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基于网络药理学及体外细胞实验探讨复方菝葜丹参擦剂抗白癜风作用机制 被引量:1
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作者 赛力克阿拉·阿里汗 曹仕辰 +3 位作者 木合布力·阿布力孜 麦合苏木·艾克木 艾克白尔·买买提 赵婷婷 《新疆医科大学学报》 CAS 2023年第4期513-521,共9页
目的基于网络药理学研究复方菝葜丹参擦剂治疗白癜风的作用机制,通过分子对接与体外实验进行验证。方法通过TCMSP数据库搜索复方菝葜丹参中药材的有效成分及其对应作用靶点,利用GEO、OMIM以及GeneCards等数据平台,获得白癜风疾病相关靶... 目的基于网络药理学研究复方菝葜丹参擦剂治疗白癜风的作用机制,通过分子对接与体外实验进行验证。方法通过TCMSP数据库搜索复方菝葜丹参中药材的有效成分及其对应作用靶点,利用GEO、OMIM以及GeneCards等数据平台,获得白癜风疾病相关靶点,通过映射药材成分对应靶点与疾病相关靶点获得治疗疾病的潜在靶点。利用Cytoscape 3.8.0软件构建菝葜丹参与白癜风的“有效成分-潜在靶点”作用网络;通过STRING数据库建立潜在靶点间的蛋白相互作用(PPI)网络;利用R语言及其相关依赖包对潜在靶点进行GO富集分析和信号通路富集分析。通过CytoNCA拓扑分析筛选出主要活性成分与核心潜在靶点进行分子对接,验证复方菝葜丹参活性成分与疾病靶点的结合效能,通过体外药理实验探究复方提取液对黑色素细胞的作用。结果复方菝葜丹参擦剂中有106个有效成分作用于STAT3、AKT1、RELA等8个核心靶点,GO富集结果显示潜在靶点参与了氧化应激、活性氧代谢过程等反应。信号通路富集结果表明,靶点涉及AGE-RAGE通路、Th17细胞分化等多条信号通路。分子对接结果显示,复方主要活性成分与核心靶点结合紧密。复方菝葜丹参对黑色素细胞有较好的促增殖作用,其中有效成分木樨草素对酪氨酸酶激活作用较强,芒柄花素可提高黑素含量。结论复方菝葜丹参擦剂是多种成分通过多种途径作用到多靶点对白癜风产生的治疗作用,其中丹参与鸡血藤为君药,木樨草素与芒柄花素为重要活性成分。 展开更多
关键词 复方菝葜丹参擦剂 白癜风 中药配方 网络药理学 体外细胞实验 药理活性
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基于体外细胞实验和网络药理学研究乳香挥发油抗心脏肥大的作用机制 被引量:6
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作者 谢梦蝶 王衬衬 +6 位作者 李冰涛 欧阳长生 邱雨美 李洪铭 涂珺 尚广彬 汤喜兰 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2022年第3期241-252,共12页
目的:通过体外细胞实验和网络药理学方法探讨乳香挥发油抗心脏肥大的作用机制。方法:通过异丙肾上腺素(isoproterenol,ISO)诱导的H9c2心肌细胞肥大模型研究乳香挥发油抗心脏肥大的作用。通过CNKI、Pubmed、Pubchem等数据平台检索筛选并... 目的:通过体外细胞实验和网络药理学方法探讨乳香挥发油抗心脏肥大的作用机制。方法:通过异丙肾上腺素(isoproterenol,ISO)诱导的H9c2心肌细胞肥大模型研究乳香挥发油抗心脏肥大的作用。通过CNKI、Pubmed、Pubchem等数据平台检索筛选并收集乳香挥发油活性成分、作用靶点及心脏肥大疾病靶点;利用String数据库和Cytoscape 3.8.0软件构建乳香挥发油抗心脏肥大蛋白互作(PPI)网络和乳香挥发油“药物-活性成分-关键靶点-疾病”网络,筛选分析乳香挥发油抗心脏肥大的关键靶点,并采用荧光定量PCR实验进行关键靶点的验证。通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果:体外细胞实验表明乳香挥发油可抑制ISO诱导的H9c2心肌细胞表面积增大、蛋白合成增加以及心脏肥大相关胚胎基因心房钠尿肽(ANP)、β-MHC mRNA表达上调。基于文献筛选乳香挥发油有效成分86种,抗心脏肥大靶点36个。网络分析雌激素受体1(ESR1)、内皮型一氧化氮合酶(NOS3)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)是关键靶点,荧光定量PCR结果显示乳香挥发油抑制ISO诱导的心肌细胞ESR1、PTGS2、TNF、MAPK14 mRNA水平上调,NOS3、PPARG mRNA水平下调。GO功能富集分析主要涉及脂多糖介导的信号通路、一氧化氮生物合成过程的正调控、质膜穴样内陷、酶结合等。KEGG通路富集分析包含通路22条,主要与VEGF signaling pathway,TNF signaling pathway,Sphingolipid signaling pathway等相关。结论:乳香挥发油活性成分可能是通过作用于ESR1、NOS3、PTGS2、TNF、MAPK14、PPARG等关键靶点,调节VEGF signaling pathway,TNF signaling pathway,Sphingolipid signaling pathway等途径,影响脂多糖介导的信号通路、一氧化氮生物合成过程的正调控、质膜穴样内陷、酶结合等改善心脏肥大。 展开更多
关键词 乳香挥发油 心脏肥大 作用机制 体外细胞实验 网络药理学
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基于网络药理学、分子对接、体外细胞实验预测珠子参保肝机制 被引量:2
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作者 张海潮 周瑞 +5 位作者 唐志书 苏洁 刘妍如 潘亚磊 刘红波 宋忠兴 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2342-2351,共10页
