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SWI/SNF复合体在胃癌发生和免疫治疗中的研究进展
1
作者 张江涛(综述) 王春泽 +1 位作者 李径庭 高小玲(审校) 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第7期881-888,共8页
SWI/SNF复合体为具有调控转录活性的染色质重塑家族之一,在调控机体生理功能稳态发挥重要作用。近年来多项研究表明,SWI/SNF复合体相关基因失调在肿瘤发生发展扮演重要角色,且具有作为肿瘤免疫检查点疗效生物标志物的潜能。因此,文章就... SWI/SNF复合体为具有调控转录活性的染色质重塑家族之一,在调控机体生理功能稳态发挥重要作用。近年来多项研究表明,SWI/SNF复合体相关基因失调在肿瘤发生发展扮演重要角色,且具有作为肿瘤免疫检查点疗效生物标志物的潜能。因此,文章就近年来SWI/SNF成员与胃癌临床特征、分子机制和免疫治疗等相关研究展开综述,为胃癌诊疗提供新见解。 展开更多
关键词 染色质重塑 胃癌 SWI/snf 免疫治疗
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子宫颈SWI/SNF缺陷型未分化癌的临床病理分析
2
作者 周永清 褚红娟 +1 位作者 饶楠 唐福婷 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期540-543,共4页
目的探讨子宫颈SWI/SNF缺陷型未分化癌的临床病理及分子学特征。方法回顾性分析2例子宫颈SWI/SNF缺陷型未分化癌的临床资料、细胞学涂片、组织学切片、免疫表型和基因检测结果,并复习相关文献。结果患者年龄分别为50岁和51岁,均因阴道... 目的探讨子宫颈SWI/SNF缺陷型未分化癌的临床病理及分子学特征。方法回顾性分析2例子宫颈SWI/SNF缺陷型未分化癌的临床资料、细胞学涂片、组织学切片、免疫表型和基因检测结果,并复习相关文献。结果患者年龄分别为50岁和51岁,均因阴道不规则出血就诊,高危型HPV检测阴性,子宫颈细胞学涂片显示与基底细胞类似的恶性肿瘤细胞;组织学表现为肿瘤细胞呈片状、梁状浸润性生长,肿瘤细胞小,核质比高,染色质粗,核仁不明显,可见核分裂象及坏死。免疫表型:2例肿瘤均弥漫表达vimentin,局部表达CK8/18,1例缺失表达SMARCA4、SMARCA2,1例缺失表达SMARCA2、保留表达SMARCA4,2例均不表达Syn、CgA、CKpan、CK5/6、p40、S-100、SOX10、CD3、CD20、CD43、MPO、CD34、TDT、desmin和MyoD1;基因检测显示2例均出现SMARCA4基因突变。随访12个月,1例确诊后6个月死亡,1例手术后无瘤生存。结论子宫颈SWI/SNF缺陷型未分化癌为罕见肿瘤,组织学形态与小细胞癌相似,SMARCA4是常见的突变基因,不同病例的分子改变及预后有差异,基因检测对该肿瘤的诊断与预后具有重要价值。 展开更多
关键词 子宫颈肿瘤 未分化癌 SWI/snf SMARCA4
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SWI/SNF复合体基因突变促进NSCLC细胞在NSI小鼠体内肝转移的研究
3
作者 高玲玲 谢至 +14 位作者 林首恒 吕志异 周文斌 陈冀 朱琳琳 张莉 曾鹏辉 黄晓丹 颜文青 陈宇 卢丹霞 张水莲 郭伟浜 李鹏 张绪超 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期753-764,共12页
背景与目的SWI/SNF复合体(switch/sucrose nonfermentable chromatin-remodeling complex,SWI/SNF)是一种重要的染色质重塑复合物,其亚基变异在多种肿瘤中存在,并与多种肿瘤细胞生物学特征相关。但其基因突变是否参与非小细胞肺癌(non-s... 背景与目的SWI/SNF复合体(switch/sucrose nonfermentable chromatin-remodeling complex,SWI/SNF)是一种重要的染色质重塑复合物,其亚基变异在多种肿瘤中存在,并与多种肿瘤细胞生物学特征相关。但其基因突变是否参与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)肝转移过程尚不清楚。本研究拟探究SWI/SNF复合体基因突变对NSCLC肝转移的影响及潜在机制。