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免疫筛选恶性疟原虫cDNA克隆 被引量:6
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作者 王燕妮 谢毅 +5 位作者 肖谷田 李明 毕惠祥 巢穗 王萍 李英杰 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第4期193-197,共5页
目的 :获取恶性疟原虫 (海南株 )抗原的 c DNA克隆并进行初步鉴定。方法 :采用 dot-EL ISA,以兔免疫血清对恶性疟原虫 c DNA表达文库约 80万个重组噬斑进行筛选 ,并用 2 0株单克隆抗体和恶性疟患者血清对强阳性克隆进行再筛选。 PCR初... 目的 :获取恶性疟原虫 (海南株 )抗原的 c DNA克隆并进行初步鉴定。方法 :采用 dot-EL ISA,以兔免疫血清对恶性疟原虫 c DNA表达文库约 80万个重组噬斑进行筛选 ,并用 2 0株单克隆抗体和恶性疟患者血清对强阳性克隆进行再筛选。 PCR初步鉴定 17个强阳性克隆。结果 :兔免疫血清确定了 17个强阳性克隆 ,患者血清检测到 11个阳性克隆 (含 8个强阳性 ) ,11株单抗与 9个 c DNA克隆呈阳性反应。 17个强阳性克隆均能扩增出大小在 30 0 bp- 2 .5kb左右的条带。结论 :已筛选到能与抗恶性疟原虫兔血清、单克隆抗体及患者血清产生特异性免疫反应的 c DNA克隆。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 cdna克隆 抗体 筛选
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人血管内皮生长因子-C基因编码区cDNA的克隆与测序 被引量:8
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作者 潘剑 华成舸 +5 位作者 温玉明 李珉 王刚 王昌美 李龙江 陈绍维 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期318-320,共3页
目的 克隆人舌癌组织中血管内皮生长因子 (VEGF)_C功能片段的cDNA ,为进一步研究VEGF_C在口腔鳞癌中表达的意义及与淋巴转移的关系打下基础。方法 以RT_PCR法从舌鳞癌组织中克隆VEGF_C基因功能片段的cDNA ,用限制性内切酶消化和PCR筛... 目的 克隆人舌癌组织中血管内皮生长因子 (VEGF)_C功能片段的cDNA ,为进一步研究VEGF_C在口腔鳞癌中表达的意义及与淋巴转移的关系打下基础。方法 以RT_PCR法从舌鳞癌组织中克隆VEGF_C基因功能片段的cDNA ,用限制性内切酶消化和PCR筛选出阳性克隆pCRII_VEGF_C ,以SP6和T7引物完成VEGF_CcDNA的全序列测定。结果 从人舌癌组织总RNA中克隆到约 1 1kb大小的VEGF_C基因cDNA ,经测序与Genbank公布的人VEGF_C基因cDNA序列的同源性为 99 6 %。结论 从人舌癌组织中克隆得到的VEGF_C基因功能片段cDNA ,为进一步研究VEGF_C在口腔癌颈淋巴结转移中的功能效应提供了物质基础。 展开更多
关键词 血管内皮生长因子-c 基因编码区 cdna 克隆 测序 舌鳞癌组织
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囊虫病诊断用抗原编码cDNA的分子克隆 被引量:62
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作者 孙树汉 王俊霞 +3 位作者 陈蕊雯 陆惠萍 彭郁葱 王朝霞 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期15-20,共6页
目的 :克隆与分析囊虫病诊断用抗原及其编码基因。方法 :采用基因重组技术 ,构建来源于猪囊尾蚴 m RNA的 c DNA文库。以囊虫病患者、囊虫病病猪的血清为探针从 c DNA文库中筛选出目的克隆。结果 :获得人、猪共同抗原 2个 (分子量分别为 ... 目的 :克隆与分析囊虫病诊断用抗原及其编码基因。方法 :采用基因重组技术 ,构建来源于猪囊尾蚴 m RNA的 c DNA文库。以囊虫病患者、囊虫病病猪的血清为探针从 c DNA文库中筛选出目的克隆。结果 :获得人、猪共同抗原 2个 (分子量分别为 2 8k Da和 18k Da) ,人特异性抗原和猪特异性抗原各 1个 (分子量为 34 k Da、 14k Da)。这些抗原的编码克隆分别命名为λc C1、λc C2、λc H1及 λc P1。c C1c DNA含有编码 2 8k Da的人、猪共同抗原的完整基因 ,全长 10 70 bp,起始密码 ( ATG)从自 2 2 bp,终止密码 ( TGA)结于 74 7bp,长为 74 7bp的开放阅读框架编码由 2 4 9个氨基酸组成的多肽 ,其理论推导分子量为 2 7.36k Da。结论 :以 c C1等融合蛋白为诊断用抗原 ,具有高度的特异性和较理想的敏感性。 展开更多
关键词 囊尾蚴病 猪囊尾蚴 抗原多肽 分子克隆
