N,N'-二甲基-5-硝基-2,2'-联咪唑锌(Ⅱ)配合物的合成,表征及与DNA相互作用 被引量：1

1

作者 杨莉宁 刘春叶 《化学工程师》 CAS 2021年第8期6-9,21,共5页

以直接合成法合成了N,N'-二甲基-5-硝基-2,2'-联咪唑(NO2Me2biim)的锌(Ⅱ)配合物,利用元素分析、红外光谱、紫外-可见光谱、固体荧光光谱、摩尔电导率和热重分析等方法对配合物的组成和结构进行了表征。以电子光谱、荧光光谱和... 以直接合成法合成了N,N'-二甲基-5-硝基-2,2'-联咪唑(NO2Me2biim)的锌(Ⅱ)配合物,利用元素分析、红外光谱、紫外-可见光谱、固体荧光光谱、摩尔电导率和热重分析等方法对配合物的组成和结构进行了表征。以电子光谱、荧光光谱和粘度法研究了配体NO2Me2biim及配合物与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用机制,研究表明配体NO2Me2biim和配合物与ct-DNA以嵌插模式进行相互作用。 展开更多

关键词 N N'-二甲基-5-硝基-2 2'-联咪唑 ZN配合物 与dna相互作用

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基于小波变换的蛋白质与DNA相互作用的计算机预测

2

作者 江浩 冯铁男 +1 位作者 秦殿刚 王翼飞 《上海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期281-285,共5页

蛋白质与DNA的相互作用在细胞的转录调控和DNA修饰等活动中至关重要.将改进的共鸣识别模型应用于预测酵母蛋白质与DNA的相互作用,运用小波变换找出阳性数据和随机数据的信噪比分布的差异,并通过阈值的选取达到了较好的预测结果.同时,将... 蛋白质与DNA的相互作用在细胞的转录调控和DNA修饰等活动中至关重要.将改进的共鸣识别模型应用于预测酵母蛋白质与DNA的相互作用,运用小波变换找出阳性数据和随机数据的信噪比分布的差异,并通过阈值的选取达到了较好的预测结果.同时,将阳性数据与相应复合物的序列进行序列联配,找到了保守位点,进而从结合位点的角度验证了本方法的正确性. 展开更多

关键词 共鸣识别模型 离散小波变换 蛋白质与dna相互作用 信噪比

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基于含N、O配体过渡金属配合物的合成及与DNA相互作用研究

3

作者 宋青青 《山东化工》 CAS 2021年第12期33-35,共3页

合成了金属配合物[Cu 4(bipy)4(OH)4(H_(2)O)(1,3-BDC)](1,3-BDC)·13H_(2)O。并利用紫外光谱法和粘度法,研究了配合物与DNA的相互作用模式。实验结论为,配合物与CT-DNA之间的相互作用模式应该为静电作用或沟槽结合。本文还研究了... 合成了金属配合物[Cu 4(bipy)4(OH)4(H_(2)O)(1,3-BDC)](1,3-BDC)·13H_(2)O。并利用紫外光谱法和粘度法,研究了配合物与DNA的相互作用模式。实验结论为,配合物与CT-DNA之间的相互作用模式应该为静电作用或沟槽结合。本文还研究了配合物的核酸酶活性,结果表明,配合物有较好的核酸酶活性。希望本文的研究能为配合物类药物价值研究提供有效的理论依据。 展开更多

关键词 金属配合物 含N、O有机配体 与dna相互作用

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圆二色谱测定技术在小分子化合物与DNA相互作用研究中的应用 被引量：18

4

作者 刘振佳 司伊康 陈晓光 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1478-1484,共7页

