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表面活性剂辅助蛋白质体外折叠:分子模拟 被引量:3
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作者 卢滇楠 王君 +2 位作者 刘志霞 张敏莲 刘铮 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期1063-1069,共7页
采用分子模拟方法考察表面活性剂与蛋白质分子之间的相互作用及其对蛋白质折叠过程热力学特性的影响,蛋白质分子构建采用HP模型并引入了方阱类势函数.模拟结果显示:模型蛋白分子的某些折叠中间态会陷入局部能量最低状态而无法完成折叠;... 采用分子模拟方法考察表面活性剂与蛋白质分子之间的相互作用及其对蛋白质折叠过程热力学特性的影响,蛋白质分子构建采用HP模型并引入了方阱类势函数.模拟结果显示:模型蛋白分子的某些折叠中间态会陷入局部能量最低状态而无法完成折叠;弱疏水性表面活性剂对模型蛋白的稳定性影响小,但可有效地帮助处于局部能量最低状态的蛋白折叠中间态通过能量壁垒而实现折叠;强疏水性表面活性剂则可与蛋白质形成高稳定性的复合物而阻止折叠的进行,需将其脱除才能使折叠过程重新开始.模拟结果还显示:表面活性剂的加入会使蛋白质折叠中间态更加丰富,从而能够光滑折叠过程中的能量阱;表面活性剂与变性环境对于蛋白质的折叠具有协同效应.模拟结果与文献报道的实验结果具有一致性,显示分子模拟的方法在揭示蛋白质折叠过程的微观机理以及表面活性剂类折叠助剂的分子设计方面有很好的应用前景. 展开更多
关键词 分子模拟 HP模型 表面活性剂 折叠中间态 动态MonteCarlo模拟 蛋白质体外折叠
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PEG修饰对溶菌酶体外折叠过程的影响
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作者 田浤 申庆亮 +1 位作者 姚东宁 李闻 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期466-470,共5页
以溶菌酶为模型蛋白,通过活性测定比较了PEG修饰前后溶菌酶复性动力学的差异,同时利用圆二色谱、色氨酸荧光谱等方法比较了PEG修饰前后蛋白质折叠过程中构象变化。结果显示:PEG修饰改变了溶菌酶复性动力学过程,使溶菌酶在低浓度变性剂... 以溶菌酶为模型蛋白,通过活性测定比较了PEG修饰前后溶菌酶复性动力学的差异,同时利用圆二色谱、色氨酸荧光谱等方法比较了PEG修饰前后蛋白质折叠过程中构象变化。结果显示:PEG修饰改变了溶菌酶复性动力学过程,使溶菌酶在低浓度变性剂条件下快速折叠。色氨酸荧光谱结果显示,PEG修饰对溶菌酶折叠过程中疏水微环境的形成有明显影响,稳定了溶菌酶折叠过程中的"熔球态",从而提高了溶菌酶正确折叠的概率。 展开更多
关键词 PEG修饰 蛋白质体外折叠 熔球态 荧光光谱 圆二色谱
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感光受体外周蛋白结合蛋白对虫荧光素酶体外折叠的促进作用
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作者 刘成刚 朱美财 +3 位作者 占志 王荫静 李文 刘亚宁 《空军总医院学报》 2003年第2期109-112,共4页
目的 探讨感光受体外周蛋白结合蛋白 (PBP)在体外是否有促进变性蛋白质复性的作用。虫荧光素酶用盐酸胍变性 ,然后在 PBP、HSP70、HSP6 0存在下进行体外复性 ,用虫荧光素酶分析系统检测该酶的复性程度。结果显示 PBP对虫荧光素酶的复... 目的 探讨感光受体外周蛋白结合蛋白 (PBP)在体外是否有促进变性蛋白质复性的作用。虫荧光素酶用盐酸胍变性 ,然后在 PBP、HSP70、HSP6 0存在下进行体外复性 ,用虫荧光素酶分析系统检测该酶的复性程度。结果显示 PBP对虫荧光素酶的复性能力很低 ,当与 HSP70同时作用时 ,酶活力明显高于 PBP或 HSP70组 ,而 PBP与 HSP6 0组合对酶的复性能力较HSP6 0组未见有明显差异 ;当 PBP,HSP70 ,HSP6 0三者同时存在时 ,酶活力恢复率最高。去除复性缓冲液中的 ATP及其再生系统 ,酶活力的复性率明显下降。结果表明 PBP具有协助 HSP70 ,在 ATP依赖的情况下促进变性虫荧光素酶体外复性的分子伴侣功能。 展开更多
关键词 感光受周蛋白结合蛋白 虫荧光素酶 体外折叠 促进作用 热休克蛋白质类 突变
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预先形成的重链二硫键有助于HLA-A2-抗原肽复合物体外折叠 被引量:1
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作者 费世江 吴雄文 +4 位作者 翁秀芳 蔡蕾 梁智辉 韩军艳 龚非力 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期167-170,共4页
