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基于SRAP分子标记构建云南旱冬瓜核心种质
1
作者 邹广权 王晓丽 +3 位作者 曹现富 李艳 张新洛 曹子林 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期49-55,共7页
【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐... 【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐步取样法取样,采用4个遗传多样性指数分析种质子集对原种质的代表性,通过均值t检验和方差F检验分析种质子集与原种质集变异是否同质,利用相关系数分析种质子集与原种质集的相关性,通过遗传距离比较和聚类分析确认核心种质。【结果】25%抽样比例构建的种质子集的多态位点数、多态位点百分率、观测等位基因数和等位基因保留率与原种质集一致,其余4个评价指数皆显著大于原种质集,均值和方差与原种质的相关系数均接近或者等于1,平均遗传距离较原种质提高16.82%,因此认为在25%抽样比例构建的种质子集能很好地代表原种质。【结论】综合考虑核心种质的有效性、实用性、费用和工作量等,认为25%抽样比例构建的旱冬瓜核心种质能充分代表原种质的遗传多样性。 展开更多
关键词 旱冬瓜 srap标记数据 核心种质
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基于形态标记与SRAP标记的莱豆种质资源遗传多样性分析 被引量：1
2
作者 郭媛贞 黄强 +5 位作者 叶新如 陈芝 黄枝 陈海玲 颜墩炜 薛珠政 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期166-173,共8页
[目的]探明莱豆种质资源遗传多样性和亲缘关系,为莱豆种质资源优良基因深度发掘和新品种选育提供科学依据。[方法]利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对22份莱豆资源的26个数量性状和18个质量性状进行测定、分析。[结果]筛选出的28对S... [目的]探明莱豆种质资源遗传多样性和亲缘关系,为莱豆种质资源优良基因深度发掘和新品种选育提供科学依据。[方法]利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对22份莱豆资源的26个数量性状和18个质量性状进行测定、分析。[结果]筛选出的28对SRAP引物扩增多态性条带158条,平均多态性比率为77.75%。两种标记方法聚类结果显示,根据莱豆荚果大小可以将22份莱豆资源分为三大类群体。其中,“上横山10-2-6”和“下横山10-3-3”亲缘关系较近,推测可能存在频繁的基因交流。[结论]22份莱豆资源遗传多样性丰富,形态标记和SRAP分子标记两种聚类方法基本支持根据荚果大小划分莱豆资源,为莱豆种质资源的创新利用奠定基础。 展开更多
关键词 莱豆 形态标记 srap分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性
3
作者 刘佳 张梦雅 +7 位作者 任世龙 王永芳 马继芳 全建章 刘磊 董志平 白辉 李志勇 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期179-187,共9页
了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计... 了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明,筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析,这8对引物共扩增出条带1728条,其中多态性条带1492条,多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析,其相似性系数为0.77~0.85,遗传相似系数为0.802时,所有菌株被分为27个遗传宗谱(L1~L27),其中L1为绝对优势组群,共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌,占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析,9个地区谷瘟病菌的Nei′s遗传多样性指数(H)为0.1414~0.2881,Shannon′s信息指数(I)为0.1960~0.4416,河北夏谷区Nei′s遗传多样性指数和Shannon′s信息指数最高,遗传多样性最丰富,而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较,吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远,而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见,不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富,各菌株间存在遗传分化,但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。 展开更多
