细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CDK1近年来已成为一个理想的治疗靶点.本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CDK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接.分别运用三种叠合...细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CDK1近年来已成为一个理想的治疗靶点.本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CDK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接.分别运用三种叠合方法进行分子叠合,并在此基础上采用Sybyl 7.1中的比较分子场分析(CoMFA)模块及Discovery Studio 3.0中的三维定量构效关系(3D-QSAR)模块(以下简称为DS)分别建立了3D-QSAR模型.其中,将分子对接叠合与公共骨架叠合联合运用的叠合方法所得3D-QSAR模型的评价参数是最佳的(CoMFA:q2=0.681,r2=0.909,r2pred.=0.836;DS:q2=0.579,r2=0.971,r2pred.=0.795,其中q2为交叉验证系数,r2为非交叉验证系数).本文的研究结果在对靛玉红类小分子进行结构修饰设计出新的CDK1抑制剂方面,可提供重要的理论基础.展开更多
In this paper, a set of ATP sensitive K+ channel openers (KCO), whose structure are different, were investigated with the aim to develope our previously defined KCO’s pharmacophore model.To validate the effectiveness...In this paper, a set of ATP sensitive K+ channel openers (KCO), whose structure are different, were investigated with the aim to develope our previously defined KCO’s pharmacophore model.To validate the effectiveness of the pharmacophore model, A comparative molecule field analysis (CoMFA) was proceeded, aligning the molecules according to the requirernent of the model, and good results were obtained. This pharmacophore model may be a start point to design new KCO compounds.展开更多
目的:为了定量解释12-LOX抑制剂活性和结构的关系,得到分子优化的方向。方法:从文献中得到一系列化合物,进行Topomer Co MFA研究。结果:模型具有良好统计学意义,分别为N=7,Q2=0.540,R2=0.952,F=162.3,SEE=0.14,Stderr=0.44,R2pred=5.52...目的:为了定量解释12-LOX抑制剂活性和结构的关系,得到分子优化的方向。方法:从文献中得到一系列化合物,进行Topomer Co MFA研究。结果:模型具有良好统计学意义,分别为N=7,Q2=0.540,R2=0.952,F=162.3,SEE=0.14,Stderr=0.44,R2pred=5.52。结论:计算值与测量值的低偏差表示模型具有较强的预测能力,等势图和假设的结合模式提供了选择性的合理解释,这将指导进一步的研究。展开更多
文摘细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CDK1近年来已成为一个理想的治疗靶点.本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CDK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接.分别运用三种叠合方法进行分子叠合,并在此基础上采用Sybyl 7.1中的比较分子场分析(CoMFA)模块及Discovery Studio 3.0中的三维定量构效关系(3D-QSAR)模块(以下简称为DS)分别建立了3D-QSAR模型.其中,将分子对接叠合与公共骨架叠合联合运用的叠合方法所得3D-QSAR模型的评价参数是最佳的(CoMFA:q2=0.681,r2=0.909,r2pred.=0.836;DS:q2=0.579,r2=0.971,r2pred.=0.795,其中q2为交叉验证系数,r2为非交叉验证系数).本文的研究结果在对靛玉红类小分子进行结构修饰设计出新的CDK1抑制剂方面,可提供重要的理论基础.
文摘In this paper, a set of ATP sensitive K+ channel openers (KCO), whose structure are different, were investigated with the aim to develope our previously defined KCO’s pharmacophore model.To validate the effectiveness of the pharmacophore model, A comparative molecule field analysis (CoMFA) was proceeded, aligning the molecules according to the requirernent of the model, and good results were obtained. This pharmacophore model may be a start point to design new KCO compounds.
文摘目的:为了定量解释12-LOX抑制剂活性和结构的关系,得到分子优化的方向。方法:从文献中得到一系列化合物,进行Topomer Co MFA研究。结果:模型具有良好统计学意义,分别为N=7,Q2=0.540,R2=0.952,F=162.3,SEE=0.14,Stderr=0.44,R2pred=5.52。结论:计算值与测量值的低偏差表示模型具有较强的预测能力,等势图和假设的结合模式提供了选择性的合理解释,这将指导进一步的研究。