圆二色谱(CD)是研究DNA构象随环境条件(如温度、离子强度和pH)的改变而变化的检测技术,也是研究DNA与配基(包括小分子和蛋白质等大分子)相互作用的有力工具。DNA的圆二色谱是由其骨架结构中的不对称糖分子和由这些糖分子的构型决定的螺... 圆二色谱(CD)是研究DNA构象随环境条件(如温度、离子强度和pH)的改变而变化的检测技术,也是研究DNA与配基(包括小分子和蛋白质等大分子)相互作用的有力工具。DNA的圆二色谱是由其骨架结构中的不对称糖分子和由这些糖分子的构型决定的螺旋结构产生的。根据配基对原有的DNA圆二色谱信号的影响,以及诱导产生的圆二色谱新信号(ICD)的不同特点,不仅可以得知配基与DNA具有相互作用,还可以推断配基与DNA结合的不同模式。研究表明这些ICD信号是由配基的电子跃迁偶极矩与DNA的碱基电子跃迁偶极矩在DNA不对称环境中发生偶合产生的。如果使用不同序列的短链DNA进行深入的研究,还可获知配基与DNA相互作用中的序列特异性。实验已经证明,圆二色谱法虽然灵敏度较低,但它具有快速、简便、样品用量少、对构象变化敏感及不受分子大小的限制等特点,可以作为核磁共振(NMR)和X-光单晶衍射技术的补充。本文将介绍圆二色谱技术在研究DNA与小分子化合物相互作用中的应用以及本实验室利用圆二色谱技术研究抗肿瘤新药的初步结果。由于圆二色谱可作为新药研究中发现先导化合物辅助筛选的手段,因此可用于发现更多以DNA为靶点的药物,如抗肿瘤药、抗菌药、抗病毒药等。 展开更多

关键词 圆二色谱 诱导圆二色谱 抗肿瘤药 药物与dna相互作用 dna嵌入 dna沟结合

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Cu(Ⅱ)联咪唑硝基衍生物配合物的合成表征及其与CT-DNA相互作用研究 被引量：1

5

作者 王航天 范倩倩 +1 位作者 李焱 杨莉宁 《云南化工》 CAS 2022年第4期30-32,共3页

以联咪唑硝基衍生物(NO_(2)Me_(2)biim)为配体,通过直接法合成了其铜(Ⅱ)配合物。利用元素分析、红外光谱、紫外-可见光谱、摩尔电导率等方法对配合物的组成和结构进行了表征。以电子光谱、荧光光谱和黏度法研究了配体NO_(2)Me_(2)biim... 以联咪唑硝基衍生物(NO_(2)Me_(2)biim)为配体,通过直接法合成了其铜(Ⅱ)配合物。利用元素分析、红外光谱、紫外-可见光谱、摩尔电导率等方法对配合物的组成和结构进行了表征。以电子光谱、荧光光谱和黏度法研究了配体NO_(2)Me_(2)biim及配合物与小牛胸腺DNA(CT-DNA)的相互作用机制。研究表明,配体NO_(2)Me_(2)biim和配合物与CT-DNA分别以典型插入和部分插入模式进行相互作用。 展开更多

关键词 联咪唑硝基衍生物 Cu(Ⅱ)配合物 与dna相互作用

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含2-氨基吡啶及去甲基斑蝥酸根的钴(Ⅱ)配合物的晶体结构、与DNA和BSA相互作用及体外抗增殖活性(英文) 被引量：1

6

作者 张帆 林秋月 +2 位作者 郑博雯 胡益丹 郑晓诗 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2451-2457,共7页

溶液法合成了二(去甲基斑蝥酸根)合钴(Ⅱ)酸二(2-氨基吡啶鎓)配合物(Hapy)2[Co(DCA)2].6H2O(DCA=去甲基斑蝥酸根,C8H8O5;Hapy=2-氨基吡啶鎓,C5H7N2)。通过元素分析、摩尔电导、红外光谱、热重分析和X-射线单晶衍射对配合物进行了结构表... 溶液法合成了二(去甲基斑蝥酸根)合钴(Ⅱ)酸二(2-氨基吡啶鎓)配合物(Hapy)2[Co(DCA)2].6H2O(DCA=去甲基斑蝥酸根,C8H8O5;Hapy=2-氨基吡啶鎓,C5H7N2)。通过元素分析、摩尔电导、红外光谱、热重分析和X-射线单晶衍射对配合物进行了结构表征。该配合物为三斜晶系P空间群,中心离子配位数为6。利用荧光光谱法和粘度法对配合物与DNA之间的相互作用进行了研究。结果表明,配合物以部分插入模式与DNA键合,猝灭常数Ksq为0.18。同时,利用荧光光谱研究了配合物与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。结果显示,配合物能与BSA发生较强的键合作用,键合常数Ka=3.88×106L.mol-1。体外抗增值活性结果显示,配合物对人肝癌细胞(SMMC-7721)和人胃癌细胞(MGC80-3)的抑制活性均强于去甲基斑蝥酸钠。 展开更多