关键词 谷子 谷瘟病菌 srap 相似性系数 遗传多样性
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利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性 被引量：3
4
作者 黄锦春 万思琦 +7 位作者 陈扬 李丽红 张自力 朱建军 吴梅 邢丙聪 邵清松 陆晨飞 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期22-29,共8页
【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多... 【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多态性(ISSR)与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,各挑选11条(对)多态性好、扩增条带清晰的引物。经琼脂糖凝胶电泳成像后,统计其扩增条带数,运用NTSYS-PC 2.1和POPGENE 32软件进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】ISSR分子标记技术共扩增出86条条带,其中多态性条带84条,多态位点百分率为97.67%;SRAP分子标记技术共扩增出88条条带,其中多态性条带86条,多态位点百分率为97.73%,ISSR和SRAP标记均表现出较高的多态性。不同样本间的遗传距离和遗传一致度表明:浙江省与福建省的金线莲种质混杂严重,而遗传多样性结果显示:福建省的金线莲种群遗传多样性更高。此外,基于ISSR和SRAP标记的UPGMA聚类结果显示:48份不同种源的金线莲依亲缘关系的远近可分为四大类,聚类的划分受到一定地域性的影响,但各地域的金线莲品种在这四大类中均互有混杂。【结论】金线莲在物种水平上遗传多样性较高,在各地区、各品种(系)间遗传交流频繁,ISSR与SRAP分子标记技术可以从分子水平上揭示浙江与福建等地金线莲的遗传多样性,且结合ISSR标记与SRAP标记的分析结果要优于单一的分子标记结果。 展开更多
关键词 金线莲 遗传多样性 分子标记 种质资源 ISSR srap
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基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性 被引量：2
5
作者 李亚萍 戴惠明 +3 位作者 姜武 陈家栋 段晓婧 陶正明 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期658-664,共7页
【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(... 【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(四川、贵州、云南)等4个居群的47份黄精种质资源的遗传多样性。【结果】对88对SRAP引物进行筛选,有7对可用于黄精种质资源的SRAP-PCR分析,共得到159条扩增条带,其中多态性条带140条。物种水平上,多态性比率为88.05%,有效等位基因数(Ne)为1.600 6,Nei’s基因多样性指数(H)为0.204 1,Shannon信息指数(I)为0.308 0;居群水平上,多态性比率为42.14%~86.16%,H和I分别为0.188 1~0.259 1和0.238 2~0.399 4;4个居群的基因分化系数(G_(st))为0.194 1,表明有80.59%的遗传变异在种群内进行,基因流(N_(m))为2.075 4,表明居群间存在一定的基因流动;从非加权组平均法(UPGMA)聚类结果可知:当相似系数为0.66时,47份样品分成4组,Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ类的均为华东地区浙江种质资源,当相似系数为0.68时,Ⅱ类分成2支。西南与西北聚为一类,浙江庆元黄精聚类结果复杂,表明地理位置差异与亲缘关系远近没有特定关系。整体上华东居群遗传多样性丰富,而庆元黄精种质遗传多样性最丰富。【结论】黄精遗传多样性水平较高,居群间存在一定的基因交流,可为黄精新品种选育工作提供参考。图3表4参22。 展开更多
关键词 黄精 相关序列扩增多态性(srap)分子标记 遗传多样性 产区
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南召辛夷SRAP遗传多样性分析及指纹图谱的构建 被引量：1
6
作者 王岚 郭晓琴 +1 位作者 张宏 李靖靖 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2023年第2期249-254,共6页