方法我们使用全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES)分析了NSCLC细胞H1299、H23和H460中SWI/SNF复合体基因突变。通过CRISPR/Cas9(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)技术构建了ARID1A基因稳定敲除的H1299细胞株,建立了小鼠模型模拟NSCLC肝转移,观察不同基因突变对肝转移的影响。利用RNA-Seq和蛋白印迹分析差异基因的表达,并通过免疫组化技术(immunohistochemistry,IHC)检测了SWI/SNF复合体调控的靶分子在小鼠肝转移灶中的表达。结果WES分析确定了SWI/SNF复合体基因的突变情况。动物实验结果显示SWI/SNF复合体基因突变与免疫缺陷小鼠较高的肝转移率相关。转录组测序和蛋白印迹分析显示SWI/SNF复合体基因突变细胞中ALDH1A1和APOBEC3B表达上调,尤其是ARID1A蛋白缺失的H460和H1299 sgARID1A中ALDH1A1表达水平显著上升。IHC染色亦显示H460和H1299 sgARID1A细胞肝转移灶中ALDH1A1高表达。结论本研究强调了SWI/SNF复合体基因ARID1A和SMARCA4等突变在促进肺癌细胞肝转移中的关键作用。这些基因突变可能通过促进ALDH1A1与APOBEC3B高表达进而发挥肝特异性转移的作用,为深入探究肺癌肝转移分子机制提供了新线索。 展开更多
关键词 肺肿瘤 SWI/snf复合体 突变 肿瘤转移
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SWI/SNF染色质重塑复合体及其与肿瘤病理生理相关性的研究进展
4
作者 肖兆铭 宋先璐 +3 位作者 谢涛 余雨中 李康劲 赵善超 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第11期2128-2135,共8页
SWI/SNF复合体是具有ATP酶活性的染色质结构重塑复合体,通过调控核小体空间位置、结构的方式产生相应表观遗传学效应。SWI/SNF复合体表观遗传学效应主要涉及细胞增殖、分化及DNA修复等过程,其有序进行密切相关复合体的完整性。体细胞内... SWI/SNF复合体是具有ATP酶活性的染色质结构重塑复合体,通过调控核小体空间位置、结构的方式产生相应表观遗传学效应。SWI/SNF复合体表观遗传学效应主要涉及细胞增殖、分化及DNA修复等过程,其有序进行密切相关复合体的完整性。体细胞内,累及SWI/SNF复合体编码基因的失能性突变可造成其亚基缺失,并破坏相关细胞生理活动的有序进行。最终,导致多种肿瘤的发生与进展。全基因组测序示,SWI/SNF复合体编码基因失能性突变比例在泛癌组织中达25%,略低于经典抑癌基因TP53编码基因突变率(26%)。SWI/SNF复合体内亚基缺失所产生的促癌效应具有多层次性。在表观遗传学层面,亚基缺失可阻遏SWI/SNF复合体有效拮抗多种癌症相关表观遗传学效应因子,如PRC合体的转录效应。导致细胞去分化或过度增殖。在基因组层面,由于SWI/SNF复合体参与以同源重组修复为主的DNA修复进程,可导致基因组不稳定及癌症相关突变的累积。此外,亚基缺失可转变SWI/SNF复合体功能表观遗传学功能,致使其以“残余”效应促进肿瘤进展。由于SWI/SNF复合体部分亚基在细胞生理功能上存在互补性且密切参与DNA双链修复途径,靶向其特定亚基或使用PARP抑制剂,可产生合成致死效应而有效抑制SWI/SNF复合体缺陷肿瘤进展。部分SWI/SNF复合体缺陷肿瘤,如ARID1A缺陷型,其肿瘤免疫微环境存在显著抑制状态,使其对肿瘤免疫治疗存在良好的敏感性。 展开更多
关键词 SWI/snf复合体 染色质重构 肿瘤发生 肿瘤进展
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SWI/SNF中BAF和PBAF复合物在乳腺癌中的作用
5
作者 邹芳芳 张振坤 秦春新 《南昌大学学报（医学版）》 2023年第3期89-92,共4页
由于人口老龄化、环境恶化和一些不良生活习惯的出现,乳腺癌发病率和致死率位居女性恶性肿瘤的首位。SWI/SNF复合物中BAF和PBAF染色质重塑复合物在转录机制中起至关重要的作用,全基因组测序发现癌症中SWI/SNF复合物发生约20%的突变。文... 由于人口老龄化、环境恶化和一些不良生活习惯的出现,乳腺癌发病率和致死率位居女性恶性肿瘤的首位。SWI/SNF复合物中BAF和PBAF染色质重塑复合物在转录机制中起至关重要的作用,全基因组测序发现癌症中SWI/SNF复合物发生约20%的突变。文章综述BAF和PBAF复合物与乳腺癌相关研究进展,并讨论各亚基在乳腺癌形成和发展机制中的重要作用。 展开更多