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沙田柚无机焦磷酸酶基因的cDNA克隆及序列分析 被引量:1
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作者 秦新民 万珊 +2 位作者 李惠敏 覃屏生 张渝 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期842-847,867,共7页
植物自交不亲和性是植物生殖过程中普遍存在的一种现象,是植物特异性识别并拒绝自身花粉或亲缘关系很相近的花粉的一种遗传机制。无机焦磷酸酶(inorganic pyrophosphatase,IPPase)在植物生长发育方面起重要作用。该研究根据沙田柚花柱... 植物自交不亲和性是植物生殖过程中普遍存在的一种现象,是植物特异性识别并拒绝自身花粉或亲缘关系很相近的花粉的一种遗传机制。无机焦磷酸酶(inorganic pyrophosphatase,IPPase)在植物生长发育方面起重要作用。该研究根据沙田柚花柱消减文库中EST序列(无机焦磷酸酶基因内部片段),设计了2对特异引物5'-GSP1,5'-n GSP1,3'-GSP2 and 3'-n GSP2,通过SMART-RACE PCR技术从所构建的沙田柚花柱抑制性消减文库中克隆了沙田柚无机焦磷酸酶基因的c DNA全长序列,利用Blastn、DNAman和Expasy软件对所克隆的基因进行同源性分析,以及基因编码的氨基酸的分子量、等电点、疏水性等理化性质分析。结果表明:IPPase基因c DNA全长为1 136 bp(Gen Bank登录号为KF990474),开放阅读框(ORF)全长为654 bp,共编码217个氨基酸,包括170 bp 5'UTR和312 bp的3'UTR;编码的蛋白质的分子量为24.4 k Da,等电点为5.96;蛋白结构域分析显示沙田柚IPPase与焦磷酸酶具有相同的保守结构域;对沙田柚IPPase蛋白质序列进行疏水性分析,结果表明沙田柚IPPase基因编码的肽链中疏水性最大值约为3.21,最小值约为-2.98,属于亲水性蛋白,无跨膜区域;Blastn搜索的结果显示,沙田柚IPPase基因序列与多种植物的IPP基因高度同源;序列分析表明,沙田柚IPPase基因核苷酸的同源性与毛果杨(Populus trichocarpa)和橡胶树(Hevea brasiliensis)IPPase基因均为87%;氨基酸序列与克莱门柚(Citrus clementina)无机焦磷酸酶完全一致。该研究结果可为深入研究无机焦磷酸酶在沙田柚自交不亲和中的作用机理提供基础。 展开更多
关键词 沙田柚 无机焦磷酸酶 全长c dna 基因克隆 序列分析
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人蛋白CcDNA基因的克隆及序列分析 被引量:3
5
作者 贾莉玮 吕茂民 +3 位作者 沈永才 赵保全 张亚东 章金刚 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第4期26-28,32,共4页
为实现人蛋白CcDNA在哺乳动物细胞中的表达以及研究其生物学特性 ,针对人蛋白CcDNA序列设计引物 ,运用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)从人胎肝总RNA中钓取人蛋白CcDNA ,将其克隆入 pIRESneo载体中 ,通过酶切和PCR鉴定出重组体并进行测序... 为实现人蛋白CcDNA在哺乳动物细胞中的表达以及研究其生物学特性 ,针对人蛋白CcDNA序列设计引物 ,运用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)从人胎肝总RNA中钓取人蛋白CcDNA ,将其克隆入 pIRESneo载体中 ,通过酶切和PCR鉴定出重组体并进行测序分析。结果表明 ,获得大小为 1386bp的人蛋白CcDNA基因 ,成功构建人蛋白CcDNA载体 pIRES/hPC ,为进一步进行人蛋白CcDNA的表达和活性鉴定奠定了基础。 展开更多
关键词 人蛋白c cdna基因 克隆 序列分析 逆转录聚合酶链反应
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HCV5'端非编码区cDNA的体外转录 被引量:1
6
作者 李刚 姚集鲁 +2 位作者 彭文伟 王斌 陈青 《中国病毒学》 CSCD 1996年第4期332-337,共6页