目的借助网络药理学、分子对接、体外细胞实验预测珠子参保肝的主要成分及作用机制。方法通过ETCM、SwissTargetPrediction、SymMap、Melacards数据库以及文献查阅,搜索整理珠子参的活性成分以及与疾病的作用靶点,利用STRING数据库构建... 目的借助网络药理学、分子对接、体外细胞实验预测珠子参保肝的主要成分及作用机制。方法通过ETCM、SwissTargetPrediction、SymMap、Melacards数据库以及文献查阅,搜索整理珠子参的活性成分以及与疾病的作用靶点,利用STRING数据库构建蛋白互作网络以及GO和KEGG富集分析,并采用Cytoscape3.7.2构建“成分-靶点通路”图,预测其可能的保肝作用机制,进一步采用分子对接和细胞实验检测珠子参对肝细胞损伤模型的保护作用。结果获得珠子参活性成分43种,作用靶点247个,与309个疾病靶点相交后,得到TNF、CASP3、IL6、IL1B、JUN等27个靶点及竹节参皂苷Ⅳa、人参皂苷Re、人参皂苷Ro、越南皂苷R4和三七皂苷R1等37种对应成分。GO富集分析共得到条目616条(P<0.05),KEGG富集共得到通路122条,主要涉及乙型肝炎、Th17细胞分化、TNF信号通路和IL17信号通路等。分子对接结果显示,预测的珠子参保肝的重要活性化合物与关键靶点具有较好的结合活性。体外结果显示,珠子参皂苷对LPS诱导L02细胞的炎性损伤模型具有一定的保护作用。结论本研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验表明,珠子参具有一定的保肝作用。 展开更多
关键词 珠子参 保肝作用 网络药理学 分子对接 体外细胞实验
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基于网络药理学及体外细胞实验分析生姜泻心汤治疗溃疡性结肠炎的潜在作用
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作者 熊诗琳 林小荷 +4 位作者 黄松 侯少贞 刘昌辉 姜小艳 梁健 《新中医》 CAS 2024年第5期36-43,共8页
目的:基于网络药理学及体外细胞实验分析生姜泻心汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的潜在作用。方法:运用中医系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选生姜泻心汤的活性成分及相关靶点,利用GeneGards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、药物遗传学和药... 目的:基于网络药理学及体外细胞实验分析生姜泻心汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的潜在作用。方法:运用中医系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选生姜泻心汤的活性成分及相关靶点,利用GeneGards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、药物遗传学和药物基因组学知识库(PharmGkb)、治疗靶点数据库(TTD)和开放数据药物和药物靶标数据库(DrugBank)筛选UC疾病靶点,将药物靶点与疾病靶点匹配所得交集靶点导入互作基因/蛋白质检索工具(STRING)数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,并构建药物-成分-靶点-疾病网络。采用分子对接分析核心靶点和活性成分结合力,并通过脂多糖(LPS)诱导人结直肠腺癌细胞(Caco2细胞)损伤模型,给予生姜泻心汤干预24 h后,采用qPCR和免疫荧光探索生姜泻心汤对核心靶点的作用。结果:生姜泻心汤治疗UC的有效成分共215个,靶点171个,其中潜在核心有效成分为姜烯酮A、槲皮素、山柰酚、汉黄芩素和柚皮素;核心靶点包括HIF1A、STAT3、CTNNB1、CASP3、AKT1、IL-1β、TP53、EGFR和JUN。分子对接结果显示,AKT1、TP53和IL-1β与姜烯酮A、槲皮素、山柰酚、汉黄芩素和柚皮素均有较强的结合能力。细胞实验发现,生姜泻心汤干预LPS刺激Caco2细胞模型,能显著地抑制AKT1、TP53和IL-1β基因和蛋白的表达。结论:生姜泻心汤能够调控AKT1、TP53和IL-1β等靶点,发挥治疗UC的作用。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 生姜泻心汤 网络药理学 体外细胞实验 作用机制
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基于网络药理学和体外细胞实验探究“三七-骨碎补”药对活性成分治疗骨质疏松症的作用机制 被引量:10
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作者 杨雯静 黄健 +3 位作者 王维 彭立军 李晋玉 朱卫丰 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1087-1097,共11页
