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糙皮侧耳原基发育关联物质及代谢通路分析
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作者 刘芹 孔维丽 +5 位作者 崔筱 牛森园 师子文 吴杰 梁雪迪 刘阳 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第6期52-60,共9页
为揭示糙皮侧耳原基发育的潜在调控物质,采用代谢组学的方法对糙皮侧耳菌丝体和原基细胞代谢物进行检测分析。结果表明,菌丝体与原基细胞的代谢物具有显著差异。采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS‐DA),以VIP(varible importance in the ... 为揭示糙皮侧耳原基发育的潜在调控物质,采用代谢组学的方法对糙皮侧耳菌丝体和原基细胞代谢物进行检测分析。结果表明,菌丝体与原基细胞的代谢物具有显著差异。采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS‐DA),以VIP(varible importance in the projection)≥1和倍数变化≥2或≤0.5为条件共筛选到400种差异代谢物。调控通路分析表明,这些差异物质涉及33条代谢通路,其中丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸、氨酰tRNA生物合成、嘌呤代谢等8条代谢通路具有极显著影响。谷氨酸和谷氨酰胺涉及p<0.01的大部分代谢通路,可能在糙皮侧耳原基发育过程中具有重要调控作用。研究结果为糙皮侧耳以及其他大型真菌原基发育机制的探索提供了理论依据。 展开更多
关键词 糙皮侧耳 原基发育 代谢组学 差异代谢 代谢通路
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宫颈上皮细胞HPV阳性细菌性阴道炎患者阴道菌群的多样性、差异代谢组分及其代谢通路变化观察
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作者 熊文娟 王晓娟 +2 位作者 杨珊珊 吴丽萍 湛文博 《山东医药》 CAS 2024年第18期16-20,共5页
目的观察宫颈上皮细胞人乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus,HPV)阳性细菌性阴道炎(Bacterial Vaginosis,BV)患者阴道菌群多样性及代谢组分变化,探索HPV阳性BV患者的潜在生物标志物。方法选择宫颈上皮细胞HPV阳性BV感染患者6例(观察组)... 目的观察宫颈上皮细胞人乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus,HPV)阳性细菌性阴道炎(Bacterial Vaginosis,BV)患者阴道菌群多样性及代谢组分变化,探索HPV阳性BV患者的潜在生物标志物。方法选择宫颈上皮细胞HPV阳性BV感染患者6例(观察组)、健康查体者6例(对照组),留取阴道分泌物标本,采用16S rDNA(16S ribosomal DNA Sequencing,16S rDNA)基因测序技术检测两组阴道菌群,通过物种组成、α多样性、β多样性分析阴道菌群多样性,采用线性判别分析效应大小筛选两组差异菌群,采用液相色谱—质谱联用技术检测两组阴道菌群代谢组分,采用V16.0.2版SIMCA软件筛选正交偏最小二乘判别分析中可变信息处理信息倍数>1、P<0.05的阴道菌群差异代谢组分,运用京都基因与基因组百科全书数据库对宫颈上皮细胞HPV阳性BV感染患者阴道菌群差异代谢组分进行通路富集分析。结果观察组、对照组阴道菌群共有操作分类单元(OTUs)201个,特有OTUs分别为526、293个;观察组、对照组Shannon指数分别为3.93±1.11、1.65±0.85,Simpson指数分别为0.84±0.14、0.41±0.21,pielou_e指数分别为0.52±0.13、0.23±0.10(t分别为0.130、0.122、0.122,P均<0.05);两组阴道菌群相似度jaccard anosim检测结果为R=0.3726,P<0.05。与对照组相比,门水平上观察组阴道分泌物与梭杆菌门丰度升高,属水平上观察组阴道分泌物纤毛菌属、奇异菌属丰度升高,链球菌属丰度低(P均<0.05);两组阴道菌群的差异物种为梭杆菌门梭杆菌纲梭杆菌目、纤毛菌属、奇异菌科奇异菌属、Mageeibacillus菌属、Shuttleworthia菌属。与对照组相比,观察组患者阴道菌群差异代谢组分主要有尿嘧啶、甲基丙二酸和烟酸等24个,差异代谢通路有嘧啶代谢、烟酸酯和烟酰胺代谢通路等6个。结论宫颈上皮细胞HPV阳性BV感染患者的阴道菌群多样性增加,以纤毛菌属、奇异菌属及链球菌属菌群变化为主,HPV阳性BV患者阴道菌群差异代谢组分有尿嘧啶、甲基丙二酸和烟酸等,差异代谢通路主要有嘧啶代谢、烟酸酯和烟酰胺代谢通路等。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 细菌性阴道病 阴道菌群 菌群多样性 代谢组分 代谢通路
