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以mzXML格式文件搭建中药色谱质谱联用数据的MATLAB分析平台
1
作者
姚卫峰
刘卉
+2 位作者
陈汀
张丽
丁安伟
《南京中医药大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期396-397,412,共3页
目的解决当前色谱质谱联用仪器生产厂商的工作站输出数据格式不一致以及工作站本身信息处理和评价能力有限的问题。方法利用Trans Proteomic Pipeline先将不同厂商的色谱质谱联用数据转变成mzXML格式文件,然后通过MATLAB软件进行mzXML...
目的解决当前色谱质谱联用仪器生产厂商的工作站输出数据格式不一致以及工作站本身信息处理和评价能力有限的问题。方法利用Trans Proteomic Pipeline先将不同厂商的色谱质谱联用数据转变成mzXML格式文件,然后通过MATLAB软件进行mzXML的读取,三维数据的可视化,和有价值信息的发掘。结果 MATLAB提供了质谱图匹配、色谱图匹配的功能函数以及多种数据分析方法。结论 MATLAB分析平台方便研究人员对于不同来源数据的重复利用和共享。
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关键词
mzxml
MATLAB
色谱质谱联用
数据处理
下载PDF
职称材料
mzXML在质谱数据共享中的应用
被引量：
4
2
作者
扈庆
方向
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第12期1635-1637,共3页
要实现分析仪器数据的共享,首先应建立一套统一的数据交换标准,以规范数据格式;XML在共享性、开放性和扩展性等方面的诸多优点,因而更适用于质谱数据的存储与交换。本文解析MS文件的存储结构,介绍基于XML的mzXML标准,达到从MS到mzXML文...
要实现分析仪器数据的共享,首先应建立一套统一的数据交换标准,以规范数据格式;XML在共享性、开放性和扩展性等方面的诸多优点,因而更适用于质谱数据的存储与交换。本文解析MS文件的存储结构,介绍基于XML的mzXML标准,达到从MS到mzXML文件的转换目的,并以随机访问的形式解析mzXML文件,以提高mzXML文件的解析速度。
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关键词
mzxml
随机访问
数据共享
原文传递
蛋白质组学中质谱数据标准研究进展
被引量：
3
3
作者
马海滨
张纪阳
+2 位作者
刘辉
孙汉昌
谢红卫
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
2011年第3期129-137,共9页
质谱分析是蛋白质组学的一项支撑技术。质谱数据处理过程具有多策略、多处理步骤、多种处理软件的特点,数据处理过程中数据格式不统一的问题给数据交换和整合带来了一定的困难,也给质谱分析平台和质谱数据库的建设带来了挑战。研究质谱...
质谱分析是蛋白质组学的一项支撑技术。质谱数据处理过程具有多策略、多处理步骤、多种处理软件的特点,数据处理过程中数据格式不统一的问题给数据交换和整合带来了一定的困难,也给质谱分析平台和质谱数据库的建设带来了挑战。研究质谱数据分析中的质谱数据标准,不仅可以系统地梳理归纳目前分析方法中需要使用的全部数据信息,而且有利于质谱数据分析平台的建设。本文介绍了近几年制定的一些质谱数据标准,总结这些标准各自的特点、不足及应用情况,并展望质谱数据标准可能的发展方向。
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关键词
质谱数据标准
mzxml
mzML
mzIdentML
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职称材料
基于UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓的香丹注射液快速质量分析
被引量：
4
4
作者
姚卫峰
刘卉
+2 位作者
陈汀
张丽
丁安伟
《中国药房》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第47期4468-4470,共3页
目的:研究利用UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓快速分析香丹注射液质量的方法。方法:首先将香丹注射液的UPLC-TOF-MS数据转变成mzXML格式文件,然后读取基峰强度色谱图轮廓,采用多种数据预处理手段消除各样品之间基线不稳、保留时间漂移...
