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湖羊公羔体重与体尺的主成分分析及回归模型的建立 被引量：1
1
作者 张衍震 章晓炜 +4 位作者 曹丁壬 张文龙 陈悦 王翀 孙玲玲 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期178-182,共5页
为研究湖羊体重和体尺性状的关联,试验选取浙江省内湖羊种羊场80只6月龄湖羊公羔,分别测定其体重和11个体尺性状并进行相关性、主成分分析及建立回归模型。结果表明:湖羊公羔的体重、尾长、尾宽、尾周长、肥周长、胸宽以及睾丸围的变异... 为研究湖羊体重和体尺性状的关联,试验选取浙江省内湖羊种羊场80只6月龄湖羊公羔,分别测定其体重和11个体尺性状并进行相关性、主成分分析及建立回归模型。结果表明:湖羊公羔的体重、尾长、尾宽、尾周长、肥周长、胸宽以及睾丸围的变异系数均大于10%;羔羊体重与除体高外所有体尺指标呈显著正相关,胸围与体重间的相关系数最大,其次为体斜长和管围,睾丸围与体重间的相关系数最小。在主成分分析中,12个性状可简化为3个主成分指标,相关矩阵特征值为4.286、2.131和1.552,累计贡献率为66.408%。使用体尺指标建立体重的最优回归方程为Y=-56.55+0.65×X1+0.671×X2(Y为体重,X1为胸围,X2为体斜长),R^(2)=0.727,P<0.01。综上,在针对湖羊公羔选育时,可将多个性状简化为综合指标以提高育种效率;逐步回归分析的结果提示,胸围和体斜长可作为重要性状进行选育。 展开更多
关键词 湖羊 公羔 体重体尺性状 主成分分析 回归模型
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雷州山羊体尺与体重指标的主成分分析
2
作者 张仕唐 黄艳霞 +1 位作者 尹福泉 高振华 《现代畜牧科技》 2024年第1期22-26,共5页
目的:选育工作中以主成分为单位首先进行集团选择,再根据对主成分贡献率较大的单一性状进行筛选,以提高选育效率。根据雷州山羊体重和体尺性状之间的相关性进行主成分分析,可以为雷州山羊的选种提供重要参考依据。方法:该试验选取体重... 目的:选育工作中以主成分为单位首先进行集团选择,再根据对主成分贡献率较大的单一性状进行筛选,以提高选育效率。根据雷州山羊体重和体尺性状之间的相关性进行主成分分析,可以为雷州山羊的选种提供重要参考依据。方法:该试验选取体重相近且健康状况良好的雷州山羊公羔60只,采用放牧+补饲方式饲养至60日龄断奶,并进行体重、体高、体斜长等11个体尺指的测定及主成分分析。结果:雷州山羊公羔的腰角宽变异系数最大,有较大的选择潜力;体重与管围的相关系数为0.484,达到显著正相关的水平(P<0.05)。体重与体尺性状可区分为相对独立的4个主成分:躯体因子、匀称因子、特征类因子以及宽度因子。第一主成分的贡献率为31.727%,其中胸深、额宽、体斜长以及肢高的特征向量系数较大,分别为0.432、0.413、0.384以及0.361。结论:胸深、额宽、体斜长以及肢高是雷州山羊公羔的主要性状指标。 展开更多
关键词 雷州山羊 体重体尺性状 主成分分析
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狮头鹅群体遗传多样性和体重体尺全基因组关联分析
3
作者 黄红艳 张力允 +8 位作者 黄智荣 伍仲平 张续勐 欧阳宏佳 陈俊鹏 林桢平 田允波 李秀金 黄运茂 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3914-3924,共11页
旨在探究狮头鹅群体遗传多样性和体重体尺性状全基因关联分析。本试验随机选取2年龄休产状态的狮头鹅111只(公鹅20、母鹅91只),进行体重和体尺指标表型测定和二代基因组测序(5×),对测序数据进行SNPs位点检测,计算狮头鹅群体遗传多... 旨在探究狮头鹅群体遗传多样性和体重体尺性状全基因关联分析。本试验随机选取2年龄休产状态的狮头鹅111只(公鹅20、母鹅91只),进行体重和体尺指标表型测定和二代基因组测序(5×),对测序数据进行SNPs位点检测,计算狮头鹅群体遗传多样性指标,利用单标记回归混合模型开展SNPs与体重体尺性状的关联分析。本试验采用Bonferroni法校正,即全基因组水平阈值(0.05/总SNPs)和染色体水平阈值(0.05/染色体SNP数目),确定显著性SNPs位点,并对染色体水平显著性SNPs位点上、下游50 kb进行基因注释。经过质控,共计获得7577552个有效SNPs用于进一步分析。