关键词 去甲基斑蝥酸根 2-氨基吡啶 钴(Ⅱ)配合物 与dna和BSA相互作用

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镍(Ⅱ)、镉(Ⅱ)与去甲基斑蝥酸钠和咪唑配合物的结构、与DNA/BSA的作用及抗增殖活性(英文) 被引量：2

7

作者 杜芳园 李士坤 +2 位作者 林秋月 魏琼 汤宁宁 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第4期813-823,共11页

以2种配体去甲基斑蝥酸钠(Na2DCA=7-氧杂二环[2.2.1]庚烷-2,3-二甲酸钠)和咪唑(IM),分别与镍(Ⅱ)和镉(Ⅱ)的醋酸盐通过溶液法合成了2种配合物[Ni(IM)(DCA)(H2O)2]·2H2O(1),[Cd2(IM)4(DCA)2]·2H2O(2)。应用元素分析、热重分析... 以2种配体去甲基斑蝥酸钠(Na2DCA=7-氧杂二环[2.2.1]庚烷-2,3-二甲酸钠)和咪唑(IM),分别与镍(Ⅱ)和镉(Ⅱ)的醋酸盐通过溶液法合成了2种配合物[Ni(IM)(DCA)(H2O)2]·2H2O(1),[Cd2(IM)4(DCA)2]·2H2O(2)。应用元素分析、热重分析、红外光谱及X-射线单晶衍射法对配合物的组成和结构进行了表征。配合物1与2的中心离子分别与咪唑的亚胺氮原子、去甲基斑蝥酸根的羧基氧原子和醚键氧原子配位,配位数均为6,分别为单核(1)和双核(2)配合物。通过紫外光谱法、荧光光谱法和粘度法研究了配合物与DNA的相互作用。结果表明,配合物能通过部分插入模式与DNA发生较强的结合作用(Kb:5.51×103(1)、1.01×103(2)L·mol-1)。同时,利用荧光光谱法研究了配合物与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。配合物能与BSA发生强烈的相互作用(KA:1.91×105(1)和6.17×105(2)L·mol-1),结合位点数均为1。测试了配合物对人肝癌细胞(SMMC7721)和人乳腺癌(MCF-7)的体外抗增殖活性。结果显示,配合物对不同癌细胞具有选择性抑制作用。镍配合物(1)对SMMC7721的抗癌活性较去甲基斑蝥酸钠有明显提高。 展开更多

关键词 咪唑 去甲基斑蝥酸钠 镍配合物 镉配合物 与dna和BSA相互作用 体外抗增殖活性

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双咪唑硝基衍生物银(Ⅰ)配合物的合成及抗厌氧菌活性

8

作者 杨莉宁 范涛 +4 位作者 姜箴一 姚琳 胡娅琪 王荣 余丽丽 《贵州师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第6期35-43,66,共10页

