部分残差模块,提出Res-Efficient模型。实验证明,使用学习率动态衰减策略能提高Res-Efficient模型识别作物病害的准确率,Res-Efficient模型在Plant Village和2018 AI Challenger测试集上分别达到99.70%和87.20%的准确率,模型尺寸减少到14.0 MB。Res-Efficient模型能为移动端和嵌入式设备部署作物病害自动识别应用提供参考。 展开更多
关键词 作物病害 自动识别 模型
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Reverse Transcription-loop-mediated Isothermal Amplification for Detection of Maize Chlorotic Mottle Virus 被引量:4
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作者 Ying XU Yafei XU +2 位作者 Yongfeng LIU Zhijun QIU Wei ZHENG 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2017年第1期123-126,共4页
Maize chlorotic mottle virus (MCMV) is a quarantine pest as approved by Chinese government: A rapid, sensitive and specific MCMV detection method using reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification ... Maize chlorotic mottle virus (MCMV) is a quarantine pest as approved by Chinese government: A rapid, sensitive and specific MCMV detection method using reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) was established in this study. Based on the sequence of MCMV coat protein coding gene, 3 sets of primers were designed and specificity test showed that the second set of primers was specific to MCMV, Similar sensitivities were observed on RT-LAMP and RT-PCR, except that RT-LAMP was quicker, and the reaction could be finished within 1 h. In addition, the presence or absence of the fluorescence under daylight allows naked easy detection of the amplification of MCMV genomic RNA using calcein. The RT-LAMP assay was applied successfully to detect MCMV in maize seeds, and the result by the addition of calcein was consistent with the result detected by the real time turbidimeter. The method is rapid, specific, sensitive without the need for complicated equipment, and is suitable for rapid field detection of MCMV. 展开更多
关键词 Maize chlorotic mottle virus (MCMV) Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) DETECTION
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基于种特异性SS-COⅠ技术快速鉴定瘤胫实蝇 被引量:1
15
作者 黄振 郭琼霞 《生物安全学报》 CSCD 北大核心 2022年第2期179-184,共6页
【目的】瘤胫实蝇为我国进境植物检疫性有害生物。寄主范围广、危害大,形态与其同属近缘种相似,传统鉴定方法是将果蔬上的各虫态饲养至成虫后进行分类鉴定,鉴定周期较长,影响口岸进境果蔬快速通关,而采用分子鉴定不仅快速且不受虫态影... 【目的】瘤胫实蝇为我国进境植物检疫性有害生物。寄主范围广、危害大,形态与其同属近缘种相似,传统鉴定方法是将果蔬上的各虫态饲养至成虫后进行分类鉴定,鉴定周期较长,影响口岸进境果蔬快速通关,而采用分子鉴定不仅快速且不受虫态影响。【方法】选用瘤胫实蝇为鉴定靶标,番石榴实蝇、锈红果实蝇等19种实蝇作阴性对照,应用种特异性技术,基于mtDNA COⅠ线粒体基因序列,研究筛选并设计一对种特异性引物(SS-COⅠ)LJF400和LJR564,进行PCR扩增并将PCR产物进行电泳检测。【结果】种特异性引物仅对靶标种瘤胫实蝇的COⅠ基因有扩增能力,能扩增出一条单一的长度约165 bp清晰的条带,而对其余阴性对照种均不具有扩增效果,未出现任何条带。【结论】设计的种特异性引物具高特异性,能够快速准确鉴定瘤胫实蝇,适用于各种虫态,对瘤胫实蝇的检疫鉴定和进境果蔬的快速通关具有重要意义。 展开更多
关键词 瘤胫实蝇 mtDNA COⅠ 种特异性引物 分子生物学技术 快速鉴定
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A Rapid Identification Method of Bactrocera cilifera (Hendel) with Species-Specific Primers(SS-COI)
16
作者 Zhen Huang Qiongxia Guo 《Plant Diseases and Pests》 CAS 2021年第2期33-37,共5页
[Objective]The paper was to establish a rapid identification method of Bactrocera cilifera(Hendel)with species-specific primers(SS-COI).[Method]Using B.cilifera(Hendel)as the positive control,and 19 species of fruit f... [Objective]The paper was to establish a rapid identification method of Bactrocera cilifera(Hendel)with species-specific primers(SS-COI).[Method]Using B.cilifera(Hendel)as the positive control,and 19 species of fruit flies such as B.diaphora(Coquillett)and B.dorsalis(Hendel)as the negative controls,a pair of species-specific primers,YF290 and YR511,were designed and screened for accurate identification of B.cilifera,based on mitochondrial DNA COI sequence.