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λ噬菌体DNA形成三链辫状结构的序列搜索 被引量:1
1
作者 刘次全 黄京飞 +1 位作者 王莹 荣茂森 《Zoological Research》 CAS CSCD 1993年第S1期12-19,共8页
本文按照三碱基体中碱基的配合原则,通过对λ噬菌体DNA核苷酸序列作计算机深度搜索。在理论上建立了三链辫状结构模型。
关键词 λ噬菌体 核苷酸序列 深度搜索 三链辫状结构
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λ噬菌体和cosmid重组DNA克隆的快速限制性内切酶图谱分析方法 被引量:6
2
作者 柴建华 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1990年第2期136-142,共7页
cosmld克隆的线性化用λcos末端酶来完成,线性的cosmid或λDNA经部份限制性内切酶酶解后,分别与已标记的cos顺序探针杂交(探针为分别与λ的左端或右端的cos顺序互补的12核苷酸单链片段),杂交后的部份酶解片段经电泳分离和自显影后,酶切... cosmld克隆的线性化用λcos末端酶来完成,线性的cosmid或λDNA经部份限制性内切酶酶解后,分别与已标记的cos顺序探针杂交(探针为分别与λ的左端或右端的cos顺序互补的12核苷酸单链片段),杂交后的部份酶解片段经电泳分离和自显影后,酶切点位置可直接在X-底片上读出。在本实验室条件下,可一次完成二个克隆包括5—6种限制性内切酶的图谱分析,分析和作图可通过计算机或手工进行。 展开更多
关键词 λ噬菌体 重组DNA 克隆 酶图谱
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λ噬菌体调节蛋白与操纵基因相互作用的研究 被引量:1
3
作者 张利绒 李前忠 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第3期275-278,共4页
根据 λ噬菌体调节蛋白和特异的 DNA部位的相互作用提出一种线性三位点的结合模型 ,从理论上解释了调节蛋白结合左右操纵基因的协同性 ,得出耦合自由能的分配 .
关键词 调节蛋白 操纵基因 自由能 λ噬菌体 相互作用
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λ噬菌体nutL序列突变对N蛋白生物功能的影响 被引量:2
4
作者 周建光 DonaldL.COURT 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 1999年第4期572-575,共4页
λ噬菌体 N 蛋白不仅是抗转录终止的正调控因子,也是在翻译水平上阻遏自身基因表达的负调控蛋白.nut R N A 位点(包括 box A 和 box B)参与了这两种生物效应.对位于左向操纵子(p L)的 nut L 序列进行了... λ噬菌体 N 蛋白不仅是抗转录终止的正调控因子,也是在翻译水平上阻遏自身基因表达的负调控蛋白.nut R N A 位点(包括 box A 和 box B)参与了这两种生物效应.对位于左向操纵子(p L)的 nut L 序列进行了突变后,证明 nut L 缺失及 box B 第 6 位核苷酸突变使 N 丧失了正、负调控功能,提示 nut L 在 N 介导的调控反应中是必需的.nut L 序列中 box A 单碱基突变使 N 丧失了正调控功能,部分保留了负调控功能.这种负调控作用导至极性效应,使 lac Z基因转录水平明显下降. 展开更多
关键词 nutL突变 基因调控 λ噬菌体 N蛋白
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nutR中的突变对λ噬菌体早期转录抗终止作用的影响 被引量:2
5
作者 张兆山 Patt,TA 《生物化学杂志》 CSCD 1995年第3期348-353,共6页