该研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验,探究三七总皂苷(Panax notoginseng saponins,PNS)和骨碎补总黄酮(osteopractic total flavone,OTF)治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的主要活性成分和潜在作用机制,为临床用药提供... 该研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验,探究三七总皂苷(Panax notoginseng saponins,PNS)和骨碎补总黄酮(osteopractic total flavone,OTF)治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的主要活性成分和潜在作用机制,为临床用药提供理论依据。首先通过文献检索和在线数据库获取OTF和PNS的入血成分,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与SwissTargetPrediction数据库获得药物的潜在靶点;借助OMIM、GeneCards数据库检索OP相关靶点,并利用韦恩在线分析工具将药物靶点和疾病靶点取交集;运用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,依据其节点度值筛选出核心成分;根据筛选出来的药物与疾病交集靶点,利用STRING平台和Cytoscape软件构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络,依据节点度值筛选出核心靶点;借助R语言对潜在治疗靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析;并采用AutoDock Vina等软件对部分活性成分与潜在靶点进行分子对接验证;最后依据KEGG通路分析结果,选择HIF-1信号通路进行体外细胞实验验证。网络药理学结果得到里查酮A、苦参酮、20(R)-原人参三醇、20(S)-原人参三醇、山柰酚等45个活性成分,IL6、AKT1、TNF、VEGFA、MAPK3等103个治疗靶点,靶点蛋白富集的通路有PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路等。分子对接结果显示核心成分与核心靶点均有较好的结合能力。体外细胞实验结果表明,PNS-OTF能上调HIF-1α、VEGFA、Runx2的mRNA表达水平,说明PNS-OTF治疗OP的作用机制可能与激活HIF-1信号通路相关,从而起到促进血管生成与成骨分化的作用。综上,该研究运用网络药理学预测了PNS-OTF治疗OP的核心靶点与通路并进行了体外细胞实验验证,体现了多成分、多靶点、多途径协同作用的特点,同时为今后临床治疗OP提供新思路。 展开更多
关键词 网络药理学 骨质疏松症 三七总皂苷 骨碎补总黄酮 作用机制 分子对接 体外细胞实验
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砷中毒对体外实验细胞损伤的分子生物学机制研究进展 被引量:2
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作者 席淑华 《国外医学(医学地理分册)》 CAS 2012年第2期73-75,共3页
砷是确认的人类致癌物,但由于无机砷的致癌动物模型较难复制,使体外细胞实验成为砷致癌机制研究的必要手段。随着分子生物学技术的快速发展,体外细胞实验在揭示砷致细胞损伤的分子生物学作用、增强人们对砷致癌机制的认识上提供了有价... 砷是确认的人类致癌物,但由于无机砷的致癌动物模型较难复制,使体外细胞实验成为砷致癌机制研究的必要手段。随着分子生物学技术的快速发展,体外细胞实验在揭示砷致细胞损伤的分子生物学作用、增强人们对砷致癌机制的认识上提供了有价值、可信的成果,对砷致癌机制研究的深入开展有重要的推动作用。然而,由于体外细胞实验自身的特点,以及砷在生物体内的甲基化代谢模式,使体外细胞实验在砷致癌机制的研究上也存在一定的局限性。 展开更多
关键词 癌症 体外细胞实验 细胞损伤
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基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎的作用机制
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作者 黄上 朱克俭 +5 位作者 李仲普 郭玉星 涂岑 马思静 王宇 刘劲松 《湖南中医杂志》 2022年第10期175-183,共9页
目的:基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎(RA)的作用机制。方法:基于TCMID、TCMSP和DrugBank数据库筛选复方清痹片的活性成分并预测潜在活性成分靶点;基于GeneCard、OMIM等数据库筛选RA疾病靶点;明确复方清... 目的:基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎(RA)的作用机制。方法:基于TCMID、TCMSP和DrugBank数据库筛选复方清痹片的活性成分并预测潜在活性成分靶点;基于GeneCard、OMIM等数据库筛选RA疾病靶点;明确复方清痹片活性成分与RA的共同潜在靶标;利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,RT-PCR检测复方清痹片对肿瘤坏死因子(TNF-α)诱导的人类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞(HFLS-RA)模型白介素6(IL-6)、TNF-α、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)和血管内皮生长因子A(VEGFA)mRNA表达的影响。结果:筛选出217种潜在活性成分以及158个潜在靶点;IL-6、TNF、AKT1、白蛋白(ALB)、VEGFA等是复方清痹片治疗RA的关键靶点;复方清痹片主要通过炎性因子、趋化因子、免疫调控等信号通路来发挥治疗RA的作用。复方清痹片能够抑制HFLS-RA增殖,下调IL-6、TNF、AKT1和VEGFA mRNA的表达,这与网络药理学预测的结果相一致。结论:本研究揭示了复方清痹片治疗RA“活性成分-靶点-通路”的复杂关系,为后续该药的临床应用提供了研究基础。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 复方清痹片 体外细胞实验 分子机制 网络药理学
