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多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析 被引量：2
1
作者 陈琦 赵静 +1 位作者 张立岭 马月辉 《热带生物学报》 2011年第2期157-163,共7页
参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊H... 参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊Hoxc8的exon-1和exon-2序列分别与其他物种进行同源性比对,蒙古羊Hoxc8 exon-1与人、小鼠、大鼠、犬的同源性达到96%以上,与斑马鱼的同源性为75.8%;exon-2与大猩猩、犬、人、小鼠、大鼠的同源性达到91%以上,与斑马鱼的同源性为74%。 展开更多
关键词 多脊椎蒙古羊 序列分析 Hoxc8 exon-1 Hoxc8exon-2
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西农萨能羊乳腺脂肪酸合酶基因exon 9-15的克隆与序列分析 被引量：5
2
作者 王海滨 罗军 +3 位作者 武会娟 韩雪峰 单翠燕 张宁 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期828-833,共6页
【目的】山羊FAS基因exon 9-15编码的乙酰/丙二酸单酰基转移酶(acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases,AT/MT)区域对山羊乳短、中链脂肪酸的合成起重要调控作用。本研究针对西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15进行克隆和序列分析。【... 【目的】山羊FAS基因exon 9-15编码的乙酰/丙二酸单酰基转移酶(acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases,AT/MT)区域对山羊乳短、中链脂肪酸的合成起重要调控作用。本研究针对西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15进行克隆和序列分析。【方法】以处于泌乳期28d的西农萨能羊乳腺组织mRNA反转录的cDNA为模板,通过RT-PCR方法首次扩增出西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15的cDNA序列全长及exon 8的3′端和exon 16的5′端部分cDNA序列(GenBank收录号为DQ915966),并对其进行了同源性分析和功能预测。【结果】克隆片段全长1449bp,其中包括exon 9-15共1388bp、exon 8的3′端9bp和exon 16的5′端52bp,编码483个氨基酸,包含编码的AT/MT区域951bp(454～1404nt);西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15与牛(NM_001012669),人(NM_004104),大鼠(NM_017332)和鸡(NM_205155)核苷酸序列相似度分别为95%、85.7%、82.7%、73.2%,氨基酸相似度分别为92.9%、77.7%、82.3%、64.7%;exon 10较其它物种缺失1个氨基酸。【结论】克隆获得西农萨能羊FAS基因片段全长1449bp,外显子9-15大小分别为463、185、190、95、135、204和116bp;核苷酸及氨基酸序列与牛相应序列的同源性均高于其它物种;AT/MT区域的活性位点在各物种间均为高度保守的丝氨酸,但西农萨能羊exon 10较其它物种缺失1个氨基酸,这可能对AT/MT区域的空间构象及其生理功能产生重要影响。本研究为西农萨能羊FAS基因cDNA全长克隆以及基因功能研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 山羊 乳腺组织 脂肪酸合酶基因 exon 9-15
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a-1,3-N-乙酰半乳糖胺转移酶基因EXON 7突变形成A311血型基因亚型 被引量：5
3
作者 刘衍春 刘毅 +5 位作者 赵卫军 郑凌 马玲 薛敏 吴敏慧 孙俊 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期821-824,共4页