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制草乌肝毒性效应的代谢通路分析
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作者 姜艳丽 图布新 +5 位作者 乌日汉 胡伊力格其 刘锦文 韩晓静 阿都沁夫 白梅荣 《云南中医中药杂志》 2024年第3期84-89,共6页
目的基于代谢组学技术检测制草乌对大鼠肝功能指标及肝组织病理影响从而探究代谢通路分析。方法以制草乌为示例药物,以大鼠为研究对象,将大鼠按体重随机分成4组。根据预试验结果设定正常组、制草乌高剂量组、中剂量组、低剂量组。除正... 目的基于代谢组学技术检测制草乌对大鼠肝功能指标及肝组织病理影响从而探究代谢通路分析。方法以制草乌为示例药物,以大鼠为研究对象,将大鼠按体重随机分成4组。根据预试验结果设定正常组、制草乌高剂量组、中剂量组、低剂量组。除正常组外,其余各给药组灌胃相应的药物溶液,1次/d,连续灌胃28 d,末次给药后收集血清样本,检测各组的血清生化指标及采用LC-MS非靶向代谢组学技术对血清内源性代谢产物变化进行分析。结果血清生化指标结果显示,与正常组比较,制草乌高剂量组ALT含量显著升高,有统计学意义(P<0.05);制草乌中和低剂量组指标差异无统计学意义(P>0.05);肝组织病理检测显示,正常组肝小叶结构清晰,肝细胞索和肝血窦大致呈放射状排列,肝细胞圆润、饱满,肝板排列规则、整齐。制草乌高剂量组肝细胞广泛水肿、空泡化、丧失结构完整性;制草乌中和低剂量组未见明显异常;从血清中共筛选出34个内源性差异代谢物,其中上调15个、下调19个,多数涉及烟酸和多种氨基酸代谢。结论明确制草乌具有一定的肝毒性;肝毒性机制主要与烟酰胺(NA)和1-甲基烟酰胺(MNA)代谢有关。 展开更多
关键词 制草乌 肝脏毒性 血清 代谢通路 机制分析
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针灸基于高血糖引发代谢通路治疗糖尿病周围神经病变研究进展
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作者 张长龙 李阳 +4 位作者 田源 全爱君 焦敏娜 郭祀慧 尚莉莉 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2024年第9期157-163,共7页
糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)的患病人数呈逐年上升趋势,严重影响患者的生活质量。高血糖引发的代谢通路是糖尿病周围神经病变的重要发病机制,主要包括多元醇通路、蛋白激酶C途径、己糖胺途径以及糖基化终... 糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)的患病人数呈逐年上升趋势,严重影响患者的生活质量。高血糖引发的代谢通路是糖尿病周围神经病变的重要发病机制,主要包括多元醇通路、蛋白激酶C途径、己糖胺途径以及糖基化终产物生成4种途径。现代医学证明上述4种途径的过度开启会导致DPN或加快其进展。中医理论认为糖尿病周围神经病变主要由瘀血所致。临床上采用针灸疗法可活血祛瘀,明显改善症状。研究证实针灸治疗机制与作用于上述4种异常通路途径相关,可降低山梨醇、蛋白激酶C(protein kinase C,PKC)途径、己糖胺途径以及糖基化终产物(advanced glycation end-products,AGEs)的含量,纠正神经细胞水肿等。但现有研究仍存在分子机制缺乏深入探索、针灸治疗选穴无标准化、干预方式实际作用无对比效果等问题。因此未来应进一步探究针灸治疗糖尿病周围神经病变的具体分子机制,如结合微小RNA(microRNA,miRNA)、雪旺细胞等相关研究热点以探索新的研究方向,完善相关选穴及干预方式的理论依据。该文通过对基于高血糖引发的代谢通路的相关作用以及针灸有效性进行综述及探讨,为后续研究提供新的方向与思路。 展开更多
关键词 糖尿病周围神经病变 针灸 代谢通路
原文传递
向日葵对列当寄生的生理响应及关键代谢通路分析
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作者 赵榕 王猛 +3 位作者 赵雅杰 朱孔艳 温玉洁 包海柱 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期43-52,共10页
【目的】分析向日葵对列当寄生的生理响应及其相关代谢通路,揭示向日葵对列当寄生的抗性分子机制。【方法】以抗列当向日葵材料(s41)和感列当向日葵材料(s26)为供试材料进行接种列当处理,对正常生长(s41CK,s26CK)和列当寄生胁迫(s41,s26... 【目的】分析向日葵对列当寄生的生理响应及其相关代谢通路,揭示向日葵对列当寄生的抗性分子机制。【方法】以抗列当向日葵材料(s41)和感列当向日葵材料(s26)为供试材料进行接种列当处理,对正常生长(s41CK,s26CK)和列当寄生胁迫(s41,s26)条件下的4个样本进行转录组测序分析,同时对部分关键代谢物质进行生理验证分析。【结果】(1)在列当接种条件下,向日葵高感列当材料的植株高度和根量明显受到抑制,而且已有部分列当出土,而高抗列当材料无明显变化,仅有极少数列当寄生。