关键词 乳腺癌 BAF和PBAF复合物 SWI/snf复合物
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多原发恶性肿瘤合并SWI/SNF复合体缺陷型胃癌1例报告及文献复习
6
作者 吕纯鑫 吴秀奇 夏青 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期495-498,共4页
多原发恶性肿瘤合并SWI/SNF复合体缺陷型胃癌的病例报道较少见。本例是由上海交通大学医学院附属仁济医院肿瘤科收治的1例多原发恶性肿瘤合并SWI/SNF复合体缺陷型胃癌的病例,通过分析临床病理特点、诊疗过程等,并结合文献复习,讨论该类... 多原发恶性肿瘤合并SWI/SNF复合体缺陷型胃癌的病例报道较少见。本例是由上海交通大学医学院附属仁济医院肿瘤科收治的1例多原发恶性肿瘤合并SWI/SNF复合体缺陷型胃癌的病例,通过分析临床病理特点、诊疗过程等,并结合文献复习,讨论该类肿瘤的发生、病理和免疫组化特征、诊治及预后。该例患者是异时性多原发恶性肿瘤,先确诊早期肺癌,经手术治愈,后确诊为SWI/SNF复合体缺陷型胃癌,合并ARID1A突变及TMB-H,经化疗联合免疫治疗效果不佳,总生存期13月。本报道旨在提高对多原发恶性肿瘤合并SWI/SNF复合体缺陷型胃癌的认知及诊治水平,改善患者的生存预后。 展开更多
关键词 多原发恶性肿瘤 SWI/snf复合体缺陷 胃癌
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肝癌中SWI/SNF复合物突变与免疫检查点抑制剂治疗应答反应的研究进展
7
作者 尹雪 于明航 +1 位作者 王玺 陈京龙 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期768-774,共7页
SWI/SNF(SWItch/sucrose non-fermentable)复合物是一类依赖ATP的染色质重塑复合物,其亚基在肝癌中频繁发生突变或缺失。这些突变或缺失易导致染色质结构和功能异常,进而影响肝癌细胞的生物学行为,并影响肝癌患者对免疫检查点抑制剂治... SWI/SNF(SWItch/sucrose non-fermentable)复合物是一类依赖ATP的染色质重塑复合物,其亚基在肝癌中频繁发生突变或缺失。这些突变或缺失易导致染色质结构和功能异常,进而影响肝癌细胞的生物学行为,并影响肝癌患者对免疫检查点抑制剂治疗的应答反应。本文主要总结了肝癌中SWI/SNF复合物亚基突变与免疫检查点抑制剂治疗应答反应的研究进展,探讨其亚基突变与免疫检查点抑制剂治疗应答率、耐药性和预测标志物的关系,并展望未来的研究方向和临床应用前景。 展开更多
关键词 SWI/snf复合物 肝癌 免疫检查点抑制剂 染色质重塑
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肾细胞癌细胞中PBRM1-SWI/SNF复合体通过E2F1参与细胞周期控制
8
作者 潘有福 金燕红 +5 位作者 李胡丽 辛慧 田瑜 徐丹 郑前 张晓兰 《遵义医科大学学报》 2023年第2期105-113,共9页
目的探讨敲减PBRM1是否会影响ccRCC细胞增殖以及在转录水平上PBRM1如何调控这一过程。方法通过RNA干扰、RT-PCR、Western blot、MTT和FACS实验,对于敲减PBRM1后的细胞增殖、E2F1家族成员的表达进行了分析;同时也通过ChIP实验研究了E2F1... 目的探讨敲减PBRM1是否会影响ccRCC细胞增殖以及在转录水平上PBRM1如何调控这一过程。方法通过RNA干扰、RT-PCR、Western blot、MTT和FACS实验,对于敲减PBRM1后的细胞增殖、E2F1家族成员的表达进行了分析;同时也通过ChIP实验研究了E2F1与PBRM1的相互转录调控机制。结果数据显示,在SN12C细胞中敲减PBRM1显著增加有丝分裂指数(MI),并伴随E2F1转录因子的上调。PBRM1被招募到E2F1启动子,与该启动子的活性组蛋白修饰共同发生。E2F1也被招募到PBRM1启动子,并通过结合其应答元件对PBRM1的表达起抑制作用。结论含有PBRM1的SWI/SNF复合体具有抗增殖作用;PBRM1缺陷以及PBRM1和(或)E2F成员的下游调控基因,可能在ccRCC的发生和发展中起协同作用。 展开更多
关键词 ccRCC PBRM1 E2F1转录因子 SWI/snf 细胞周期 组蛋白修饰