将λDNA的nutR序列置于Lac启动子的下游,在nutR和β-半乳糖苷酶基因(galK)之间插入λ噬茵体依赖rho的终止子tR1,使galK的表达取决于N蛋白介导的转录抗终止作用。为研究nutR对抗终止的影响,系统... 将λDNA的nutR序列置于Lac启动子的下游,在nutR和β-半乳糖苷酶基因(galK)之间插入λ噬茵体依赖rho的终止子tR1,使galK的表达取决于N蛋白介导的转录抗终止作用。为研究nutR对抗终止的影响,系统地进行了该序列中每个碱基的点突变(A→C,G→T,C→A及T→G).结果表明boxA中有两个碱基(位置2和5)的突变对抗终止作用是至关重要的,使抗终止效率降低了10倍;而其他位置的改变影响甚微。boxA的缺失在nus ̄+宿主中使抗终止数率降低了40%,但在nusB宿主中却恢复到野生型水平。boxB茎环结构中,茎部顶端的碱基对及环中邻近茎部的两个碱基的突变对抗终止作用影响很大,被认为是N蛋白的识别序列.boxA和boxB之间的间隔序列中有两个碱基的突变几乎使抗终止作用丧失。 展开更多
关键词 λ噬菌体 nutR 突变 抗终止作用
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利用微课教学启发学生科研思维,增强学生学习兴趣——以λ噬菌体生长途径的控制和选择为例 被引量:2
6
作者 刘青珍 《高校生物学教学研究(电子版)》 2014年第4期56-58,共3页
在分子生物学课程教学中,原核基因表达调控是很重要的一章。学生普遍反应,这一章中最复杂最枯燥的内容就是λ噬菌体生长途径的调控。如果教师能够掌握λ噬菌体生长途径调控的关键、逻辑和目的,这部分内容就不但不复杂不枯燥,反而会变得... 在分子生物学课程教学中,原核基因表达调控是很重要的一章。学生普遍反应,这一章中最复杂最枯燥的内容就是λ噬菌体生长途径的调控。如果教师能够掌握λ噬菌体生长途径调控的关键、逻辑和目的,这部分内容就不但不复杂不枯燥,反而会变得非常有趣。本文以微课"λ噬菌体生长途径的控制和选择"为例,阐述如何在有限的时间内讲好这部分内容,并启发学生科研思维,增强学生学习兴趣。 展开更多
关键词 λ噬菌体 生长途径 调控 启发式教学
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κ-演算建模λ噬菌体的生活周期
7
作者 李丹 张敏 董笑菊 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期42-44,50,共4页
κ-演算是一种描述生物蛋白质分子间相互作用的形式化语言.介绍了κ-演算的语法、语义以及λ噬菌体侵蚀大肠杆菌细胞的生物过程,提出了用κ-演算建模生物过程的一种方法,给出翻译规则,并在规则的指导下建模具体的生物过程.根据模型的特... κ-演算是一种描述生物蛋白质分子间相互作用的形式化语言.介绍了κ-演算的语法、语义以及λ噬菌体侵蚀大肠杆菌细胞的生物过程,提出了用κ-演算建模生物过程的一种方法,给出翻译规则,并在规则的指导下建模具体的生物过程.根据模型的特点,分析和研究κ-演算的表达能力和表达特点. 展开更多
关键词 κ-演算 λ噬菌体 生活周期 蛋白质
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λ噬菌体DNA的制备
8
作者 徐贤秀 唐伟 孙乃恩 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1991年第3期515-519,共5页
本文报导了一种较为简单的入噬菌体DNA制备方法.首先在LB琼脂平皿中扩增噬菌体,待取得1×10^(11)噬菌体后进行氯化铯梯度离心,取出噬菌体条带;继而加入蛋白酶K分解噬菌休颗粒以释放其DNA;经酚/氯仿抽提和酒精沉淀,最后可得纯DNA10-2... 本文报导了一种较为简单的入噬菌体DNA制备方法.首先在LB琼脂平皿中扩增噬菌体,待取得1×10^(11)噬菌体后进行氯化铯梯度离心,取出噬菌体条带;继而加入蛋白酶K分解噬菌休颗粒以释放其DNA;经酚/氯仿抽提和酒精沉淀,最后可得纯DNA10-20ug。该样品可用于限制酶酶谱分析或次级克隆。 展开更多