(2)通过对样品间进行差异基因筛选,得到差异表达基因(DEGs)数量分别为6362,6609,5490,5469个。GO分析表明,s26-s41、s26CK-s41CK、s26-s26CK、s41-s41CK4个比较组参与生物过程的差异基因数量较多,参与细胞组分的差异基因数量次之,参与分子功能的较少;KEGG分析表明列当寄生对向日葵的植物信号转导、次生代谢物的生物合成、脂质代谢、氨基酸代谢、糖代谢有较大的影响。(3)在列当寄生条件下,向日葵抗、感列当材料苯丙氨酸解氨酶、肉桂醇脱氢酶活性及谷胱甘肽、总酚、水杨酸含量均有上升趋势,它们的抗逆系统被激活,但感、抗材料相关生理指标变化趋势有所不同,控制相关生理指标的基因表达情况也不同。【结论】接种列当会明显抑制高感向日葵材料植株高度和根量,而对高抗材料则无明显影响;抗性材料通过增强根部木质素合成、抗氧化酶活性以及调控苯丙烷类代谢、水杨酸信号途径等关键基因表达来提高向日葵植株对列当的抗性。 展开更多
关键词 向日葵列当 向日葵 转录组 生理响应 代谢通路
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原位制备混合菌基复合酶强化餐厨垃圾定向水解和厌氧消化:效能、机制、微生物群落和全局代谢通路
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作者 陈佳新 崔理慧 +5 位作者 延一鸣 吉星星 费强 马英群 陈佳新(译) 马英群(审查) 《环境卫生工程》 2024年第5期128-128,共1页
1研究亮点*研发了适用于餐厨垃圾定向酶解的混合菌基复合酶,餐厨垃圾厌氧消化效率提升,甲烷产率提高55.9%;*混合菌基复合酶促进了餐厨垃圾溶解,破坏了餐厨垃圾结构,增强了其生物可降解性;*混合菌基复合酶预处理重塑了厌氧消化过程的微... 1研究亮点*研发了适用于餐厨垃圾定向酶解的混合菌基复合酶,餐厨垃圾厌氧消化效率提升,甲烷产率提高55.9%;*混合菌基复合酶促进了餐厨垃圾溶解,破坏了餐厨垃圾结构,增强了其生物可降解性;*混合菌基复合酶预处理重塑了厌氧消化过程的微生物群落,强化了甲烷生产的代谢通路。2背景水解是餐厨垃圾厌氧消化过程的限速步骤,开发绿色高效的餐厨垃圾预处理技术迫在眉睫。酶解技术具有反应条件温和、无副产物/难降解物质产生和无化学污染等优点,特别是其高选择性和专一性,可实现餐厨垃圾中可生物降解组分的定向水解,是一种极具应用前景的餐厨垃圾预处理技术。然而,商业酶通常以单一类型的形式提供,对组分复杂的餐厨垃圾酶解效率偏低,且长期连续使用成本较高,限制其进一步推广应用。 展开更多
关键词 餐厨垃圾 混合菌基复合酶 厌氧消化 酶水解机制 微生物群落 代谢通路
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单唾液酸四己糖神经节苷脂对DPN大鼠多元醇代谢通路及尾神经电生理变化的影响 被引量:2
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作者 任丽敏 何红丽 +1 位作者 白玲茹 赵霞 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第2期414-418,共5页
目的 探索单唾液酸四己糖神经节苷脂(GM1)对糖尿病周围神经病变(DPN)大鼠多元醇代谢通路及尾神经电生理变化的影响。方法 复制DPN大鼠,随机分为5组:模型组、GM1低剂量(1.0 mg/kg)组、GM1中剂量(2.5 mg/kg)组、GM1高剂量(5.0 mg/kg)组、... 目的 探索单唾液酸四己糖神经节苷脂(GM1)对糖尿病周围神经病变(DPN)大鼠多元醇代谢通路及尾神经电生理变化的影响。方法 复制DPN大鼠,随机分为5组:模型组、GM1低剂量(1.0 mg/kg)组、GM1中剂量(2.5 mg/kg)组、GM1高剂量(5.0 mg/kg)组、甲钴胺(0.25 mg/kg)组,每组12只,另取12只SD大鼠作为对照组。给药结束后,以机械性疼痛刺激和热敏试验检测各组大鼠疼痛情况;测定大鼠尾神经电生理变化;苏木素-伊红(HE)染色检测大鼠坐骨神经病理变化情况;以试剂盒检测大鼠坐骨神经醛糖还原酶活性、多元醇(山梨醇、果糖)含量及血清肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6水平。结果 与对照组相比,模型组神经纤维结构混乱,排列松散分离,出现明显的病理损伤,坐骨神经醛糖还原酶活性、多元醇(山梨醇、果糖)含量及血清TNF-α、IL-6水平显著升高,缩爪阈值、热敏潜伏期、运动及感觉神经传导速度和波幅显著降低(均P<0.05)。与模型组相比,GM1低、中、高剂量组及甲钴胺组坐骨神经病理损伤减轻,坐骨神经醛糖还原酶活性、多元醇(山梨醇、果糖)含量及血清TNF-α、IL-6水平明显降低,大鼠缩爪阈值、热敏潜伏期、运动及感觉神经传导速度和波幅明显升高(P<0.05),且GM1各组呈剂量依赖性(P<0.05),GM1高剂量组与甲钴胺组相比,各指标差异无统计学意义(P>0.05)。结论 GM1可抑制DPN大鼠炎症反应,减弱多元醇代谢过程,改善其尾神经电生理异常,减轻坐骨神经病理损伤,缓解其临床症状。 展开更多
关键词 单唾液酸四己糖神经节苷脂 糖尿病周围神经病变 多元醇代谢通路 尾神经电生理变化