采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)从广东省一例慢性丙型肝炎病人血清中获得丙型肝炎病毒(HCV)5'端非编码区(5'NCR)302bp的cDNA片段,经补齐和提纯后插入pUC19质粒,获得的重组体pUN进行序列测定... 采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)从广东省一例慢性丙型肝炎病人血清中获得丙型肝炎病毒(HCV)5'端非编码区(5'NCR)302bp的cDNA片段,经补齐和提纯后插入pUC19质粒,获得的重组体pUN进行序列测定。将pUN的目的基因亚克隆进体外转录载体pSPORTI多克隆位点的EooRI和PstI切点之间,所得重组体pSN线性化后由T_7RNA多聚酶及SP6RNA多聚酶引导体外转录反应,产物经凝胶电泳及特异引物RT-PCR,证实SP6引导的是正义RNA,T7合成的是反义RNA,其大小分别力429bp和362bp。并证实所得RNA力HCV5'NCRcDNA转录而来。获得的HCV5'NCRcDNA和RNA在常规逆转录和PCR步骤中用于设立有效的模板对照,对消除假用性及评估试剂有重要意义。同时,HCV5'NCR体外转录载体的构建可用于制各RNA探针和反义RNA,改进后还可作为定量PCR的竞争性模板。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 分子克隆 体外转录 cdna
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鸭坦布苏病毒基因组全长cDNA克隆构建与分析
7
作者 云涛 陈柳 +4 位作者 张存 倪征 华炯钢 余斌 叶伟成 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第11期1910-1915,共6页
根据鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)ZJ-407株全基因组序列设计并合成4对特异的Infusion引物,应用RT-PCR技术分4段扩增了DTMUV全基因组c DNA。通过In-fusion技术将扩增的c DNA重叠片段A,B,C和D片段分别克隆到载体p BluescriptⅡ... 根据鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)ZJ-407株全基因组序列设计并合成4对特异的Infusion引物,应用RT-PCR技术分4段扩增了DTMUV全基因组c DNA。通过In-fusion技术将扩增的c DNA重叠片段A,B,C和D片段分别克隆到载体p BluescriptⅡKS(+)中,获得了DTMUV全长基因组c DNA克隆p SK-T7-DTMUV。在扩增5'末端时,引入T7启动子序列;在基因组3'末段引入SmaⅠ酶切位点,以供c DNA模板的线性化之用。核酸序列分析表明,DTMUV毒株基因组全长为10 990个核苷酸,与DTMUV ZJ-407 DF-1细胞分离株的同源性为99.9%;全长基因组中有9个核苷酸发生突变,其中7处为沉默突变,2处导致相对应的氨基酸发生改变,且这两处均位于非结构蛋白NS5。结果表明,本研究成功构建了DTMUV ZJ-407株基因组全长c DNA,为其感染性c DNA的拯救奠定基础。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 全长cdna克隆 感染性克隆
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梅花鹿鹿茸组织Anxa-1基因cDNA克隆及表达 被引量:3
8
作者 曲昊淼 丁玲 +1 位作者 赵姬臣 夏彦玲 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期99-103,共5页
从梅花鹿(Cervus nippon)鹿茸间充质中成功克隆出包括膜联蛋白A1(Anxa-1)基因全部编码区的c DNA序列,并结合生物学信息方法及实时荧光定量技术对该基因的氨基酸序列及不同生长时期的表达情况进行了分析。结果表明:Anxa-1基因编码346个... 从梅花鹿(Cervus nippon)鹿茸间充质中成功克隆出包括膜联蛋白A1(Anxa-1)基因全部编码区的c DNA序列,并结合生物学信息方法及实时荧光定量技术对该基因的氨基酸序列及不同生长时期的表达情况进行了分析。结果表明:Anxa-1基因编码346个氨基酸。经生物学信息分析,该基因编码蛋白为稳定蛋白,不具备信号肽,相对分子质量为38 830.4,理论等电点为6.17,一级结构中亮氨酸占最大比例(10.4%)。同源序列比对及系统进化树分析表明,梅花鹿Anxa-1氨基酸序列与藏羚羊(Pantholops hodgsonii)、绵羊(Ovis aries)、山羊(Capra hircus)和水牛(Bubalus bubalis)相似性较高。实时荧光定量RT-PCR分析表明,Anxa-1基因在不同生长时期鹿茸顶端间充质表达存在差异,生长前期的表达量高于中期与后期。 展开更多
关键词 膜联蛋白A1 鹿茸 c dna 克隆 实时荧光定量RT-PcR
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Cloning and RNA interference analysis of the salivary protein C002 gene in Schizaphis graminum 被引量:6
9
作者 ZHANG Yong FAN Jia +1 位作者 SUN Jing-rui CHEN Ju-lian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期698-705,共8页
