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烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1信号肽预测及分析 被引量：5
1
作者 王铁霖 李晶 +1 位作者 杨玉文 赵廷昌 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第1期92-100,共9页
利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs（Open reading frame）所编码的N端有信号肽序... 利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs（Open reading frame）所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽（SPI）,81条脂蛋白型信号肽（SPII）。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为11~42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示,具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间是高度保守的。该研究提供了野火病原菌致病因子的备选基因,提高该病菌致病因子的筛选效率。 展开更多
关键词 Pseudomonas SYRINGAE pv.tabaci 信号肽 Signal P 4.0 Lipo P 1.0 tmhmm v2.0
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