关键词 λ噬菌体 脱氧核糖核酸 克隆
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λ噬菌体阻遏蛋白与操纵基因相互作用的动力学研究
9
作者 丁辉 李前忠 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期271-275,共5页
根据 λ噬菌体阻遏蛋白与操纵基因的相互作用特点 ,提出了他们相互作用的化学动力学模型 .用此模型计算各结合位点饱和分数与阻遏蛋白浓度的关系函数 ,并对λ噬菌体阻遏蛋白与操纵基因相互作用的本征自由能及各位点间的偶联自由能进行... 根据 λ噬菌体阻遏蛋白与操纵基因的相互作用特点 ,提出了他们相互作用的化学动力学模型 .用此模型计算各结合位点饱和分数与阻遏蛋白浓度的关系函数 ,并对λ噬菌体阻遏蛋白与操纵基因相互作用的本征自由能及各位点间的偶联自由能进行了估算 。 展开更多
关键词 λ噬菌体 阻遏蛋白 操纵基因 结合位点 饱和分数 自由能 基因表达控制 相互作用运力学
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λ噬菌体操纵基因和调控蛋白相互作用网络及溶原态/裂解态转变特性的动力学研究
10
作者 丁辉 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期537-546,共10页
根据大肠杆菌中λ噬菌体操纵基因与调控蛋白相互作用特点,提出操纵基因与调控蛋白相互作用模型.利用动力学方法,得到了两种调控蛋白浓度随时间变化的关系和在一定的时间范围内两种调控蛋白之间的关系,并且得到调控系统的稳态性质,进而... 根据大肠杆菌中λ噬菌体操纵基因与调控蛋白相互作用特点,提出操纵基因与调控蛋白相互作用模型.利用动力学方法,得到了两种调控蛋白浓度随时间变化的关系和在一定的时间范围内两种调控蛋白之间的关系,并且得到调控系统的稳态性质,进而分析调控系统溶原态/裂解态的转变特性. 展开更多
关键词 λ噬菌体 操纵基因 调节蛋白 溶原态 裂解态
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λ噬菌体的溶原和溶菌过程与基因表达的时序控制
11
作者 张安世 《河南教育学院学报(自然科学版)》 2000年第4期47-49,80,共4页
本文从λ噬菌体的生活周期入手 ,介绍了λ噬菌体的基因组结构及基因的表达过程和方式 ,展示了λ基因组表达的时间流程 .
关键词 λ噬菌体 溶原 溶菌 基因表达 操纵子 时序控制 基因组结构
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nut R 中的突变对λ噬菌体早期转录抗终止作用的影响
12
作者 张兆山 Thomas A.Potterson Donald L.Court 《生物技术通讯》 CAS 1995年第1期1-5,共5页
将λDNA的nutR序列置于Lac启动子的下游,在nut R和β-半乳糖苷酶基因(gal K)之间插入λ噬菌体依赖rho的终止子tR1,使ga1 K的表达取决于N蛋白介导的转录抗终止作用。为研究nutR对抗终止的影响,系统地进行了该序列中每个碱基的点突变(A→... 将λDNA的nutR序列置于Lac启动子的下游,在nut R和β-半乳糖苷酶基因(gal K)之间插入λ噬菌体依赖rho的终止子tR1,使ga1 K的表达取决于N蛋白介导的转录抗终止作用。为研究nutR对抗终止的影响,系统地进行了该序列中每个碱基的点突变(A→C,G→T,C→A及T→G)。结果表明boxA中有两个碱基(位置2和5)的突变对抗终止作用是至关重要的,使抗终止效率降低了10倍;而其他位置的改变影响甚微。boxA的缺失在nus^+宿主中使抗终止效率降低了40%,但在nusB宿主中却恢复到野生型水平。boxB茎环结构中,茎部顶端的碱基对及环中邻近基部的两个碱基的突变对抗终止作用影响很大,被认为是N蛋白的识别序列。boxA和boxB之间的间隔序列中有两个碱基的突变几乎使抗终止作用丧失。 展开更多
