应用代表性差异分析法筛选人癌候选抑癌基因 被引量：2

1

作者 湛凤凰 江宁 +5 位作者 曹利 邓龙文 周鸣 谢奕 曾朝阳 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第2期165-169,共5页

运用ｃＤＮＡ代表性差异分析法（ｃＤＮＡｒｅｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎａｌｄｉｆｅｒｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓ，ｃＤＮＡＲＤＡ），以正常人鼻咽上皮细胞及鼻咽癌ＨＮＥ１细胞作为比较的样品来源，分离了四个在鼻咽癌中缺失的ｃＤＮ... 运用ｃＤＮＡ代表性差异分析法（ｃＤＮＡｒｅｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎａｌｄｉｆｅｒｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓ，ｃＤＮＡＲＤＡ），以正常人鼻咽上皮细胞及鼻咽癌ＨＮＥ１细胞作为比较的样品来源，分离了四个在鼻咽癌中缺失的ｃＤＮＡ片段．以此四个片段作探针，分别进行ＤＮＡ杂交、ＲＮＡ杂交，结果显示，这些差异性的ｃＤＮＡ序列确实来自正常人鼻咽上皮且只在其中表达和／或在鼻咽癌ＨＮＥ１中表达降低，并在鼻咽癌病人中存在不同程度的缺失．序列分析结果表明这些差异性表达的基因为具有相当抑癌基因功能的已知基因和可能与鼻咽癌相关的抑癌基因的新基因．从而说明ｃＤＮＡＲＤＡ是一种高效、敏感。 展开更多

关键词 鼻咽癌 抑癌基因 cDNA代表性差异分析法

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应用cDNA RDA联合cDNA阵列点杂交筛查差异表达基因的方法学分析 被引量：1

2

作者 彭依群 邓小戈 +3 位作者 翟木绪 隋国良 王敏 廖二元 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 2005年第4期413-417,共5页

目的探讨采用cDNA代表性差异分析法(representational difference analysis,RDA)联合cDNA阵列点杂交筛查差异表达基因的可行性及局限性。方法将17β雌二醇(E2)干预MG63细胞cDNA分别制备成检测和驱赶扩增子进行消减杂交作为整个cDNARDA... 目的探讨采用cDNA代表性差异分析法(representational difference analysis,RDA)联合cDNA阵列点杂交筛查差异表达基因的可行性及局限性。方法将17β雌二醇(E2)干预MG63细胞cDNA分别制备成检测和驱赶扩增子进行消减杂交作为整个cDNARDA的内部质控,以干预组扩增子、对照组扩增子和第4轮双向消减产物为模板,行内对照基因GAPDH的RTPCR进行消减效率分析,Southern杂交证实消减产物来源,快速Northern杂交证实消减产物确实呈差异表达;克隆到pGEMTeasy载体,转化JM109感受态细菌并铺Amp+XgalIPTG琼脂皿得到差异表达文库,随机挑取白色单菌落培养后点成尼龙阵列膜,分别与干预组和对照组扩增子及第4轮消减产物杂交,得到差异表达克隆用于后续研究。结果内部质控结果显示,第3轮消减杂交后,PCR未见差异性产物扩增;cDNARDA共得到3个雌二醇诱导表达上调条带和2个表达下调条带。Southern杂交结果显示在检测扩增子及第1～4轮差异产物中均可见阳性杂交信号,而驱赶扩增子中无杂交信号;快速Northern杂交证实干预组细胞总RNA的两处杂交信号均较对照组强;阵列膜同一克隆两个点对应的杂交信号呈高度相关一致性,共得到120个差异表达克隆(56个表达上调,64个表达下调)。结论cDNA代表性差异分析法联合cDNA阵列点杂交方法能有效快速高通量筛查E2诱导MG63差异表达基因。 展开更多

关键词 cDNA代表性差异分析法 CDNA阵列 基因表达 方法学

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小菜蛾对杀虫双抗性遗传的RDA分析 被引量：3

3

作者 张晓飞 程罗根 +2 位作者 陈之浩 于光 李忠英 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2003年第1期78-82,共5页

采用代表性差异分析法 (RDARepresentationaldifferenceanalysis)初步研究了小菜蛾两个品系 ,敏感品系和抗杀虫双近等基因系之间基因组的差异 .用敏感品系作为驱动扩增子 (driver) ,抗杀虫双近等基因系作为检验扩增子 (tester) ,通过四... 采用代表性差异分析法 (RDARepresentationaldifferenceanalysis)初步研究了小菜蛾两个品系 ,敏感品系和抗杀虫双近等基因系之间基因组的差异 .用敏感品系作为驱动扩增子 (driver) ,抗杀虫双近等基因系作为检验扩增子 (tester) ,通过四轮消减杂交后 ,得到两个差异片段 ,范围在 1 50bp至 30 0bp之间 。 展开更多

关键词 小菜蛾 近等基因系 杀虫双抗性 代表性差异分析法

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小菜蛾对溴氰菊酯抗性相关的DNA片段的克隆与分析 被引量：2

4

作者 程罗根 陈之浩 +1 位作者 张晓飞 李忠英 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期526-529,共4页

