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PRRSV云南A06株ORF5和ORF7基因的克隆与序列分析
被引量:
2
1
作者
曾少灵
林庆燕
+8 位作者
花群义
张彩虹
阮周曦
杨俊兴
孙洁
秦智锋
曹琛福
陈兵
吕建强
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010年第3期12-17,共6页
设计2对引物分别扩增PRRSV的ORF5和ORF7基因,对从云南某猪场分离到的毒株A06进行RT-PCR检测,得到2条特异性扩增带,克隆至pMD18-T载体并测序。将A06株的ORF5和ORF7基因及其推断氨基酸序列分别与PRRSV欧洲型代表株LV、美洲型代表株VR2332...
设计2对引物分别扩增PRRSV的ORF5和ORF7基因,对从云南某猪场分离到的毒株A06进行RT-PCR检测,得到2条特异性扩增带,克隆至pMD18-T载体并测序。将A06株的ORF5和ORF7基因及其推断氨基酸序列分别与PRRSV欧洲型代表株LV、美洲型代表株VR2332和7株中国分离的美洲型毒株相应基因进行核苷酸和氨基酸序列比对分析。结果显示,A06株属于美洲型,其ORF5和ORF7基因及推断氨基酸与我国2006年分离的4株HP-PRRSV代表株的相似性高达98%~99%,与欧洲型代表株LV的相似性只有56%~64%。分别构建了以上毒株ORF5和ORF7基因的亲缘关系图谱,反映了A06株ORF5和ORF7基因的进化位置,完成2个基因的遗传变异分析。
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关键词
PRRSV
ORF5基因
ORF7基因
亲缘关系图谱
下载PDF
职称材料
龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)选育品系及其野生型的ISSR指纹分析
被引量:
20
2
作者
李文红
姚建亭
+2 位作者
王继成
王如才
段德麟
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期241-247,共7页
采用ISSR标记对龙须菜一个野生型群体和选育品系两个不同年代的栽培群体,进行了亲缘关系分析,构建了龙须菜选育品系的指纹图谱。通过实验从22个ISSR引物中筛选出16条引物,可以产生清晰稳定及可重复的带,共扩增出118个位点;野生型和选育...
采用ISSR标记对龙须菜一个野生型群体和选育品系两个不同年代的栽培群体,进行了亲缘关系分析,构建了龙须菜选育品系的指纹图谱。通过实验从22个ISSR引物中筛选出16条引物,可以产生清晰稳定及可重复的带,共扩增出118个位点;野生型和选育品系两个群体的遗传相似率分别为0.7301、0.7189,选育品系的两养殖种群间的遗传相似率为0.9375;遗传距离聚类分析证明,龙须菜选育品系与其青岛野生型亲缘关系很近。7条引物产生的12条特异片段可用于龙须菜选育品系的种质鉴定,每条引物都能将龙须菜选育品系和其野生型分开;根据引物S848扩增的位点构建了指纹图谱,可用于区分龙须菜选育种群及野生种群。
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关键词
龙须菜
红藻
亲缘
关系
分析
种质鉴定
指纹
图谱
ISSR
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职称材料
题名
PRRSV云南A06株ORF5和ORF7基因的克隆与序列分析
被引量:
2
1
作者
曾少灵
林庆燕
花群义
张彩虹
阮周曦
杨俊兴
孙洁
秦智锋
曹琛福
陈兵
吕建强
机构
深圳出入境检验检疫局动植中心
出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010年第3期12-17,共6页
基金
国家质检总局科技项目(2008IK262-2)
深圳出入境检验检疫局科技项目(SZ2007038)
文摘
设计2对引物分别扩增PRRSV的ORF5和ORF7基因,对从云南某猪场分离到的毒株A06进行RT-PCR检测,得到2条特异性扩增带,克隆至pMD18-T载体并测序。将A06株的ORF5和ORF7基因及其推断氨基酸序列分别与PRRSV欧洲型代表株LV、美洲型代表株VR2332和7株中国分离的美洲型毒株相应基因进行核苷酸和氨基酸序列比对分析。结果显示,A06株属于美洲型,其ORF5和ORF7基因及推断氨基酸与我国2006年分离的4株HP-PRRSV代表株的相似性高达98%~99%,与欧洲型代表株LV的相似性只有56%~64%。分别构建了以上毒株ORF5和ORF7基因的亲缘关系图谱,反映了A06株ORF5和ORF7基因的进化位置,完成2个基因的遗传变异分析。
关键词
PRRSV
ORF5基因
ORF7基因
亲缘关系图谱
Keywords
PRRSV
ORF5 gene
ORF7 gene
phylogenetic tree
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
Q788 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)选育品系及其野生型的ISSR指纹分析
被引量:
20
2
作者
李文红
姚建亭
王继成
王如才
段德麟
机构
中国科学院海洋研究所
中国海洋大学水产学院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期241-247,共7页
基金
国家高技术发展计划(863)课题(2001AA621090)资助
广西科学基金(桂科基0236011)资助
青岛市科技计划项目(0321JSH02)资助
文摘
采用ISSR标记对龙须菜一个野生型群体和选育品系两个不同年代的栽培群体,进行了亲缘关系分析,构建了龙须菜选育品系的指纹图谱。通过实验从22个ISSR引物中筛选出16条引物,可以产生清晰稳定及可重复的带,共扩增出118个位点;野生型和选育品系两个群体的遗传相似率分别为0.7301、0.7189,选育品系的两养殖种群间的遗传相似率为0.9375;遗传距离聚类分析证明,龙须菜选育品系与其青岛野生型亲缘关系很近。7条引物产生的12条特异片段可用于龙须菜选育品系的种质鉴定,每条引物都能将龙须菜选育品系和其野生型分开;根据引物S848扩增的位点构建了指纹图谱,可用于区分龙须菜选育种群及野生种群。
关键词
龙须菜
红藻
亲缘
关系
分析
种质鉴定
指纹
图谱
ISSR
Keywords
Gracilaria lemaneiformis, Rhodophyta, Relationship analysis, Germplasm identification, Fingerprint,ISSR
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PRRSV云南A06株ORF5和ORF7基因的克隆与序列分析
曾少灵
林庆燕
花群义
张彩虹
阮周曦
杨俊兴
孙洁
秦智锋
曹琛福
陈兵
吕建强
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010
2
下载PDF
职称材料
2
龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)选育品系及其野生型的ISSR指纹分析
李文红
姚建亭
王继成
王如才
段德麟
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2005
20
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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