目的:研究利用UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓快速分析香丹注射液质量的方法。方法:首先将香丹注射液的UPLC-TOF-MS数据转变成mzXML格式文件,然后读取基峰强度色谱图轮廓,采用多种数据预处理手段消除各样品之间基线不稳、保留时间漂移等不利因素后,计算不同批次之间以皮尔逊相关系数和夹角余弦为测度的相似度,对10批香丹注射液的指纹图谱进行分析。结果:采用经数据平滑、基线矫正和色谱峰匹配后的基峰强度色谱图轮廓计算10批香丹注射液的相似度,皮尔逊相关系数和夹角余弦2种测度均分辨出了差异较大的3号和10号样品。结论:以UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓为分析对象的香丹注射液相似度评价具有可行性,整个分析过程均可由计算机独立完成,能够为中药质量快速分析提供有效方法。
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关键词
色谱-质谱联用
基峰强度色谱图
mzxml
格式
MATLAB软件
香丹注射液
指纹图谱
快速质量分析
原文传递
题名
以mzXML格式文件搭建中药色谱质谱联用数据的MATLAB分析平台
1
作者
姚卫峰
刘卉
陈汀
张丽
丁安伟
机构
南京中医药大学药学院
出处
《南京中医药大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期396-397,412,共3页
基金
南京中医药大学青年自然科学基金项目(09XZR14)
文摘
目的解决当前色谱质谱联用仪器生产厂商的工作站输出数据格式不一致以及工作站本身信息处理和评价能力有限的问题。方法利用Trans Proteomic Pipeline先将不同厂商的色谱质谱联用数据转变成mzXML格式文件,然后通过MATLAB软件进行mzXML的读取,三维数据的可视化,和有价值信息的发掘。结果 MATLAB提供了质谱图匹配、色谱图匹配的功能函数以及多种数据分析方法。结论 MATLAB分析平台方便研究人员对于不同来源数据的重复利用和共享。
关键词
mzxml
MATLAB
色谱质谱联用
数据处理
分类号
O657.3 [理学—分析化学]
下载PDF
职称材料
题名
mzXML在质谱数据共享中的应用
被引量：
4
2
作者
扈庆
方向
机构
北京大学医药卫生分析中心
国家标准物质研究中心
出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第12期1635-1637,共3页
基金
"十五"国家科技攻关重大项目(2004BA210A04)
文摘
要实现分析仪器数据的共享,首先应建立一套统一的数据交换标准,以规范数据格式;XML在共享性、开放性和扩展性等方面的诸多优点,因而更适用于质谱数据的存储与交换。本文解析MS文件的存储结构,介绍基于XML的mzXML标准,达到从MS到mzXML文件的转换目的,并以随机访问的形式解析mzXML文件,以提高mzXML文件的解析速度。
关键词
mzxml
随机访问
数据共享
Keywords
mzxml
, random access, data sharing
分类号
O657.3 [理学—分析化学]
原文传递
题名
蛋白质组学中质谱数据标准研究进展
被引量：
3
3
作者
马海滨
张纪阳
刘辉
孙汉昌
谢红卫
机构
国防科学技术大学
军事医学科学院
出处
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
2011年第3期129-137,共9页
基金
国家重点基础研究发展计划(973)项目(2006CB910803,2006CB910706,2010CB912700)
国家高技术研究发展计划(863)项目(2006AA02A312)
+1 种基金
国家科技重大专项(2008ZX10002-016,2009ZX09301-002)
蛋白质组学国家重点实验室课题(SKLP-Y200811)资助
文摘
质谱分析是蛋白质组学的一项支撑技术。质谱数据处理过程具有多策略、多处理步骤、多种处理软件的特点,数据处理过程中数据格式不统一的问题给数据交换和整合带来了一定的困难,也给质谱分析平台和质谱数据库的建设带来了挑战。研究质谱数据分析中的质谱数据标准,不仅可以系统地梳理归纳目前分析方法中需要使用的全部数据信息,而且有利于质谱数据分析平台的建设。本文介绍了近几年制定的一些质谱数据标准,总结这些标准各自的特点、不足及应用情况,并展望质谱数据标准可能的发展方向。
关键词
质谱数据标准
mzxml
mzML
mzIdentML
Keywords
mass spectrometry data standards
mzxml
mzML
mzIdentML
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
下载PDF
职称材料
题名
基于UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓的香丹注射液快速质量分析
被引量：
4
4
作者
姚卫峰
刘卉
陈汀
张丽
丁安伟
机构
南京中医药大学药学院
江苏省方剂研究重点实验室
出处
《中国药房》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第47期4468-4470,共3页
基金
2009年度江苏省高等学校大学生实践创新训练计划
南京中医药大学科技项目(09XZR14)
文摘
目的:研究利用UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓快速分析香丹注射液质量的方法。方法:首先将香丹注射液的UPLC-TOF-MS数据转变成mzXML格式文件,然后读取基峰强度色谱图轮廓,采用多种数据预处理手段消除各样品之间基线不稳、保留时间漂移等不利因素后,计算不同批次之间以皮尔逊相关系数和夹角余弦为测度的相似度,对10批香丹注射液的指纹图谱进行分析。结果:采用经数据平滑、基线矫正和色谱峰匹配后的基峰强度色谱图轮廓计算10批香丹注射液的相似度,皮尔逊相关系数和夹角余弦2种测度均分辨出了差异较大的3号和10号样品。结论:以UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓为分析对象的香丹注射液相似度评价具有可行性,整个分析过程均可由计算机独立完成,能够为中药质量快速分析提供有效方法。
关键词
色谱-质谱联用
基峰强度色谱图
mzxml
格式
MATLAB软件
香丹注射液
指纹图谱
快速质量分析
Keywords
Chromatography/mass spectrometry
Base peak intensity chromatography
mzxml
MATLAB
Xiangdan injection
Fingerprint
Fast quality analysis
分类号
R283.61 [医药卫生—中药学]
R927.2 [医药卫生—药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
以mzXML格式文件搭建中药色谱质谱联用数据的MATLAB分析平台
姚卫峰
刘卉
陈汀
张丽
丁安伟
《南京中医药大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
下载PDF
职称材料
2
mzXML在质谱数据共享中的应用
扈庆
方向
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
原文传递
3
蛋白质组学中质谱数据标准研究进展
马海滨
张纪阳
刘辉
孙汉昌
谢红卫
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
2011
3
下载PDF
职称材料
4
基于UPLC-TOF-MS基峰强度色谱图轮廓的香丹注射液快速质量分析
姚卫峰
刘卉
陈汀
张丽
丁安伟
《中国药房》
CAS
CSCD
北大核心
2010
4
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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