利用毛细管电泳技术,鉴定SRAP(Sequence-related amplified polymorphisms)引物在34个南召辛夷种系中扩增条带的遗传多样性,聚类分析并构建DNA指纹图谱,为南召辛夷的种系鉴定和分子育种提供理论依据。结果表明:(1)5对SRAP引物共扩增出7... 利用毛细管电泳技术,鉴定SRAP(Sequence-related amplified polymorphisms)引物在34个南召辛夷种系中扩增条带的遗传多样性,聚类分析并构建DNA指纹图谱,为南召辛夷的种系鉴定和分子育种提供理论依据。结果表明:(1)5对SRAP引物共扩增出71条带,其中59条多态性的条带(83.1%),每对引物扩增出多态性位点为9~15条,平均为11.8条;(2)选用多态性高、鉴别能力强的2对引物构建了34份南召辛夷种系基于22个位点的DNA指纹图谱;(3)34份南召辛夷的遗传相似系数为0.58~0.97。UPGMA聚类结果显示,34个南召辛夷样品可分为6大类群,且与采摘地无直接关系。 展开更多
关键词 南召辛夷 srap 遗传多样性 指纹图谱 分子标记
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基于SRAP分子标记的147份睡莲属植物遗传多样性分析 被引量：1
7
作者 毛立彦 龙凌云 +7 位作者 黄秋伟 丁丽琼 李慧敏 池昭锦 唐毓玮 苏群 农晓慧 朱天龙 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期454-466,共13页
【目的】对147份睡莲属植物的遗传多样性及亲缘关系进行分析,为睡莲属种质资源保护、开发利用及新品种选育的亲本选择提供科学参考。【方法】筛选获得扩增条带清晰、多态性好的SRAP引物,对112份睡莲属植物种质和35份杂交后代进行多态性... 【目的】对147份睡莲属植物的遗传多样性及亲缘关系进行分析,为睡莲属种质资源保护、开发利用及新品种选育的亲本选择提供科学参考。【方法】筛选获得扩增条带清晰、多态性好的SRAP引物,对112份睡莲属植物种质和35份杂交后代进行多态性扩增,基于扩增结果构建0/1矩阵,利用Popgene 1.32计算遗传多样性相关参数。最后采用NTSYS 2.1的非加权组平均法(UPGMA)计算遗传相似系数和遗传距离并构建聚类图。【结果】利用筛选的10个引物对从147份睡莲属植物材料中扩增出207个条带,其中多态性条带207条,多态性比率100%,平均每对引物扩增20.7条。147份睡莲属植物的观测等位基因数(Na)为2.0000,有效等位基因数(Ne)为1.1777~1.3339,平均为1.2535,Shannon信息指数(I)为0.2459~0.3703,平均为0.3155,Nei’s遗传多样性指数(H')为0.1345~0.2230,平均为0.1835。在遗传相似系数0.65和遗传距离为1.12时,均可将147份睡莲属植物材料划分为六大类,并依据10个引物对扩增的0/1矩阵构建了147份睡莲属植物材料的DNA分子身份证。【结论】睡莲属植物具有丰富的遗传多样性。采用SRAP分子标记可有效鉴定睡莲属植物材料的亲缘关系远近,有助于提高亲本选择率和育种进程。筛选出的10个引物对能有效地鉴定35份杂交后代。 展开更多
关键词 睡莲 种质资源 遗传多样性 srap分子标记
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基于SRAP分子标记的孔雀草种质资源遗传多样性分析
8
作者 陈利文 马薇 +1 位作者 唐楠 唐道城 《青海大学学报》 2023年第1期28-35,共8页
为有效利用孔雀草种质资源、促进新品种选育,本研究利用SRAP技术对18份孔雀草材料进行遗传多样性分析和聚类分析。结果表明:利用24对SRAP引物检测到多态性条带数平均为117.39条,多态性条带比例平均为38.70%,Shannon多样性指数平均为0.2... 为有效利用孔雀草种质资源、促进新品种选育,本研究利用SRAP技术对18份孔雀草材料进行遗传多样性分析和聚类分析。结果表明:利用24对SRAP引物检测到多态性条带数平均为117.39条,多态性条带比例平均为38.70%,Shannon多样性指数平均为0.290,选用的SRAP分子标记可有效鉴别孔雀草种质在分子水平上的遗传变异。18份孔雀草材料的遗传相似系数在0.608以上,平均为0.793,表明供试材料有一定的遗传背景差异,但丰富度不高。UPGMA聚类分析表明,聚类结果与孔雀草的花色、株高、冠幅有一定的联系,可部分反映参试株系的遗传背景差异,在田间依据植株表型性状进行亲本选配时,花色、生长势、冠幅可作为区分孔雀草种质的参考指标。本研究结果对孔雀草品种鉴定、杂交育种中亲本选配和分子标记辅助选择具有重要意义。 展开更多
关键词 孔雀草 种质资源 srap 遗传多样性 亲缘关系
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NaN_(3)诱变草莓突变体的表型筛选与SRAP分子鉴定
9
作者 彭安妹 徐梦琴 +4 位作者 毛敏 何克勤 胡能兵 兰伟 崔广荣 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第2期77-82,92,共7页