本研究对1例产生抗A抗体的血清学正反定型不符的A血型标本进行血型血清学分析及基因分析,以了解其分子基础。采用试管法进行血型血清学的检测,采用PCR-SSP对A基因进行扩增分析,采用Sanger测序法对A血型糖基转移酶基因进行测序分析。结... 本研究对1例产生抗A抗体的血清学正反定型不符的A血型标本进行血型血清学分析及基因分析,以了解其分子基础。采用试管法进行血型血清学的检测,采用PCR-SSP对A基因进行扩增分析,采用Sanger测序法对A血型糖基转移酶基因进行测序分析。结果表明:血清学正反定型不符,初定为A亚型;PCR-SSP扩增检测结果有O、A血型基因的存在;对ABO基因第6外显子测序发现存在c.261delG,显示有O基因;对A、O基因第7外显子进行特异性扩增测序分析显示,在A单倍型基因第7外显子出现c.467 C>T、c.626 G>A的突变,在O单倍型基因第7外显子出现c.646T>A、681G>A、771C>T、829G>A等突变。结论:该献血者在A基因第7外显子的c.626G>A是新的等位基因突变,c.467 C>T是SNP;新突变的GenBank序列号是KC690281,被BGMUT命名为1个新的A等位基因亚型A311。 展开更多
关键词 a-1 3-N-乙酰半乳糖胺转移酶基因 exon 7基因突变 A311血型基因亚型
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中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析 被引量：3
4
作者 丁栋 沈菲菲 +4 位作者 张保卫 李崇奇 张晨岭 周开亚 常青 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期117-125,共9页
本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作... 本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用。在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同。野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关。 展开更多
关键词 野猪 DRB exon 2 遗传变异 平衡选择 系统发生
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GHR基因exon 9和exon 10多态性与西农萨能奶山羊产奶性能的相关分析 被引量：3
5
作者 孙瑞萍 王利心 +4 位作者 朱广琴 王建刚 宋宇轩 梁昭义 曹斌云 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期70-74,共5页
针对GHR基因exon 9和exon 10设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术检测该基因这2个位点在西农萨能羊群上的单核苷酸多态性,同时研究其对产奶性能的影响。结果表明:exon 9具有多态,exon 10不存在多态性。Exon 9位点在西农萨能山羊中检测到NN型... 针对GHR基因exon 9和exon 10设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术检测该基因这2个位点在西农萨能羊群上的单核苷酸多态性,同时研究其对产奶性能的影响。结果表明:exon 9具有多态,exon 10不存在多态性。Exon 9位点在西农萨能山羊中检测到NN型和NT型,纯化测序发现有1个SNP位点,NN型与NT型相比在该片段第241 bp处有1个G→T的突变;NN和NT基因型之间产奶量的最小二乘均值差异显著(P<0.05):NN基因型在各胎次产奶量和平均产奶量等指标上均好于NT基因型,其中在第3胎的产奶量和第4胎产奶量2项指标上都达到显著水平(P<0.05)。研究结果提示:GHR基因exon 9对奶山羊产奶量有显著影响,因此认为GHR基因exon 9位点可作为奶山羊高产奶量的标记辅助选择的有效分子标记。 展开更多
关键词 西农萨能奶山羊 PCR—SSCP GHR基因 产奶性能 exon
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利用PCR-RFLP分析eNOS基因exon7BanⅡ酶切位点的遗传多态性 被引量：2
6
作者 谢卫兵 李月琴 +4 位作者 周广新 林琳 海戎 云泓若 周天鸿 《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 CAS CSCD 2000年第4期32-35,共4页