关键词 λ噬菌体 NUT R 突变 抗终止作用
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抗坏血酸对λ噬菌体紫外诱导过程的影响 被引量:2
13
作者 朱素华 方呈祥 +3 位作者 朱石桥 彭方 张珞珍 范成鹏 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期383-386,共4页
本文通过研究抗坏血酸对紫外诱导λ噬菌体的影响 ,从自由基角度探讨了λ噬菌体紫外诱导过程的机制。结果表明抗坏血酸可有效抑制紫外对λ噬菌体的诱导 ,抑制效果具有明显的量效性。抗坏血酸浓度为 31 .8μmol/L时 ,抑制率高达 98%。细... 本文通过研究抗坏血酸对紫外诱导λ噬菌体的影响 ,从自由基角度探讨了λ噬菌体紫外诱导过程的机制。结果表明抗坏血酸可有效抑制紫外对λ噬菌体的诱导 ,抑制效果具有明显的量效性。抗坏血酸浓度为 31 .8μmol/L时 ,抑制率高达 98%。细胞密度影响试验表明细胞密度为 4× 1 0 8cells/m L时 ,噬菌斑形成单位数最高。随着细胞密度的逐渐增加或减少 ,噬菌斑形成单位数均呈下降趋势。利用电子自旋共振及自旋捕捉技术 ,检测到紫外诱导过程中的自由基信号 ,其强弱与细胞密度密切相关 ,1 0 8cells/m L时自由基的信号明显强于 1 0 10 cells/m L。抗坏血酸的加入可消除所产生的自由基信号。由此可得出结论 :λ噬菌体的诱导裂解与自由基密切相关 。 展开更多
关键词 抗坏血酸 λ噬菌体 紫外诱导 自由基 裂解 溶原性细菌
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新疆分离细菌的提取物对λ噬菌体紫外诱导的抑制作用 被引量:1
14
作者 邹颖颖 方呈祥 +7 位作者 杨桥 罗雪松 周国玲 张磊 唐雅丽 李红 张珞珍 辛晓红 《中国病毒学》 CSCD 2006年第5期499-505,共7页
本研究从我国夏季高温、强辐射的新疆塔里木地区采集样品,进行了细菌的分离、纯化及分类鉴定。用丙酮萃取法抽提39个分离菌株的培养产物,通过高效液相色谱和紫外-可见吸收光谱分析其主要组分;利用λ噬菌体紫外诱导系统研究抽提物清除自... 本研究从我国夏季高温、强辐射的新疆塔里木地区采集样品,进行了细菌的分离、纯化及分类鉴定。用丙酮萃取法抽提39个分离菌株的培养产物,通过高效液相色谱和紫外-可见吸收光谱分析其主要组分;利用λ噬菌体紫外诱导系统研究抽提物清除自由基的能力。高效液相色谱和紫外-可见吸收光谱分析的结果表明:多数分离菌株丙酮提取物的主要组分为类胡萝卜素物质。λ噬菌体紫外诱导系统抑制实验结果表明:29个菌株的丙酮提取物对λ噬菌体的紫外诱导具有不同程度的抑制作用,抑制率最高达81%。不同菌株之间的比较试验显示不同属细菌的丙酮提取物对λ噬菌体紫外诱导系统的抑制效果存在很大差异,其中以Methylobacterium的抑制作用最强;不同颜色菌株提取物的抑制效果也出现较大差异;Koanria中不同颜色菌株的抑制效果也有类似结果。本文为类胡萝卜素可能是该类细菌具有抗辐射能力的内因之一提供了直接证据。同时,也证实了λ噬菌体紫外诱导系统是一种很好的探讨细菌抗辐射机理的研究模型。 展开更多
关键词 分离 抗辐射 类胡萝卜素 λ噬菌体 紫外诱导
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λ噬菌体切除酶基因Xis在大肠杆菌中的可溶性融合表达
15
作者 陈晚苹 周玉玲 马立新 《湖北大学学报(自然科学版)》 CAS 2016年第2期116-119,共4页
