基于MPICH2的高性能计算集群系统研究 被引量：13

1

作者 王勇超 张璟 +1 位作者 王新卫 马静 《计算机技术与发展》 2008年第9期101-104,共4页

目前在高等学校和科研机构中对于高性能计算的需求很大,而商业的超级计算机性能虽高但价格昂贵,同时这些单位又都拥有大量普通的PC机和网络设备。为了利用现有硬件资源获取高性能计算能力,文中研究了在PC机和Linux环境下构建基于MPICH2... 目前在高等学校和科研机构中对于高性能计算的需求很大,而商业的超级计算机性能虽高但价格昂贵,同时这些单位又都拥有大量普通的PC机和网络设备。为了利用现有硬件资源获取高性能计算能力,文中研究了在PC机和Linux环境下构建基于MPICH2的高性能计算集群系统的方法,搭建了一个拥有16个节点的系统并利用高性能Linpack基准测试方法进行了性能测试。测试结果表明,这种构建高性能计算集群系统的方法切实可行,是低成本获取高性能计算能力的良好途径。 展开更多

关键词 高性能计算 集群 PC机 并行计算 LINUX mpich2

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基于MPICH2和并行Q学习的模具制造项目群随机调度

2

作者 张沙清 陈新度 +1 位作者 陈庆新 陈新 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2010年第9期3242-3246,共5页

通过分析模具制造项目工期、费用与报酬的不确定性以及项目返修频繁发生的特点,建立了基于离散时间马尔可夫链的模具制造项目群随机演化模型,提出了基于MPICH2和并行Q学习的模型求解算法,在一定程度上克服了维数灾难问题。最后以Visual ... 通过分析模具制造项目工期、费用与报酬的不确定性以及项目返修频繁发生的特点,建立了基于离散时间马尔可夫链的模具制造项目群随机演化模型,提出了基于MPICH2和并行Q学习的模型求解算法,在一定程度上克服了维数灾难问题。最后以Visual C＋＋6为工具,在多核环境下实现了该算法,并结合示例说明了算法的可行性与有效性。结果表明该算法在模具制造项目群随机调度中具有一定的应用价值。 展开更多

关键词 模具制造项目群 mpich2 多核 并行Q学习 METROPOLIS准则

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一种面向集群应用的MPICH2编程模型设计 被引量：1

3

作者 郑波祥 殷进勇 《工业控制计算机》 2017年第11期9-10,13,共3页

设计了一种面向集群单一映像系统的编程模型,该模型在编程方式向共享内存编程模型靠齐,在实现方式上向分布内存方式靠齐,编程接口遵循MPI规范,采用消息传递方式实现进程间通信。编程模型以MPICH2为基础,并做了适当的改进,实现了共享内... 设计了一种面向集群单一映像系统的编程模型,该模型在编程方式向共享内存编程模型靠齐,在实现方式上向分布内存方式靠齐,编程接口遵循MPI规范,采用消息传递方式实现进程间通信。编程模型以MPICH2为基础,并做了适当的改进,实现了共享内存的并行编程模型、TIPC通道以及TIPC协议在Rapid IO上的移植。设计的并行编程模型的并行算法以静态链接库的形式存在,对用户是透明的,实现灵活,代码复用率高。 展开更多

关键词 集群 单一映像 编程模型 mpich2

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基于虚拟化技术实现MPICH2的高可用管理

4

作者 苏磊 吕英 +1 位作者 董绍经 沈崧 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2010年第24期5220-5223,共4页

为实现MPICH2的高可用,将MPICH2计算平台构建在虚拟机环境中,使得参与MPICH2运算的各个结点均是虚拟机,而物理机器并不直接作为结点参与运算;当物理机器需要进行维护、升级或负载均衡时,通过在线迁移的方式将其上运行的虚拟机迁移至另... 为实现MPICH2的高可用,将MPICH2计算平台构建在虚拟机环境中,使得参与MPICH2运算的各个结点均是虚拟机,而物理机器并不直接作为结点参与运算;当物理机器需要进行维护、升级或负载均衡时,通过在线迁移的方式将其上运行的虚拟机迁移至另一个物理结点上,然后在新的结点上重新启动虚拟机,恢复其上运行的MPICH2计算任务,从而避免了终止整个计算任务的需要。实验结果表明,虚拟机在线迁移之后,整个MPICH2计算任务可以正确恢复;同时,比较了虚拟机和物理机器执行MPICH2计算任务的效率,表明了以虚拟机取代物理机器构建MPICH2计算平台在性能上是可行的。 展开更多