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PIH1D1对染色质重塑复合物SNF5亚基降解的影响 被引量：1
9
作者 翟妞 张业 沈珝琲 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期756-759,共4页
目的探讨PIH1D1对其结合蛋白SNF5的稳定性的影响。方法通过蛋白合成抑制剂环己酰亚胺(CHX)和蛋白酶体抑制剂MG132抑制作用找到SNF5的降解路径,而后转染PIH1D1真核表达质粒,探讨其对SNF5稳定性的影响。结果得到CHX和MG132的最佳作用浓度;... 目的探讨PIH1D1对其结合蛋白SNF5的稳定性的影响。方法通过蛋白合成抑制剂环己酰亚胺(CHX)和蛋白酶体抑制剂MG132抑制作用找到SNF5的降解路径,而后转染PIH1D1真核表达质粒,探讨其对SNF5稳定性的影响。结果得到CHX和MG132的最佳作用浓度;SNF5通过蛋白酶体依赖的途径降解;PIH1D1抑制SNF5的降解,从而稳定SNF5。结论PIH1D1可能通过阻断蛋白酶体依赖途径,抑制SWI/SNF染色质重塑复合物SNF5亚基的降解,从而起到稳定SNF5的作用。 展开更多
关键词 SWI/snf染色质重塑复合物 snf5 PIH1D1 蛋白酶体依赖降解
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SNF2家族新成员Ercc6l的cDNA克隆与表达分析(英文) 被引量：6
10
作者 陈祥贵 李勇 +3 位作者 臧明玺 裴新荣 许雅君 高丽芳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第5期443-448,共6页
SNF2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用 .报道了SNF2家族新成员Ercc6l (excisionrepaircross complementingrodentrepairdeficiency,complementationgroup 6 like)的cDNA克隆、特性与表达分析 .通过表达序列标签 (EST)... SNF2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用 .报道了SNF2家族新成员Ercc6l (excisionrepaircross complementingrodentrepairdeficiency,complementationgroup 6 like)的cDNA克隆、特性与表达分析 .通过表达序列标签 (EST)搜索和组装 ,获得了cDNA全长 4 0 0 2bp的新基因Ercc6l (GenBankAcc .NoAY172 6 88) ,然后通过RT PCR在小鼠胚胎心脏成功克隆了该基因 .Ercc6l在小鼠基因组中由两个外显子和一个内含子组成 ,定位于X染色体 ,最大开放阅读框 (ORF)编码一个含 12 4 0个氨基酸的假定蛋白质 .该假定蛋白质含有SNF2蛋白的 8个保守基序 (SNF2结构域 ) .通过与SNF2家族各亚家族的成员进行多重比对 ,初步确认Ercc6l属于ERCC6亚家族成员 .将Ercc6l编码区克隆到pEGFP C3然后转染HeLa ,3T3和B16细胞 ,融合蛋白主要定位于胞浆 .BLAST搜索检索出 6 9条小鼠EST与Ercc6l同源 ,这些EST主要来自胚胎和肿瘤组织 .对小鼠不同发育时期的多种组织进行RT PCR ,发现Ercc6l在胚胎期强表达 ,出生产后表达显著下调 . 展开更多
关键词 Ercc6l 基因克隆 snf2蛋白 表达谱 亚细胞定位
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香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析 被引量：2
11
作者 刘一贤 周端咏 +2 位作者 毛超 汪军 黄俊生 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第21期160-164,共5页
为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白... 为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白进行氨基酸序列比对和分析。研究结果显示,2个生理小种的SNF1基因的ORF分别为2 136、2 130 bp,二者相差6个碱基,同源性为99.5%。FOC1和FOC4的SNF1基因分别编码711、709个氨基酸,相差两个氨基酸,为丝氨酸(FOC1)和谷氨酰胺(FOC1)。生物信息学软件预测结果表明该蛋白N端不存在信号肽,但具有两个相同的功能结构域位点,分子量约为79 ku,pI为6.80。 展开更多