λ噬菌体切除酶Xis(excisionase)是调控λ噬菌体溶源裂解转换过程中的一种重要蛋白质.通过密码子优化及两步法将来自λ噬菌体切除酶基因Xis在体外合成,然后克隆到带有类泛素蛋白SUMO标签的定向原核表达载体SUMO-p ETG上,测序正确后,然... λ噬菌体切除酶Xis(excisionase)是调控λ噬菌体溶源裂解转换过程中的一种重要蛋白质.通过密码子优化及两步法将来自λ噬菌体切除酶基因Xis在体外合成,然后克隆到带有类泛素蛋白SUMO标签的定向原核表达载体SUMO-p ETG上,测序正确后,然后转化至E.coli BL21(DE3)细胞可溶性表达.经SDS-PAGE及质谱检测证实表达蛋白确实为目的蛋白.该研究通过融合表达λ噬菌体切除酶Xis不仅解除了Xis对E.coli宿主细胞的毒害作用,而且实现在E.coli中的高水平可溶性表达.因此,Xis的大量制备,将会促进Gateway克隆技术的广泛应用. 展开更多
关键词 λ噬菌体切除酶Xis 大肠杆菌 融合表达 鉴定
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λ噬菌体阻抑物基因表达调控的随机稳态结构
16
作者 黄婷 张宇欣 +1 位作者 唐伟 游雄 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期721-728,共8页
[目的]本文旨在研究λ噬菌体自阻抑蛋白CI降解对基因表达稳态的影响。[方法]根据λ噬菌体阻抑物基因cI表达调控的化学反应,针对线性降解和非线性降解情形,分别建立化学主方程。通过无量纲化速率方程的分支分析,确定2种稳态结构的降解速... [目的]本文旨在研究λ噬菌体自阻抑蛋白CI降解对基因表达稳态的影响。[方法]根据λ噬菌体阻抑物基因cI表达调控的化学反应,针对线性降解和非线性降解情形,分别建立化学主方程。通过无量纲化速率方程的分支分析,确定2种稳态结构的降解速率范围,画出参数平面上的分支图。应用蒙特卡洛模拟探究cI基因表达稳态结构及其转换。[结果]随着蛋白降解速率常数的减小,蛋白的降解方式由线性降解变为非线性降解,细菌由裂解态经过不稳定的双稳态转换到溶原态。[结论]阻抑物蛋白CI的降解率及降解方式的变化可能是噬菌体溶原/裂解途径决定的一种新机制。 展开更多
关键词 λ噬菌体 化学主方程 蒙特卡洛模拟 双稳态
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关于λ噬菌体DNA复制起始的转录激活的研究
17
作者 王思远 何涛 《中国科技教育》 2002年第6期23-25,共3页
先前的研究提示,λ噬菌体DNA复制起始之所以依赖于转录激活,可能是因为处于DNA裸露部分的复制原点只有在被转录时才能形成复制起始所需的较高的负超螺旋状态。为了验证这一假设,我们设法获得了大肠杆菌的HU全蛋白及HU-α、HU-β单亚... 先前的研究提示,λ噬菌体DNA复制起始之所以依赖于转录激活,可能是因为处于DNA裸露部分的复制原点只有在被转录时才能形成复制起始所需的较高的负超螺旋状态。为了验证这一假设,我们设法获得了大肠杆菌的HU全蛋白及HU-α、HU-β单亚基突变体以及topA突变体,并进行了超感染和电泳试验。与野生型相比,在HU突变体和topA突变体的细胞中,DNA裸露部分的负超螺旋强度从理论上讲应当增强。采用具有不同免疫型的λ噬菌体对这些大肠杆菌突变体及其野生型亲本的λ溶源菌株进行超感染实验后,我们发现,在这些突变体内,λ噬菌体的复制仍然需要转录激活。我们又通过电泳实验测定了突变体细胞内DNA的超螺旋程度,发现在大肠杆菌体内,DNA裸露部分的负超螺旋强度可能始终维持在一个较低的水平,在上述突变大肠杆菌中,虽然某个基因的突变应当引起DNA裸露部分负超螺旋强度的增强,但DNA裸露部分负超螺旋的真实强度似乎仍被限制在需要转录激活的水平。此外,我们还发现,HU异源二聚体以及HU-α、HU-β同源二聚体吸收负超螺旋的多少,与它们对λDNA体外复制的转录激活的决定作用大小呈现正相关,因此,在体外进行λDNA复制时,HU异源二聚体以及HU-α、HU-β同源二聚体可能是通过改变DN负超螺旋强度间接使复制起始与转录相偶联。 展开更多
关键词 λ噬菌体 DNA 复制 转录 激活 中学 科学实践课程 学生论文