采用代表性差异分析 (representationaldifferenceanalysis ,RDA)方法 ,以小菜蛾Plutellaxylostella (L .)的敏感品系作为对照组 ,溴氰菊酯抗性近等基因系 (nearisogenicline)作为测试组 ,通过三轮消减杂交得到大小为 15 0～ 30 0bp的... 采用代表性差异分析 (representationaldifferenceanalysis ,RDA)方法 ,以小菜蛾Plutellaxylostella (L .)的敏感品系作为对照组 ,溴氰菊酯抗性近等基因系 (nearisogenicline)作为测试组 ,通过三轮消减杂交得到大小为 15 0～ 30 0bp的差异扩增带 ,经亚克隆测序并与GenBank等数据库同源比较 ,发现差异片段与已知抗性相关基因无同源性 ;以随机选取的差异片段作探针进行Southernblot分析 ,在测试组扩增子和三轮差异产物中都获得了阳性结果 ,而在对照组扩增子中的结果是阴性的。 展开更多

关键词 小菜蛾 溴氰菊酯 抗药性 代表性差异分析法 DNA测序

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小菜蛾溴氰菊酯抗性和敏感种群遗传差异的cDNA RDA分析 被引量：1

5

作者 王淑珍 程罗根 +1 位作者 陈之浩 李忠英 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期63-66,共4页

寻找小菜蛾抗溴氰菊酯品系中差异表达基因,初步分析小菜蛾敏感品系与抗溴氰菊酯品系间的遗传差异。采用改进的 cDNA 代表性差异分析法,以小菜蛾抗溴氰菊酯品系的 cDNA为 Driver 扩增子、敏感品系的 cDNA 为 Tester 扩增子,通过四轮消减... 寻找小菜蛾抗溴氰菊酯品系中差异表达基因,初步分析小菜蛾敏感品系与抗溴氰菊酯品系间的遗传差异。采用改进的 cDNA 代表性差异分析法,以小菜蛾抗溴氰菊酯品系的 cDNA为 Driver 扩增子、敏感品系的 cDNA 为 Tester 扩增子,通过四轮消减杂交,获得1条200bp 左右的差异扩增带。将此差异扩增带克隆于 pMD18-T 载体,随机挑选10个克隆测序。将所得的10个序列与 GenBank 等数据库作同源比较,发现仅有1个序列与已知泛素基因有较高同源性,但它与小菜蛾抗药性的关系尚未查明。 展开更多

关键词 CDNA 溴氰菊酯 遗传差异 小菜蛾 敏感种群 RDA 代表性差异分析法 GenBank 抗性 差异表达基因 Driver 敏感品系 初步分析 消减杂交 克隆测序 同源比较 泛素基因 T载体 数据库 同源性 抗药性 序列

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苏南地区TTV DNA病毒的临床观察 被引量：1

6

作者 杭双荣 王永忠 +1 位作者 陈敏 洑翔科 《放射免疫学杂志》 CAS 2006年第5期440-441,共2页

关键词 DNA病毒 TTV 苏南地区 临床观察 代表性差异分析法 聚合酶反应 肝炎病毒 肝炎病人

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雌二醇诱导人成骨样MG-63细胞表达下调基因的筛查

7

作者 彭依群 翟木绪 +3 位作者 邓小戈 隋国良 王敏 廖二元 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1507-1510,共4页

目的筛查17β雌二醇(E2)诱导MG-63细胞下调表达cDNA片段,寻找MG-63细胞中E2相关基因,探讨雌激素的骨保护作用机制。方法用改良cDNA代表性差异分析法筛查E2干预MG-63细胞表达下调的cDNA片段,Southern杂交和快速Northern杂交分析cDNA片段... 目的筛查17β雌二醇(E2)诱导MG-63细胞下调表达cDNA片段,寻找MG-63细胞中E2相关基因,探讨雌激素的骨保护作用机制。方法用改良cDNA代表性差异分析法筛查E2干预MG-63细胞表达下调的cDNA片段,Southern杂交和快速Northern杂交分析cDNA片段来源后,克隆到pGEM-Teasy载体,蓝白筛选挑取阳性克隆进行测序和同源性比较分析。最后选取部分阳性差异表达克隆行Northern杂交分析。结果得到2个表达下调的cDNA条带,证实差异表达cDNA片段经E2干预后表达下调。随机挑取20个克隆测序得到19个序列,分别代表14个不同基因,均与已知基因高度同源,这些基因与骨基质形成、转录信号转导及细胞分化发育调节等相关,其中1个克隆经Northern杂交证实其受E2干预表达下调。结论cDNA代表性差异分析法可快速筛查差异表达基因。MG-63细胞受E2诱导下调表达的部分基因可能参与了雌激素介导的骨重建过程从而起到骨保护作用。 展开更多