以柔性双咪唑硝基衍生物1,3-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)]丙烷(L1)和1,4-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)丁烷(L2)分别与硝酸银发生反应,得到配合物{[Ag(L1)NO_(3)]·H_(2)O}_n(1)和[Ag(L2)_(2)NO_(3)]·2H_(2)O(2)。采用元素分析、摩... 以柔性双咪唑硝基衍生物1,3-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)]丙烷(L1)和1,4-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)丁烷(L2)分别与硝酸银发生反应,得到配合物{[Ag(L1)NO_(3)]·H_(2)O}_n(1)和[Ag(L2)_(2)NO_(3)]·2H_(2)O(2)。采用元素分析、摩尔电导率、紫外光谱、红外光谱、固体荧光光谱、电喷雾质谱及热重分析等方法对配合物(1)、配合物(2)的组成和化学结构进行了表征与确认。通过光谱法研究了配合物与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用,并测试了配合物对ct-DNA黏度的影响。结果表明配合物(1)、配合物(2)分别以插入、部分插入模式与DNA作用。抗厌氧菌活性实验发现,配合物(1)对厌氧菌变形链球菌(Streptococcus mutans,UA 159)和伴放线放线杆菌(Aggregatibacter actinomycetemcomitans,ATCC 29523)的抗菌活性较强,最小抑菌浓度MIC为20~40μg/mL,推测银(Ⅰ)配合物的抗菌机理有可能部分靶向细菌的DNA。固体荧光光谱实验表明配合物(1)的荧光发射光谱强度远远高于其有机配体,几乎达到其有机配体发射强度的20倍,在光致发光领域具有潜在的应用前景。 展开更多

关键词 双咪唑硝基衍生物 银(Ⅰ)配合物 与dna相互作用 抗厌氧菌活性 荧光性质

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HeLa、HEK293、SH-SY5Y细胞中的Tau蛋白 被引量：8

9

作者 盛之玲 曲梅花 +1 位作者 何海进 赫荣乔 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1364-1370,共7页

通过间接免疫荧光测定了HeLa、HEK-293、SH-SY5Y细胞内Tau蛋白的分布,观察到在细胞间期单克隆抗体Tau-1的荧光信号分布于细胞质和胞核中.特别是HeLa细胞,其胞核内具有相对较高的Tau蛋白免疫荧光信号.通过分离SH-SY5Y的细胞核,更为清楚... 通过间接免疫荧光测定了HeLa、HEK-293、SH-SY5Y细胞内Tau蛋白的分布,观察到在细胞间期单克隆抗体Tau-1的荧光信号分布于细胞质和胞核中.特别是HeLa细胞,其胞核内具有相对较高的Tau蛋白免疫荧光信号.通过分离SH-SY5Y的细胞核,更为清楚地显示了Tau蛋白在细胞核中的分布,并且免疫荧光信号与DNA的Hoechst33258染色信号相重合.Western blotting的测定结果进一步证明了SH-SY5Y细胞的胞质和胞核中均含有Tau蛋白的不同异构体.以上结果提示,Tau蛋白不仅存在于神经、肌肉等细胞内,也存在于肿瘤细胞系,并且分布于间期的胞核中. 展开更多

关键词 TAU蛋白 神经Tau 肿瘤细胞 细胞核 Tau与dna相互作用

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基于硝基咪唑衍生物的Cu(Ⅱ)、Ag(Ⅰ)配合物的合成、晶体结构及生物活性 被引量：6

10

作者 杨莉宁 刘春叶 +2 位作者 成昭 梁玲玲 张剑 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1547-1554,共8页

设计、合成了硝基咪唑衍生物N,N’-二甲基-5-硝基-2,2’-联咪唑(L)的过渡金属配合物[Cu(L)(Ac)_(2)]_(2)(1)和[Ag(L)(NO3)·H_(2)O(2)。X射线单晶衍射分析表明配合物1是一个醋酸根桥联的五配位双核Cu(Ⅱ)浆轮笼型配合物。通过元素... 设计、合成了硝基咪唑衍生物N,N’-二甲基-5-硝基-2,2’-联咪唑(L)的过渡金属配合物[Cu(L)(Ac)_(2)]_(2)(1)和[Ag(L)(NO3)·H_(2)O(2)。X射线单晶衍射分析表明配合物1是一个醋酸根桥联的五配位双核Cu(Ⅱ)浆轮笼型配合物。通过元素分析、紫外光谱、红外光谱、固体荧光光谱、电喷雾质谱、摩尔电导率及热重分析等测试手段对配合物2进行了性质表征,初步确定了其结构可能为二配位的线型单核配合物。紫外可见光谱、荧光光谱及黏度法分析表明配合物1与小牛胸腺DNA(ct-DNA)相互作用强于配体及配合物2。以2倍稀释法研究了配体L及配合物的抗厌氧菌活性,发现配体对伴放线放线杆菌(ATCC 29523)的抑菌活性最强(最低抑菌浓度MIC=0.625~1.25μg·mL^(-1)),这甚至要强于经典抗厌氧菌药物甲硝唑的抗菌性。 展开更多