目的 :探讨内皮型一氧化氮合酶基因多态性与妊高征的相关性。方法 :应用PCR -RFLP技术检测了 12例正常女性的内皮型一氧化氮合酶基因第 7外显子。结果 :发现 12例正常女性中有 4例的基因型是eNOS/GG ,有 8例的基因型是eNOS/GT ,未检测到... 目的 :探讨内皮型一氧化氮合酶基因多态性与妊高征的相关性。方法 :应用PCR -RFLP技术检测了 12例正常女性的内皮型一氧化氮合酶基因第 7外显子。结果 :发现 12例正常女性中有 4例的基因型是eNOS/GG ,有 8例的基因型是eNOS/GT ,未检测到eNOS/TT型的个体。等位基因A1(eNOS/G)的频率为 66 7% ,等位基因A2 (eNOS/T)的频率为 33 3%。结论 :广东女性人群存在内皮型一氧化氮合酶第 7外显子BanⅡ酶切位点遗传多态性。 展开更多
关键词 ENOS基因 exon7外显子 多态性 BanhⅡ酶切位点
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内蒙古地区3个马品种ELA-DRA＊exon2的PCR-SSCP分析 被引量：3
7
作者 孟青龙 李金莲 +2 位作者 石有斐 孙玉江 芒来 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第5期42-44,共3页
为了检测内蒙古地区3个马品种ELA_DRA*exon2的多态性,通过PCR_SSCP技术内蒙古地区3个马品种(三河马、锡尼河马和巴尔虎马)各50匹的ELA_DRA*exon2进行检测,用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结... 为了检测内蒙古地区3个马品种ELA_DRA*exon2的多态性,通过PCR_SSCP技术内蒙古地区3个马品种(三河马、锡尼河马和巴尔虎马)各50匹的ELA_DRA*exon2进行检测,用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果表明,150匹马中共出现6种基因型:3种纯合子分别记为AA,BB和CC型,均为3条带;3种杂合子分别记为AB,BC和AC型,均为4条带。其中A等位基因频率最高,B次之,而C只在三河马中出现。因此说三河马ELA_DRA*exon2的多态性比锡尼河马和巴尔虎马丰富。 展开更多
关键词 马 ELA—DRA exon2 PCR—SSCP 多态性
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MTNR1A基因ExonⅡ T/C突变与绵羊季节性繁殖的关联性分析 被引量：1
8
作者 张伟 石国庆 +1 位作者 邓双义 王世银 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1582-1586,共5页
【目的】分析MTNR1A基因ExonⅡT/C突变与绵羊季节性繁殖性状的关联性,为深入研究MTNR1A基因在绵羊繁殖活动中的作用机制打下基础。【方法】以季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊为研究对象,采用PCR-... 【目的】分析MTNR1A基因ExonⅡT/C突变与绵羊季节性繁殖性状的关联性,为深入研究MTNR1A基因在绵羊繁殖活动中的作用机制打下基础。【方法】以季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊为研究对象,采用PCR-SSCP及测序技术检测MTNR1A基因ExonⅡT/C突变在4个绵羊品种群体中的分布情况,并分析其与绵羊季节性繁殖性状的关联性。【结果】MTNR1A基因ExonⅡT/C突变致使MTNR1A蛋白的胞内无规卷曲结构域构象发生变化。在4个绵羊品种群体MTNR1A基因ExonⅡ处均可检测到T/C突变,其中阿勒泰羊和小尾寒羊中以TT基因型为主,T等位基因频率分别为C等位基因的3.4和11.2倍;在中国美利奴羊(军垦型)中则以TC基因型为主,TC基因型频率分别为TT和CC基因型的17.6和19.6倍;在湖羊中3种基因型的分布无明显差异。在阿勒泰羊群体中MTNR1A基因ExonⅡT/C突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而在中国美利奴羊(军垦型)、湖羊和小尾寒羊群体中处于极度不平衡状态(P<0.01)。【结论】在季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊群体MTNR1A基因ExonⅡ处均可检测到T/C突变,但该突变与绵羊的季节性繁殖性状无关联。 展开更多
关键词 绵羊 MTNR1A基因 exonⅡ T/C突变 季节性繁殖 PCR-SSCP