The full-length c DNA of functionally-unknown salivary protein C002 in Schizaphis graminum was cloned using rapid amplification of c DNA ends(RACE) and designated as Sg C002(Gen Bank accession no. KC977563). It is... The full-length c DNA of functionally-unknown salivary protein C002 in Schizaphis graminum was cloned using rapid amplification of c DNA ends(RACE) and designated as Sg C002(Gen Bank accession no. KC977563). It is 767 bp long and encodes a protein of 190 amino acid residues with a predicted mass of 21.5 k Da and a predicted cleavage site of N-terminal signal peptide between the 24 th and the 25 th residues. Sg C002 is specifically expressed in salivary gland with the highest level at the 2nd instar. Introducing Sg C002-specific 476-si RNA, but not 546-si RNA to aphids through artificial diet significantly suppressed Sg C002 expression. Silencing Sg C002 gene led to lethality of the aphid on wheat plants, but not on pure artificial diet. Our study demonstrated that artificial diet-mediated RNAi can be a useful tool for research on the roles of genes in aphid salivary gland, and also provided new insights into the characteristics of C002 in wheat aphids. 展开更多
关键词 Schizaphis graminum salivary protein c002 c dna clone si RNA
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大鲵免疫分子CD9的克隆与鉴定(英文) 被引量:2
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作者 尤修玲 聂东宋 +3 位作者 秦华夏 刘榴 陈晓俊 廖志勇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期397-407,共11页
CD9是4次跨膜蛋白家族成员,对机体的免疫调控发挥着重要作用.本文首次报道了大鲵CD9的鉴定及其对免疫刺激的应答.大鲵CD9(Chinese giant salamander CD9,cgs CD9)由232个氨基酸组成,被4个跨膜结构域分割成1个胞内环、2个胞外环和2个短... CD9是4次跨膜蛋白家族成员,对机体的免疫调控发挥着重要作用.本文首次报道了大鲵CD9的鉴定及其对免疫刺激的应答.大鲵CD9(Chinese giant salamander CD9,cgs CD9)由232个氨基酸组成,被4个跨膜结构域分割成1个胞内环、2个胞外环和2个短的胞内末端,这是4次跨膜蛋白的主要结构特征.1个糖基化位点NDS、1个CCG模体和7个半胱氨酸残基保守地存在于cgs CD9.cgs CD9与其它脊椎动物CD9具有最高77%氨基酸序列一致性,并与两栖动物CD9归属一族.实时定量RT-PCR结果显示,cgs CD9在大鲵中分布广泛,脾脏组织的表达水平最高,并且脂多糖能显著提高cgs CD9 mRNA的表达.过表达于Jurkat细胞中的cgs CD9能促进核因子κB的活化以及白介素-6的表达,而cgs CD9的作用在CCG模体突变为AAA后几乎丧失.上述结果表明,cgs CD9在大鲵抵抗细菌的免疫应答中发挥重要作用. 展开更多
关键词 大鲵 cD9 c dna克隆 免疫应答
原文传递
戊型肝炎病毒Ch-S-1株全长体外转录载体的构建及表达初步研究
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作者 朱光泽 李一权 +7 位作者 兰添 范园园 张诺娜 胡宁宁 邢彬 尹秀英 李霄 金宁一 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1663-1667,1673,共6页