关键词 硝基咪唑衍生物 金属配合物 晶体结构 与dna相互作用 抗厌氧菌活性

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双咪唑硝基衍生物配合物的合成及其生物活性研究

11

作者 杨莉宁 黑嘉慧 +2 位作者 李立 成昭 余丽丽 《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期63-67,共5页

以2-甲基-4-硝基咪唑为原料按照文献方法合成了1,2-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)]乙烷配体,进而制备了其铜、银配合物,通过紫外吸收光谱、荧光光谱及黏度法研究所合成的有机配体及其配合物与DNA相互作用模式,并以二倍稀释法研究抗厌氧菌的... 以2-甲基-4-硝基咪唑为原料按照文献方法合成了1,2-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)]乙烷配体,进而制备了其铜、银配合物,通过紫外吸收光谱、荧光光谱及黏度法研究所合成的有机配体及其配合物与DNA相互作用模式,并以二倍稀释法研究抗厌氧菌的活性。结果表明,目标化合物与DNA相互作用方式可能为部分插入,并伴随有静电式结合。Cu,Ag配合物对两种厌氧菌菌株的抗菌性相对配体明显增强。 展开更多

关键词 双咪唑硝基衍生物 金属配合物 与dna相互作用 抗厌氧菌

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阿魏酸双苄酯的合成及生物活性研究 被引量：1

12

作者 孟繁龙 李硕 +3 位作者 张庆一 张宇超 杨云彩 孙学军 《化学与生物工程》 CAS 2012年第3期30-34,共5页

以DMSO为溶剂,以阿魏酸与氯化苄在碱性条件下反应,合成了阿魏酸双苄酯,产率为94.32%、纯度为98.5%。通过紫外光谱、红外光谱、核磁共振氢谱、质谱及X-单晶衍射对产物结构进行了表征。用微量量热法证明了阿魏酸双苄酯对大肠杆菌具有一定... 以DMSO为溶剂,以阿魏酸与氯化苄在碱性条件下反应,合成了阿魏酸双苄酯,产率为94.32%、纯度为98.5%。通过紫外光谱、红外光谱、核磁共振氢谱、质谱及X-单晶衍射对产物结构进行了表征。用微量量热法证明了阿魏酸双苄酯对大肠杆菌具有一定的抑制作用,其最小抑菌浓度(MIC)为29.81μg.mL-1。通过紫外光谱、荧光光谱和粘度测定研究了阿魏酸双苄酯与ct-DNA的相互作用,证明其作用方式为经典插入方式,对ct-DNA的猝灭是由于形成复合物所引起的静态猝灭,与ct-DNA的结合常数为1.58×103 L.mol-1。 展开更多

关键词 阿魏酸双苄酯 合成 生物活性 抑菌活性 与dna相互作用

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新型安曲霉素类N-杂衍生物的合成及活性研究 被引量：1

13

作者 张晓婷 黄婉云 +2 位作者 廖月英 谭梦云 潘成学 《合成化学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期721-726,共6页

