目的:基于网络药理学方法分析五味子防治稽留流产的潜在作用机制,并通过实验进行验证。方法:运用系统药理学方法查找并从中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Pla...目的:基于网络药理学方法分析五味子防治稽留流产的潜在作用机制,并通过实验进行验证。方法:运用系统药理学方法查找并从中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)筛选五味子的活性成分及靶点,查找稽留流产相关基因,确定五味子防治稽留流产的靶点。利用Cytoscape构建“药物成分-靶点”网络,筛选关键化合物。利用String建立蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过Cytoscape-CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点。通过对靶基因进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析,以预测其可能的信号通路及机制。最后借助人绒毛膜外滋养层细胞系(HTR-8/SVneo)利用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测和蛋白质印迹(Western blotting)检测进行机制验证。结果:从TCMSP数据库中鉴定了7种五味子活性成分。PPI网络表明雄激素受体(androgen receptor,AR)、雌激素受体(estrogen receptor,ER)、环氧合酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2)、核受体辅激活因子2(nuclear receptor coactivator 2,NCOA2)和乙酰胆碱酯酶(acetylcholine esterase,ACHE)可能是五味子防治稽留流产的核心作用靶点。GO富集分析获得44个细胞生物学过程,KEGG途径富集分析获得2个相关信号通路,主要包括甲状腺激素信号通路和雌激素信号通路;在利用细胞模型验证机制过程中发现,二羟环氧苯并芘[benzo(a)pyren-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide,BPDE]染毒后的细胞中AR、ER和COX-2的蛋白质和(或)mRNA水平高于正常细胞,而先使用五味子乙素(Schisandrin B,Sch B)预处理后再染毒BPDE的细胞中AR、ER和COX-2的蛋白质和(或)mRNA水平均较未用Sch B预处理的细胞降低,而NCOA2和ACHE的蛋白质和(或)mRNA水平变化不明显。结论:五味子可通过抗炎和调节AR、ER发挥防治稽留流产的作用,这一保护作用可能是通过雌激素信号通路来实现的。展开更多
目的基于网络药理学和分子对接方法探究“麦冬-五味子”药对治疗心肌纤维化的作用机制。方法运用TCMSP数据库及HERB数据库筛选“麦冬-五味子”药对药物成分和靶点,运用GeneCards数据库、Disgenet数据库、OMIM数据库筛选疾病靶点,获取共...目的基于网络药理学和分子对接方法探究“麦冬-五味子”药对治疗心肌纤维化的作用机制。方法运用TCMSP数据库及HERB数据库筛选“麦冬-五味子”药对药物成分和靶点,运用GeneCards数据库、Disgenet数据库、OMIM数据库筛选疾病靶点,获取共同靶点;通过Cytoscape软件构建“药物活性成分-疾病-靶点”网络模型;利用微生信平台进行基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG);利用STRING数据库构建蛋白互作网络;通过Auto Dock Tools1.5.6软件进行分子对接验证。结果“麦冬-五味子”药对中共筛选得到戈米辛M2、五味子酚乙、麦冬二氢高异黄酮B等85个活性成分,主要作用于HSP90AA1、AKT1、SRC等163个心肌纤维化靶点上,主要富集在脂质与动脉粥样硬化信号通路、糖尿病并发症中的age-rage信号通路、癌症发病途径信号通路等相关通路上。结论“麦冬-五味子”药对主要通过调控炎性反应、氧化应激、脂质沉积、细胞增殖凋亡等多种生物过程来抑制心肌纤维化。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子对接方法探究“麦冬-五味子”药对治疗心肌纤维化的作用机制。方法运用TCMSP数据库及HERB数据库筛选“麦冬-五味子”药对药物成分和靶点,运用GeneCards数据库、Disgenet数据库、OMIM数据库筛选疾病靶点,获取共同靶点;通过Cytoscape软件构建“药物活性成分-疾病-靶点”网络模型;利用微生信平台进行基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG);利用STRING数据库构建蛋白互作网络;通过Auto Dock Tools1.5.6软件进行分子对接验证。结果“麦冬-五味子”药对中共筛选得到戈米辛M2、五味子酚乙、麦冬二氢高异黄酮B等85个活性成分,主要作用于HSP90AA1、AKT1、SRC等163个心肌纤维化靶点上,主要富集在脂质与动脉粥样硬化信号通路、糖尿病并发症中的age-rage信号通路、癌症发病途径信号通路等相关通路上。结论“麦冬-五味子”药对主要通过调控炎性反应、氧化应激、脂质沉积、细胞增殖凋亡等多种生物过程来抑制心肌纤维化。