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基于网络药理学和体外细胞实验分析黄芪治疗IgA肾病的作用机制 被引量:12
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作者 庞爽 赵栓 +2 位作者 徐夏莲 於佳炜 丁小强 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第15期139-147,共9页
目的:基于网络药理学方法分析黄芪治疗免疫球蛋白A肾病(IgAN)的多成分、多靶点、多通路作用机制,为该药材的基础研究和临床应用提供依据。方法:通过GeneCards,TCMID及中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库检索和文献挖掘筛选... 目的:基于网络药理学方法分析黄芪治疗免疫球蛋白A肾病(IgAN)的多成分、多靶点、多通路作用机制,为该药材的基础研究和临床应用提供依据。方法:通过GeneCards,TCMID及中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库检索和文献挖掘筛选黄芪活性成分、作用靶点及与IgAN相关的疾病靶点,运用Cytoscape 3.7.1软件绘制网络图,利用网络拓扑分析黄芪治疗IgAN的关键靶点,采用R语言中的不同软件包分别进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。在此基础上,通过体外细胞实验验证黄芪中活性成分黄芪甲苷对人肾小球系膜细胞磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/肿瘤抑制基因p53(PI3K/Akt/p53)信号通路的激活作用。结果:筛选得到黄芪25个活性成分,49个药物-疾病共同作用靶点。GO功能富集分析包含条目84个,主要涉及细胞核激素受体结合、细胞核受体活性、脱氧核糖核酸结合转录激活因子活性等。KEGG通路富集分析包含通路88条,主要与PI3K/Akt信号通路、低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE/RAGE)信号通路等密切相关。体外细胞实验证实,黄芪甲苷可通过调控PI3K/Akt/p53信号通路抑制重组人血小板衍生生长因子BB诱导的人肾小球系膜细胞增生。结论:黄芪多种活性成分可能通过作用于细胞凋亡、氧化应激和炎症反应等相关的靶点及通路,起到治疗IgAN的作用,为IgAN的新药开发及机制研究提供了思路。 展开更多
关键词 黄芪 免疫球蛋白A(IgA) IGA肾病 网络药理学 黄芪甲苷 分子机制 体外细胞实验
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基于网络药理学和体外细胞实验探讨芍药甘草汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制 被引量:3
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作者 何毅豪 王冰 +1 位作者 杨骏 张彤 《上海中医药大学学报》 CAS 2022年第6期59-69,共11页
目的:利用网络药理学、差异基因分析、分子对接技术和体外细胞实验,探究芍药甘草汤(SYGCD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的初步作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)和文献检索,获取SYGCD中白芍和甘草的活性成分和作用靶点。从基... 目的:利用网络药理学、差异基因分析、分子对接技术和体外细胞实验,探究芍药甘草汤(SYGCD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的初步作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)和文献检索,获取SYGCD中白芍和甘草的活性成分和作用靶点。从基因表达综合(GEO)数据库中筛选获得GSE47908芯片数据,绘制差异基因热图和火山图。运用Cytoscape软件构建SYGCD治疗UC分子基因网络图,借助Bisogenet和CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络,使用R 3.6.3软件对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析。采用分子对接解析活性成分与关键靶点的相互作用。采用RAW264.7巨噬细胞,通过MTT实验和RT-qPCR实验初步验证SYGCD的抗炎作用的相关靶点。结果:①获得SYGCD治疗UC的102个活性成分,主要为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等,拓扑网络筛选出关键候选基因为过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、诱导型一氧化氮合酶(NOS2)等。富集分析显示,与UC治疗相关的信号通路主要为白介素(IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。②分子对接结果显示,SYGCD中核心成分与关键靶点均能通过氢键结合。③MTT实验结果显示,SYGCD对RAW264.7细胞几乎没有毒性;RT-qPCR结果显示,SYGCD能降低RAW264.7细胞炎症模型中细胞因子TNF-α、IL-1β和IL-6 mRNA表达水平。结论:SYGCD治疗UC具有多成分、多靶点、多途径等特征,作用机制可能是SYGCD中的槲皮素、山柰酚、芒柄花素、异鼠李素等活性成分作用于PPARγ、NOS2、IL-1β等靶点,调控IL-17、TNF、NF-κB等信号通路发挥治疗UC的作用;且SYGCD可通过调节促炎性细胞因子TNF-α、IL-1β和IL-6发挥抗炎效果。 展开更多