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羊驼催乳素受体基因(PRLR)exon10的克隆与序列分析 被引量：1
9
作者 张巧灵 董常生 +1 位作者 贺俊平 姜俊兵 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期321-325,共5页
通过氰仿／异戊醇法从羊驼血液和组织中提取羊驼基因组DNA，首次扩增出羊驼PRLR基因（Prolactin Receptor，PRLR）exon10序列（GenBank登录号为DQ206831），并与其它动物相应区域作了同源性比较，结果表明：羊驼PRLR基因exon10的开放阅... 通过氰仿／异戊醇法从羊驼血液和组织中提取羊驼基因组DNA，首次扩增出羊驼PRLR基因（Prolactin Receptor，PRLR）exon10序列（GenBank登录号为DQ206831），并与其它动物相应区域作了同源性比较，结果表明：羊驼PRLR基因exon10的开放阅读框为1133bp，包括1046bp的编码区和87bp的拖尾区；同源性比较显示，羊驼PRLR基因exon10的核苷酸序列与哺乳动物（牛、绵羊、猪、狗、兔、大鼠等）的同源性较高，达80％，氨基酸序列的同源性则≥66％，而与鱼类的同源性则较低，仅为40％～45％。 展开更多
关键词 羊驼 催乳素受体基因 exon10 克隆
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蒙古马与其他品种马的ELA-DRA＊ exon2多态性分析 被引量：1
10
作者 李金莲 石有斐 +1 位作者 刘淑娟 芒来 《山东农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2007年第3期345-350,共6页
本实验通过PCR-SSCP技术检测了三大品种6个类型共296匹马ELA-DRA* exon2的多态性。用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果296匹马中共出现6种基因型:三种纯合子分别记为AA、BB和CC型,均为3条带... 本实验通过PCR-SSCP技术检测了三大品种6个类型共296匹马ELA-DRA* exon2的多态性。用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果296匹马中共出现6种基因型:三种纯合子分别记为AA、BB和CC型,均为3条带;三种杂合子分别记为AB、BC和AC型,均为4条带;且AA和AB两种基因型是所研究的各类型马的优势基因型。纯血马和三河马的PIC和He值均较高,属于高度多态,4个类型蒙古马均属于中度多态。聚类分析表明三大品种各聚一支,各类型蒙古马中锡尼河马和巴尔虎马关系较近。 展开更多
关键词 马 ELA-DRA＊ exon2 PCR-SSCP 多态性
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BMY牛MSTN基因exon2克隆及序列分析 被引量：3
11
作者 和占星 亐开兴 +5 位作者 张继才 王安奎 金显栋 杨国荣 昝林森 黄必志 《中国牛业科学》 2013年第4期1-5,共5页
[目的]克隆BMY牛MSTN基因外显子2的序列，以期分析其遗传变异。[方法]通过对PCR产物进行克隆，比较哺乳动物MSTN基因外显子2之间的同源性，并构建其系统发育关系。[结果]通过PCR扩增，对PCR产物克隆得到BMY牛MSTN基因exon2序列为372bp编... [目的]克隆BMY牛MSTN基因外显子2的序列，以期分析其遗传变异。[方法]通过对PCR产物进行克隆，比较哺乳动物MSTN基因外显子2之间的同源性，并构建其系统发育关系。[结果]通过PCR扩增，对PCR产物克隆得到BMY牛MSTN基因exon2序列为372bp编码124个氨基酸残基，牛亚科物种间的核苷酸同源性较高，在98．7％～100．0％之间，BMY牛、瘤牛、牦牛与大额牛079-gayal（Bosfrontalis）的氨基酸序列一致，而日本和牛在第89位发生了天冬酰胺（Asn）→丝氨酸（Ser）的突变。构建的牛亚科几个物种之间的系统发育关系表明，含有瘤牛血统的BMY牛与瘤牛、牦牛的关系较近，且大额牛079-gayal与瘤牛的关系也近，推测大额牛在其形成历史中曾经受过瘤牛的基因渐渗。牛亚科物种的牦牛、大额牛、日本和牛、瘤牛与BMY牛聚为一支，而与水牛的关系较远。人与黑猩猩、猕猴聚为明显的一支。[结论]BMY牛MSTN基因外显子2长度为372bp，系统聚类分析表明BMY牛含有瘤牛血统和典型的瘤牛特征。 展开更多
关键词 BMY牛 MSTN基因exon 2 系统发育关系