目的:构建出HEV Ch-S-1株的全长c DNA克隆,并转染至Hep G2细胞并对其表达进行初步研究。方法:利用重叠PCR方法获得HEV Ch-S-1株全长PCR产物;构建体外转录载体p KS-HEV,成功获得HEV基因组RNA,并转染至Hep G2细胞,通过RT-n PCR、套式PCR... 目的:构建出HEV Ch-S-1株的全长c DNA克隆,并转染至Hep G2细胞并对其表达进行初步研究。方法:利用重叠PCR方法获得HEV Ch-S-1株全长PCR产物;构建体外转录载体p KS-HEV,成功获得HEV基因组RNA,并转染至Hep G2细胞,通过RT-n PCR、套式PCR和间接免疫荧光实验检测病毒的表达。结果:成功构建了HEV基因组全长c DNA体外转录载体p KS-HEV,并证明了该c DNA克隆在Hep G2细胞中成功进行了表达。结论:成功构建了HEV Ch-S-1株全长体外转录载体p KS-HEV,并对其表达进行了初步研究,为将来在分子水平上研究HEV及研发疫苗提供了一些实验基础。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 反向遗传学 全长c dna克隆 表达载体
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eglinC基因的化学合成与克隆
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作者 傅敏杰 张晓东 +3 位作者 王鄂生 申宗侯 王启松 闵永洁 《武汉大学学报(自然科学版)》 CSCD 1994年第3期110-116,共7页
采用固相亚磷酰胺法合成了eglinC全基因,该基因全长221bp,包括其结构基因,5'-端起始密码子ATG和3'-端终止密码子TAG,并在基因的5'-和3'-分别装上EcoRI和BamHI位点.共分12个片段,采取分... 采用固相亚磷酰胺法合成了eglinC全基因,该基因全长221bp,包括其结构基因,5'-端起始密码子ATG和3'-端终止密码子TAG,并在基因的5'-和3'-分别装上EcoRI和BamHI位点.共分12个片段,采取分段合成,酶促连接成完整的eglinC基因.合成的基因克隆于M13载体,经杂交、检测,筛选出含eglinC基因的克隆.用双脱氧链终止法测其序列,结果与设计的一致. 展开更多
关键词 eglinc基因 化学合成 无性系 载体
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益母草糖基转移酶基因的克隆及原核表达分析(英文) 被引量:4
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作者 徐德宏 谭朝阳 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期397-405,共9页
通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从益母草(Leonurus heterophyllus Sweet)叶片中克隆获得了一个编码糖基转移酶的基因(LhsUGT)。该基因cDNA全长为1562 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)... 通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从益母草(Leonurus heterophyllus Sweet)叶片中克隆获得了一个编码糖基转移酶的基因(LhsUGT)。该基因cDNA全长为1562 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1368 bp,编码455个氨基酸残基,其分子量和等电点分别为50.47 k D和5.52。生物信息学分析结果显示:LhsUGT编码的酶蛋白含有3种二级结构,其中α螺旋占43.1%,β折叠片占17.5%,无规卷曲占39.4%,其C端还发现了一段高度保守的PSPG结构域,说明LhsUGT编码的酶蛋白属于植物糖基转移酶超家族;对LhsUGT的氨基酸序列进行BLAST同源比对,发现益母草与其它植物的糖基转移酶序列相似性为26.4%-68.0%;系统进化树分析表明,LhsUGT蛋白属于拟南芥糖基转移酶超家族的L组,故推测它可能具有催化简单酚类发生糖基化的功能;SDS-PAGE电泳显示,原核表达系统成功表达出分子量约为69 k D的LhsUGT重组蛋白,其N端含有一段17.9 k D的His标签,且在IPTG诱导5 h后达到最高表达量。本研究结果为进一步开展体外酶促反应、阐明益母草糖基转移酶的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 益母草 糖基转移酶基因 cdna克隆 生物信息学分析 原核表达
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泥鳅角蛋白18(K18)基因的克隆与表达分析
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作者 吴卫君 刘士力 +6 位作者 李倩 王雨辰 练青平 胡廷尖 贾永义 蒋文枰 李喜莲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期114-123,共10页
