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硝化细菌中亚硝酸盐氧化还原酶的研究进展 被引量:16
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作者 张星 林炜铁 朱雅楠 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1806-1810,共5页
亚硝酸盐氧化还原酶(nitrite oxidoreductase,NXR)是硝化细菌将亚硝酸盐氧化为硝酸盐的关键酶,广泛存在于亚硝酸盐氧化菌中。由于它是可溶性的膜内酶,其催化机理与膜内电子传递密切联系,给它的研究带来了一定的困难。本文综述了多年来... 亚硝酸盐氧化还原酶(nitrite oxidoreductase,NXR)是硝化细菌将亚硝酸盐氧化为硝酸盐的关键酶,广泛存在于亚硝酸盐氧化菌中。由于它是可溶性的膜内酶,其催化机理与膜内电子传递密切联系,给它的研究带来了一定的困难。本文综述了多年来国内外研究者从不同方面对NXR研究的成果,详细论述了NXR的组成结构、工作机理以及不同因子对其活性的影响,总结了近几年应用于研究NXR的新方法,并展望了对NXR研究的发展方向及其意义。 展开更多
关键词 亚硝酸盐氧化还原酶 催化机理 硝化细菌
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游离亚硝酸对亚硝酸盐氧化菌活性的抑制作用机制 被引量:2
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作者 杨昕怡 常焕焕 +3 位作者 于雪 李晓强 王光杰 孙洪伟 《化学与生物工程》 CAS 2022年第1期25-30,共6页
为探究游离亚硝酸(FNA)对亚硝酸盐氧化菌(NOB)活性的影响,以富集的NOB菌属为研究对象,基于4种抑制动力学模型,考察了不同pH值(6.5、7.0、8.0)条件下FNA对NOB活性的抑制影响,并基于荧光定量PCR技术,研究了不同pH值条件下,亚硝酸盐氧化还... 为探究游离亚硝酸(FNA)对亚硝酸盐氧化菌(NOB)活性的影响,以富集的NOB菌属为研究对象,基于4种抑制动力学模型,考察了不同pH值(6.5、7.0、8.0)条件下FNA对NOB活性的抑制影响,并基于荧光定量PCR技术,研究了不同pH值条件下,亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA和nxrB)的变化规律。结果表明:NOB富集系统内硝化杆菌属(Nitrobacter)为最优势菌属,其相对丰度为38.0%;Haldane模型、Aiba模型和Edwards模型均能较好地描述FNA对NOB活性的抑制影响,具有显著的“低促高抑”的特征;统计学分析结果表明Aiba模型最优,获得的最大动力学常数r_(max)为13.63 g N·(g VSS·d)^(-1)(pH值8.0),KS为0.13 mg·L^(-1)(pH值7.0),KI为0.63 mg·L^(-1)(pH值7.0);此外,pH值显著影响nxrA和nxrB基因的绝对丰度,随着pH值的增大,两者均表现出先升高后降低的趋势;nxrA基因的拷贝数(1.6×10^(9)~2.6×10^(9)拷贝数/g湿污泥)比nxrB基因的拷贝数(3.1×10^(7)~4.6×10^(7)拷贝数/g湿污泥)高1~2个数量级,nxrA是NOB菌属的主导功能基因。 展开更多
关键词 游离亚硝酸 PH值 亚硝酸盐氧化 动力学 亚硝酸盐氧化还原酶
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硝化作用微生物的分子生物学研究进展 被引量:79
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作者 刘志培 刘双江 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2004年第4期521-525,共5页
回顾了硝化作用微生物的分子生物学研究进展 ,主要介绍了硝化作用微生物的种类 ,包括氨氧化菌、亚硝酸氧化菌、异养氨氧化菌和厌氧氨氧化菌 .这些微生物的系统发育分析表明亚硝化菌的系统发育相对简单 ,而硝化细菌则要复杂许多 .还介绍... 回顾了硝化作用微生物的分子生物学研究进展 ,主要介绍了硝化作用微生物的种类 ,包括氨氧化菌、亚硝酸氧化菌、异养氨氧化菌和厌氧氨氧化菌 .这些微生物的系统发育分析表明亚硝化菌的系统发育相对简单 ,而硝化细菌则要复杂许多 .还介绍了在硝化作用微生物生态学研究中应用的分子生物学技术 ,如PCR、变性梯度胶电泳 (DGGE)、原位荧光杂交 (FISH)等 ,以及不同类群细菌中与硝化作用相关的酶类及其基因 .文章的最后还提出了一些研究展望 .图 3参 展开更多
关键词 氧化细菌 硝化细菌 氨单加氧酶 羟氨氧化还原酶 亚硝酸盐氧化还原酶 AMO hao NOR
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Directed Molecular Evolution of Nitrite Oxido-reductase by DNA-shuffling 被引量:1
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作者 JUN-WEN LI JIN-LAI ZHENG XIN-WEI WANG MIN JIN FU-HUAN CHAO 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2007年第2期113-118,共6页