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SP-C基因exonⅡ结构基因突变与新生儿呼吸窘迫综合征的关系 被引量：1
12
作者 牛银萍 郭淼 +1 位作者 付朝阳 王喆 《实验与检验医学》 CAS 2018年第5期679-682,共4页
目的探讨表面活性物质蛋白C(SP-C)基因exonⅡ结构基因突变与新生儿呼吸窘迫综合征(NRDS)的关系。方法选取2014年2月至2017年12月在我院治疗的NRDS患儿110例(NRDS组),同时选取新生儿病房非NRDS患儿110例作为对照组,采用PCR及基因分析技... 目的探讨表面活性物质蛋白C(SP-C)基因exonⅡ结构基因突变与新生儿呼吸窘迫综合征(NRDS)的关系。方法选取2014年2月至2017年12月在我院治疗的NRDS患儿110例(NRDS组),同时选取新生儿病房非NRDS患儿110例作为对照组,采用PCR及基因分析技术检测SP-C基因exonⅡ突变。结果 SP-C基因exonⅡ基因测序发现第115位基因位点杂合突变c.115G>T,为错义突变;NRDS组G/T基因型比例为8.18%,明显高于对照组0.00%,差异比较有统计学意义(P<0.05);G/T患儿胸片Ⅲ~Ⅳ级比例和病死率分别为100.00%和66.67%,明显高于GG型患儿51.49%和6.93%(P<0.05);G/T和GG型患儿性别、胎龄、出生体重、使用机械通气比例和PS使用3~4剂比例差异比较无统计学意义(P>0.05)。结论 SP-C基因exonⅡc.115G>T基因突变可能与NRDS严重程度有一定关系,值得进一步研究。 展开更多
关键词 表面活性物质蛋白C exonⅡ结构 基因突变 新生儿呼吸窘迫综合征
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巢式聚合酶链反应检测人类DNA修复基因:ERCC2/XPD exon 6突变
13
作者 郭丽 马业罡 +2 位作者 孙中芙 祁荣 尹娇杨 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2005年第1期33-35,共3页
背景与目的:探讨血样DNA来源困难及DNA产量低的情况下,获得理想的可供突变分析的PCR产物的方法。材料与方法:应用巢式聚合酶链反应(NPCR)-限制性片断长度多态(RFLP)技术检测了人类微量DNA样品的DNA修复基因:ERCC2／XPD exon 6的单核甘... 背景与目的:探讨血样DNA来源困难及DNA产量低的情况下,获得理想的可供突变分析的PCR产物的方法。材料与方法:应用巢式聚合酶链反应(NPCR)-限制性片断长度多态(RFLP)技术检测了人类微量DNA样品的DNA修复基因:ERCC2／XPD exon 6的单核甘酸多态(SNP)。 结果:该位点群体基因分型结果显示:自身平衡检验结果符合Hardy-Weinberg遗传平衡法则。 结论:巢式PCR技术在扩增微量DNA、分析突变的实验中较一般单次扩增PCR技术更具有敏感性高,特异性强的优点。 展开更多
关键词 巢式聚合酶链反应 微量DNA样品 DNA修复基因 ERCC2/XPD exon 6
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河南省汉族糖尿病肾病患者肝细胞核因子-1β基因exon2测定
14
作者 苏永 常雯雯 +3 位作者 牛红艳 汪艳芳 马书平 赵志刚 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2004年第6期1063-1065,共3页
目的 :探讨河南省汉族人群中家族性糖尿病肾病与肝细胞核因子 - 1β(HNF - 1β)基因exon2是否关联。方法 :运用聚合酶链反应 -单链构象多态性技术 (PCR -SSCP)检测 2型糖尿病患者 6 2例 ,健康献血者 82例 ,11个糖尿病家系中 5 6例糖尿... 目的 :探讨河南省汉族人群中家族性糖尿病肾病与肝细胞核因子 - 1β(HNF - 1β)基因exon2是否关联。方法 :运用聚合酶链反应 -单链构象多态性技术 (PCR -SSCP)检测 2型糖尿病患者 6 2例 ,健康献血者 82例 ,11个糖尿病家系中 5 6例糖尿病肾病患者的HNF - 1β基因exon2片段。 结果 :糖尿病肾病患者、2型糖尿病患者、健康献血者均未发现有HNF - 1β基因exon2异常条带。 结论 :HNF - 展开更多
关键词 糖尿病肾病 肝细胞核因子1β基因 exon2
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牦牛GHR exon 10-2序列SNP多态性分析 被引量：2
15
作者 金鑫燕 《青海畜牧兽医杂志》 2020年第4期29-34,共6页