角蛋白18(K18)是角蛋白的一种,为中间纤维蛋白,是细胞骨架的组成部分。为了解泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)K18序列特征及其在不同组织中的表达,研究采用3'-和5'-RACE法克隆K18基因c DNA全长序列,并运用实时荧光定量PCR技... 角蛋白18(K18)是角蛋白的一种,为中间纤维蛋白,是细胞骨架的组成部分。为了解泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)K18序列特征及其在不同组织中的表达,研究采用3'-和5'-RACE法克隆K18基因c DNA全长序列,并运用实时荧光定量PCR技术探讨其在不同组织中的表达。结果表明,泥鳅K18基因c DNA全长序列1 694 bp,其中包含开放阅读框1 299bp,编码432个氨基酸,其序列具有Ⅰ型角蛋白序列DGKVVS,以及非常相似序列DNA(R/K)LAADDF。相似度分析显示,泥鳅K18与大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)的相似度最高为98%,与其它物种K18也存在不同程度的相似度。系统进化分析表明,泥鳅与其他物种的K18系统发育同源,且同陆生脊椎动物和硬骨鱼类同源,并与大鳞副泥鳅的关系最为密切。通过定量分析,K18基因在泥鳅肠、肌肉、心脏、胃、肝脏、精巢、卵巢、脾脏等8种组织都有表达,其中,肠表达最高,心脏最低。统计学分析表明,K18基因的表达在不同组织间存在显著性差异。 展开更多
关键词 角蛋白18(K18) c dna克隆 泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus) 定量表达
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竹花叶病毒福州分离物基因组序列分析及其侵染性克隆的构建
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作者 闫文凯 林文武 +3 位作者 杨文婷 杜雅馨 吴祖建 杨靓 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第8期35-42,共8页
【目的】研究BaMV福州分离物BaMV-TMS1及其携带的卫星RNA(satBaMV)分离物satBaMV-TMS1的全基因组特征,明确其系统发育关系;对BaMV进行c DNA侵染性克隆构建方法的改进,为其反向遗传学体系的快速建立提供简便的方法。【方法】根据已报道的... 【目的】研究BaMV福州分离物BaMV-TMS1及其携带的卫星RNA(satBaMV)分离物satBaMV-TMS1的全基因组特征,明确其系统发育关系;对BaMV进行c DNA侵染性克隆构建方法的改进,为其反向遗传学体系的快速建立提供简便的方法。【方法】根据已报道的BaMV和satBaMV全长序列保守区分别设计2对和1对扩增引物,从感染BaMV的竹叶中扩增、克隆获得BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1的全长序列,并进行序列特征分析和系统发育树构建。采用多片段无缝克隆方法将扩增得到的2个病毒DNA片段和载体进行连接并转化农杆菌,接种本氏烟后检验其侵染性。【结果】测序获得的BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1分离物核苷酸序列全长分别为6 366和834 nt(不含3'端的多聚腺苷酸尾),具有典型的BaMV和satBaMV基因组结构特征。BaMV-TMS1分离物与已报道的其他分离物序列同源性为82%~83%,而satBaMV-TMS1分离物与其他分离物的序列同源性为92%~93%。系统进化树分析表明,BaMV-TMS1分离物可单独形成一簇,satBaMV-TMS1分离物也单独形成一个新的分支。侵染性克隆通过农杆菌注射接种本氏烟10天以后,RT-PCR检测以及透射电镜负染观察结果都验证病毒成功侵染。【结论】BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1分离物与已知序列有着较高的变异度且生成新的系统发育树分支,体现了该病毒与卫星RNA较高的遗传多样性。本研究成功构建具有生物活性的BaMV侵染性克隆且构建方法相对简单快速。 展开更多
关键词 竹花叶病毒 卫星RNA 全基因组 系统发育 侵染性克隆
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中介蝮毒腺C-型凝集素样蛋白基因的cDNA克隆和序列分析
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作者 陈毓 张卫柱 +2 位作者 刘玲玲 杨玉娥 杨章民 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1129-1136,共8页