【目的】探索NaN_(3)对红花草莓的诱变效果,筛选出红花草莓突变体。【方法】在对NaN_(3)诱变红花草莓植株形态学初筛的基础上,进一步采用SRAP分子标记技术进行分子鉴定,通过聚类分析鉴定了红花草莓与其突变单株的遗传背景和亲缘关系。... 【目的】探索NaN_(3)对红花草莓的诱变效果,筛选出红花草莓突变体。【方法】在对NaN_(3)诱变红花草莓植株形态学初筛的基础上,进一步采用SRAP分子标记技术进行分子鉴定,通过聚类分析鉴定了红花草莓与其突变单株的遗传背景和亲缘关系。【结果】从M1代中筛选出23株具有不同表型变化的突变体,总突变率为4.6%,包括株型紧凑、株高变矮、茎纤细、小叶、叶片卷曲皱缩、花叶、白色花、三色花、花瓣短缩花、球型花、球形果、矩形果共12种突变性状;SRAP分子标记分析结果显示,8对SRAP引物扩增出的总条带数为72,多态性条带数为47,多态性比例为65%,23株表型突变株中有22个单株在DNA水平发生了基因突变;聚类分析表明,N-5、N-8和N-9与对照在遗传距离上相差最远,产生的变异最大,N-15与对照无差异。【结论】NaN_(3)诱变红花草莓育种是行之有效的,可产生草莓突变体,为红花草莓新品种选育以及相关研究提供参考依据。 展开更多
关键词 草莓 NaN_(3)诱变 形态学鉴定 srap分子标记
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烟草DNA的提取与SRAP反应体系的建立 被引量：66
10
作者 梁景霞 祁建民 +4 位作者 吴为人 周东新 陈顺辉 王涛 陶爱芬 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 2005年第4期33-38,共6页
以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μm... 以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μmol,上下引物各30ng、DNA模板40ng、DNA聚合酶1.5U,扩增程序为:在94℃预变性5min,反应前5个循环在94℃1min,33℃1min,72℃1min条件下运行;随后的30个循环复性温度提高到53℃,最后72℃延伸5min。本文还讨论了不同分子标记在烟草中应用的优缺点以及SRAP分子标记在烟草上的应用前景,提出了应用SRAP分子标记构建烟草遗传图谱的可行性。 展开更多
关键词 烟草 DNA提取 srap反应体系 PCR反应体系 DNA模板 srap 提取方法 DNA聚合酶 分子标记 MGCL2
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怀地黄SRAP分子标记体系的建立与DNA指纹图谱的构建 被引量：14
11
作者 谷凤平 周春娥 +4 位作者 路淑霞 姚换灵 王芳 段红英 周延清 《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期175-178,共4页
以怀地黄DNA为模板,进行SRAP反应条件的优化及DNA指纹图谱构建,优化的反应体系为:25μL的体积中,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度2.5 mmol.L-1,上下游引物各0.36μmol.L-1,dNTPs 0.30 mmol.L-1,Taq DNA酶2.0 U.构建了怀地黄23个品种的DNA指纹图... 以怀地黄DNA为模板,进行SRAP反应条件的优化及DNA指纹图谱构建,优化的反应体系为:25μL的体积中,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度2.5 mmol.L-1,上下游引物各0.36μmol.L-1,dNTPs 0.30 mmol.L-1,Taq DNA酶2.0 U.构建了怀地黄23个品种的DNA指纹图谱,为怀地黄品种鉴定、遗传多样性分析、分子标记辅助育种和质量综合评价等研究奠定了基础. 展开更多
关键词 怀地黄 srap扩增体系优化 srap DNA指纹图谱
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甜菜SRAP-PCR反应体系的优化 被引量：13
12
作者 王华忠 吴则东 +1 位作者 韩英 王丛玲 《中国糖料》 2007年第2期1-4,共4页
为了建立适宜甜菜的SRAP反应体系,以40个不同类型的甜菜品系为试验材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响。对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立了适合甜菜的SRAP... 为了建立适宜甜菜的SRAP反应体系,以40个不同类型的甜菜品系为试验材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响。对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立了适合甜菜的SRAP反应体系为:在20μL反应体系中,模板DNA为40ng,Taq DNA聚合酶1.0U,引物60ng,dNTP(2.5mmol/L)为1.6μL,扩增程序为94℃预变性3min,反应前5个循环在94℃1min,35℃1min,72℃1min的条件下运行;随后的35个循环复性温度提高到50℃,最后72℃延伸10min。并利用该反应体系对甜菜40个不同品系进行SRAP反应,用6%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,不同品系间DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠,可以用于甜菜的分子标记研究。 展开更多