[Result]The PCR products were amplified and detected by electrophoresis.Only a clear and single band was observed at about 222 bp in the positive control,while no bands were found in the other negative controls.[Conclusion]The established rapid identification method with species-specific primers(SS-COI)is of great practical significance for rapid identification of fruit flies intercepted from import and export fruits and vegetables at ports,and for rapid clearance and early warning of import fruits and vegetables at ports. 展开更多
关键词 Bactrocera cilifera(Hendel) Species-specific primers Species-specific PCR(SS-PCR) mt DNA COI Rapid identification
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基于校正光谱序列融合的小麦腥黑穗病籽粒分类方法
17
作者 梁琨 宋金鹏 +3 位作者 张驰 梅秀明 陈赵越 张靖笛 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期263-272,共10页
针对小麦腥黑穗病轻度患病籽粒易与健康籽粒混淆,人工识别难度大的问题,将校正光谱序列融合技术与深度学习模型相结合,实现小麦腥黑穗病籽粒快速、精准分类。以健康、轻度患病、重度患病各300粒小麦籽粒的高光谱数据为样本,通过多元散... 针对小麦腥黑穗病轻度患病籽粒易与健康籽粒混淆,人工识别难度大的问题,将校正光谱序列融合技术与深度学习模型相结合,实现小麦腥黑穗病籽粒快速、精准分类。以健康、轻度患病、重度患病各300粒小麦籽粒的高光谱数据为样本,通过多元散射校正算法(MSC)和标准正态变换算法(SNV)对原始光谱进行预处理,并利用二维相关光谱法(2D-COS)分析SNV与MSC算法处理后的光谱之间的互补性。使用校正光谱序列融合技术将原始光谱、SNV预处理光谱与MSC预处理光谱三者进行融合得到序列融合光谱,以充分利用不同光谱预处理数据间的互补信息。最终,利用序列融合光谱数据建立基于ResNet 50算法的小麦腥黑病分类模型。试验结果表明,序列融合光谱ResNet 50模型总体准确率最高为93.89%,F1值为93.87%,分类性能优于单一预处理光谱建立的ResNet 50模型。为进一步评估模型分类效果,使用序列融合光谱分别建立偏最小二乘判别分析(PLS-DA)、支持向量机(SVM)以及集成学习算法模型随机森林(RF)与极端梯度提升树(XGBoost)模型,并进行对比,结果显示:SVM、PLS-DA、RF与XGBoost总体准确率分别为81.67%、84.44%、89.44%与90.55%,F1值分别为81.59%、84.04%、89.49%与90.59%,ResNet 50总体准确率与F1值优于传统光谱分析模型。因此,本研究表明校正光谱序列融合技术结合深度学习模型,能够实现对不同患病程度腥黑穗病籽粒的有效分类。 展开更多
关键词 小麦腥黑穗病 籽粒分类 校正光谱序列融合 二维相关光谱法 深度学习
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大豆疫霉的ITS分子检测 被引量:34
18
作者 王立安 张文利 +2 位作者 王源超 王良华 郑小波 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期38-41,共4页
根据大豆疫霉及其近缘卵菌ITS序列差异设计了一对寡聚核苷酸引物 ,用于对包括大豆疫霉在内的 2 0种真菌的PCR检测。结果表明 :在优化的反应体系及扩增条件下 ,该对引物只在大豆疫霉为模板的扩增体系中具有一 330bp的扩增产物 ,表现出强... 根据大豆疫霉及其近缘卵菌ITS序列差异设计了一对寡聚核苷酸引物 ,用于对包括大豆疫霉在内的 2 0种真菌的PCR检测。结果表明 :在优化的反应体系及扩增条件下 ,该对引物只在大豆疫霉为模板的扩增体系中具有一 330bp的扩增产物 ,表现出强特异性。利用该特异引物可稳定地从含有大豆疫霉游动孢子或卵孢子的土壤及其发病组织中检测出病原菌。该检测方法对大豆疫霉游动孢子和卵孢子的检测理论精度可达 0 展开更多
关键词 大豆疫霉 病菌 核糖体 基因区段 寡聚核苷酸 特异引物 分子检测
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烟草环斑病毒的RT-PCR和IC-RT-PCR检测方法研究 被引量:11
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作者 杨翠云 曹洁 +3 位作者 于翠 高焕利 沈禹飞 代光辉 《上海农业学报》 CSCD 2007年第1期83-87,共5页
根据TRSV CP基因的保守序列设计引物,RT-PCR和IC-RT-PCR能从TRSV的2个分离物中分别扩增到与预期大小相同的DNA条带,序列测定和分析表明所扩增序列为TRSV CP基因的部分序列,在系统关系树上与TRSV的其他分离物形成一簇,表明所建立的RT-PCR... 根据TRSV CP基因的保守序列设计引物,RT-PCR和IC-RT-PCR能从TRSV的2个分离物中分别扩增到与预期大小相同的DNA条带,序列测定和分析表明所扩增序列为TRSV CP基因的部分序列,在系统关系树上与TRSV的其他分离物形成一簇,表明所建立的RT-PCR和IC-RT-PCR检测方法是可靠的。 展开更多
关键词 烟草环斑病毒(TRSV) RT-PCR IC-RT-PCR 检测方法
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ITS序列及其SNP位点在外来入侵杂草长芒苋、西部苋和糙果苋物种鉴定中的应用 被引量:6
20
作者 徐晗 赵彩云 +2 位作者 刘勇波 陈鹏程 李俊生 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期128-133,共6页
对于以种子形态为物种主要识别依据的口岸部门,外来入侵杂草长芒苋、西部苋和糙果苋一直是鉴定的难点。本文对34种苋属植物的ITS序列和26SrDNA进行分析,通过SNP变异位点及特异性引物,借助PCR-RFLP方法,对长芒苋、西部苋与糙果苋进行快... 对于以种子形态为物种主要识别依据的口岸部门,外来入侵杂草长芒苋、西部苋和糙果苋一直是鉴定的难点。本文对34种苋属植物的ITS序列和26SrDNA进行分析,通过SNP变异位点及特异性引物,借助PCR-RFLP方法,对长芒苋、西部苋与糙果苋进行快速、准确的分类鉴定。ITS序列分析表明,长芒苋种内变异小,种间变异显著,可与其他苋属植物明显区分。西部苋与糙果苋之间ITS序列差异小,需依据SNP位点来区别。 展开更多
关键词 ITS序列 异株苋亚属 长芒苋 西部苋 糙果苋 26SrDNA SNP PCR-RFLP
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