关键词 香蕉枯萎病菌 生理小种 snf1基因 细胞壁降解酶 致病性
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SnF_2标准生成Gibbs自由能的测定 被引量：2
12
作者 韩元山 王常珍 +1 位作者 田彦文 翟玉春 《东北大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第9期876-879,共4页
采用LaF3单晶(掺杂)作为固体电解质,在多次抽空充氩气的操作箱内,将Pb,Sn磨细过筛,按照4∶1的比例分别将Pb,PbF2,Sn,SnF2混合并压成片·Pb PbF2为参比电极,Sn SnF2为工作电极,银丝为电极引线组成工作电池·电池的结构为:(+)Ag|P... 采用LaF3单晶(掺杂)作为固体电解质,在多次抽空充氩气的操作箱内,将Pb,Sn磨细过筛,按照4∶1的比例分别将Pb,PbF2,Sn,SnF2混合并压成片·Pb PbF2为参比电极,Sn SnF2为工作电极,银丝为电极引线组成工作电池·电池的结构为:(+)Ag|Pb,PbF2|LaF3单晶(掺杂)|Sn,SnF2|Ag(-)·用高阻数字电压表准确测定了电池在293 15～353 15K范围内的电动势·以两种PbF2标准生成Gibbs自由能数据和电池电动势为基础,计算得到SnF2标准生成自由能同温度的关系·电池电动势测量的实验误差远远小于PbF2标准生成Gibbs自由能数据中所给定的误差,采用两种不同的PbF2标准生成Gibbs自由能数据所得到的SnF2标准生成自由能的数值,彼此之间的偏差很小·所以上述两种计算结果都是可靠的· 展开更多
关键词 Gibbs自由能 snf2 LaF3固体电解质 电池电动势 PbF2 误差
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SWI/SNF染色质重塑在肿瘤中的研究进展 被引量：3
13
作者 张记 吴玉章 阎萍 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第10期1437-1440,共4页
染色质重塑复合体SWI/SNF亚基基因在肿瘤中突变率高达20%,突变造成编码蛋白失活及整个复合体功能异常,导致肿瘤发生。目前SWI/SNF抑制肿瘤的已知机制主要包括其与Polycomb复合体间的表观拮抗及与c-Myc及PIK3CA等原癌基因信号通路协同作... 染色质重塑复合体SWI/SNF亚基基因在肿瘤中突变率高达20%,突变造成编码蛋白失活及整个复合体功能异常,导致肿瘤发生。目前SWI/SNF抑制肿瘤的已知机制主要包括其与Polycomb复合体间的表观拮抗及与c-Myc及PIK3CA等原癌基因信号通路协同作用等。 展开更多
关键词 SWI/snf 染色质重塑 ARID1A
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SWI/SNF染色质重塑复合物与肾脏肿瘤 被引量：3
14
作者 夏秋媛 周晓军 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期313-315,共3页
SWI/SNF复合物是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,在肿瘤中起抑癌基因作用,其多个亚基失活与肾脏肿瘤的发生、发展关系密切,且常常提示肿瘤预后不良。该文现综述SWI/SNF复合物与肾脏肿瘤的相关研究进展,旨在阐述SWI/SNF复合物在某些肾脏... SWI/SNF复合物是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,在肿瘤中起抑癌基因作用,其多个亚基失活与肾脏肿瘤的发生、发展关系密切,且常常提示肿瘤预后不良。该文现综述SWI/SNF复合物与肾脏肿瘤的相关研究进展,旨在阐述SWI/SNF复合物在某些肾脏肿瘤发生及演变过程中可能的作用。 展开更多
关键词 肾肿瘤 横纹肌样瘤 SWI/snf 染色质重塑 文献综述
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SWI/SNF染色质重塑复合物依赖的心脏发育及心脏病理性重构的表观遗传调控机制 被引量：1
15
作者 李一飞 周开宇 华益民 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期312-317,共6页