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嘎日迪-5对心脏毒性的代谢通路分析
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作者 乌日罕 姜艳丽 +5 位作者 图布新 胡伊力格其 刘锦文 韩晓静 阿都沁夫 白梅荣 《中国民族医药杂志》 2023年第12期52-55,共4页
目的:采用代谢组学方法分析嘎日迪-5心脏毒性机制。方法:以大鼠为研究对象,以嘎日迪-5为示例药物,将大鼠按体质量随机分为正常组,嘎日迪-5高、中、低剂量组。除正常组外,各给药组灌胃药物溶液,连续灌胃28 d,末次给药后收集血清样本,采用... 目的:采用代谢组学方法分析嘎日迪-5心脏毒性机制。方法:以大鼠为研究对象,以嘎日迪-5为示例药物,将大鼠按体质量随机分为正常组,嘎日迪-5高、中、低剂量组。除正常组外,各给药组灌胃药物溶液,连续灌胃28 d,末次给药后收集血清样本,采用LC-MS非靶向代谢组学技术分析血清内源性代谢产物变化。结果:与正常组比较,嘎日迪-5高剂量组CK、CKMB含量显著升高(P<0.05),嘎日迪-5中剂量、嘎日迪-5低剂量组CKMB含量显著降低(P<0.05)。各给药组大鼠的心电图主要表现为嘎日迪-5高剂量组心动过缓,ST段压低;嘎日迪-5中剂量组室早,宽大畸形的QRS波(P<0.05);嘎日迪-5低剂量组ST段压低。心脏组织病理检测显示,正常组心肌纤维排列整齐规则,胞核呈蓝色,胞质呈淡粉色,细胞结构清晰。嘎日迪-5高剂量、嘎日迪-5中剂量组心肌纤维排列紊乱,胞质疏松淡染,部分细胞水肿。嘎日迪-5低剂量组心肌纤维排列略紊乱,胞质疏松淡染;嘎日迪-5高剂量(GG)组心脏样本中筛出121个差异代谢物。结论:嘎日迪-5心脏毒性机制与大鼠心脏内ABC转运蛋白、精氨酸和脯氨酸代谢、烟酸和烟酰胺代谢等通路有关。 展开更多
关键词 嘎日迪-5 心脏毒性 代谢通路 机制分析
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基于网络药理学探讨治疗乳难中药共同代谢通路
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作者 沈冰芳 方聪 +5 位作者 徐小妹 张亚敏 卢雪花 李丽莎 徐榕青 林文津 《中国兽药杂志》 2023年第7期33-41,共9页
基于网络药理学的方法探讨乳难中药共同代谢通路。遴选2020年版《中国药典》中具有下乳或通乳作用的中药材,应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中国知网筛选中药材的全部活性成分,并使用TCMSP和Swiss Target Prediction分析平台查询... 基于网络药理学的方法探讨乳难中药共同代谢通路。遴选2020年版《中国药典》中具有下乳或通乳作用的中药材,应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中国知网筛选中药材的全部活性成分,并使用TCMSP和Swiss Target Prediction分析平台查询相关靶点。借助UniPort数据库进行基因标准化查询。应用GeneCards数据库和OMIM数据库筛选乳难疾病的靶点;通过在线Venny获得药物疾病的共同靶点。将获得的结果导入Cytoscape软件中进行可视化分析,构建PPI网络,筛选核心靶点。采用Metascape数据库对核心靶点进行GO分析和KEGG相关通路富集。共获得有效活性成分58种,潜在靶点336个,疾病靶点2175个,得到共同靶点158个。GO分析得到生物过程947个,细胞组分29个,分子功能54个,KEGG得到IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等119条通路。利用网络药理学分析平台可对治疗乳难中药的有效成分靶点、乳难疾病靶点以及相关信号通路进行预测,为进一步研究探讨乳难中药共同代谢通路提供了重要依据。 展开更多
关键词 网络药理学 中药 乳难 靶点 代谢通路
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急性心肌梗死血浆标志代谢物及相关代谢通路的筛选 被引量:4
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作者 许文轩 李彤 +5 位作者 张磊 连烁 稂与恒 胡晓旻 高文卿 宁萌 《山东医药》 CAS 2018年第7期23-27,共5页
目的对经皮冠状动脉介入(PCI)治疗的急性心肌梗死(AMI)患者血浆代谢轮廓进行分析,筛选心肌梗死血浆标志代谢物和相关代谢通路。方法收集25例AMI患者(病例组)手术前后的血浆及26例健康志愿者(对照组)的血浆,进行基于超高效液相色谱与超... 目的对经皮冠状动脉介入(PCI)治疗的急性心肌梗死(AMI)患者血浆代谢轮廓进行分析,筛选心肌梗死血浆标志代谢物和相关代谢通路。方法收集25例AMI患者(病例组)手术前后的血浆及26例健康志愿者(对照组)的血浆,进行基于超高效液相色谱与超高分辨生物质谱联用(UPLC-MS)代谢组学分析,经MZmine2.0系统对离子色谱峰进行识别、匹配及归一化处理,进一步将数据导入SIMCA-P+12.0.1.0系统,构建得到主成分分析(PCA)及正交偏最小二乘判别(OPLS-DA)模型。