关键词 芍药甘草汤 溃疡性结肠炎 网络药理学 GEO芯片 分子对接 体外细胞实验
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反复熔铸Ni-Cr烤瓷合金体外细胞毒性实验(MTT法) 被引量:12
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作者 张长源 程辉 +2 位作者 王希 郑明 李秀容 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期306-309,共4页
目的:初步评价反复熔铸后Ni-Cr烤瓷合金的生物相容性。方法:根据ISO标准采用体外细胞毒性试验(MTT法)测试不同熔铸次数Ni-Cr烤瓷合金不同浓度的浸提液培养小鼠结缔组织成纤维细胞(L-929)的结果,从而对反复熔铸后Ni-Cr烤瓷合金的生物相... 目的:初步评价反复熔铸后Ni-Cr烤瓷合金的生物相容性。方法:根据ISO标准采用体外细胞毒性试验(MTT法)测试不同熔铸次数Ni-Cr烤瓷合金不同浓度的浸提液培养小鼠结缔组织成纤维细胞(L-929)的结果,从而对反复熔铸后Ni-Cr烤瓷合金的生物相容性进行初筛。结果:各浓度实验组细胞生长形态良好、细胞毒性级为0~1级;经过2~5次熔铸的Ni-Cr烤瓷合金不同浓度的浸提液、不同培养时间的A492均值与经过1次熔铸的Ni-Cr烤瓷合金相应A492均值无显著性差异(P>0.05)。结论:初步认为Ni-Cr烤瓷合金经过1~5次熔铸后具有较好的生物相容性。 展开更多
关键词 反复熔铸 Ni-Cr烤瓷合金 细胞毒性实验(MTT法)
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基于网络药理学及分子对接的胃复春片治疗慢性萎缩性胃炎机制探讨及体外细胞实验验证 被引量:5
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作者 蒋欣琪 卢涛 +3 位作者 罗志强 赵智慧 张金东 张晓晴 《药物评价研究》 CAS 2022年第10期1959-1971,共13页
目的基于网络药理学和分子对接技术探讨胃复春片治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制,结合体外细胞实验初步验证胃炎相关靶点。方法综合运用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、台湾中医药、DrugBank数据库和中药分子机制的生物分析... 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨胃复春片治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制,结合体外细胞实验初步验证胃炎相关靶点。方法综合运用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、台湾中医药、DrugBank数据库和中药分子机制的生物分析工具检索胃复春片的活性成分和作用靶点,通过OMIM、GeneCards、DisGeNET数据库获取CAG的疾病靶点,取交集获得共同靶点。将作用靶点导入STRING在线平台构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行拓扑分析筛选核心靶点。利用DAVID 6.8数据库进行基因本体论(GO)功能、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后对主要活性成分与关键靶点进行分子对接,同时运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测CAG相关基因mRNA的表达。结果经筛选获得胃复春片活性成分60个,作用靶点550个,经筛选获得胃复春片-CAG关键靶点30个。胃复春片作用靶点涉及磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶(PI3K-Akt)、肿瘤坏死因子(TNF)、核转录因子-κB(NF-κB)、胃癌相关通路等多条信号通路,通过调控细胞增殖、分化、凋亡、炎症反应等发挥抗CAG作用。分子对接结果表明,活性成分与核心靶点有良好的结合能力。细胞实验结果也证实,胃复春片可通过下调肿瘤坏死因子-α(TNF)、白细胞介素-6(IL6)、白细胞介素-1β(IL1B)、信号转导及转录激活蛋白-3(STAT3)的mRNA表达量(P<0.01),上调蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素-4(IL4)的mRNA表达量治疗CAG。结论胃复春片能够通过多成分-多靶点-多通路发挥治疗CAG的作用,其主要作用成分有槲皮素、β-豆甾醇、辛弗林、新橙皮苷、新北美圣草苷等,其主要靶点有TNF、IL6、IL1B、STAT3、AKT1、IL4等。 展开更多
关键词 胃复春片 慢性萎缩性胃炎 网络药理学 分子对接 体外细胞实验 槲皮素 β-豆甾醇 辛弗林 新橙皮苷 新北美圣草苷
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转铁蛋白修饰的阿霉素隐形脂质体的制备及体外细胞试验 被引量:5
