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不同芯片密度对华西牛重要经济性状基因组评估准确性的影响
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作者 王元清 王泽昭 +7 位作者 朱波 陈燕 徐凌洋 张路培 高会江 李超 李俊雅 高雪 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第2期591-602,共12页
旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体... 旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体为研究对象,利用重测序数据将3948头华西牛770K芯片填充至790K后,分别取90K(两款芯片交集)、110K、770K、790K(两款芯片并集)4种标记密度,对华西牛遗传评估所涉及的5个性状(断奶重、育肥期平均日增重、产犊难易度、胴体重、屠宰率)进行遗传力估计,并通过GBLUP模型利用五折交叉验证对基因组评估准确性进行比较,筛选并确定华西牛遗传评估中最适标记密度。结果显示:1)4种标记密度下,估计的华西牛5个性状遗传力差异不显著,断奶重和平均日增重的遗传力为0.47~0.50,属于高遗传力;胴体重为0.37~0.39,属于中等遗传力;产犊难易度和屠宰率性状为0.14~0.21,属于中低遗传力。2)在GBLUP评估模型中,Cattle 110K在各个性状上的预测准确性均表现良好,并较Illumina BovineHD 770K芯片有显著提升(P<0.05),其中胴体重、产犊难易度和屠宰率3个性状提升较为明显,分别提升了14.9%、13.8%和8.4%;断奶重和育肥期平均日增重分别提升2.8%和4.5%。3)各性状预测准确性随着遗传力的升高而增加,不同标记密度的回归系数分别为0.4392(90K)、0.3741(110K)、0.4136(770K)、0.4593(790K)。因此,在华西牛实际遗传评估中,可直接使用Cattle 110K芯片进行评估,在获得较好评估准确性的同时降低成本。 展开更多
关键词 华西牛 基因组选择 标记密度 育种芯片 中国肉牛基因组选择指数
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“十二五”国家863计划现代农业技术领域“中国肉牛重要经济性状功能基因组学研究”课题启动会顺利召开
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《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期184-184,共1页
2013年7月27日，“十二五”国家863计划现代农业技术领域“主要农业动物功能基因组研究与应用”主题项目“中国肉牛重要经济性状功能基因组学研究”课题启动会在陕西杨凌顺利召开。科技部农村中心有关同志，课题承担单位西北农林科技大... 2013年7月27日，“十二五”国家863计划现代农业技术领域“主要农业动物功能基因组研究与应用”主题项目“中国肉牛重要经济性状功能基因组学研究”课题启动会在陕西杨凌顺利召开。科技部农村中心有关同志，课题承担单位西北农林科技大学及吉林大学、甘肃农业大学、扬州大学、兰州大学、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所5家合作单位主要研究人员共计20余人参加此次启动会。 展开更多
关键词 中国农业科学院 国家863计划 功能基因组学 重要经济性状 农业技术 肉牛 西北农林科技大学 畜牧兽医研究所
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国内外肉牛遗传评估体系概况 被引量：8
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作者 朱波 李宏伟 +11 位作者 周姵诺 李倩 高翰 王泽昭 汪聪勇 蔡文涛 徐凌洋 陈燕 张路培 高雪 高会江 李俊雅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1447-1460,共14页
种公牛的选育是肉牛育种工作的核心。传统选育肉用种公牛需要经过后裔测定进行选择,其优点是准确性高,但存在周期长、屠宰和肉质性状难以收集、成本高等问题,致其选择效率低。自2001年全基因组选择概念提出后,该技术迅速成为动植物育种... 种公牛的选育是肉牛育种工作的核心。传统选育肉用种公牛需要经过后裔测定进行选择,其优点是准确性高,但存在周期长、屠宰和肉质性状难以收集、成本高等问题,致其选择效率低。自2001年全基因组选择概念提出后,该技术迅速成为动植物育种领域研究的热点。利用全基因组选择进行肉用种公牛的选育,进行早期选择从而大幅度缩短世代间隔,可以提高繁殖性状等低遗传力性状的选择准确性,加快遗传进展,并大大降低育种成本。2014年,美国安格斯协会开始应用全基因组选择技术,其他欧美发达国家也陆续使用,肉牛育种进入基因组时代。中国自2017年开始使用全基因组选择技术选择青年肉用种公牛,并于2020年在全国范围内使用该技术进行基因组遗传评估。本文综述了国内外肉牛遗传评估现状,以期为我国肉牛育种工作提供参考和借鉴。 展开更多
关键词 肉牛 遗传评估 综合选择指数 全基因组选择
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