根据离子对模型的贡献度及置信区间,筛选潜在标志代谢物,对两组代谢物水平进行比较,鉴别差异性代谢产物;将筛选鉴定出的标志代谢物输入Metabo Analyst3.0数据库,进行代谢通路分析。结果成功构建了两组血浆代谢轮廓的PCA模型和OLPS-DA模型。从模型中筛查出8种在两组血浆中存在显著差异的代谢物,即溶血磷脂酰胆碱(Lyso PC)类物质[18∶2(9Z,12Z)]、Lyso PC(16∶0)、Lyso PC(P-16∶0)、Lyso PC(18∶0),溶血磷脂酸(LPA)类物质[0∶0/18∶1(9Z)]、孕烷三醇(Pregnanetriol)、N-软脂酰基鞘氨醇(NPalmitoylsphingosine),神经酰胺类物质Cer(d18∶0/16∶0)。其中病例组术后血浆Lyso PC[18∶2(9Z,12Z)]、Lyso PC(16∶0)、Pregnanetriol、Lyso PC(P-16:0)水平趋于正常,说明AMI及PCI手术治疗是影响这些代谢物变化的重要因素。将8种差异性代谢物输入Metabo Analyst3.0数据库,共筛查出与AMI相关的两条代谢通路,为甘油磷脂代谢通路和甘油脂类代谢通路,在两条代谢通路中存在共有的受到AMI影响的代谢物,即磷脂酸类物质1,2-diacyl-snglycerol-3-phosphate。结论筛选出8种AMI标志代谢物,包括Lyso PC[18∶2(9Z,12Z)]、LPA[0∶0/18∶1(9Z)]、Lyso PC(16∶0)、Pregnanetriol、Lyso PC(P-16∶0)、N-Palmitoylsphingosine、Cer(d18∶0/16∶0)、Lyso PC(18∶0);筛查出与AMI相关的两条代谢通路为甘油磷脂代谢通路和甘油脂类代谢通路,在两条代谢通路中存在共有的受到AMI影响的代谢物,即磷脂酸类物质1,2-diacyl-sn-glycerol-3-phosphate。 展开更多
关键词 心肌梗死 经皮冠状动脉介入治疗 代谢组学 甘油磷脂代谢通路 甘油脂类代谢通路
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甲钴胺、格列齐特及其联合用药对糖尿病周围神经病变大鼠坐骨神经功能和多元醇代谢通路的影响 被引量:20
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作者 封卫毅 侯家玉 +1 位作者 王晶 邢建峰 《中国药学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第1期27-30,共4页
目的 研究甲钴胺、格列齐特及其联合用药对链脲佐菌素 (STZ)糖尿病大鼠坐骨神经功能和多元醇代谢通路的影响。方法 动物灌胃给药 ,连续 8周 ,观察药物对链脲佐菌素糖尿病大鼠坐骨神经形态学改变、运动神经传导速度、坐骨神经Na+,K+ AT... 目的 研究甲钴胺、格列齐特及其联合用药对链脲佐菌素 (STZ)糖尿病大鼠坐骨神经功能和多元醇代谢通路的影响。方法 动物灌胃给药 ,连续 8周 ,观察药物对链脲佐菌素糖尿病大鼠坐骨神经形态学改变、运动神经传导速度、坐骨神经Na+,K+ ATP酶和醛糖还原酶活性及山梨醇、肌醇、果糖、葡萄糖、甘露糖等多元醇含量的影响。结果 格列齐特及格列齐特与甲钴胺联合用药对链脲佐菌素糖尿病大鼠坐骨神经形态学改变有明显保护作用 ,坐骨神经传导速度明显提高 ,坐骨神经Na+,K+ ATP酶活性增强 ,醛糖还原酶活性降低 ,葡萄糖含量减少 ,联合用药组山梨醇和果糖含量也明显降低。甲钴胺、格列齐特联合用药与两药单用相比 ,给药两周时的坐骨神经传导速度明显快于格列齐特组 ,给药 8周时坐骨神经中的山梨醇含量较两药单用有非常显著性降低 ,果糖含量较格列齐特组有明显降低。结论 甲钴胺、格列齐特及其联合用药对STZ糖尿病大鼠周围神经功能有明显的保护作用 ,对周围神经组织多元醇通路增强有明显的抑制作用 ,两药合用显示出一定的疗效增强作用。 展开更多
关键词 甲钴胺 格列齐特 联合用药 糖尿病周围神经病变 大鼠 坐骨神经功能 多元醇代谢通路 并发症
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基于组学数据库整合工具的代谢通路分析应用 被引量:6
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作者 周滔 李静宜 +1 位作者 马毅 薛明 《国际药学研究杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期587-592,600,共7页
组学技术方法和工具研究系统生物学的发展产生海量的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等组学数据。基于多平台组学数据整合的代谢通路分析为全面深刻了解生物医学系统提供了前提条件。本文综述了近年来基于组学数据库和整合工具的代谢... 组学技术方法和工具研究系统生物学的发展产生海量的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等组学数据。基于多平台组学数据整合的代谢通路分析为全面深刻了解生物医学系统提供了前提条件。本文综述了近年来基于组学数据库和整合工具的代谢通路分析方面的研究进展,包括新的数据整合方法和数据库分析平台。 展开更多