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作者 李学明 丁丽燕 +2 位作者 顾立 周维娜 平其能 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期111-115,共5页
目的:用转铁蛋白(Tf)修饰盐酸阿霉素隐形脂质体(SL),以增加药物在肿瘤部位的积蓄,从而增加药物向肿瘤细胞内的转运。方法:采用薄膜超声法制备空白脂质体,硫酸铵梯度法装载盐酸阿霉素(DOX);通过膜材DSPE-PEG2000-COOH上的活性羧基末端与T... 目的:用转铁蛋白(Tf)修饰盐酸阿霉素隐形脂质体(SL),以增加药物在肿瘤部位的积蓄,从而增加药物向肿瘤细胞内的转运。方法:采用薄膜超声法制备空白脂质体,硫酸铵梯度法装载盐酸阿霉素(DOX);通过膜材DSPE-PEG2000-COOH上的活性羧基末端与Tf上的氨基连接制备Tf修饰的隐形脂质体(Tf-SL);采用凝胶柱-UV法测定脂质体中DOX的包封率,双辛丁酸试剂盒测定蛋白结合效率;通过流式细胞试验和激光共聚焦显微试验考察肝癌细胞HepG2对SL包封的DOX(DOX-SL)及Tf-SL包封的DOX(Tf-DOX-SL)的结合或摄取情况,并观察两种脂质体对HepG2细胞的体外杀伤作用。结果:Tf-DOX-SL的平均粒径为(62±17)nm,药物平均包封率为96.4%,蛋白结合效率为100.28μg Tf/μmol磷脂。与DOX-SL相比,Tf-DOX-SL与肝癌细胞HepG2的结合及摄取均增加。48 h细胞毒试验表明Tf-DOX-SL对HepG2细胞的杀伤作用(IC50=20.4μmol/L)明显优于DOX-SL(IC50=166.2μmol/L)(P<0.01)。结论:Tf修饰的隐形脂质体可作为肿瘤靶向的载体通过受体介导的方式促进DOX向肿瘤细胞内的传递。 展开更多
关键词 阿霉素 隐形脂质 转铁蛋白 介导 体外细胞实验
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染料木黄酮对NIH/3T3细胞体外短期转化实验的影响 被引量:3
13
作者 王晨 张立实 何涛 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2002年第11期1322-1323,共2页
目的 通过观察染料木黄酮对NIH/ 3T3细胞体外恶性转化的影响 ,研究染料木黄酮在癌症起始阶段的预防作用。方法 体外短期转化实验。结果 染料木黄酮在对细胞无明显毒性的浓度下 ,对MNNG所诱发NIH/ 3T3细胞恶性转化有明显的抑制作用 ,... 目的 通过观察染料木黄酮对NIH/ 3T3细胞体外恶性转化的影响 ,研究染料木黄酮在癌症起始阶段的预防作用。方法 体外短期转化实验。结果 染料木黄酮在对细胞无明显毒性的浓度下 ,对MNNG所诱发NIH/ 3T3细胞恶性转化有明显的抑制作用 ,其最低抑制浓度为 3 7μmol/L。结论 染料木黄酮可能是化学致癌过程的抑制剂。 展开更多
关键词 染料木黄酮 NIH/3T3细胞 细胞短期转化实验 抑瘤作用
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单抗诱发性细胞因子释放综合征和体外细胞因子释放实验的研究进展 被引量:3
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作者 尉骁璐 孙建华 宫丽崑 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1185-1189,共5页
单克隆抗体引发的细胞因子释放综合征(CRS)具有发病迅速、危害严重、难以预测和控制等特点。近年来,建立可靠的体内动物模型和体外细胞因子释放实验(CRA)预测CRS的发生成为临床前安全性评价的研究热点。该文着重从CRA的适用对象、方法... 单克隆抗体引发的细胞因子释放综合征(CRS)具有发病迅速、危害严重、难以预测和控制等特点。近年来,建立可靠的体内动物模型和体外细胞因子释放实验(CRA)预测CRS的发生成为临床前安全性评价的研究热点。该文着重从CRA的适用对象、方法设计考虑因素、方法优化等方面进行综述,为CRA预测平台的优化提供建议。 展开更多
关键词 单克隆抗 细胞因子释放综合征 TGN1412 细胞因子释放实验 最低预期生物效应剂量 临床前安全性研究
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WGCNA和机器学习识别骨关节炎铁死亡特征基因及实验验证 被引量:1
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作者 徐文飞 明春玉 +5 位作者 段戡 袁长深 郭锦荣 胡琪 曾超 梅其杰 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第30期4909-4914,共6页
背景:铁死亡与骨关节炎发生、发展密切相关,但具体特征基因及调控机制尚不清楚。目的:运用WGCNA及多种机器学习方法识别骨关节炎铁死亡特征基因及免疫浸润分析。方法:从GEO数据库下载骨关节炎相关数据集,同时在FerrDb网站中获取铁死亡... 背景:铁死亡与骨关节炎发生、发展密切相关,但具体特征基因及调控机制尚不清楚。目的:运用WGCNA及多种机器学习方法识别骨关节炎铁死亡特征基因及免疫浸润分析。方法:从GEO数据库下载骨关节炎相关数据集,同时在FerrDb网站中获取铁死亡相关基因,采用R语言对骨关节炎数据集进行批次校正、提取骨关节炎铁死亡基因并进行差异分析,对差异基因进行GO功能及KEGG信号通路分析;同时运用WGCNA分析及机器学习(随机森林、LASSO回归及SVM-RFE分析)筛选骨关节炎铁死亡特征基因,并进行体外细胞实验,将软骨细胞分为正常组和骨关节炎组,运用数据集及qPCR验证表达并行相关免疫浸润分析。