基于酶与底物的相互作用原理,将安曲霉素核心骨架吡咯骈苯并二氮杂卓中关键的不对称碳原子替换为氮原子,利用三取代氮易于在R和S构型间相互转化的特性,以及DNA小沟区手性环境对配体的诱导契合作用,设计并合成了11个新型的N-杂安曲霉素... 基于酶与底物的相互作用原理,将安曲霉素核心骨架吡咯骈苯并二氮杂卓中关键的不对称碳原子替换为氮原子,利用三取代氮易于在R和S构型间相互转化的特性,以及DNA小沟区手性环境对配体的诱导契合作用,设计并合成了11个新型的N-杂安曲霉素衍生物(8a^8g,9a^9d)。以邻氨基苯甲酸衍生物为原料,先与三聚光气反应制得靛红酸酐衍生物,再与六氢哒嗪发生开环反应,最后与三聚光气发生环化反应合成目标产物,其结构经~1H NMR,^(13)C NMR,IR和HR-MS(ESI)表征。并研究了化合物对肿瘤细胞的体外生长抑制活性及与DNA的相互作用。结果表明:8a^8e对人肺癌细胞(NCI-H460),人宫颈癌细胞(Hela)和人胃癌细胞(MGC-803)有一定的抑制活性,IC_(50)为19~47μmol·L^(-1)。8d与超螺旋DNA有弱相互作用。 展开更多

关键词 安曲霉素 吡咯环骈苯并二氮杂卓衍生物 N-杂衍生物 合成 与dna相互作用

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单核Ru(Ⅲ)-edta类配合物的合成﹑结构及性质研究

14

作者 况微微 杨培培 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2719-2725,共7页

采用K[Ru(Hedta)Cl]·1.5H2O(edta为乙二胺四乙酸根)与含氮杂环配体5-(4-吡啶)四唑(4-ptz)或2,5-吡啶二甲酸(2,5-Pydc)反应,设计合成了2个单核[Ru(Hedta)(4-ptz)]·4H2O(1)和[Ru(Hedta)(2,5-Pydc)]·3H2O(2)配合物。晶体结... 采用K[Ru(Hedta)Cl]·1.5H2O(edta为乙二胺四乙酸根)与含氮杂环配体5-(4-吡啶)四唑(4-ptz)或2,5-吡啶二甲酸(2,5-Pydc)反应,设计合成了2个单核[Ru(Hedta)(4-ptz)]·4H2O(1)和[Ru(Hedta)(2,5-Pydc)]·3H2O(2)配合物。晶体结构解析表明配合物1属于单斜晶系C2/c空间群,晶胞参数为a=2.348 06(15)nm,b=1.301 23(8)nm,c=1.493 08(9)nm,β=101.075 0(10)°;配合物2属于单斜晶系I2/a空间群,晶胞参数为a=3.249 4(7)nm,b=0.966 23(19)nm,c=1.434 1(3)nm,β=93.88(3)°。对2个配合物分别进行了IR及UV-Vis的表征,并通过电子吸收光谱和荧光淬灭光谱研究了配合物与DNA的作用,实验结果表明这2个钌配合物通过插入方式与DNA作用。 展开更多

关键词 Ru(Ⅲ)配合物 晶体结构 光谱表征 与dna相互作用

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基于二次打断IPed DNA片段ChIP-Seq的模拟分析 被引量：1

15

作者 王薇 施小龙 陆祖宏 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第14期1347-1357,共11页