关键词 组学 数据库 代谢通路 分析工具 整合
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环磷酰胺对小鼠免疫抑制作用过程中代谢通路变化的代谢组学研究 被引量:8
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作者 师萱 阳勇 +3 位作者 秦伟瀚 徐嘉红 杨大坚 郭延垒 《中国实验动物学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期539-543,共5页
目的采用代谢组学方法,研究环磷酰胺对小鼠免疫抑制作用过程中代谢通路的变化。方法采用流式细胞术了解免疫细胞变化情况,通过建立偏最小二乘法模型多结果进行判别。以偏最小二乘法模型中变量重要性投影(variable importance in projec... 目的采用代谢组学方法,研究环磷酰胺对小鼠免疫抑制作用过程中代谢通路的变化。方法采用流式细胞术了解免疫细胞变化情况,通过建立偏最小二乘法模型多结果进行判别。以偏最小二乘法模型中变量重要性投影(variable importance in projection,VIP)参数筛选潜在的生物标志物,通过统计分析确定差异性代谢物,借助代谢组学小分子化合物快速鉴定分析软件系统对差异性代谢物进行进一步鉴定分析,通过搜库及运算最终确定差异代谢物质9种,通路富集结果分析差异代谢通路3条。结果环磷酰胺对正常机体的不饱和脂肪酸的生物合成、线粒体脂肪酸代谢、甘油磷脂代谢、甾类激素的生物合成、花生四烯酸代谢、脂肪酸代谢、嘧啶的生物合成等代谢通路均产生明显影响。结论环磷酰胺在正常组与实验组中影响最重要的代谢通路为花生四烯酸代谢、甘油磷脂代谢和嘧啶代谢。 展开更多
关键词 环磷酰胺 免疫抑制 代谢组学 代谢通路
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同病异治对戊四氮点燃大鼠海马区谷氨酸代谢通路的影响 被引量:10
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作者 于云红 谢炜 赵云燕 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期95-99,共5页
目的观察并比较癫痫"从肝论治"复方柴胡疏肝汤和"从痰论治"定痫丸对戊四氮(pentylenetetrazole,PTZ)点燃大鼠海马区谷氨酸代谢通路的影响,探讨同病异治理论的分子机制。方法以亚惊厥剂量PTZ腹腔注射大鼠建立慢性点... 目的观察并比较癫痫"从肝论治"复方柴胡疏肝汤和"从痰论治"定痫丸对戊四氮(pentylenetetrazole,PTZ)点燃大鼠海马区谷氨酸代谢通路的影响,探讨同病异治理论的分子机制。方法以亚惊厥剂量PTZ腹腔注射大鼠建立慢性点燃癫痫模型。完全点燃大鼠24只,随机分为4组,分别为模型组、丙戊酸钠组、定痫丸组和柴胡疏肝汤组,并分别给予生理盐水、丙戊酸钠、定痫丸和柴胡疏肝汤灌胃干预;对照组大鼠给予生理盐水腹腔注射和灌胃干预。连续灌胃4周后,应用HPLC荧光法检测大鼠海马谷氨酸(gluta-mate,Glu)含量;Western blot技术观察谷氨酸转运体-1(glutamate transporter-1,GLT-1)蛋白表达水平;谷氨酰胺合成酶检测试剂盒检测谷氨酰胺合成酶(glutamine synthetase,GS)活性。结果与对照组比较,模型组大鼠海马区Glu含量显著升高、GLT-1蛋白表达及GS活性显著降低(P<0.01);与模型组比较,各用药组大鼠海马区Glu含量均显著降低,GLT-1蛋白表达及GS活性均显著升高(P<0.01);两中药复方组比较,柴胡疏肝汤组大鼠海马区Glu含量降低及GS活性升高较定痫丸组更显著(P<0.01),而两组GLT-1蛋白表达,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 "从肝论治"复方柴胡疏肝汤和"从痰论治"定痫丸均能降低PTZ点燃大鼠海马区Glu含量,提高GLT-1蛋白表达及GS活性,说明两复方均能通过调节Glu代谢通路影响脑内Glu水平;而柴胡疏肝汤降低癫痫大鼠海马区Glu含量、上调GS活性效果优于定痫丸,提示柴胡疏肝汤和定痫丸对Glu代谢通路的调节存在不同作用靶点,这可能是癫痫同病异治理论的分子机制之一。 展开更多
关键词 谷氨酸转运体 大鼠海马 代谢通路 同病异治 海马区 戊四氮 点燃癫痫模型 蛋白表达水平
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基于宏基因组技术分析传统红茶菌中菌群组成及其主要代谢通路 被引量:21
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作者 徐伟 葛阳阳 +1 位作者 陈翠婷 马婷婷 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期119-123,129,共6页