结果与结论:①经批次校正及PCA分析获得骨关节炎基因12548个,同时获得铁死亡基因484个,进而得到24个骨关节炎铁死亡差异基因;②GO分析主要涉及对氧化应激反应、对有机磷反应等生物过程;涉及细胞顶端、顶端质膜等细胞组分;涉及血红素结合、四吡咯结合等分子功能;③KEGG分析显示,骨关节炎铁死亡差异基因与白细胞介素17信号通路、肿瘤坏因子信号通路等信号通路有关;④运用WGCNA分析及机器学习筛选后获得特征基因KLF2;通过基因芯片验证后发现实验组半月板组织中KLF2基因表达高于对照组(P=0.00014);⑤体外细胞实验显示,骨关节炎组软骨细胞中Ⅱ型胶原、KLF2基因表达低于对照组(P<0.05),同时在骨关节炎铁死亡中肥大细胞与树突状细胞密切相关(r=0.99),KLF2与自然杀伤细胞(r=-1,P=0.017)、滤泡辅助性T细胞(r=-1,P=0.017)等密切相关;⑥结果显示,运用WGCNA分析及机器学习方法证实KLF2可作为骨关节炎铁死亡的特征基因,可能通过干预KLF2来改善骨关节炎铁死亡。 展开更多
关键词 WGCNA分析 机器学习 骨关节炎 铁死亡 特征基因 免疫浸润分析 体外细胞实验
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基于网络药理学、分子对接和体外实验探讨穿山龙治疗IgA肾病的分子机制 被引量:4
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作者 沈佳晨 任翼 +2 位作者 饶向荣 游云 李深 《世界中西医结合杂志》 2021年第12期2246-2254,共9页
目的通过网络药理学、分子对接和体外实验的方法,对穿山龙治疗IgA肾病的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM获取穿山龙的主要活性成分,利用PharmMapper预测活性成分的... 目的通过网络药理学、分子对接和体外实验的方法,对穿山龙治疗IgA肾病的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM获取穿山龙的主要活性成分,利用PharmMapper预测活性成分的作用靶点,并通过GeneCards、OMIM数据库检索获得疾病作用靶点。将疾病及药物预测靶点进行交集,筛选出共同的潜在治疗靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-疾病-靶点"相互作用网络图;运用STRING数据库构建蛋白相互作用的PPI网络。运用R软件将药物-疾病共同靶点进行关键靶基因GO与KEGG功能富集分析,采用Autodock vina 1.1.2进行分子对接。最后,通过薯蓣皂苷干预人B淋巴细胞(DAKIKI)增殖的体外实验进行核心靶点的初步验证,采用CCK-8法检测细胞的增殖情况,运用Western blot检测Caspase 3的蛋白表达。结果该研究筛选出穿山龙12个活性成分(其中11个活性成分涉及IgA肾病相关靶点及信号通路),涉及45个IgA肾病靶点及65条相关信号通路。网络分析结果表明穿山龙可能通过作用于ALB、CASP3、EGFR、ESR1、HSP90AA1等关键靶点及RAS等关键通路发挥治疗IgA肾病作用。分子对接提示穿山龙活性成分薯蓣皂苷元、脱氧替告皂甙元、紫杉醇、薯蓣皂苷与ALB、CASP3、EGFR、ESR1等关键靶点结合性较好,薯蓣皂苷元与HSP90AA1、CASP3、EGFR的Vina得分最低且相近。体外实验结果显示,薯蓣皂苷对LPS刺激的DAKIKI细胞增殖有一定的抑制作用,并能上调Caspase 3的蛋白水平。结论本研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验表明,穿山龙治疗IgA肾病具有一定的效果。 展开更多
关键词 穿山龙 IGA肾病 网络药理学 体外细胞实验 薯蓣皂苷
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基于网络药理学和分子对接技术及实验验证探讨江南卷柏治疗喉癌的分子机制 被引量:1
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作者 李媛媛 王思斯 +3 位作者 法缇玛·瑟菲迪肯 刘文琪 康丽 杨新洲 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期352-362,共11页
目的探讨江南卷柏治疗喉癌的分子机制。方法根据文献报道获取江南卷柏化学成分,SwissADME数据库筛选活性成分,PharmMapper数据库筛选作用靶点。检索OMIM等数据库收集喉癌相关靶点,Venny 2.1.0在线平台将二者取交集,STRNG平台进行蛋白相... 目的探讨江南卷柏治疗喉癌的分子机制。方法根据文献报道获取江南卷柏化学成分,SwissADME数据库筛选活性成分,PharmMapper数据库筛选作用靶点。检索OMIM等数据库收集喉癌相关靶点,Venny 2.1.0在线平台将二者取交集,STRNG平台进行蛋白相互作用分析。通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,使用Cytoscape 3.8.0软件构建可视化网络。通过SYBYL-X 2.0软件进行分子对接验证。利用MTT法、Hoechst 33258染色法、Western blot进行验证。结果在分子水平上,筛选出江南卷柏活性成分110个及药物靶点82个,喉癌相关靶点1642个,交集靶点34个。GO分析得到135个条目,KEGG分析共得到88条通路。分子对接结果显示,2″,3″-二氢金连木黄酮等11个关键活性成分和MAPK1等4个核心靶蛋白有95.5%有较好的对接活性。在细胞水平上,通过MTT法细胞活力测定筛选出SM-BFRE对喉癌细胞增殖的抑制作用最强,进一步通过Hoechst 33258染色表明SM-BFRE处理后的Hep-2细胞活力下降与细胞凋亡有关,最后通过Western blot验证SM-BFRE通过抑制PI3K/Akt/NF-κB/Cox-2通路来诱导喉癌细胞发生凋亡。结论充分体现了江南卷柏治疗喉癌多成分、多靶点、多通路协同作用的特点,为深入阐明江南卷柏治疗喉癌的作用机制提供理论参考。 展开更多