近年来随着表观遗传研究的发展,染色质重塑对于基因表达的调控也越来越受到关注。其中SWI/SNF作为最为重要的一种染色质重塑复合物,其在种属间具有较高的保守性,通过结合相应的DNA序列,改变染色质局部形态,从而调控基因的表达。SWI/SNF... 近年来随着表观遗传研究的发展,染色质重塑对于基因表达的调控也越来越受到关注。其中SWI/SNF作为最为重要的一种染色质重塑复合物,其在种属间具有较高的保守性,通过结合相应的DNA序列,改变染色质局部形态,从而调控基因的表达。SWI/SNF染色质重塑复合物及其主要功能亚基在心脏发育、心脏功能整合及心肌病理性重构调控过程中均具有重要意义,且已经取得了众多突破性研究成果。这些研究结果为心脏疾病的发生发展机制提供了一种全新的理论与实验支持。文章综述SWI/SNF染色质重塑复合物在心脏发育及病理性重构中的研究进展。 展开更多
关键词 SWI/snf染色质重塑复合物 表观遗传学 心脏发育 病理性重构
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基于SNF的一种检测和跟踪性能优化方法 被引量：1
16
作者 徐本连 董学平 王执铨 《火力与指挥控制》 CSCD 北大核心 2006年第8期11-14,共4页
对于一个监视系统,跟踪性能的优化要求检测系统和跟踪系统通过引入反馈进行联合设计,针对最大量测幅值邻域滤波器(SNF),提出了先验和后验检测跟踪优化准则,通过分析得出先验优化准则不可行这一结论,而利用后验优化准则同时对检测阈值和... 对于一个监视系统,跟踪性能的优化要求检测系统和跟踪系统通过引入反馈进行联合设计,针对最大量测幅值邻域滤波器(SNF),提出了先验和后验检测跟踪优化准则,通过分析得出先验优化准则不可行这一结论,而利用后验优化准则同时对检测阈值和门值的联合优化,仿真结果表明,用后验优化准则进行检测和跟踪性能优化,不仅具有比恒虚警率更好的跟踪精度,而且其计算代价也大为降低。 展开更多
关键词 snf滤波器 目标跟踪 优化方法
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酿酒酵母SNF4基因的克隆及生物信息学分析 被引量：1
17
作者 吴毕莎 柯崇榕 +3 位作者 林晓华 林清强 陈由强 黄建忠 《生物信息学》 2012年第1期8-11,共4页
SNF4基因编码的Snf4p具有调节Snf1复合体的蛋白激酶活性功能,根据已知的SNF4基因序列设计引物扩增获得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列。序列分析表明,SNF4基因的开放阅读框为969bp,编码322个氨基酸残基。应用生物信息方法预测其理... SNF4基因编码的Snf4p具有调节Snf1复合体的蛋白激酶活性功能,根据已知的SNF4基因序列设计引物扩增获得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列。序列分析表明,SNF4基因的开放阅读框为969bp,编码322个氨基酸残基。应用生物信息方法预测其理化性质、疏水性、信号肽、亚细胞定位、活性位点及其高级结构。结果表明:Snf4p为具有一定亲水性的非跨膜胞内稳定酸性蛋白,功能结构域为CBS_pair superfamily结构域,二级结构主要由a-螺旋组成,空间结构是由4个CBS结构域构成两个CBS对围绕形成的二聚体。Snf4p的第一个CBS对区域的β片层结构是Snf1p、Sip2p的β发夹结构结合作用区。 展开更多
关键词 snf4 酿酒酵母 ADH2 生物信息学
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Na_2SnF_6水解反应的高温高压实验方法研究
18
作者 王玉荣 I-MingChou CyganGaryL. 《地球化学》 CAS 1987年第3期280-285,共6页
用四种不同类型高压釜研究Na_2SnF_6在200—647℃、1 kbar条件下的水解特征。实验表明,淬火速率影响实验结果的精度。快速淬火高压釜及金袋摇摆釜是研究这类化学平衡反应的理想设备,采用水解法可获得水解常数及热焓。
关键词 Na2snf6 水解反应 高温高压 化学平衡 水热实验
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不同碳、氮源质量浓度对高山被孢霉脂质积累及SNF1复合体转录调控的影响研究 被引量：4
19
作者 常璐璐 唐鑫 +3 位作者 张灏 陈永泉 陈海琴 陈卫 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期113-118,140,共7页