由于传统红茶菌发酵过程中,微生物的种类及数量随时间延长而不断变化,导致红茶菌发酵液代谢产物难以控制。采用高通量测序技术对发酵7 d的传统红茶菌进行宏基因组测序,获得65771178个clean reads数据,经拼接组装,获得93449个Unigene片... 由于传统红茶菌发酵过程中,微生物的种类及数量随时间延长而不断变化,导致红茶菌发酵液代谢产物难以控制。采用高通量测序技术对发酵7 d的传统红茶菌进行宏基因组测序,获得65771178个clean reads数据,经拼接组装,获得93449个Unigene片段。以BLAST(E-value<1.0e-5)将Unigene对NR、KEGG数据库进行比对,与NR库比对共65515个Unigene得到注释信息,再将得到的注释信息根据GI(Gen Info Identifier)与物种分类的关系得到物种分类信息,分为细菌、真菌2个界,细菌界占96.57%,真菌界占3.40%,细菌的主要优势菌种是Gluconacetobacter sp.SXCC-1(29.17%)、Komagataeibacter medellinensis(7.84%)、Komagataeibacter xylinus(7.58%),真菌的优势菌种是Brettanomyces bruxellensis(1.86%);与KEGG数据库比对,共47234个Unigene注释到KEGG的代谢通路中,分属338类代谢通路,其中有2475个Unigene参与氨基酸代谢过程,307个属于次生代谢途径。序列已提交至Gen Bank数据库,登录号SRP103682。利用宏基因组技术将传统红茶菌中的微生物鉴定到"种"的水平,同时了解红茶菌微生物群落的代谢机理,可以更有效地控制红茶菌的发酵进程。 展开更多
关键词 红茶菌 菌群组成 代谢通路 宏基因组
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原发性肾病综合征患者血清异常代谢通路的代谢组学分析 被引量:18
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作者 李鞠 唐凤英 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第30期1-4,I0001,共5页
目的通过液相色谱质谱联用的代谢组学方法,分析与原发性肾病综合征(PNS)相关的异常代谢通路,探讨PNS的发病机制。方法应用超高效液相色谱-高分辨质谱法方法对40例PNS患者(观察组)和40例健康体检者(对照组)血清样本中的代谢物进行检测,... 目的通过液相色谱质谱联用的代谢组学方法,分析与原发性肾病综合征(PNS)相关的异常代谢通路,探讨PNS的发病机制。方法应用超高效液相色谱-高分辨质谱法方法对40例PNS患者(观察组)和40例健康体检者(对照组)血清样本中的代谢物进行检测,采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)法进行模式识别,构建PNS诊断模型,采用Met PA数据库进行代谢通路分析。结果 OPLS-DA模型的质量参数R2X=71.4%,Q2Y=0.517,观察组、对照组间的区分非常明显。代谢通路分析共筛选出有差异的代谢物相关通路9个,其中硫胺素代谢、嘧啶代谢、苯基丙氨酸代谢、柠檬酸循环4个代谢通路影响值均大于0.1。结论 PNS患者存在硫胺素代谢、嘧啶代谢、苯基丙氨酸代谢、柠檬酸循环代谢紊乱,可能与PNS的发生发展密切相关。 展开更多
关键词 代谢组学 液相色谱质谱联用 原发性肾病综合征 代谢通路 通路分析
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CYP2C19基因多态性对中国人体内兰索拉唑药代动力学及其5-羟基代谢通路的影响 被引量:6
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作者 严非 夏春华 熊玉卿 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2011年第12期1397-1402,共6页
目的:研究CYP2C19基因多态性对中国人体内兰索拉唑药代动力学及其5-羟基代谢通路的影响。方法:采用RFLP-PCR方法对12名健康受试者进行CYP2C19基因多态性检测,并采用液相色谱-质谱法(LC-MS)检测兰索拉唑体内血药浓度并计算相关的药代动... 目的:研究CYP2C19基因多态性对中国人体内兰索拉唑药代动力学及其5-羟基代谢通路的影响。方法:采用RFLP-PCR方法对12名健康受试者进行CYP2C19基因多态性检测,并采用液相色谱-质谱法(LC-MS)检测兰索拉唑体内血药浓度并计算相关的药代动力学参数,比较不同基因型受试者之间主要药代动力学参数以及AUCLPZ/AUC5-OH LPZ比值(AUClansoprazole/AUC5-hydroxy lansoprazole,此参数用以评价5-羟基代谢的标准)的差异。结果:12名健康受试者在给予30mg兰索拉唑后,发现突变型个体AUC0-t、AUC0-∞、CLz、(AUCLPZ/AUC5-OH LPZ)0-t、(AUCLPZ/AUC5-OH LPZ)0-∞分别相当于野生型个体的2.381、2.572、0.428、3.602、4.083倍。结论:CYP2C19的基因多态性对中国人体内兰索拉唑药代动力学过程有显著影响(P<0.05),而对兰索拉唑5-羟基代谢通路有极显著影响(P<0.01),结果提示CYP2C19的基因多态性是导致兰索拉唑体内血药浓度个体差异性的重要因素之一,且与兰索拉唑5-羟基代谢通路之间存在更好的相关性。 展开更多