ChIP-Seq是在全基因组水平上研究活体细胞中蛋白质和DNA相互作用谱的有效手段.近年来,随着高通量短序列DNA测序技术的快速发展,研究基于新一代DNA测序方法的ChIP-Seq分析算法已经成为热点之一.然而,目前报道的分析方法主要是基于对免疫... ChIP-Seq是在全基因组水平上研究活体细胞中蛋白质和DNA相互作用谱的有效手段.近年来,随着高通量短序列DNA测序技术的快速发展,研究基于新一代DNA测序方法的ChIP-Seq分析算法已经成为热点之一.然而,目前报道的分析方法主要是基于对免疫共沉淀获得的DNA片段进行片段大小选择后的ChIP-Seq数据,也就是主要针对Solexa系统获得的数据进行分析的算法.SOLiD系统是目前测序通量最高的新一代DNA测序系统.在SOLiD系统的DNA测序文库制备过程中,采用对免疫共沉淀获得的DNA片段进行二次超声打断可以满足ePCR对序列长度的要求,因此SOLiD测序文库中的DNA测序片段较短.到目前为止,基于SOLiD系统测序特点的ChIP-Seq研究很少报道.本文旨在研究测序文库中DNA片段的长度对ChIP-Seq分析的影响.通过真实的ChIP-seq数据和模拟产生的ChIP-Seq数据,对目前3种主要的ChIP-Seq分析方法(CisGenome,SISSRs以及MACS)的特点进行研究.有报道表明来自Solexa系统的ChIP-Seq数据局部有明显的正负链双峰特征,而通过对真实的来自SOLiD系统的ChIP-Seq数据特征的挖掘,我们发现单个峰局部无明显的正负链双峰特征,并且峰的局部的序列分布大部分符合正态分布.基于这些特征,我们模拟了两个不同测序平台的ChIP-Seq实验.在控制了模拟实验的可比性后,我们发现当前基于Solexa文库制备方案的ChIP-Seq数据发展的算法,并不能有效地捕获来自SOLiD系统的ChIP-Seq数据特征.我们的研究还表明,误用ChIP-seq软件可能是导致部分SOLiD的ChIP-seq实验失败的原因.因此,需要开发一种新的基于二次打断IPedDNA片段的ChIP-Seq分析策略. 展开更多

关键词 蛋白质与dna相互作用 下一代测序技术 序列方向性 乳液PCR ChlP-Seq SOLID

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哒嗪并[6,1-b]喹唑啉酮类化合物的合成及其生物活性 被引量：4

16

作者 王淑琴 黄婉云 +2 位作者 张小蓉 张晓婷 潘成学 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2020年第4期959-968,共10页

通过将两个优势结构单元的组合设计了一个含氮杂环新骨架哒嗪并[6,1-b]喹唑啉酮,并发展了一条以2-氨基苯甲酸酯等为原料,以分子内酰腙跟酯基的分子内缩合反应为关键步骤,经4步反应来合成哒嗪并[6,1-b]喹唑啉酮衍生物的路线.14个目标化合... 通过将两个优势结构单元的组合设计了一个含氮杂环新骨架哒嗪并[6,1-b]喹唑啉酮,并发展了一条以2-氨基苯甲酸酯等为原料,以分子内酰腙跟酯基的分子内缩合反应为关键步骤,经4步反应来合成哒嗪并[6,1-b]喹唑啉酮衍生物的路线.14个目标化合物4a^4n被合成,其结构经1H NMR,13C NMR和HRMS表征和确认.采用噻唑蓝(MTT)法测试了目标化合物对人肿瘤细胞SK-OV-3,CNE-2,MGC-803,NCI-H460和人正常肝细胞LO2的体外细胞毒活性,发现2个化合物具有很强的抗肿瘤活性,其中2-(4-溴苯基)-4-羟基-10H-哒嗪并[6,1-b]喹唑啉-10-酮(4b)对人鼻咽癌细胞CNE-2和2-(3-氯苯基)-4-羟基-10H-哒嗪并[6,1-b]喹唑啉-10-酮(4d)对人肺癌细胞NCI-H460的IC50值分别为2.31和0.85μmol/L,远强于阳性对照药顺铂,与抗肿瘤天然药物喜树碱相当.用紫外光谱法、荧光滴定法进一步研究了化合物与DNA的相互作用,证实化合物可通过嵌入DNA的方式与DNA相互作用.活性强而且毒性低的化合物4d还可以剂量依赖性关系将人肺癌细胞NCI-H460的细胞周期阻滞在G1期,并显著诱导细胞发生凋亡,而毒性高的化合物4b则可诱导细胞的双链DNA发生断裂. 展开更多

关键词 喹唑啉酮 哒嗪衍生物 抗肿瘤活性 与dna相互作用

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