生长激素受体基因是泌乳性状重要候选基因,研究牦牛GHR基因SNP多态性是开展牦牛乳用性能分子标记辅助选育的重要基础。本试验对牦牛GHR基因exon 10-2片段SNP多态性检测结果表明:相对于普通牛GHR exon 10(Genebank登录号AM161140.1),本... 生长激素受体基因是泌乳性状重要候选基因,研究牦牛GHR基因SNP多态性是开展牦牛乳用性能分子标记辅助选育的重要基础。本试验对牦牛GHR基因exon 10-2片段SNP多态性检测结果表明:相对于普通牛GHR exon 10(Genebank登录号AM161140.1),本试验青海泽库高原型牦牛GHR基因exon 10-2含SNP多态位点5个,AM161140.1-10第702位T(C/C型),该碱基编码的氨基酸为半胱氨酸(C),本群体所有样本该SNP位点编码氨基酸均为精氨酸(R)。第730位A(A/G型),导致编码的氨基酸由丝氨酸(S)变成甘氨酸(G),第755位C(T/T型),该位点碱基突变并未造成氨基酸的变化,为同义突变。第810位T(C/T型),导致编码的氨基酸由脯氨酸(P)变成丝氨酸(S)。第989位T(C/C型),碱基T编码的氨基酸为酪氨酸(Y),本群体所有样本该SNP位点编码氨基酸均为组氨酸(H);相对于本试验群体,共含SNP多态位点2个(第730位A,第810位T),且2个SNP多态位点共形成3种基因型,AA/CT共1头,基因型频率为4.35%,AG/TT共7头,基因型频率为30.43%,AA/TT共15头,基因型频率为65.22%,AA/TT为该群体优势基因型。 展开更多
关键词 牦牛 GHR exon 10-2 SNP 多态性
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牦牛GHR基因exon 10 SNP对乳成分影响的研究 被引量：1
16
作者 金鑫燕 《青海畜牧兽医杂志》 2021年第4期13-19,共7页
对牦牛GHR基因exon 10片段SNP多态性检测结果表明,相对于普通牛GHR exon 10(Genebank登录号AM161140.1),青海泽库高原型牦牛GHR基因exon 10含SNP多态位点8个,第267位G(GG/AG),第336位T(TT/GT),第650位A(AA/AC),第702位T(C/C型),第730位A... 对牦牛GHR基因exon 10片段SNP多态性检测结果表明,相对于普通牛GHR exon 10(Genebank登录号AM161140.1),青海泽库高原型牦牛GHR基因exon 10含SNP多态位点8个,第267位G(GG/AG),第336位T(TT/GT),第650位A(AA/AC),第702位T(C/C型),第730位A(A/G型),第755位C(T/T型),第810位T(C/T型),第989位T(C/C型);SNP多态位点共形成4种基因型,GG/GT/AA/CC/AA/TT/CT/CC (基因型Ⅰ)1头、GG/TT/AC/CC/AG/TT/TT/CC(基因型Ⅱ) 5头、GG/TT/AA/CC/AA/TT/TT/CC 12头(基因型Ⅲ)、AG/TT/AA/CC/AA/TT/TT/CC (基因型Ⅳ)2头,各基因型占比为1∶5∶12∶2,其中GG/TT/AA/AA/TT为优势基因型。4种基因型间各乳成分差异显著性分析表明,牦牛GHR基因exon 10各SNP均为同义突变,未造成泌乳性状的改变。 展开更多
关键词 牦牛 GHR exon 10 SNP 多态性
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一种用于基因5’exons预测的新方法
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作者 童庆 郑浩然 +1 位作者 宁岩 王煦法 《北京生物医学工程》 2007年第1期13-18,共6页
基因预测是生物信息学领域中的一个重要研究方向。本文在研究了基因局部特征的基础上,针对现有遗传算法在预测基因5’exons方面的不足,从生物免疫机制出发,构建了一种用于基因5’exons预测的免疫遗传算法。该算法利用T细胞发育过程中强... 基因预测是生物信息学领域中的一个重要研究方向。本文在研究了基因局部特征的基础上,针对现有遗传算法在预测基因5’exons方面的不足,从生物免疫机制出发,构建了一种用于基因5’exons预测的免疫遗传算法。该算法利用T细胞发育过程中强大的多样性维持机制来设计算法的选择机制,提高算法的求解性能。实验结果表明该算法提高了基因预测的精度,提供了一种可能的研究基因预测方案。 展开更多
关键词 基因预测 5'exons 遗传算法 T细胞 生物信息学
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冉冉升起的肺癌靶向治疗新星:MET exon14-skipping