关键词 高可用 虚拟机 在线迁移 mpich2 物理机器

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基于Lustre文件系统的MPI检查点系统实现技术与性能测试 被引量：4

5

作者 谢旻 卢宇彤 +2 位作者 周恩强 曹宏嘉 杨学军 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2007年第10期1709-1716,共8页

基于协同式检查点的回卷恢复是在大规模并行计算机系统中得到采用的一项重要容错技术,其性能开销主要为协同协议和检查点映像存储所决定.描述了一个在MPICH2中实现的应用透明的并行检查点系统,相比已有的技术,该系统有以下特点:1)协同... 基于协同式检查点的回卷恢复是在大规模并行计算机系统中得到采用的一项重要容错技术,其性能开销主要为协同协议和检查点映像存储所决定.描述了一个在MPICH2中实现的应用透明的并行检查点系统,相比已有的技术,该系统有以下特点:1)协同协议操作利用了并行应用的近邻通信特性,通过虚连接方法减少协议的处理开销;2)采用Lustre文件系统简化检查点映像文件管理的复杂性;3)通过并行I/O操作提高性能,优化检查点映像的存储过程.实际应用的测试表明,该检查点系统具有较小的运行时间开销和良好的可扩展性. 展开更多

关键词 容错技术 mpich2 回卷恢复 协同式检查点 LUSTRE文件系统

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微机集群的并行蒙特卡罗模拟 被引量：5

6

作者 王同权 于万瑞 冯煜芳 《微电子学与计算机》 CSCD 北大核心 2006年第z1期210-212,共3页

针对目前蒙特卡罗模拟并行计算的两个制约因素,提出了利于普及的完整解决方案。建立了算法、参数与MCNP一致的并行随机数发生器模块。参考Linux集群方案,提出了一种基于Windowsxp的pc机并行计算系统的实现方案,采用通用局域网络设置,并... 针对目前蒙特卡罗模拟并行计算的两个制约因素,提出了利于普及的完整解决方案。建立了算法、参数与MCNP一致的并行随机数发生器模块。参考Linux集群方案,提出了一种基于Windowsxp的pc机并行计算系统的实现方案,采用通用局域网络设置,并行环境为MPICH2实现,编程调试工具为MicrosoftDevelopStudio。该方案对并行系统中的计算机没有硬件和软件的一致性的严格要求,具有灵活的可扩展性,对于一台计算机的也可以虚拟并行,适合单机下的并行程序调试。最后给出了简单蒙特卡罗模拟实例进行演示。 展开更多

关键词 并行计算 mpich2 蒙特卡罗模拟 随机数发生器

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回线源瞬变电磁法一维正演并行算法 被引量：2

7

作者 李刚 潘和平 +2 位作者 王智 吴爱平 方思南 《地质科技情报》 CSCD 北大核心 2017年第3期299-305,共7页

利用余弦变换的高精度优势,采用并行计算来弥补余弦变换在计算速度方面的不足。深入分析原串行程序中的外层时间节点循环和内层余弦变换这种多层次循环结构的特点,给出了3种并行方案,在WINDOWS系统上使用FORTRAN和MPICH2相结合的开发工... 利用余弦变换的高精度优势,采用并行计算来弥补余弦变换在计算速度方面的不足。深入分析原串行程序中的外层时间节点循环和内层余弦变换这种多层次循环结构的特点,给出了3种并行方案,在WINDOWS系统上使用FORTRAN和MPICH2相结合的开发工具实现了一维瞬变电磁并行正演程序。通过理论模型并行试算,与串行程序进行对比,验证了并行程序的可行性和正确性。3种并行方案均有效地提高了正演计算速度,在相同进程数目的情况下,外层循环时刻点之间的粗粒度并行效率最高,为高维的正反演并行提供了设计思路及研究基础。 展开更多