关键词 cDNA代表性差异分析法 雌激素 MG-63细胞 基因

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TT病毒的研究进展 被引量：1

8

作者 卢瑗瑗 钱超 卢春 《国外医学（病毒学分册）》 2004年第3期78-81,共4页

1997年 1 2月 ,日本学者Nishizwa等用代表性差异分析法 (representationaldifferenceanalysis ,RDA) ,从原因不明的输血后肝炎患者血清中发现了TTV。此后 ,许多学者开展了对TTV的研究 ,其生物学特性、流行病学、检测方法、及临床致病性... 1997年 1 2月 ,日本学者Nishizwa等用代表性差异分析法 (representationaldifferenceanalysis ,RDA) ,从原因不明的输血后肝炎患者血清中发现了TTV。此后 ,许多学者开展了对TTV的研究 ,其生物学特性、流行病学、检测方法、及临床致病性等方面的研究取得了一定的进展。本文结合国内外文献。对以上问题简要综述如下。 展开更多

关键词 TT病毒 生物学 代表性差异分析法 肝炎

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泉州地区肝炎患者TTV感染状况调查

9

作者 苏智军 张奕返 +5 位作者 杨海杰 郭如意 叶汉年 曾庆欣 张军 夏宁邵 《中西医结合肝病杂志》 CAS 1999年第S1期22-23,共2页

近年来,人们注意到除HAV、HBV、HCV、HDV、HEV和HGV等肝炎病毒外,仍有5％～10％的肝炎患者不能确定原因。1997年底Nishizawa等使用代表性差异分析法(RDA)首次从1例非A～G型的输血后肝炎患者血清中分离到一种新的单链DNA的病毒基因,暂命... 近年来,人们注意到除HAV、HBV、HCV、HDV、HEV和HGV等肝炎病毒外,仍有5％～10％的肝炎患者不能确定原因。1997年底Nishizawa等使用代表性差异分析法(RDA)首次从1例非A～G型的输血后肝炎患者血清中分离到一种新的单链DNA的病毒基因,暂命名为输血传播病毒(transfusiontransmitted virus,TTV)。我们根据公布的TTV序列,设计了两对特异性引物,建立了检测血清TTV DNA的巢式PCR方法,对泉州地区各类型肝炎患者TTV感染状况进行调查。 展开更多

关键词 肝炎患者 TTV感染 泉州地区 肝炎病毒 巢式PCR 国家专业实验室 代表性差异分析法 病毒性肝炎 DNA阳性 肿瘤细胞

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输血传播病毒单独感染者肝组织病理学观察

10

作者 黄萃 许佳平 +1 位作者 李纲 努尔陶 《武警医学》 CAS 2004年第10期776-777,共2页

关键词 输血传播病毒 肝组织病理 观察 单独感染 肠道传播 肝炎病毒感染 肝炎相关病毒 代表性差异分析法 类病毒 发现

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人成骨肉瘤MG-63细胞雌激素相关基因的分离

11

作者 彭依群 廖二元 邓小戈 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第5期459-462,共4页

目的 :筛查 17β雌二醇 (17β estradiol,E2 )诱导人成骨肉瘤MG 6 3细胞株差异表达cDNA片段 ,寻找雌激素相关基因。方法 :改良的cDNA代表性差异分析法 (cDNArepresentationaldifferenceanalysis,cDNARDA)分离E2 干预MG 6 3细胞株表达上... 目的 :筛查 17β雌二醇 (17β estradiol,E2 )诱导人成骨肉瘤MG 6 3细胞株差异表达cDNA片段 ,寻找雌激素相关基因。方法 :改良的cDNA代表性差异分析法 (cDNArepresentationaldifferenceanalysis,cDNARDA)分离E2 干预MG 6 3细胞株表达上调cDNA片段 ,经Southern和快速Northern杂交证实表达上调的cDNA片段来源后 ,将其克隆到 pGEM Teasy载体 ,蓝白筛选后挑取阳性克隆进行测序和同源比较分析 ,最后选取其中部分克隆行Northern印迹杂交。结果 :第 4轮消减杂交得到 5个E2 诱导人成骨肉瘤MG 6 3细胞表达上调的差异cDNA条带 ,Southern和快速Northern杂交证明表达上调的cDNA片段来自E2 干预的MG 6 3细胞 ;随机选 2 5个克隆测序得到13个序列 ,7个与已知基因高度同源 ;其中 2个克隆经Northern杂交证实E2 干预后表达上调。结论 :cDNARDA能有效筛查差异表达基因 ,人成骨肉瘤MG 6 3细胞中某些基因受雌激素诱导表达上调 ,可能与绝经后骨质疏松的发病相关。 展开更多

关键词 cDNA代表性差异分析法 雌激素 MG-63细胞 差异表达基因

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表型克隆策略及其技术与肿瘤相关基因克隆

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作者 陆元志 姚运红 唐慰萍 《医学综述》 2001年第11期648-650,共3页

关键词 肿瘤 表型遗传学 代表性差异分析法 抑制消减杂交

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人类疱疹病毒8型诊断学的研究进展

13

作者 张德志 普雄明 《新疆医科大学学报》 CAS 2006年第12期1199-1201,共3页

关键词 人类疱疹病毒8型 诊断学 KAPOSI肉瘤 LYMPHOMA 代表性差异分析法 HHV-8 相关疱疹病毒 生物学特性

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