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作者 刘学文 《循证医学》 CSCD 2016年第2期68-69,共2页
2014年7月,美国癌症基因研究组（The CancerGenome Atlas,TCGA）在《Nature》上发布了230例可切除肺腺癌的包含DNA、mRNA、micro RNA水平的综合基因谱分析结果。通过对mRNA和DNA高通量测序结果及序列比对分析,发现约4%（10/230）肺腺癌... 2014年7月,美国癌症基因研究组（The CancerGenome Atlas,TCGA）在《Nature》上发布了230例可切除肺腺癌的包含DNA、mRNA、micro RNA水平的综合基因谱分析结果。通过对mRNA和DNA高通量测序结果及序列比对分析,发现约4%（10/230）肺腺癌因MET基因DNA水平第14外显子剪接区域（splice-sites）的突变导致MET第14外显子在mRNA水平出现部分或完全跳跃缺失（exon14．skipping）。 展开更多
关键词 肺癌 靶向治疗 MET exon14-skipping
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牦牛和普通牛DRB1*Intron1-exon2序列变异分析 被引量：3
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作者 田知利 陈杰 +5 位作者 胡江 罗玉柱 刘秀 李少斌 郭淑珍 牟永娟 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期72-79,共8页
为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因... 为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处SNPs及1处插入/缺失突变,第2外显子区检测到17处SNPs,两区域均表现为高度多态;单倍型连锁分析发现21种intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象,A-A1、A-B1、B-A1和B-B1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高;聚类分析表明,牦牛DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高,系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富,可作为牦牛和普通牛BoLADRB1的遗传标记。 展开更多
关键词 牦牛 普通牛 DRB1基因 INTRON l exon 2 多态性
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绵羊MHC-DQB2 exon3单倍型的构建及其与布鲁氏菌病易感性相关性 被引量：1
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作者 严国 王元元 +3 位作者 罗成 齐江姣 牟云 高剑峰 《江苏农业科学》 2018年第10期154-159,共6页
为探究绵羊MHC-DQB2基因exon3单核苷酸多态性及其单倍型与布鲁氏菌病易感性的相关性,对145只哈萨克绵羊进行了布鲁氏菌虎红平板检测(RBPT),并通过PCR-SSCP试验选取不同基因型个体进行扩增测序,对测序结果进行统计分析。结果发现,在exon3... 为探究绵羊MHC-DQB2基因exon3单核苷酸多态性及其单倍型与布鲁氏菌病易感性的相关性,对145只哈萨克绵羊进行了布鲁氏菌虎红平板检测(RBPT),并通过PCR-SSCP试验选取不同基因型个体进行扩增测序,对测序结果进行统计分析。结果发现,在exon3 282 bp内共有22个单核苷酸多态性位点,其中140A/C/T/G位点、155T/C位点在病例和正常组间存在显著差异(P<0.05);在22个单核苷酸多态位点中,有18个符合Hardy-Weinberg平衡定律,最终构建得到21个单倍型,其中有2个单倍型(Hap6、Hap9)在病例和正常组间存在显著差异(P<0.05),一个单倍型(Hap4)存在极显著差异(P<0.01)。由此表明,绵羊MHC-DQB2 exon3单核苷酸多态性与布鲁氏菌病存在显著相关性。 展开更多
关键词 哈萨克绵羊 布鲁氏菌病 MHC-DQB2 exon3 单核苷酸多态性 单倍型
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