关键词 余弦变换 并行 mpich2 一维 瞬变电磁

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MPI系统中共享内存通信技术研究 被引量：1

8

作者 张洋 卢宇彤 蒋艳凰 《现代电子技术》 2010年第19期179-182,共4页

MPI是消息传递并行程序设计接口,目前已经成为主流的并行编程模式。多核处理系统的出现,使得高性能计算更加关注节点内的进程通信性能。介绍多种节点内通信协议,以及两种MPI实现(Open MPI和MPICH2)的结构,并对其中基于共享内存的消息传... MPI是消息传递并行程序设计接口,目前已经成为主流的并行编程模式。多核处理系统的出现,使得高性能计算更加关注节点内的进程通信性能。介绍多种节点内通信协议,以及两种MPI实现(Open MPI和MPICH2)的结构,并对其中基于共享内存的消息传递功能采用的通信协议进行了研究,最后对两者的点点通信性能测试结果进行了比较和分析同时提出了优化策略。 展开更多

关键词 Open MPI mpich2 多核 共享内存 SM nemesis

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一种三维结构网格并行算法 被引量：1

9

作者 韩志熔 陆志良 +1 位作者 郭同庆 陈迎春 《航空计算技术》 2010年第6期58-61,共4页

基于三维结构网格,以MPICH2作为并行开发环境,研究了对等模式下流场的并行计算问题。在三维结构网格已经生成的前提下,针对计算区域的划分,网格输出格式和数据通信,提出了一种并行算法。算法的核心思想是将需要通讯的其他区域的单元按... 基于三维结构网格,以MPICH2作为并行开发环境,研究了对等模式下流场的并行计算问题。在三维结构网格已经生成的前提下,针对计算区域的划分,网格输出格式和数据通信,提出了一种并行算法。算法的核心思想是将需要通讯的其他区域的单元按区号从1到n排列,并获得本区域通信单元的I-J-K编号与其他区域通讯单元的排列序号的映射关系。最后,在IBM BladeCenter HS22刀片机平台上进行了算例验证,结果表明算法具有很好的可靠性与通用性。 展开更多

关键词 三维结构网格 mpich2 并行计算 数据通信

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一种三维并行自适应计算方法 被引量：1

10

作者 韩志熔 《航空计算技术》 2015年第3期21-24,共4页

基于串行网格划分软件METIS与并行化消息传递编程接口(MPICH2)对现有串行自适应程序进行简单的并行化改造,给出了一种三维可压缩无粘流数值模拟的并行自适应方法。首先利用单个进程调用METIS,串行划分网格;然后对所有进程并行计算以获... 基于串行网格划分软件METIS与并行化消息传递编程接口(MPICH2)对现有串行自适应程序进行简单的并行化改造,给出了一种三维可压缩无粘流数值模拟的并行自适应方法。首先利用单个进程调用METIS,串行划分网格;然后对所有进程并行计算以获得初始网格下的流场解;再次利用单个进程对整个流场运用自适应方法进行局部网格加密并调用METIS串行划分网格;最后全部进程在流场初始解的基础上继续并行计算,以获得自适应网格下的流场解。数值模拟算例验证了此方法的可靠性与高效性。 展开更多

关键词 METIS mpich2 并行自适应方法 局部网格加密

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NWChem并行计算集群的组建

11

作者 张明昕 陈莲英 陈小辉 《科技资讯》 2009年第32期92-94,共3页

量子化学计算模拟是应用于药物设计、化学反应机理探讨等领域的重要技术手段,而组建相关计算平台是其基础。本文介绍了以NWChem量化计算软件包为核心,采用普通个人微机为节点,通过千兆以太网和MPICH软件实现并行,用Torque软件进行作业... 量子化学计算模拟是应用于药物设计、化学反应机理探讨等领域的重要技术手段,而组建相关计算平台是其基础。本文介绍了以NWChem量化计算软件包为核心,采用普通个人微机为节点,通过千兆以太网和MPICH软件实现并行,用Torque软件进行作业管理的,高性价比的量化计算解决方案。 展开更多

关键词 计算模拟 分布式 集群 NWChem mpich2 TORQUE

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基于Windows和MPI的PC机群的构建 被引量：1

12

作者 李静 《科技信息》 2013年第24期254-255,共2页

目前高校和科研机构对高性能计算机的要求很大,而商业的超级计算机性能高却价格昂贵,采用并行计算和网络技术构建机群,可以利用高校所拥有的大量普通PC机,提高计算速度,降低运算成本。本文介绍了MPICH2在Windows系统上的安装配置及机群... 目前高校和科研机构对高性能计算机的要求很大,而商业的超级计算机性能高却价格昂贵,采用并行计算和网络技术构建机群,可以利用高校所拥有的大量普通PC机,提高计算速度,降低运算成本。本文介绍了MPICH2在Windows系统上的安装配置及机群测试。据此以了解建立高性能计算机的方法,使用现有计算机组装高性能计算机。 展开更多

