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番鸭呼肠孤病毒S基因组的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 耿宏伟 郭东春 +2 位作者 刘明 胡奇林 张云 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期305-311,共7页
对番鸭呼肠孤病毒S12和S14毒株S基因组(S1-4)中σA、σB、σNS和σC蛋白基因进行了克隆和测序。序列分析表明:鸭呼肠孤病毒(DRV)与禽呼肠孤病毒(ARV)的σA和σNS基因的核苷酸同源性分别为76.0%~77.1%和78.4%~79.6%,... 对番鸭呼肠孤病毒S12和S14毒株S基因组(S1-4)中σA、σB、σNS和σC蛋白基因进行了克隆和测序。序列分析表明:鸭呼肠孤病毒(DRV)与禽呼肠孤病毒(ARV)的σA和σNS基因的核苷酸同源性分别为76.0%~77.1%和78.4%~79.6%,氨基酸同源性分别为89.5%~91.2%和91.6%~92.7%;而具有诱导群特异性和型特异性中和抗体的σB和σC基因的核苷酸同源性分别为60.3%~64.4%和2.7%~9.9%,氨基酸同源性分别为61.4%~62.0%和22.6%~26.7%;DRV和ARV抗原性存在差异。而DRVS12/S14与法国89026株σA、σB、σNS和σC基因的核苷酸同源性分别为90.0%、93.6%、87.9%~88.0%和93.1%,氨基酸同源性分别为97.1%、94.3%、95.7%~95.9%和93.7%。进化树分析表明,DRV与ARV形成不同的分支,DRV是正呼肠孤病毒属中不同于ARV的一种新的呼肠孤病毒。 展开更多
关键词 番鸭呼肠孤病毒 σA基因 σB基因 σNS基因 σC基因 进化树
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番鸭呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法的建立 被引量:7
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作者 叶伟成 余斌 +3 位作者 刘跃生 华炯钢 云涛 张存 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第6期1453-1456,共4页
根据经典和新型水禽呼肠孤病毒σA基因的保守序列设计一对PCR引物,通过优化病毒RNA提取方法和PCR条件,建立了番鸭呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法。该方法可自1株经典型或4株新型水禽呼肠孤病毒特异性扩增出436 bp条带,其最低病毒检出量为... 根据经典和新型水禽呼肠孤病毒σA基因的保守序列设计一对PCR引物,通过优化病毒RNA提取方法和PCR条件,建立了番鸭呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法。该方法可自1株经典型或4株新型水禽呼肠孤病毒特异性扩增出436 bp条带,其最低病毒检出量为3.6 TCID50,而对鸭甲肝病毒、鸭瘟病毒、新城疫病毒、坦布苏病毒、番鸭细小病毒、产蛋下降综合征病毒和H9N2亚型禽流感病毒扩增均为阴性。对2011-2012采集的224份(番鸭74、鹅68、鸭82)疑似临床病料进行检测,结果 56份为阳性,番鸭、鸭和鹅阳性率分别为59.5%(44/74),11.0%(9/82)和4.4%(3/68),表明水禽呼肠孤病毒主要在番鸭中流行。 展开更多
关键词 番鸭呼肠孤病毒 RT-PCR σA基因 通用检测方法
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Expression of Avian Reovirus (ARV) σA Protein in HEK293T Cells
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作者 Ren Hongyu Xie Zhixun +9 位作者 Xie Liji Wang Sheng Huang Jiaoling Fan Qing Luo Sisi Zhang Yanfang Zeng Tingting Zhang Mingxiu Xie Zhiqin Deng Xianwen 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2019年第5期145-148,共4页
[Objective]The paper was to construct eukaryotic expression vector of Avian reovirus(ARV)σA gene and expressσA protein accurately in HEK293T cells.[Method]The specific primers of ARVσA gene were designed according ... [Objective]The paper was to construct eukaryotic expression vector of Avian reovirus(ARV)σA gene and expressσA protein accurately in HEK293T cells.[Method]The specific primers of ARVσA gene were designed according to the gene sequence of ARV S2 gene in GenBank(accession number KF741763.1).With pMD18-T-σA recombinant vector as the template,the specific sequence ofσA gene was amplified by PCR and cloned into pMD18-T vector to construct recombinant plasmid.The cloning vector pMD18-T-σA and eukaryotic expression plasmid pEF1α-HA were double digested by restriction enzymes Kpn I and Not I.The purifiedσA gene was connected with pEF1α-HA to construct eukaryotic expression plasmid pEF1α-HA-σA.After colony PCR,double enzyme digestion and sequencing,the recombinant plasmid pEF1α-HA-σA was tansfected into HEK293T cells.The proteins were collected at 24 h after tansfection and verified by Western-blot.[Result]The ARVσA gene was successfully cloned in the test.The eukaryotic expression plasmid pEF1α-HA-σA was constructed,which could be expressed in HEK293T cells.[Conclusion]The protein could be accurately expressed in HEK293T cells. 展开更多