 目的: 提高可溶性HLA -A2 肽复合物体外折叠效率。方法: 在变性非还原条件下提取原核表达的HLA重链(HC)。通过离子交换及硫酸铵沉淀初步纯化后, 在β2微球蛋白(β2m)及特异性抗原肽 (Try369-377 )存在的情况下, 于pH6. 6的折叠缓冲体...  目的: 提高可溶性HLA -A2 肽复合物体外折叠效率。方法: 在变性非还原条件下提取原核表达的HLA重链(HC)。通过离子交换及硫酸铵沉淀初步纯化后, 在β2微球蛋白(β2m)及特异性抗原肽 (Try369-377 )存在的情况下, 于pH6. 6的折叠缓冲体系中稀释复性。利用Westernblot及ELISA检测折叠产物。结果: 折叠复合物中主要含有HLA-A2 抗原肽复合物和β2m, 较少含有HC聚合体; 折叠效率较传统方法提高 2. 5倍。结论: 通过与传统方法作比较, 证实此法折叠效率比传统方法高, 为进一步HLA 肽四聚体及人工抗原提呈细胞的制备可提供足够可溶性的HLA -A2 肽单体。 展开更多
关键词 HLA-A2-抗原肽复合物 体外折叠 二硫键形成
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仪器分析方法研究蛋白质体外折叠的进展 被引量:3
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作者 童宇峰 郁鉴源 《分析测试学报》 CAS CSCD 1997年第6期76-81,共6页
本文论述了蛋白质体外折叠问题的研究现状及几种常用的仪器分析方法在体外折叠问题研究中的应 用,展望了今后的发展方向。
关键词 蛋白质折叠 折叠起点 体外折叠
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抗菌肽Plectasin的新型体外折叠方法与活性鉴定 被引量:1
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作者 阮进成 叶跳菲 +3 位作者 荆许恩 李锐 徐学清 陈新 《药物生物技术》 CAS 2018年第4期316-318,共3页
在体外条件下,通过体外折叠体系折叠化学合成的Plectasin,经过HPLC纯化及圆二色谱仪(CD)进行结构鉴定。以耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA),耐万古霉素肠球菌(VREF)及耐青霉素肺炎链球菌(PRSP)为实验菌株,用微量肉汤稀释法测定Plectasin... 在体外条件下,通过体外折叠体系折叠化学合成的Plectasin,经过HPLC纯化及圆二色谱仪(CD)进行结构鉴定。以耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA),耐万古霉素肠球菌(VREF)及耐青霉素肺炎链球菌(PRSP)为实验菌株,用微量肉汤稀释法测定Plectasin对耐药菌的最小抑菌浓度(MIC)。结果:经体外折叠的Plectasin通过HPLC进行纯化,样品峰约在44.8 min出现,回收率约15%;圆二色谱鉴定显示,折叠后的Plectasin分子结构与折叠前不同,和天然构象类似;折叠活化的Plectasin对MRSA、VREF及PRSP的MIC分别为28,14,28μg/m L。通过体外折叠体系折叠化学合成的Plectasin抗菌肽,能使其获得与天然构象相当的抗菌活性。 展开更多
关键词 抗菌肽Plectasin 化学合成 体外折叠 高效液相 圆二色谱
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革兰氏阴性细菌β-桶状结构外膜蛋白体外折叠的研究进展 被引量:3
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作者 代先祝 邵娜娜 罗峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1241-1247,共7页
除了细胞质膜,革兰氏阴性细菌细胞还有一层组成细胞壁的外膜(Outer Membrane)。膜蛋白是外膜的主要组成成分之一,绝大多数外膜蛋白是由反向平行的β-折叠(β-Strands)通过相邻的氢键结合形成的β-桶状结构蛋白(β-Barrel Proteins)。这... 除了细胞质膜,革兰氏阴性细菌细胞还有一层组成细胞壁的外膜(Outer Membrane)。膜蛋白是外膜的主要组成成分之一,绝大多数外膜蛋白是由反向平行的β-折叠(β-Strands)通过相邻的氢键结合形成的β-桶状结构蛋白(β-Barrel Proteins)。这些蛋白既可作为通道蛋白、转运蛋白、酶、受体、毒力因子,也可作为结构蛋白发挥稳定外膜的重要作用,它们是否正确折叠并整合到外膜对革兰氏阴性细菌的生存至关重要。大多数外膜蛋白易于重组表达和体外重折叠(in vitro refolding),并且折叠状态可通过多种方法测定,因此β-桶状结构外膜蛋白被当着模式蛋白来研究各类生物和非生物因子对膜蛋白折叠的影响,是膜蛋白研究的一大热点。本文将从β-桶状结构外膜蛋白体外折叠的研究方法和影响折叠的因素角度对近年相关研究进展进行综合述评,最后总结了外膜蛋白体外折叠模式,并结合作者的相关研究结果和观点对该领域的研究前景进行了展望。 展开更多
关键词 β-桶状结构膜蛋白 折叠 折叠效率
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耐冷希瓦氏菌外膜蛋白的体外折叠研究