关键词 MPI 机群 mpich2

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基于RapidIO的MPI设备层的设计与实现 被引量：2

13

作者 金亨科 雷咏梅 梁基 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2008年第21期5464-5467,共4页

针对RapidIO网络的特点,分析MPICH2的层次设计以及建立在TCP,SCTP网络通信协议上的MPI通信方法,通过重新定义ADI3下的CH3层,设计并实现了一种基于RapidIO的MPI设备层,建立了从MPI到RapidIO的通信通道并实现了多流通信的思想。通过在装有... 针对RapidIO网络的特点,分析MPICH2的层次设计以及建立在TCP,SCTP网络通信协议上的MPI通信方法,通过重新定义ADI3下的CH3层,设计并实现了一种基于RapidIO的MPI设备层,建立了从MPI到RapidIO的通信通道并实现了多流通信的思想。通过在装有RapidIO网卡机器上的实验表明,在带宽和延迟通信性能上,这种专用的MPI设备层要比以太网模拟器表现出色,而且对于大数据量的通信,性能表现更好。 展开更多

关键词 消息传递接口 mpich2 RAPIDIO 设备层的设计与实现 集群 高性能计算

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基于RapidIO的单边通信接口的设计与实现

14

作者 刘明雷 陈磊 +2 位作者 沈文枫 徐炜民 郑衍衡 《计算机应用与软件》 CSCD 2009年第5期31-33,共3页

随着MPI-2的发布,单边通信越来越受到广泛的关注。集群系统中单边通信将是一个重要的发展方向,由IBM研制的BlueGene/L系统就是一个典型例子。在PowerPC架构上实现了一种基于RapidIO的单边通信接口,为下一步与MPICH2的连接实现迈出了重... 随着MPI-2的发布,单边通信越来越受到广泛的关注。集群系统中单边通信将是一个重要的发展方向,由IBM研制的BlueGene/L系统就是一个典型例子。在PowerPC架构上实现了一种基于RapidIO的单边通信接口,为下一步与MPICH2的连接实现迈出了重要一步。基于RapidIO的单边通信接口,将使整个网络达到低开销、高带宽和低延时,集群系统的性能也必将得到极大的提高。 展开更多

关键词 RAPIDIO BLUE Gene/L mpich2 SCI 单边通信 点对点通信

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基于K-均值与AGNES聚类算法的校园网行为分析系统研究 被引量：5

15

作者 茆汉国 《现代电子技术》 北大核心 2016年第23期116-120,共5页

校园网中的服务器存有海量的用户访问日志文件,记录了校园网用户的访问信息。鉴于此,提出了一种基于聚类算法的校园网用户行为分析技术,设计和实现了数据预处理系统,对日志数据进行一系列的清理、合并,标准化等预处理,使其更好地适应后... 校园网中的服务器存有海量的用户访问日志文件,记录了校园网用户的访问信息。鉴于此,提出了一种基于聚类算法的校园网用户行为分析技术,设计和实现了数据预处理系统,对日志数据进行一系列的清理、合并,标准化等预处理,使其更好地适应后续的聚类操作。将预处理后的数据作为输入数据,分别实现了三种常用的聚类算法对日志数据进行聚类,然后从聚类准确率和聚类速度两个角度对现有算法进行优化。为了提高聚类准确率,提出了用K-均值算法结合AGNES算法的方法;为了提高聚类速度,在MPICH2平台上设计和实现了并行K-均值算法,实现多机并行分析,最后简单介绍了校园网行为分析系统的应用。 展开更多

关键词 校园网 行为分析 聚类算法 mpich2

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面向单一系统映像的透明MPI编程模型研究与实现 被引量：1

16

作者 孙忠义 金同标 殷进勇 《计算机应用与软件》 CSCD 北大核心 2013年第11期164-167,220,共5页

提出两种不同级别透明MPI(Message Passing Interface)的概念和结构组成,分别从应用级透明和通信级透明两个层面来阐述提出透明MPI的动机,以及它们的具体架构和基于MPICH2的实现过程,并对其优缺点进行全面分析。通过测量发现,在单一系... 提出两种不同级别透明MPI(Message Passing Interface)的概念和结构组成,分别从应用级透明和通信级透明两个层面来阐述提出透明MPI的动机,以及它们的具体架构和基于MPICH2的实现过程,并对其优缺点进行全面分析。通过测量发现,在单一系统映像的机群下,透明MPI不仅简单易用,还获得了性能上的提高。 展开更多

