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盐津乌骨鸡mtDNA D-loop区遗传多样性及其保种效果分析
被引量:
5
1
作者
王荣琼
孙利民
+3 位作者
胡瑀
滕晓红
邱立华
苗永旺
《家畜生态学报》
北大核心
2020年第11期18-23,共6页
为阐明盐津乌骨鸡的群体遗传背景和评估、监测其保种效果,采用PCR产物直接测序对保种群样品进行了mtDNA控制区的变异检测,并结合已发表的云南其他地方鸡数据进行了群体遗传学分析。结果表明,在所检测的2005年样品中,共发现40个核苷酸变...
为阐明盐津乌骨鸡的群体遗传背景和评估、监测其保种效果,采用PCR产物直接测序对保种群样品进行了mtDNA控制区的变异检测,并结合已发表的云南其他地方鸡数据进行了群体遗传学分析。结果表明,在所检测的2005年样品中,共发现40个核苷酸变异位点,其中32个为简约信息位点,8个为单一信息位点;共定义27种单倍型,单倍型多样度为0.939,核苷酸多样度为0.01595,群体内遗传距离为0.016;包含A、B、C、E、F和G等6个母系世系,所占比例分别为35.44%、3.80%、6.33%、10.13%、6.33%和37.97%。在所检测的2018年样品中,发现24个核苷酸多态位点,其中5个为单一信息位点,19个为简约信息位点;共发现到13种单倍型,单倍型多样度为0.847,核苷酸多样度为0.01118,群体内遗传距离为0.011;包含A、B、E和G等4个母系世系,所占比例分别为31.67%、10.00%、50.00%和8.33%。研究结果提示,两种样品群体遗传组成存在较大差异,2018年保种群遗传多样性水平比2005年的显著下降,群体中母系世系减少,存在较大比例外来鸡种的基因渗入,保种效果欠佳。
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关键词
盐津乌骨鸡
线粒体DNA控制区
遗传变异
世系组成
保种效果
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职称材料
题名
盐津乌骨鸡mtDNA D-loop区遗传多样性及其保种效果分析
被引量:
5
1
作者
王荣琼
孙利民
胡瑀
滕晓红
邱立华
苗永旺
机构
云南农业职业技术学院畜牧兽医学院
云南农业大学动物科学技术学院
云南省畜牧总站
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2020年第11期18-23,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31760659)。
文摘
为阐明盐津乌骨鸡的群体遗传背景和评估、监测其保种效果,采用PCR产物直接测序对保种群样品进行了mtDNA控制区的变异检测,并结合已发表的云南其他地方鸡数据进行了群体遗传学分析。结果表明,在所检测的2005年样品中,共发现40个核苷酸变异位点,其中32个为简约信息位点,8个为单一信息位点;共定义27种单倍型,单倍型多样度为0.939,核苷酸多样度为0.01595,群体内遗传距离为0.016;包含A、B、C、E、F和G等6个母系世系,所占比例分别为35.44%、3.80%、6.33%、10.13%、6.33%和37.97%。在所检测的2018年样品中,发现24个核苷酸多态位点,其中5个为单一信息位点,19个为简约信息位点;共发现到13种单倍型,单倍型多样度为0.847,核苷酸多样度为0.01118,群体内遗传距离为0.011;包含A、B、E和G等4个母系世系,所占比例分别为31.67%、10.00%、50.00%和8.33%。研究结果提示,两种样品群体遗传组成存在较大差异,2018年保种群遗传多样性水平比2005年的显著下降,群体中母系世系减少,存在较大比例外来鸡种的基因渗入,保种效果欠佳。
关键词
盐津乌骨鸡
线粒体DNA控制区
遗传变异
世系组成
保种效果
Keywords
Yanjin black-bone chicken
mitochondrial DNA Control region
genetic variation
lineage composition
preservation effect
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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1
盐津乌骨鸡mtDNA D-loop区遗传多样性及其保种效果分析
王荣琼
孙利民
胡瑀
滕晓红
邱立华
苗永旺
《家畜生态学报》
北大核心
2020
5
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职称材料
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