C-型凝集素样蛋白是一类钙离子依赖型的具有糖结合活性的非酶蛋白,可结合凝血因子及血小板而影响人体的凝血系统稳态,具有抗凝作用。本研究基于中介蝮(Gloydius intermedius)蛇毒C-型凝集素样蛋白α链和β链的部分核苷酸序列,设计了2对... C-型凝集素样蛋白是一类钙离子依赖型的具有糖结合活性的非酶蛋白,可结合凝血因子及血小板而影响人体的凝血系统稳态,具有抗凝作用。本研究基于中介蝮(Gloydius intermedius)蛇毒C-型凝集素样蛋白α链和β链的部分核苷酸序列,设计了2对PCR引物,通过RT-PCR技术从中介蝮毒腺中克隆出的α和β链(Gi-CTLPα,Gi-CTLPβ)的全长c DNA,克隆入T载体后,对所获克隆进行了测序,并进行了生物信息学分析。结果表明,Gi-CTLPα、Gi-CTLPβ的开放阅读框(ORF)分别为477 bp和462 bp,分别编码158个和153个氨基酸,信号肽分别为21个和23个氨基酸。蛋白质一级结构同源性分析表明,Gi-CTLPα和Gi-CTLPβ之间的序列相似度为29%,Gi-CTLPα和β分别与日本蝮(Gloydius blomhoffi)的Mamushiginα亚基和β亚基的同源性最高(90%和93%),Gi-CTLPα和Mamushigin的α亚基氨基酸序列的差异主要有13个,Gi-CTLPβ和Mamushigin的β亚基氨基酸序列的差异主要有7个。用蛋白功能预测软件SIFT在线分析表明,Gi-CTLPα中第47和136位的氨基酸差异使得Gi-CTLPα与Mamushiginα的功能明显不同,而Gi-CTLPβ和Mamushiginβ亚基的功能没有明显差异。由于Gi-CTLPα和β链会像Mamushigin那样通过二硫键形成异二聚体,这些一级结构的差异会影响其与靶蛋白的结合特性,这一结果为下一步研究Gi-CTLP的功能及利用奠定了理论基础。 展开更多
关键词 中介蝮 蛇毒c-型凝集素样蛋白 cdna 克隆 生物信息学
原文传递
马尾松RCA基因的克隆和序列分析 被引量:3
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作者 潘婷 张逢凯 +4 位作者 王晓锋 阮倩倩 刘靖 盛璐 季孔庶 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期391-400,共10页
1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶(Rubis CO)活化酶(RCA)是体内活化光合作用限速酶—Rubis CO的重要酶。本研究通过反转录PCR和c DNA末端快速扩增技术,从马尾松中分离得到了Pmrca1(登录号KF420118)和Pmrca2(登录号KF420119)两条RCA基因c DN... 1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶(Rubis CO)活化酶(RCA)是体内活化光合作用限速酶—Rubis CO的重要酶。本研究通过反转录PCR和c DNA末端快速扩增技术,从马尾松中分离得到了Pmrca1(登录号KF420118)和Pmrca2(登录号KF420119)两条RCA基因c DNA序列。两条序列均包含完整的编码区与5'端和3'非翻译区,长度分别为1 816 bp和1 953 bp,编码Pm RCA1和Pm RCA2两个蛋白,长度分别为480和440个氨基酸。序列分析发现两个蛋白质都具有RCA和AAA+蛋白家族(ATPase associated with various cellular activities)特异性结构域和定位于叶绿体的转运肽,Pm RCA1还具有RCA大同工型特有的由两个半胱氨酸(Cys)残基组成的保守结构。多重序列比对显示,这两个蛋白质序列分别与红花槭的RCA大同工型和小同工型的相似性达到78%。将Pm RCA1和Pm RCA2与20种不同物种RCA构建进化树,发现其与地中海松属于同一分支。研究结果为进一步分析马尾松RCA的功能和光合作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 马尾松 RcA RAcE c dna克隆 序列分析
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淋病奈瑟球菌表面蛋白A基因疫苗的构建及其诱导小鼠的免疫应答 被引量:5
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作者 谢良伊 胡四海 +3 位作者 唐湘云 杨胜辉 余敏君 韩福郎 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期392-397,共6页