关键词 江南卷柏 喉癌 网络药理学 分子对接技术 体外细胞实验 作用机制
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3Y-TZP全瓷材料体外细胞毒性试验(MTT法) 被引量:8
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作者 李国华 龚振宇 +1 位作者 于淑湘 陈吉华 《中国美容医学》 CAS 2008年第3期401-403,共3页
目的:初步评价牙科全瓷材料3Y-TZP生物相容性。方法:根据ISO标准采用体外细胞毒实验(MTT法)测试不同浓度和浸提时间的材料浸提液L-929小鼠结缔组织成纤维细胞的影响从而对全瓷材料3Y-TZP的生物相容性进行初筛。结果:各浓度组OD值均与阴... 目的:初步评价牙科全瓷材料3Y-TZP生物相容性。方法:根据ISO标准采用体外细胞毒实验(MTT法)测试不同浓度和浸提时间的材料浸提液L-929小鼠结缔组织成纤维细胞的影响从而对全瓷材料3Y-TZP的生物相容性进行初筛。结果:各浓度组OD值均与阴性对照无显著性差异(P>0.05),与阳性组差异显著(P<0.01),材料毒性级别0级。结论:两种材料体外细胞毒实验阴性,初步认为材料具有较好的生物相容性。 展开更多
关键词 3Y-TZP 生物相容性 细胞实验
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化学致癌物体外诱发细胞转化研究的近况
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作者 高风鸣 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 1990年第2期60-64,50,共6页
随着工业的迅速发展,环境污染越来越严重。目前人们生活和工作环境中约有四百多万种化合物和金属,其中生活和工作中经常用到的约有六万五千多种,而且每天又有近1000种新化合物产生,进入人们的环境,直接或间接威胁着人类健康。1982年国... 随着工业的迅速发展,环境污染越来越严重。目前人们生活和工作环境中约有四百多万种化合物和金属,其中生活和工作中经常用到的约有六万五千多种,而且每天又有近1000种新化合物产生,进入人们的环境,直接或间接威胁着人类健康。1982年国际肿瘤研究机构(IARC)收集已进行致突。 展开更多
关键词 细胞转化 化学致癌物 细胞结构 遗传毒理学 上皮细胞 成纤维细胞 动物实验 间质细胞 金黄地鼠 体外细胞实验
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不同浓度骨碎补总黄酮复合可注射骨修复材料对MC3T3-E1成骨细胞作用的实验研究 被引量:8
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作者 李晋玉 徐林 +3 位作者 谭荣伟 金合 李志勇 俞兴 《生物骨科材料与临床研究》 CAS 2014年第2期53-57,74,共6页
目的本实验旨在观察中药骨碎补提取物骨碎补总黄酮(AFDR)复合海藻酸基可注射骨修复材料对成骨细胞MC3T3-E1体外培养的影响。方法将成骨细胞株MC3T3-E1随机分为空白对照组、单纯使用海藻酸基可注射骨修复材料组、AFDR0.04mg/L、0.16mg/L... 目的本实验旨在观察中药骨碎补提取物骨碎补总黄酮(AFDR)复合海藻酸基可注射骨修复材料对成骨细胞MC3T3-E1体外培养的影响。方法将成骨细胞株MC3T3-E1随机分为空白对照组、单纯使用海藻酸基可注射骨修复材料组、AFDR0.04mg/L、0.16mg/L、0.64mg/L、1.28mg/L、5.12mg/L 7组,体外复合海藻酸基可注射骨修复材料,以24h和48h为观察时间点,倒置显微镜观察MC3T3-E1细胞形态,台盼蓝拒染法检测MC3T3-E1存活率,MTT法观察细胞增殖效应,碱性磷酸酶(ALP)活性和骨钙素定量检测分别观察不同浓度骨碎补总黄酮促进MC3T3-E1分化作用,采用Von kossa钙化染色法观察其促MC3T3-E1细胞钙化作用。结果①倒置显微镜下观察复合海藻酸基可注射骨修复材料的MC3T3-E1细胞形态,细胞形态呈三角形、多边形、长梭形等,呈集落样生长,无接触抑制,有伪足伸出,胞液透亮,核圆形。AFDR各组不同程度促进成骨细胞的增殖、分化:7组能不同程度的促进成骨细胞的增殖、分化,与空白对照组比较,以0.16 mg/L和0.64mg/L剂量组的成骨细胞增殖数量最多,1.28mg/L,5.12mg/L的AFDR对细胞增殖作用不明显;②MC3T3-E1平均存活率≥90%;③骨碎补总黄酮(AFDR)0.16 mg/L和0.64mg/L剂量组在培养24小时和48小时,其OD值与空白对照组及组间均有显著性差异,可促进MC3T3-E1细胞增殖(P<0.05和P<0.01);④AFDR 0.16 mg/L和0.64mg/L剂量组能使MC3T3-E1的ALP活性升高(P<0.05);⑤AFDR 0.64mg/L剂量组能促进MC3T3-E1骨钙素合成(P<0.05);⑥AFDR 0.16 mg/L和0.64mg/L剂量组均可促进细胞钙化(P<0.05)。结论 AFDR可显著促进在海藻酸基可注射骨修复材料上MC3T3-E1的增殖、分化和钙化,其作用具有时间依赖和剂量依赖关系。 展开更多
关键词 骨碎补总黄酮 MC3T3-E1细胞 海藻酸基可注射骨修复 四甲基偶氮唑盐比色法 体外细胞实验
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