高山被孢霉(M.alpina)是一株具有较强脂质合成能力的产油微生物,其脂质积累受培养基中碳、氮源调控。探究了不同葡萄糖和酒石酸铵质量浓度对M.alpina生长及脂质积累的影响,并进一步研究不同碳、氮源质量浓度下M.alpina SNF1复合体各亚... 高山被孢霉(M.alpina)是一株具有较强脂质合成能力的产油微生物,其脂质积累受培养基中碳、氮源调控。探究了不同葡萄糖和酒石酸铵质量浓度对M.alpina生长及脂质积累的影响,并进一步研究不同碳、氮源质量浓度下M.alpina SNF1复合体各亚基的转录水平。结果表明:初始酒石酸铵质量浓度一定时,M.alpina脂肪酸含量随碳氮比(C/N)的增加而提高,C/N为24.6时其脂肪酸含量比C/N为4.6时提高42.6%,初始葡萄糖质量浓度一定时,氮源限制下(C/N=76.7)M.alpina脂肪酸产率达到2.6 g/L,是氮源存在时的1.5~3.2倍,与葡萄糖相比氮源水平对M.alpina脂质积累影响更为显著。氮源一定时高葡萄糖质量浓度(C/N=24.6)下SNF1复合体各亚基转录水平比对照组提高13.9~20.5倍;而氮限制导致的高C/N同样可促进其转录水平的提高。高C/N和氮限制均属于营养失衡信号,说明M.alpina SNF1转录水平的变化是其对胞外营养水平的响应方式,并与脂质积累水平具有相关性。 展开更多
关键词 高山被孢霉 snf1复合体 脂质积累 营养信号 转录调控
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SWI/SNF复合体不同亚基突变晚期非小细胞肺癌的预后及免疫标志物分析 被引量：3
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作者 蒋杰 高玲玲 +11 位作者 陈宇 周文斌 陈冀 颜文青 吕志异 卢丹霞 张水莲 郭伟浜 谢至 田红霞 黄迎 张绪超 《循证医学》 2022年第2期119-125,共7页
目的探讨SWI/SNF复合体(SWItch/Sucrose Non⁃Fermentable complex)不同亚基突变与晚期非小细胞肺癌(non⁃small cell lung cancer,NSCLC)的预后及与肿瘤细胞程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD⁃L1)和肿瘤突变负荷(tumor mutat... 目的探讨SWI/SNF复合体(SWItch/Sucrose Non⁃Fermentable complex)不同亚基突变与晚期非小细胞肺癌(non⁃small cell lung cancer,NSCLC)的预后及与肿瘤细胞程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD⁃L1)和肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)表达的相关性。方法回顾性收集2019年4月至2020年9月在广东省人民医院确诊为不可切除局部晚期或转移性NSCLC患者,采用二代测序的方法检测ARID1A、ARID1B、SMARCA4、PBRM1、ARID2、SMARCB1、SMARCE1基因突变并计算样本TMB,免疫组化方法检测PD⁃L1的表达,结合患者的临床资料进行临床病理特征及生存分析。结果在66例患者中,10例患者检测到同时存在2个亚基共突变,共突变率达15.2%;12例患者检测到SWI/SNF复合体亚基突变伴随KRAS突变,共突变率达18.2%。ARID1A、ARID1B、SMARCA4、PBRM1、ARID2、SMARCB1、SMARCE1亚基突变各占24%、12%、34%、12%、16%、1%、1%。SWI/SNF复合体亚基突变的NSCLC患者PD⁃L1≥1%占83.7%,其中ARID1A和SMARCA4突变患者PD⁃L1≥1%均占22.4%;各亚基突变的TMB具有统计学差异(P=0.01),其中SMARCA4突变患者TMB≥10 Muts/Mb占24.2%。生存分析结果显示SWI/SNF复合体不同亚基突变之间的总生存时间差异无统计学意义(P=0.61)。结论SWI/SNF复合体不同亚基突变在NSCLC中的预后无明显差异,但SMARCA4突变倾向于伴随更高的TMB,其潜在的临床意义有待进一步研究。 展开更多
关键词 SWI/snf复合体 非小细胞肺癌 程序性死亡配体1 肿瘤突变负荷 预后
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