关键词 透明MPI mpich2 应用级透明 通信级透明

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基于网格环境的遥感图像并行处理 被引量：2

17

作者 张旭晴 陈圣波 +4 位作者 范继璋 魏晓辉 吴琼 王明常 金晟业 《微计算机信息》 2010年第5期5-6,30,共3页

对于海量遥感数据处理而言,关键是如何处理大量的网络计算,借助网格整合异构计算资源的优势,设计开发适合遥感图像处理的网格计算环境和算法。本文结合实际研究,以Globus为网格中间件,CSF4为元调度器构建网格环境,依据MPICH-G2编程模式... 对于海量遥感数据处理而言,关键是如何处理大量的网络计算,借助网格整合异构计算资源的优势,设计开发适合遥感图像处理的网格计算环境和算法。本文结合实际研究,以Globus为网格中间件,CSF4为元调度器构建网格环境,依据MPICH-G2编程模式,以遥感图像增强中的平滑处理为例,在网格环境下实现遥感图像并行化处理,并处理效率进行了对比分析。 展开更多

关键词 网格:CSF4 MPICH—G2 GLOBUS 图像处理

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xCAT在高性能计算机集群系统中的应用研究 被引量：1

18

作者 于佳 《电脑编程技巧与维护》 2019年第9期50-51,64,共3页

随着计算机信息技术的发展,高性能计算机集群系统中复杂数据量的计算任务,对服务器集群的节点处理能力提出了高要求。xCAT是一种分布式的计算机集群管理工具,具有非常强的实际操作能力,可以有效地对服务器集群进行节点并行管理,解决服... 随着计算机信息技术的发展,高性能计算机集群系统中复杂数据量的计算任务,对服务器集群的节点处理能力提出了高要求。xCAT是一种分布式的计算机集群管理工具,具有非常强的实际操作能力,可以有效地对服务器集群进行节点并行管理,解决服务器集群系统的计算处理问题。对xCAT和服务器集群系统进行了介绍,从针对新引进的服务器集群化改造的实际需求出发,在软件节点和计算节点配置服务等方面的基础之上,对xCAT在高性能计算机集群系统中的应用进行了研究。 展开更多

关键词 xCAT软件 高性能服务器集群系统 mpich2并行计算环境 SSH通信 节点管理 计算机维护

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网格中具有任意根结点的多层已知拓扑型广播通信算法

19

作者 王丽 苏德富 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2004年第11期139-141,共3页

网格是第三代的Internet的核心技术,它正引起人们的广泛注意,其中GLOBUS是最具有代表性的网格项目。该文在分析研究Globus的MPICH-G2中的已知拓扑型广播算法的基础上,提出了关于对该算法的改进,使之可以适应于广播操作的根进程为任意进... 网格是第三代的Internet的核心技术,它正引起人们的广泛注意,其中GLOBUS是最具有代表性的网格项目。该文在分析研究Globus的MPICH-G2中的已知拓扑型广播算法的基础上,提出了关于对该算法的改进,使之可以适应于广播操作的根进程为任意进程的一般情况。 展开更多

关键词 网格 MPICH—G2 集合通信 广播 已知拓扑型广播

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MPICH-G2及其在网格计算中的应用研究

20

作者 白雅兰 袁道华 《计算机与数字工程》 2008年第11期15-19,共5页

介绍了MPI与网格计算的相关概念,描述了MPICH-G2的工作原理、特性以及MPICH-G2在网格环境下实现MPI并行计算的方法。综合阐述了MPICH-G2的通信性能及其在网格计算中的应用现状,并且通过对近几年使用MPICH-G2和Globus网格服务结合搭建分... 介绍了MPI与网格计算的相关概念,描述了MPICH-G2的工作原理、特性以及MPICH-G2在网格环境下实现MPI并行计算的方法。综合阐述了MPICH-G2的通信性能及其在网格计算中的应用现状,并且通过对近几年使用MPICH-G2和Globus网格服务结合搭建分布式异构环境的典型实例的具体分析,展示了MPICH-G2在网格计算中的重要作用,总结了MPICH-G2的现存问题与发展前景。 展开更多

关键词 MPICH—G2 网格计算 MPI Globus隐藏异构性

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