Objective To devellop directly molecular evolution Of nitrite oxido-reductase using DNA-shuffling technique because nitrobacteria grow extremelly slow and are unable to nitrify effectively inorganic nitrogen in wastew... Objective To devellop directly molecular evolution Of nitrite oxido-reductase using DNA-shuffling technique because nitrobacteria grow extremelly slow and are unable to nitrify effectively inorganic nitrogen in wastewater treatmem. Methods The norB gene coding the ntitrite oxido-reductase in nitrobacteria was cloned and sequenced. Then, directed molecular evolution of nitrite oxido-reductase was developed by DNA-shuffling of 15 norB genes from different nitrobacteria. Results After DNA-shuffling with sexual PeR and staggered extension process PCR, the sequence was differem from its parental DNA fragmems and the homology ranged from 98% to 99%. The maximum nitrification rate of the modified bacterium of X16 by DNA-shuffling was up to 42.9 mg/L.d, which was almost 10 times higher than that of its parental bacteria. Furthermore, the modified bacterium had the same characteristics of its parental bacteria of E. coli and could grow rapidly in normal cultures. Conclusion DNA-shuffling was successfully used to engineer E. coli, which had norB gene and could degrade inorganic nitrogen effectively. 展开更多
关键词 Directed evolution DNA-shuffling Nitrite oxido-reductase norB gene Nitrobacteria
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典型对虾养殖水体中参与硝化与反硝化过程的微生物群落结构 被引量:20
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作者 李敬源 林炜铁 +1 位作者 罗剑飞 田国梁 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期478-488,共11页
【目的】本研究旨在分析典型虾塘养殖水体中参与氮循环关键过程的菌群多样性,为指导实际对虾养殖水体中NH 4+和NO 2-的微生物降解、水体氮素污染控制以及虾塘养殖氮素循环的有效管理提供科学依据。【方法】使用聚合酶链式反应及变性梯... 【目的】本研究旨在分析典型虾塘养殖水体中参与氮循环关键过程的菌群多样性,为指导实际对虾养殖水体中NH 4+和NO 2-的微生物降解、水体氮素污染控制以及虾塘养殖氮素循环的有效管理提供科学依据。【方法】使用聚合酶链式反应及变性梯度凝胶电泳技术(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient GelElectrophoresis,PCR-DGGE)从8个不同地点的虾塘水样中确定代表性水样,以此为典型水样进行研究,构建了氨单加氧酶基因(amoA)、亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA)、亚硝酸盐还原酶基因(nirS)的克隆文库。利用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术将克隆文库进行酶切分析。【结果】通过序列多态性分析,表明amoA基因克隆文库中所有序列都属于变形杆菌门β亚纲(β-Proteobacteria),分别为亚硝化单细胞菌属(Nitrosomonas)(81%)和亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)(19%)2个属。nxrA基因克隆文库检测到α-Proteobacteria和δ-Proteobacteria两个亚纲,其中硝化杆菌属(Nitrobacter)是优势菌群,占整个文库的92%,仅有一个类群属于δ亚纲的脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae)(8%)。nirS基因文库群落结构相对于amoA和nxrA基因文库较复杂,分别为α-Proteobacteria、β-Proteobacteria亚纲和Actinobacteria,序列分析表明,25%的类群为固氮弧菌属(Azoarcus),25%的类群为(Polymorphum),20%的类群为需氧去氮菌属(Thauera),10%的类群为(Sophophora),10%的的类群为链霉菌属(Streptomyces),5%的类群为(Brachymonas),5%的类群为(Ruegeria)。【结论】典型虾塘养殖水环境中氮素循环关键过程的菌群多样性丰富,其中亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和硝化杆菌属(Nitrobacter)分别是此环境中主要的氨氧化作用推动者和亚硝酸盐氧化作用推动者,而在反硝化重要环节中,固氮弧菌属等多种菌群都起着推动作用。 展开更多
关键词 PCR-DGGE 氨单加氧酶基因(amoA) 亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA) 亚硝酸盐还原酶基因 (nirS) 克隆文库 系统发育树
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