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人肺癌细胞A549λ噬菌体cDNA文库的构建与鉴定
18
作者 张红英 郭嘉雯 +3 位作者 员月明 徐志勇 邓长生 王琪 《西南医科大学学报》 2021年第4期333-337,共5页
目的构建人肺癌细胞A549λ噬菌体cDNA文库,为抗肺癌药物的筛选和药物作用分子机理的研究奠定基础。方法提取人肺癌细胞A549λ总RNA,用DnaseⅠ处理后,采用RNA 5’末端移动反转录(switching mechanism at 5′end of RNA transcript,SMART... 目的构建人肺癌细胞A549λ噬菌体cDNA文库,为抗肺癌药物的筛选和药物作用分子机理的研究奠定基础。方法提取人肺癌细胞A549λ总RNA,用DnaseⅠ处理后,采用RNA 5’末端移动反转录(switching mechanism at 5′end of RNA transcript,SMART)技术合成双链cDNA,切胶回收去除短片段,依次用蛋白酶K和SfiⅠ进行酶切,并与经过酶切的λTriplEx2载体连接后进行体外包装,得到初级文库。初级文库扩增后,测定扩增文库滴度,并通过PCR鉴定插入片段。结果构建的人肺癌细胞A549λ噬菌体初级文库库容为1.88×10^(7)pfu/mL,扩增文库滴度为2.50×10^(9)pfu/mL,插入cDNA片段为500~3000 bp。结论成功构建了人肺癌细胞A549λ噬菌体cDNA文库,为进一步筛选治疗肺癌的药物作用分子机理奠定了基础。 展开更多
关键词 肺癌 λ噬菌体 CDNA文库 SMART
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λ噬菌体DNA的一种简便纯化方法
19
作者 黄道发 《中山大学学报论丛》 1992年第3期142-145,共4页
本文介绍一种较为简便的λDNA纯化方法。经高速离心得到病毒宿主大肠杆菌的噬菌体颗粒后,采用酸、酚等处理。经纯化的λDNA样品,达到电泳纯的要求。
关键词 λ噬菌体 DNA 大肠杆菌 核酸内切限制酶 十二烷基硫酸钠一酚
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志贺毒素噬菌体研究进展 被引量:1
20
作者 杨茜 刘倩 +1 位作者 白向宁 熊衍文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期704-709,共6页
产志贺毒素大肠埃希菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)是一类重要的动物源性病原菌,其感染人体后可引起腹泻甚至致死性的溶血性尿毒综合症(hemolytic uremic syndrome,HUS)。志贺毒素(Shiga toxin,Stx)是STEC最重要的致... 产志贺毒素大肠埃希菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)是一类重要的动物源性病原菌,其感染人体后可引起腹泻甚至致死性的溶血性尿毒综合症(hemolytic uremic syndrome,HUS)。志贺毒素(Shiga toxin,Stx)是STEC最重要的致病物质,由整合于宿主染色体特定位置的Stx前噬菌体(Stx-converting prophage)编码。在自发或理化因素诱导下,Stx前噬菌体进入裂解周期,噬菌体颗粒组装并在宿主菌裂解后释放,成为游离的Stx噬菌体(Stx phage)。Stx前噬菌体调控志贺毒素表达水平进而影响细菌毒力,而游离Stx噬菌体具有介导新的致病菌型或毒力增强的杂合型致病菌型产生的潜力。本文就Stx噬菌体的形态及基因组特征、诱导特性以及其作为可移动元件对菌株致病性的影响等方面的研究进展做一简要综述。 展开更多
关键词 志贺毒素 志贺毒素噬菌体 λ噬菌体 产志贺毒素大肠埃希菌
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