群体多样性分析显示,历史有效群体含量、最小等位基因频率、多态信息含量、观察杂合度、期望杂合度和近交系数分别为234、0.25、0.34、0.26、0.34和0.22。共检测出6164个连续纯合片段,长度在1.0~2.0 Mb的纯合片段占比最多(74.4%)。体重体尺性状的全基因组关联分析发现38个染色体水平显著性SNPs,涉及90个基因。其中影响生长发育相关的基因有7个,即D 2HDH、THAP4、ESPNL、EPT1、TNPO3、MCF 2L、AIP 1。本研究利用二代基因组测序数据发现,狮头鹅群体存在一定程度近交现象,挖掘出与狮头鹅体重和体尺性状相关的7个候选基因,可为后续狮头鹅群体保种、功能基因研究和分子育种开展提供重要参考。 展开更多
关键词 狮头鹅 群体多样性 体重体尺性状 全基因组关联分析
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大菱鲆体重和体尺性状联合GWAS分析 被引量：5
4
作者 高进 杨润清 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2021年第2期63-70,共8页
为了揭示大菱鲆(Scophthalmus maximus)体重和体尺性状的分子遗传机制,探寻用于改良目标性状的分子标记及候选基因,本研究以大菱鲆育种群体为研究对象,分别测量其体重、体长、体宽和尾柄宽性状的表型值,利用简化基因组测序技术(2b-RAD)... 为了揭示大菱鲆(Scophthalmus maximus)体重和体尺性状的分子遗传机制,探寻用于改良目标性状的分子标记及候选基因,本研究以大菱鲆育种群体为研究对象,分别测量其体重、体长、体宽和尾柄宽性状的表型值,利用简化基因组测序技术(2b-RAD)获得相应基因型数据,进行全基因组关联研究(Genome-wide association study, GWAS),筛选与大菱鲆体重和体尺性状显著关联的数量性状核苷酸(Quantitative trait nucleotides, QTNs)遗传位点。结果显示,以多性状线性混合模型(mv LMM)对体重–体长和体长–体宽–尾柄宽2个性状组合进行多性状GWAS分析,分别检测到9个和2个一因多效QTNs;以单一性状线性混合模型(LMM)对各个性状进行GWAS分析,在体重性状中检测到4个与之显著关联的QTNs,在体长和体宽性状中各检测到1个QTN,而在尾柄宽性状中则没有检测到显著的遗传位点。比较2种模型的结果,发现mvLMM相较于LMM能够检测到更多QTNs,且检测到的QTNs为更具生物学意义的一因多效QTNs。本研究首次利用mvLMM和LMM对大菱鲆体重和体尺性状进行联合GWAS分析,共筛选到17个显著的QTNs,其中,有4个QTNs被重复检测到。以这些检测到的QTNs为探针,在大菱鲆全基因组上找到了距离其最近的12个候选基因,它们可能是影响大菱鲆体重和体尺性状的重要候选标记和功能基因,本研究为大菱鲆体重和体尺性状的分子标记辅助选育提供了理论素材和参考。 展开更多
关键词 大菱鲆 体重和体尺性状 全基因组关联分析 多性状线性混合模型
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山羊GHRL基因多态性及其与体重、体尺性状的关系研究 被引量：7
5
作者 罗开鹏 宋桃伟 +4 位作者 孙岩岩 刘彬 罗卫星 黄安志 张许 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期162-165,共4页
采用PCR-SSCP技术对贵州黑山羊和贵州白山羊GHRL基因进行单核苷酸多态性检测,并分析其多态与体重、体尺性状间的关联性。结果发现,在GHRL基因外显子4处存在1个同义突变位点(C345T),表现为2种基因型,分别命名为CC和CT。基因型与体重、体... 采用PCR-SSCP技术对贵州黑山羊和贵州白山羊GHRL基因进行单核苷酸多态性检测,并分析其多态与体重、体尺性状间的关联性。结果发现,在GHRL基因外显子4处存在1个同义突变位点(C345T),表现为2种基因型,分别命名为CC和CT。基因型与体重、体尺性状关联分析结果显示,在贵州黑山羊(麦坪)群体中,CT基因型个体的体重、体高和胸围均显著高于CC基因型个体,而在贵州黑山羊(纳雍)和贵州白山羊群体中差异不显著。研究结果揭示,GHRL基因突变位点(C345T)影响贵州黑山羊生长性状可能性较大,该位点有望作为山羊生长性状的一个标记辅助选择位点。 展开更多
关键词 贵州黑山羊 贵州白山羊 GHRL基因 体重、体尺性状
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广灵驴体重与体尺指标的主成分分析和回归模型的建立 被引量：2