关键词 ARV σA gene CLONING σA protein Eukaryotic expression plasmid
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禽呼肠孤病毒σA基因酵母双杂交诱饵载体的构建与鉴定 被引量:2
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作者 卢恒 谢芝勋 +9 位作者 谢丽基 黄莉 黄娇玲 王盛 张艳芳 曾婷婷 范晴 罗思思 谢志勤 邓显文 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第3期847-853,共7页
为了筛选与禽呼孤病毒σA基因相互作用的宿主蛋白,本试验应用酵母双杂交技术构建禽呼孤病毒σA基因的诱饵载体pGBKT7-σA。从禽呼肠孤病毒S1133标准毒株抽提RNA,采用RT-PCR方法扩增得到σA基因片段,将其连接到诱饵载体pGBKT7上,把通过... 为了筛选与禽呼孤病毒σA基因相互作用的宿主蛋白,本试验应用酵母双杂交技术构建禽呼孤病毒σA基因的诱饵载体pGBKT7-σA。从禽呼肠孤病毒S1133标准毒株抽提RNA,采用RT-PCR方法扩增得到σA基因片段,将其连接到诱饵载体pGBKT7上,把通过测序的重组诱饵载体命名为pGBKT7-σA。将重组诱饵载体转化酿酒酵母Y2HGold后,把不同浓度的诱饵载体转化液涂布在营养缺陷型培养基上,观察该重组诱饵载体在酵母细胞中有无毒性作用和自激活现象。结果显示,酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-σA构建成功,且对酿酒酵母无毒性和自激活现象。本研究为进一步利用酵母双杂交技术筛选与σA蛋白互作的宿主蛋白奠定了基础。 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 σA基因 酵母双杂交 诱饵载体
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禽呼肠孤病毒σA蛋白在HEK293T细胞中的表达 被引量:1
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作者 任红玉 谢芝勋 +9 位作者 谢丽基 王盛 黄娇玲 范晴 罗思思 张艳芳 曾婷婷 张明秀 谢志勤 邓显文 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第14期59-62,共4页
为了正确表达禽呼肠孤病毒(ARV)σA蛋白,试验拟构建σA基因的真核表达质粒,并将其在人胚肾细胞(HEK293T)中准确表达,参照GenBank中ARVS2基因序列(登录号为KF741763.1)设计特异性引物,以pMD18-T-σA重组载体为模板,应用PCR的方法扩增σA... 为了正确表达禽呼肠孤病毒(ARV)σA蛋白,试验拟构建σA基因的真核表达质粒,并将其在人胚肾细胞(HEK293T)中准确表达,参照GenBank中ARVS2基因序列(登录号为KF741763.1)设计特异性引物,以pMD18-T-σA重组载体为模板,应用PCR的方法扩增σA基因的特异性序列,并将其克隆到pMD18-T载体中,构建重组pMD18-T-σA表达质粒,再用限制性内切酶KpnⅠ和NotⅠ同时双酶切pMD18-T-σA和真核表达质粒pEF1α-HA,将胶回收的σA基因和pEF1α-HA进行连接,构建真核表达质粒pEF1α-HA-σA。真核表达质粒经菌落PCR、双酶切和测序验证正确后,将其转染HEK293T细胞,于24h后收取蛋白质,通过WesteRn-blot验证目的蛋白。结果表明:本试验成功克隆了ARVσA基因,构建了其真核表达质粒pEF1α-HA-σA,并在HEK293T细胞中表达。说明该蛋白可以在HEK293T细胞中准确表达。 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 σA基因 克隆 σA蛋白 真核表达质粒
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禽呼肠孤病毒σA基因对鸡胚成纤维细胞天然免疫相关基因转录水平的调控影响 被引量:7
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作者 黄莉 谢芝勋 +9 位作者 谢丽基 王盛 黄娇玲 范晴 罗思思 张艳芳 曾婷婷 张民秀 邓显文 谢志勤 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期611-618,共8页
为了明确禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)σA基因对宿主天然免疫应答的影响,本研究利用实时荧光定量PCR方法检测pCAGEN-σA转染鸡胚成纤维细胞(DF1)后,不同时间点(转染后第3、6、12、24和36小时)DF1细胞中天然免疫相关基因,包括Toll... 为了明确禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)σA基因对宿主天然免疫应答的影响,本研究利用实时荧光定量PCR方法检测pCAGEN-σA转染鸡胚成纤维细胞(DF1)后,不同时间点(转染后第3、6、12、24和36小时)DF1细胞中天然免疫相关基因,包括Toll样受体(TLRs)、MDA5、MAVS、My D88、TRIF、IRF-3、IRF7、NF-κB、IFN-α、IFN-β、IL-6、IL-8、IFITM3、Mx1和OASL等基因的转录水平变化。结果,与空载体转染细胞相比,pCAGEN-σA转染细胞中上述这些天然免疫基因的m RNA水平出现不同程度变化(P<0.05或P<0.01)。TLR3应对最快速,其m RNA水平在转染后第3小时和第6小时迅速上升,但9 h后逐渐下降;MDA5和TLR7的m RNA水平,则分别在转染后第6小时和第12小时开始显著升高,并分别在转染后第12小时和第36小时达到峰值(P<0.05或P<0.01);TLR15的m RNA水平整体变化不明显。My D88和MAVS的m RNA水平呈表达上调趋势;TRIF在转染后第6小时表达量迅速达到峰值(2.83倍),随后急速下降。NF-κB呈表达上调趋势;而IRF3/7的表达则被抑制。I型干扰素(IFN-α和IFN-β)呈现相似的表达模式,在转染后第6小时和第24小时表达量增加,其他时间点均为表达量下降; IL-6和IL-8则表达上调,分别在转染后第9小时和第6小时达到峰值(P<0.01)。IFITM3、Mx1、OASL的m RNA水平也显著升高,均在转染后第12小时达到峰值(P<0.01)。上述试验结果表明,在DF-1细胞中过表达σA基因,能显著引起天然免疫相关基因的表达的变化,为进一步阐释ARV的分子致病机制和免疫应答机理奠定了基础。 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 σA基因 天然免疫相关基因 鸡胚成纤维细胞
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