关键词 甜菜 srap标记 srap—PCR反应条件 变性聚丙烯酰胺凝胶
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基于SRAP分子标记的果桑种质资源遗传多样性分析
13
作者 孙秀秀 林夏 +3 位作者 王景飞 翁春雨 张永豪 陈宣 《现代农业科技》 2023年第15期73-78,共6页
为探索果桑种质之间的亲缘关系,选取适宜海南地区生长的34份果桑资源,通过可靠的SRAP分子标记技术,进行果桑种质的遗传多样性分析研究。结果表明:从100对SRAP引物组合中筛选获得16对扩增多态性高的引物组合,共扩增清晰的条带108条,其中... 为探索果桑种质之间的亲缘关系,选取适宜海南地区生长的34份果桑资源,通过可靠的SRAP分子标记技术,进行果桑种质的遗传多样性分析研究。结果表明:从100对SRAP引物组合中筛选获得16对扩增多态性高的引物组合,共扩增清晰的条带108条,其中多态性条带93条,平均多态性比率为84.96%,平均每对引物组合扩增6.75条。平均观测等位基因数为1.8704,平均有效等位基因数为1.5200,平均Nei′s基因多样性指数为0.3022,平均Shannon′s信息指数为0.4510。遗传相似系数为0.49~0.95,表明34份果桑种质之间遗传多样性比较高。根据UPGMA聚类树状图,在遗传相似系数为0.32处,供试34份果桑种质可归属为五大类群,其中第Ⅰ类群27份,占79.41%,包括大部分果桑供试材料;第Ⅱ类群3份种质,占8.82%,分别为嘉陵30号、云桑2号、本地桑HNQZ01(采自海南琼中);第Ⅲ类群和第Ⅳ类群各1份种质,分别为红宝石和长果桑,均占到2.94%;第Ⅴ类群包括2份种质,分别为香金葚、长相思,占5.88%。本研究结果可为果桑种质资源的鉴定、评价及优良品种选育提供科学依据。 展开更多
关键词 果桑 srap标记 种质资源 遗传多样性
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基于SRAP和SCoT标记分析不同甜樱桃品种遗传多样性
14
作者 李沛华 王进 +3 位作者 梁东 吕秀兰 周桂虹 李元美 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期12-22,共11页
【目的】探究40个甜樱桃(Prunus avium L.)品种的遗传多样性及SRAP和SCoT标记在甜樱桃上的应用。【方法】利用SRAP和SCoT分子标记进行遗传多样性分析。【结果】筛选出6对条带清晰、多态性好的SRAP引物和7条SCoT引物,在40个甜樱桃品种中... 【目的】探究40个甜樱桃(Prunus avium L.)品种的遗传多样性及SRAP和SCoT标记在甜樱桃上的应用。【方法】利用SRAP和SCoT分子标记进行遗传多样性分析。【结果】筛选出6对条带清晰、多态性好的SRAP引物和7条SCoT引物,在40个甜樱桃品种中分别扩增出多态性条带67和69条,多态性百分率分别为90.54%和93.24%。SRAP标记和SCoT标记的UPGMA聚类分析表明,40个甜樱桃品种的遗传相似系数分别在0.67~0.95和0.72~0.93,说明甜樱桃的遗传背景相对较窄。SRAP标记在相似系数0.79左右可以将40份甜樱桃分为6组,SCoT标记在相似系数在0.77左右可以将40份甜樱桃分为6组。两种分子标记中,来自不同地区的甜樱桃品种没有明显聚类,说明各个地区甜樱桃品种基因交流频繁,另外大部分黄色系甜樱桃品种聚为一类。【结论】2种分子标记均可应用于分析甜樱桃遗传多样性且能够区分不同果皮颜色甜樱桃,可以作为后期种质资源利用和新品种选育的技术手段。 展开更多
关键词 甜樱桃 相关序列扩增多态性 目标起始密码子多态性 遗传多样性
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利用SRAP、SSR和AFLP标记构建甘蓝型油菜遗传连锁图谱 被引量：88
15
作者 李媛媛 沈金雄 +2 位作者 王同华 傅廷栋 马朝芝 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期1118-1126,共9页
【目的】建立甘蓝型油菜的高质量遗传图谱,为在分子水平上研究复杂性状打下基础并提供保证。【方法】以甘蓝型油菜自交不亲和系“SI-1300”及其恢复系“Eagle”组配得到的184个F2单株为群体,利用SRAP、SSR和AFLP标记技术构建甘蓝型油菜... 【目的】建立甘蓝型油菜的高质量遗传图谱,为在分子水平上研究复杂性状打下基础并提供保证。【方法】以甘蓝型油菜自交不亲和系“SI-1300”及其恢复系“Eagle”组配得到的184个F2单株为群体,利用SRAP、SSR和AFLP标记技术构建甘蓝型油菜遗传图谱。【结果】该图谱共包含21个连锁群,涉及137个SRAP标记、143个SSR标记和118个AFLP标记。图谱总长1949.8cM,标记间平均图距为4.9cM。以SSR标记为锚定标记,该图谱与国际标准图谱进行了初步对应。研究共发现了8个偏分离区域。【结论】根据对标记分布的均匀程度,图谱覆盖程度以及标记密度等方面的分析,本研究构建的甘蓝型油菜分子遗传图谱质量较高,并且SRAP标记可能是比AFLP标记更适合于图谱构建的标记体系。 展开更多