6
作者 牛晓艳 曹亮 +6 位作者 詹海杰 冯国亮 李燕平 明世清 唐贵 梁茂文 任克良 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第6期124-129,共6页
为研究广灵驴体重和体尺性状内在的相关性,实验选取广灵县优种驴场100头不同年龄阶段的种驴进行体重和4个体尺指标的测定。结果表明:年龄对广灵驴体重、体高、体长、胸围、管围具有极显著影响,性别对广灵驴管围具有极显著影响。不同年... 为研究广灵驴体重和体尺性状内在的相关性,实验选取广灵县优种驴场100头不同年龄阶段的种驴进行体重和4个体尺指标的测定。结果表明:年龄对广灵驴体重、体高、体长、胸围、管围具有极显著影响,性别对广灵驴管围具有极显著影响。不同年龄阶段驴的体重与各体尺指标都存在极显著相关关系。主成分分析结果显示:幼驴体重体尺指标相关矩阵特征值为4.61,累积贡献率为0.92;青年驴体重体尺指标相关矩阵特征值分别为3.12、0.75、0.64,累积贡献率为0.90;成年驴体重体尺指标相关矩阵特征值为3.33和0.76,累积贡献率为0.82。通过逐步回归方法和AIC(赤池信息量)准则判定体重体尺性状最优回归模型为:BW=4.35BL+2.18CM–579.39。 展开更多
关键词 广灵驴 体重体尺性状 主成分分析 回归
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沿河铁叫鸡的体尺体重和蛋品质测定及相关性分析 被引量：1
7
作者 杨礼 杨蛟 +5 位作者 崔进华 田小波 谯玉红 虞顺刚 陈磊 张依浴 《贵州畜牧兽医》 2022年第2期15-17,共3页
为了解沿河铁叫鸡的生长发育性能和蛋品质,试验对150日龄沿河铁叫鸡的体尺、体重和蛋品质指标进行测定,并分析同类指标的相关性。结果:(1)成年公、母鸡的体重分别为1 415.18、1 162.64 kg,体斜长分别为21.20、20.19 cm。公鸡体重、体斜... 为了解沿河铁叫鸡的生长发育性能和蛋品质,试验对150日龄沿河铁叫鸡的体尺、体重和蛋品质指标进行测定,并分析同类指标的相关性。结果:(1)成年公、母鸡的体重分别为1 415.18、1 162.64 kg,体斜长分别为21.20、20.19 cm。公鸡体重、体斜长、龙骨长、胸深、胸宽、胫长均极显著大于母鸡(P<0.01)。体斜长与龙骨长、胸角极显著正相关;胫长与胸角极显著正相关(P<0.01)。(2)平均蛋重37.26 g,蛋黄重13.87 g,蛋白高度2.78 cm,哈氏单位58.19。蛋重与蛋黄重、蛋壳重极显著正相关;蛋白高度与哈氏单位、蛋形指数极显著正相关(P<0.01)。结论:沿河铁叫鸡体型偏小,蛋品质为B级。 展开更多
关键词 沿河铁叫鸡 体尺体重性状 蛋品质 相关性
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IGF-Ⅰ基因第3外显子多态性对山西白猪生长性状的影响 被引量：1
8
作者 赵园园 赵佳丽 +3 位作者 高鹏飞 郭晓红 李步高 曹果清 《畜牧与饲料科学》 2011年第12期112-114,共3页
胰岛素样生长因子Ⅰ(IGF-Ⅰ)是动物生长发育和代谢的主要调节因子,是生长激素启动生长活性的主要介导者。采用PCR-SSCP技术检测了山西白猪群体IGF-Ⅰ基因第3外显子的多态性,共检测到3个等位基因A、B、C,形成了AA、AB、AC、BB、BC和CC6... 胰岛素样生长因子Ⅰ(IGF-Ⅰ)是动物生长发育和代谢的主要调节因子,是生长激素启动生长活性的主要介导者。采用PCR-SSCP技术检测了山西白猪群体IGF-Ⅰ基因第3外显子的多态性,共检测到3个等位基因A、B、C,形成了AA、AB、AC、BB、BC和CC6种基因型。A等位基因的频率较高,为0.549,等位基因B和C的频率较低,分别为0.173和0.278。就基因型频率的分布来看,纯合子AA型、杂合子AB和AC型频率较高,分别为0.230、0.204和0.434,其他类型频率较低,均低于10%。利用最小二乘法分析了突变位点对山西白猪初生重、断奶重、6月龄体重和体高、体长、胸围、背膘厚等性状的影响。结果表明,该突变位点对6月龄猪的体高有显著影响(P<0.05),BC型个体的6月龄体高显著低于其他类型个体(P<0.05),而对其他性状的影响不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 IGF-I基因 多态性 体重和体尺性状 山西白猪
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