关键词 药代动力学参数 CYP2C19 基因多态性 兰索拉唑 代谢通路 羟基 体内 中国
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基因芯片筛选电针预处理心肌缺血再灌注大鼠细胞色素P450代谢通路相关差异表达基因 被引量:4
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作者 李洋 邵明璐 +2 位作者 杨琳 谭奇纹 崔华峰 《辽宁中医杂志》 CAS 北大核心 2017年第4期691-694,I0002,共5页
目的:利用基因芯片技术筛选电针预处理心肌缺血再灌注(MIR)大鼠心肌组织中细胞色素P450代谢通路相关差异表达的基因,寻找电针预处理对MIR大鼠产生保护作用的可能发生机制。方法:72只成年Wistar大鼠,雌雄各半,随机分为假手术组(Sham)、... 目的:利用基因芯片技术筛选电针预处理心肌缺血再灌注(MIR)大鼠心肌组织中细胞色素P450代谢通路相关差异表达的基因,寻找电针预处理对MIR大鼠产生保护作用的可能发生机制。方法:72只成年Wistar大鼠,雌雄各半,随机分为假手术组(Sham)、模型组(IR)、夹脊组(JJ)、内关组(NG)、阳陵泉组(YLQ)、曲池组(QC),每组12只。电针预处理组每天针刺30 min,连续针刺7 d。采用结扎左冠状动脉前降支的方法复制心肌缺血再灌注损伤模型。提取心肌组织总RNA并进行评估,根据Agilent One-Color Microarray-Based Gene Expression Analysis实验方案进行样品标记和芯片杂交,使用Agilent Feature Extraction、Gene Spring GX v12.1进行数据处理,使用标准的富集计算方法进行GO分析和Pathway分析。结果:电针预处理能够调控缺血再灌注大鼠的基因表达,其中夹脊穴组和内关穴组对细胞色素P450代谢通路相关基因影响显著,上调CYP450表氧化酶基因Cyp2b3、Cyp2c11、Cyp2b2、Cyp2s1,同时下调ω-羟化酶基因Cyp4a2、Cyp1a1、Cyp1b1,阳陵泉组和曲池组无显著性差异。结论:多个基因参与心肌缺血再灌注过程,涉及多条信号通路,电针夹脊穴和内关穴能够上调CYP2家族基因,下调CYP1和CYP4家族基因,从分子水平阐明了其对MIRI的保护作用机制。 展开更多
关键词 基因芯片技术 电针预处理 心肌缺血再灌注 细胞色素P450代谢通路
原文传递
与脑梗死关联的氨基酸代谢通路研究进展与发现 被引量:7
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作者 郭志丽 朱妍 +1 位作者 肖红斌 王忠 《中国医药导报》 CAS 2013年第26期24-27,共4页
本文通过检索文献,分析近年来应用代谢组学手段检测到的与脑梗死相关氨基酸以及代谢通路的文章,讲述了氨基酸的代谢变化与脑梗死的相关性,发现在脑梗死产生、演变过程中产生作用或者发生异常的有7种氨基酸以及多条代谢通路,并且从分子... 本文通过检索文献,分析近年来应用代谢组学手段检测到的与脑梗死相关氨基酸以及代谢通路的文章,讲述了氨基酸的代谢变化与脑梗死的相关性,发现在脑梗死产生、演变过程中产生作用或者发生异常的有7种氨基酸以及多条代谢通路,并且从分子微观层面上描述了脑梗死的发生机制,发现脑梗死机制多集中于三羧酸循环能量代谢失衡、缺血缺氧以及兴奋毒性作用。 展开更多
关键词 氨基酸代谢 缺血性脑梗死 代谢组学 代谢通路
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2型糖尿病易感基因代谢通路生物信息学研究 被引量:2
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作者 张丽杰 裴智勇 +1 位作者 马跃 陈禹保 《国际检验医学杂志》 CAS 2016年第21期2996-2998,3001,共4页
目的构建中国人群中2型糖尿病易感基因的代谢通路。方法采用2型糖尿病的易感基因集合,基于商用数据库Ingenutiy Pathway Analysis(后简称IPA)中的Right-Tailed Fisher′s Exact Test算法进行统计分析,找到与糖尿病相关的代谢通路,并从... 目的构建中国人群中2型糖尿病易感基因的代谢通路。方法采用2型糖尿病的易感基因集合,基于商用数据库Ingenutiy Pathway Analysis(后简称IPA)中的Right-Tailed Fisher′s Exact Test算法进行统计分析,找到与糖尿病相关的代谢通路,并从中筛选出15个与中国人群糖尿病相关的易感基因,根据易感基因建立代谢通路,探讨中国人群易感基因之间在生物学上的关联关系。结果 KCNQ1、PPARG、IRS1、ADIPOQ等基因位于多条代谢通路的节点位置,与多条代谢通路相关。结论 KCNQ1、PPARG、IRS1、ADIPOQ等基因在中国人群2型糖尿病的发生过程中起到了关键作用。该研究结果对基于代谢通路研究复杂性疾病具有很好的借鉴意义。 展开更多
关键词 2型糖尿病 易感基因 代谢通路
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