关键词 油菜 遗传图谱 AFLP srap SSR
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用SRAP标记分析中国甘蓝型油菜品种的遗传多样性和遗传基础 被引量：165
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作者 文雁成 王汉中 +2 位作者 沈金雄 刘贵华 张书芬 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期246-256,共11页
【目的】探讨中国甘蓝型油菜遗传多样性和遗传基础。【方法】采用SRAP（sequence-related amplifled polymorphiSill）标记对建国以来不同时期选育的130个品种进行分析。【结果】25个SRAP引物组合共扩增到509个谱带、123个多态性带；多... 【目的】探讨中国甘蓝型油菜遗传多样性和遗传基础。【方法】采用SRAP（sequence-related amplifled polymorphiSill）标记对建国以来不同时期选育的130个品种进行分析。【结果】25个SRAP引物组合共扩增到509个谱带、123个多态性带；多态性带的比例为24％。每对引物组合的谱带数和多态性带数分别为20．4个和4．9个。在遗传距离为0．12处，将130个甘蓝型油菜品种（系）分为A、B、C、D4个类群，其中78．5％的品种归入C类。C类又可在遗传距离0．10处分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ5个亚群，又有58．5％的品种归入Ⅲ亚群。说明我国近60%的甘蓝型油菜品种遗传多样性较匮乏。遗传基础分析结果表明，20世纪80年代前育成的甘蓝型油菜品种的遗传基础最窄，80年代最宽，90年代略有下降。进入21世纪，品种间的遗传基础进一步下降。差异显著性测验结果表明，1991～2000年间与2000年以后育成的品种间的平均遗传距离差异不显著，80年代前育成品种与80年代育成的品种平均遗传距离间差异达到0．01显著水平，80年代与90年代育成的品种间遗传距离差异达到0．05的显著水平。我国育成的品种间的遗传距离与引进品种间的遗传距离差异达到0．01的极显著水平。【结论】SRAP标记是一种经济、有效和可靠的分子标记手段。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 srap 遗传多样性 遗传基础
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番茄SRAP-PCR体系优化与品种分子鉴定 被引量：69
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作者 王燕 龚义勤 +4 位作者 赵统敏 刘广 郁樊敏 叶海龙 柳李旺 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期23-29,共7页
对番茄基因组DNA的SRAP-PCR体系中Mg^2＋、dNTPs和引物浓度进行了优化，结果表明反应体系中适宜浓度为Mg^2＋ 1．5—3．0mmol·L^-1，dNTPs0．05—0．20mmol·L^-1，引物0．25μmol·L^-1；模板DNA为10～20ng（10μL反应体... 对番茄基因组DNA的SRAP-PCR体系中Mg^2＋、dNTPs和引物浓度进行了优化，结果表明反应体系中适宜浓度为Mg^2＋ 1．5—3．0mmol·L^-1，dNTPs0．05—0．20mmol·L^-1，引物0．25μmol·L^-1；模板DNA为10～20ng（10μL反应体系）。运用优化的体系，筛选获得3个合作906与其父母本多态性标记引物组合。利用15个引物组合对11个番茄主要品种以及1个近缘野生种进行种质鉴定的SRAP标记分析，10个多态性的引物组合共检测到55个多态性位点，平均每个引物可鉴别3．7个品种，双引物组合me8／em8-1与me6—1／em14-1可以区分所有供试材料。应用NTSYS-pc软件进行聚类分析（UPGMA），园艺性状相似的品种在较近的遗传距离聚类，表明SRAP可有效用于番茄品种资源鉴定与遗传多样性分析。 展开更多
关键词 番茄 srap 体系优化 品种鉴定
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烟草SRAP和ISSR分子遗传连锁图谱构建 被引量：45
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作者 马红勃 祁建民 +7 位作者 李延坤 梁景霞 王涛 兰涛 陈顺辉 陶爱芬 林荔辉 吴建梅 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1958-1963,共6页