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作者 轩换玲 李静 +1 位作者 罗锋 代先祝 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期61-67,共7页
目的:旨在建立耐低温革兰氏阴性菌外膜蛋白体外折叠体系,为膜蛋白合成耐低温机制提供理论基础。方法:以包涵体的形式在大肠杆菌中过量表达了来源于耐低温希瓦氏菌的Omp A同源外膜蛋白Omp74的全蛋白质和N端跨膜结构域,纯化包涵体后,用高... 目的:旨在建立耐低温革兰氏阴性菌外膜蛋白体外折叠体系,为膜蛋白合成耐低温机制提供理论基础。方法:以包涵体的形式在大肠杆菌中过量表达了来源于耐低温希瓦氏菌的Omp A同源外膜蛋白Omp74的全蛋白质和N端跨膜结构域,纯化包涵体后,用高浓度尿素或强阴离子表面活性剂溶液溶解包涵体,以非离子表面活性剂为折叠介质,建立该外膜蛋白的体外折叠体系,同时以大肠杆菌的Omp A作为对照进行了比较研究。结果:与Omp A相比,Omp74体外折叠受温度影响较小,低浓度的阴离子表面活性剂能促Omp74的折叠,但对Omp A的折叠没有影响;C端结构域抑制Omp74在表面活性剂中的折叠;Omp74在0.5%的月桂酰基麦芽糖苷(DDM)和0.4%的十二烷基肌氨酸钠的混合溶液中能达到接近100%的折叠效率。 展开更多
关键词 耐冷菌 膜蛋白 体外折叠 表面活性剂
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用发光法测定DnaJ类分子伴侣MRJ对虫荧光素酶体外重折叠的促进作用(英文)
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作者 刘亚宁 朱美财 +2 位作者 刘成刚 赵新华 陈涛 《发光学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期113-116,共4页
蛋白质的折叠使新翻译合成的多肽变成有生物功能的空间结构 ,因此蛋白质折叠是后基因组时代的重要工作。而在蛋白质折叠过程中 ,必须依靠分子伴侣的相互作用 ,才能保证蛋白质折叠向正确的方向进行。MRJ是一类新发现的DnaJ类分子伴侣 ,... 蛋白质的折叠使新翻译合成的多肽变成有生物功能的空间结构 ,因此蛋白质折叠是后基因组时代的重要工作。而在蛋白质折叠过程中 ,必须依靠分子伴侣的相互作用 ,才能保证蛋白质折叠向正确的方向进行。MRJ是一类新发现的DnaJ类分子伴侣 ,已证实它有调节ATP酶活性和阻止多聚谷氨酰胺凝聚的作用。我们用胍变性的虫荧光素酶作为蛋白质恢复功能活性的分子模型 ,用生物发光法研究了MRJ对蛋白质重新折叠的作用 ,发现MRJ确实有促进变性虫荧光素酶重新折叠并恢复其催化活力的功能。而且这种过程需要另一类Hsp6 0和Hsp70的协助 ,而这三种分子伴侣组合在一起 ,功效最好。实验中还发现 ,MRJ对虫荧光素酶恢复的促进作用是与ATP密切相关的。发光分析是研究分子伴侣促进蛋白质折叠过程的一种灵敏、精确和快速的技术手段。 展开更多
关键词 DnaJ分子伴侣 MRJ 蛋白质折叠 发光分析 测定 虫荧光素酶 重新折叠 变性
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椰子花粉过敏原profilin蛋白体外重折叠过程的光谱学研究 被引量:1
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作者 罗海梅 肖杰 +3 位作者 邬玉兰 刘志刚 Jun Lu 徐宏 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2010年第9期2428-2432,共5页
在基因工程技术中,采用原核表达系统获得的重组蛋白通常都是以包涵体的形式存在。利用圆二色性光谱、荧光光谱和同步荧光光谱对尿素诱导的重组椰子花粉泛过敏原profilin蛋白包涵体的复性过程进行了系统的光谱学研究,得到了profilin蛋白... 在基因工程技术中,采用原核表达系统获得的重组蛋白通常都是以包涵体的形式存在。利用圆二色性光谱、荧光光谱和同步荧光光谱对尿素诱导的重组椰子花粉泛过敏原profilin蛋白包涵体的复性过程进行了系统的光谱学研究,得到了profilin蛋白复性过程的光谱学特征;结合生物信息学方法,通过对profilin蛋白的二级结构和三级结构的预测,进一步分析了复性过程中profilin蛋白构象变化的特点,初步建立了一种新的检测重组变应原蛋白复性程度的光谱学实验方法,为重组蛋白包涵体复性机理的深入研究进行了有益的探索。 展开更多
关键词 椰子花粉 变应原 PROFILIN 折叠 透析 生物信息学
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其他
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《中国光学》 CAS 2004年第1期14-14,共1页
O657.39 2004010100 用发光法测定DnaJ类分子伴侣MRJ对虫荧光素酶体外重折叠的促进作用=Luminescence assays for the luciferaserefolding facilitated by human chaperone DnaJ homologueMRJ in vitro[刊。
关键词 虫荧光素酶 分子伴侣 促进作用 折叠 中国人民解放军 生物发光法 重新折叠 测定 蛋白质 空军