目的构建淋病奈瑟球菌表面蛋白A(NspA)基因疫苗,并接种小鼠,评价其诱导的体液和细胞免疫应答。方法将NspA基因插入到真核表达载体pcDNA3.1(+)中,构建重组真核表达质粒pcDNA3.1(+)/NspA,并经PCR、双酶切及测序鉴定。反转录-聚合酶链反应(... 目的构建淋病奈瑟球菌表面蛋白A(NspA)基因疫苗,并接种小鼠,评价其诱导的体液和细胞免疫应答。方法将NspA基因插入到真核表达载体pcDNA3.1(+)中,构建重组真核表达质粒pcDNA3.1(+)/NspA,并经PCR、双酶切及测序鉴定。反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和免疫组织化学法分别检测NspA基因转染细胞后mRNA和蛋白的表达。以pcDNA3.1(+)/NspA重组质粒免疫45只雄性BALB/c小鼠,试管凝集法检测免疫小鼠抗体滴度,EIASA检测IFN-γ水平,四甲基偶氮唑蓝(MTT)比色法检测脾淋巴细胞增殖。提取接种部位股四头肌总DNA,PCR检测BALB/c小鼠肌细胞内NspA基因。结果成功构建pcDNA3.1(+)/NspA基因疫苗,能在真核细胞中转录和表达。pcDNA3.1(+)/NspA免疫组的抗体滴度达1:640,pcDNA3.1(+)和PBS免疫组均无特异性抗体检出。空载体pcDNA3.1(+)组IFN-γ为(23.79±11.85)pg/mL,pcDNA3.1(+)/ NspA免疫组为(169.71±30.52)pg/mL(P<0.01);脾淋巴细胞增殖的刺激指数(SI)分别为1.05±0.30和1.94±0.74(P<0.01)。并证实NspA基因可在小鼠肌细胞中稳定存在。结论构建淋病奈瑟球菌NspA基因疫苗,将其免疫BALB/c小鼠可诱导特异性体液和细胞免疫应答,为进一步用于淋病预防奠定了基础。 展开更多
关键词 奈瑟球菌 淋病 膜蛋白质类 疫苗 dna 小鼠 近交BALBc 抗体生成 免疫 细胞
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丙型肝炎病毒的分子遗传学研究现状
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作者 王福生 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 1993年第3期233-237,共5页
丙型肝炎病毒(HCV)基因组是线性、正链RNA分子,其全长核苷酸(nt)序列约为10kb,由5′端(332nt)非编码区、3′端(54nt)非编码区和一长的开读框架(ORF:1~9033nt或9075nt、9097nt)3部分构成;根据编码区基因序列可推定出HCV多聚蛋白前体(301... 丙型肝炎病毒(HCV)基因组是线性、正链RNA分子,其全长核苷酸(nt)序列约为10kb,由5′端(332nt)非编码区、3′端(54nt)非编码区和一长的开读框架(ORF:1~9033nt或9075nt、9097nt)3部分构成;根据编码区基因序列可推定出HCV多聚蛋白前体(3011aa)的组成。用计算机对基因组的核苷酸序列进行分析,结果表明HCV基因组具有较高的突变频率,因而基因序列呈现出较大的变异,其中以E_1区和E_2/NS_1区的变异性最高;相对而言,C区、NS_3~NS_5区和5′-NCR的核苷酸序列则有明显的保守性;同时将HCV和已知的其它病毒的基因组及多聚蛋白进行比较,结果显示在分类上HCV与黄病毒和瘟病毒有关。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 cdna克隆 dna序列
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红花栝楼鲨烯合酶基因的克隆及其序列分析 被引量:8
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作者 陶晨陈 马成通 +4 位作者 吴耀生 周青鸟 苏荷玲 晁耐霞 罗育 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1034-1041,共8页
目的克隆红花栝楼鲨烯合酶(squalene synthase,SS)的基因并进行序列分析,为进一步研究葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析奠定基础。方法根据绞股蓝与罗汉果SS基因c DNA比对分析的结果,设计SS的5’端简并... 目的克隆红花栝楼鲨烯合酶(squalene synthase,SS)的基因并进行序列分析,为进一步研究葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析奠定基础。方法根据绞股蓝与罗汉果SS基因c DNA比对分析的结果,设计SS的5’端简并引物,采用3’RACE扩增红花栝楼SS全长c DNA基因。结果获得红花栝楼SS c DNA全长共1 466个核苷酸,其中包括一个含有1 254个核苷酸的开放读码框,编码417个氨基酸残基。通过NCBI的Blast比对,发现红花栝楼SS基因编码的氨基酸序列与已知植物SS基因编码的氨基酸序列同源性为78%~94%,核苷酸的同源性为74%~93%。结论成功克隆了红花栝楼SS的全长c DNA,为进一步研究红花栝楼SS基因结构、基因表达、基因突变提供了基础,并为葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析提供了数据支持。 展开更多
关键词 红花栝楼 鲨烯合酶 RAcE 基因克隆 序列分析
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