采用烤烟品种台烟7号与白肋烟品种白肋21杂交,构建了187个单株的F2遗传作图群体,利用所筛选的68个能扩增出多态性条带的SRAP和ISSR引物,对F2作图群体进行PCR扩增和遗传连锁分析,初步构建了一张包含26个连锁群、112个(92个SRAP和20个ISSR... 采用烤烟品种台烟7号与白肋烟品种白肋21杂交,构建了187个单株的F2遗传作图群体,利用所筛选的68个能扩增出多态性条带的SRAP和ISSR引物,对F2作图群体进行PCR扩增和遗传连锁分析,初步构建了一张包含26个连锁群、112个(92个SRAP和20个ISSR)标记位点的烟草遗传连锁图谱。该图谱覆盖长度为1560.2cM,平均图距18.1cM。有16个标记未进入连锁群。26个连锁群包含2～20标记不等,连锁群遗传距离0～291.0cM。连锁群上有24.1%的标记出现偏分离,主要集中在LG1和LG4连锁群上,其余分散在不同连锁群。该图谱为烟草重要农艺性状的基因定位、以及分子标记辅助选择等研究奠定基础。 展开更多
关键词 烟草 srap ISSR 遗传连锁图谱
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以SRAP和EST-SSR标记分析芝麻种质资源的遗传多样性 被引量：39
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作者 张鹏 张海洋 +3 位作者 郭旺珍 郑永战 魏利斌 张天真 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1696-1702,共7页
利用SRAP和EST-SSR分子标记对192份国内外芝麻种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,2种标记都能很好地揭示品种间遗传关系;在31对SRAP引物组合扩增的270个等位基因中多态性占62.08%,平均每对引物可以检测5.45个;25对SSR引物扩增的136... 利用SRAP和EST-SSR分子标记对192份国内外芝麻种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,2种标记都能很好地揭示品种间遗传关系;在31对SRAP引物组合扩增的270个等位基因中多态性占62.08%,平均每对引物可以检测5.45个;25对SSR引物扩增的136个等位基因中56.28%呈多态性,平均每对检测引物产生3.04个。UPGMA聚类结果显示,在相似性系数为0.70时,192份材料可被分为3个类群;阈值为0.75时类群Ⅰ又可分为6组,表明芝麻品种遗传多样性比较丰富。我国南部地区芝麻品种遗传多样性(多样性指数Hi=2.572)较中部(Hi=2.117)和北部地区(Hi=2.114)丰富。分析结果将有助于更好地保护和利用芝麻种质资源,并为育种工作提供依据。 展开更多
关键词 芝麻 srap EST-SSR 遗传多样性 种质资源
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野生狗牙根种质遗传多样性的SRAP研究 被引量：54
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作者 易杨杰 张新全 +3 位作者 黄琳凯 凌瑶 马啸 刘伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期94-100,共7页
采用SRAP分子标记技术,对采自中国四川、重庆、贵州、西藏四省区的32份野生狗牙根(Cynodon dactylon)材料进行遗传多样性分析,获得下述结果:(1)用14对引物组合共得到132条多态性条带,平均每对引物扩增出9.4条多态带,多态性位点百分率为7... 采用SRAP分子标记技术,对采自中国四川、重庆、贵州、西藏四省区的32份野生狗牙根(Cynodon dactylon)材料进行遗传多样性分析,获得下述结果:(1)用14对引物组合共得到132条多态性条带,平均每对引物扩增出9.4条多态带,多态性位点百分率为79.8%,材料间的遗传相似系数范围在0.591到0.957之间,平均GS值为0.759,这些结果说明,供试野生狗牙根具有较为丰富的遗传多样性;(2)对所有材料进行聚类分析,可聚为4类,大部分来自相同或相似生态地理环境的材料聚为一类,表明供试材料的聚类和其生态地理环境间有一定的相关性;(3)基于Shannon多样性指数估算了6个狗牙根生态地理类群内和类群间的遗传分化,发现类群内遗传变异占总变异的65.56%,而类群间遗传变异占总变异的34.44%;(4)对各生态地理类群基于Nei氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明,各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性。 展开更多
关键词 狗牙根 srap 遗传多样性 聚类分析
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