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Thermal-induced Unfolding of β-Crystallin and Disassembly of its Oligomers Revealed by Temperature-Jump Time-Resolved Infrared Spectroscopy
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作者 Shan-shan Li Ying-ying Yu +3 位作者 De-yong Li Xiao-chuan He Yong-zhen Bao Yu-xiang Weng 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2013年第6期739-746,I0004,共9页
β-Crystallins are the major structural proteins existing in the vertebrate lens, and their conformational stability is critical in maintaining the life-long transparency and refraction index of the lens. Seven subuni... β-Crystallins are the major structural proteins existing in the vertebrate lens, and their conformational stability is critical in maintaining the life-long transparency and refraction index of the lens. Seven subunits of β-crystallins naturally assemble into various heteroge- neous oligomers with different sizes. Here, we systematically investigated the thermal sta- bility of the different secondary structures present in β-Crystallins and then the dynamic process for the thermal-induced unfolding of β-crystallins by Fourier transform infrared spectroscopy-monitored thermal titration and temperature-jump nanosecond time-resolved IR difference absorbance spectra. Our results show that the N-terminal anti-parallel β-sheets in β-crystallin are the most unstable with a transition midpoint temperature at 36.0-2.1℃, leading to the formation of an intermediate consisting vastly of random coil structures. This intermediate structure is temporally assigned to that of the monomer generated by the thermal-induced disassembly of β-crystallin oligomers with a transition midpoint tempera- ture of 40.4-0.7℃. The global unfolding of β-crystallins that leads to denaturation and aggregation indicated by the formation of intermolecular anti-parallel β-sheets has a transi- tion midpoint temperature determined as 72.4-0.2 ℃. Temperature-jump time-resolved IR absorbance difference spectroscopy analysis further reveals that thermal-induced unfolding of β-crystallins occurs firstly in the anti-parallel β-sheets in the N-terminal domains with a time constant of 50 ns. 展开更多
关键词 β-Crystallin Protein dynamical structure TEMPERATURE-JUMP Time-resolved IR spectrum
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